(07/05/2014) Procedimiento para la conversión por bisulfito de ADN, en el que la reacción con bisulfito se lleva a cabo a una temperatura >50ºC y con un tiempo de reacción ≥ 5 h y ≤ 18 h en presencia de un ácido 6-hidroxi-2,5,7,8- tetrametilcroman-5 2-carboxílico
(25/12/2013) Uso de i) una molécula de ácido nucleico que consiste en una secuencia de al menos 18 bases delongitud de una de las secuencias seleccionadas del grupo que consiste en las SEC ID Nº411, 412, 515, 516, 685, 686, 789 y 790, y secuencias complementarias de las mismas, ii) un oligonucleótido o PNA-oligómero que consiste en al menos una secuencia de bases quetiene una longitud de al menos nucleótidos que es complementaria o idéntica a una de lassecuencias de ácido nucleico de acuerdo con la SEC ID Nº 515, 686 y 789, iii) un conjunto de oligonucleótidos de acuerdo con ii), o iv) un kit que comprende un reactivo bisulfito(≥ bisulfito, hdrógeno…
(29/11/2013) Un procedimiento para la conversión de ADN con bisulfito, en el que se hace reaccionar ADN genómico aisladocon un reactivo de bisulfito, caracterizado porque la reacción se realiza a una temperatura en el intervalo de 0-80ºC, y porque la temperatura de la reacción aumenta hasta un intervalo de 85-100ºC brevemente durante elcurso de la conversión (termopicos), llegando a ser el número de incrementos de temperatura de corta duración(termopicos) de 1 a 10.
(23/05/2013) Método para predecir el resultado de tratamiento con antraciclinas de un sujeto con un trastorno proliferativocelular de la mama, que comprende las etapas siguientes: a) poner en contacto ADN genómico aislado de la muestra biológica con al menos un reactivo, o serie dereactivos que distinguen entre dinucleótidos de CpG metilados y no metilados; b) determinar, basándose en la puesta en contacto, un estado de metilación de al menos una secuenciadinucleotídica de CpG de al menos un gen y/o secuencia genómica seleccionadas del grupo que consiste enPITX2 y PLAU y/o sus secuencias reguladoras en dicha muestra, y c) proporcionar, basándose en el estado de metilación determinado, una…
(13/06/2012) Método para determinar el estado de metilación de por lo menos una citosina, un patrón de metilación, o ambos en el ADN de una muestra de sangre, una muestra de plasma, una muestra de suero o una muestra de orina de un individuo, que comprende: (a) proporcionar dicha muestra que comprende ADN; (b) aislar el ADN de dicha muestra; (c) tratar el ADN aislado con un reactivo bisulfito en presencia de un captador de radicales; y (d) determinar el estado de metilación de por lo menos una citosina en el ADN de dicha muestra, estando cada citosina localizada en una posición definida y/o de un patrón de metilación en el ADN de dicha muestra, con una reacción de amplificación a base de polimerasa y/o un ensayo basado en una amplificación. en el que dicho ADN tratado con bisulfito de la etapa (c) es sometido…
(14/03/2012) Método para detectar el carcinoma de pulmón mediante la detección de la presencia o la ausencia de metilación en CpG dentro del gen PTGER4 y/o elementos promotores o reguladores en un sujeto en el que la hipermetilación es indicativa de la presencia de un carcinoma de pulmón.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(22/12/2009). Ver ilustración. Inventor/es: DISTLER, JURGEN, DR., WEISS, GUNTER, COTTRELL,SUSAN, MODEL,FABIAN, SONG,XIAOLING, HAEFLIGER,CAROLINA, SLEDZIEWSKI,ANDREW,Z, SKILLMAN,THOMAS,L, THOMAS,JEFFREY G. Clasificación: C12Q1/68.
Un procedimiento para proporcionar un pronóstico a un sujeto con un trastorno proliferativo de las células de la próstata que comprende las siguientes etapas de: a. determinar el estado de metilación del gen PITX2 y/o sus regiones reguladoras en una muestra biológica obtenida de dicho sujeto; y b. determinar a partir del mismo el pronóstico de dicho sujeto por el que la hipermetilación es un indicador de mal pronóstico.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(09/12/2009). Ver ilustración. Inventor/es: SCHMITT, MANFRED, SCHMITT, ARMIN DR., FOEKENS, JOHN, HOFLER, HEINZ, KONIG, THOMAS, MAIER,SABINE, MODEL,FABIAN, NIMMRICH,INKO, RUJAN,TAMAS, HARBECK,NADIA, MARTENS,JOHN, LOOK,MAXIME,P, MARX,ALMUTH. Clasificación: C12Q1/68M6B, C12Q1/68.
Un procedimiento para predecir la capacidad de respuesta de un sujeto con un trastorno proliferativo de células positivas para ER de los tejidos de mama frente a un tratamiento que comprende uno o más fármacos antiestrógenos, comprendiendo dicho procedimiento analizar el patrón de metilación de al menos un ácido nucleico diana poniendo en contacto dicho al menos un ácido nucleico diana en una muestra biológica obtenida de dicho sujeto antes de o durante el tratamiento, con uno o más agentes que convierten bases de citosina que no están metiladas en la posición 5'' de las mismas en una base que es diferente de manera detectable a la citosina en cuanto a las propiedades de hibridación, comprendiendo dicho al menos un ácido nucleico diana el gen PITX2 y/o sus regiones reguladoras.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(20/10/2009). Ver ilustración. Inventor/es: BERLIN, KURT, BALLHAUSE,MATTHIAS, CARDON,KAREN,C/O EPIGENOMICS AG. Clasificación: C12Q1/68.
Un procedimiento para el diagnóstico y/o pronóstico de enfermedades cancerosas, interacciones farmacológicas indeseadas, enfermedad cardiovascular o inflamación en un paciente o individuo, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas: a) Se extrae el ADN de muestras de tejido o de fluidos corporales, b) El ADN se convierte con bisulfito, c) El ADN convertido se purifica mediante ultrafiltración.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(02/09/2009). Ver ilustración. Inventor/es: SCHMITT, ARMIN DR., ADORJAN,PETER, BURGER,MATTHIAS, MAIER,SABINE, LESCHE,RALF, NIMMRICH,INKO, BECKER,EVELYNE, RUJAN,TAMAS. Clasificación: C12Q1/68.
Un procedimiento para detectar y diferenciar entre los trastornos proliferativos de las células de colon que comprende las siguientes etapas: #a) proporcionar una muestra de fluido corporal que contiene ADN genómico, #b) extraer dicho ADN genómico, #c) convertir las bases de citosina de dicha muestra de ADN genómico que están desmetiladas en la posición 5, mediante tratamiento, en uracilo o en otra base que sea diferente de la citosina en términos del comportamiento en el apareamiento de bases y #d) identificar el estado de metilación de una o más posiciones de citosina del gen TPEF y/o sus regiones reguladoras.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(26/08/2009). Inventor/es: BERLIN, KURT, BALLHAUSE,MATTHIAS, GUTIG,DAVID. Clasificación: C12Q1/68.
Procedimiento para el análisis de patrones de metilación de citosina en muestras de ADN genómico, en el que se realizan las siguientes etapas de procedimiento: #a) se aísla el ADN genómico a partir de células u otros materiales acompañantes y se une de forma esencialmente irreversible a una superficie, #b) se trata el ADN unido a la superficie preferiblemente con un bisulfito (=disulfito, hidrogenosulfito) de modo que la citosina se transforme en una base distinta en el comportamiento de apareamiento de bases en el dúplex de ADN, mientras que la 5-metilcitosina permanece intacta, #c) se retiran los reactivos usados en la etapa b) en una etapa de lavado, #d) se amplifican fragmentos seleccionados del ADN inmovilizado en una reacción con polimerasa, #e) se analizan los amplificados respecto a su secuencia.
(18/05/2009) Procedimiento para la amplificación de ácidos nucleicos, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas: #a) se hace reaccionar químicamente una muestra de ácido nucleico con un reactivo, con lo que la 5-metilcitosina permanece intacta y la citosina se transforma en uracilo o en otra base similar al uracilo en el comportamiento de apareamiento de bases; #b) hibridan los segmentos a amplificar con al menos dos oligonucleótidos cebadores que presentan dos dominios, de los cuales el dominio específico de secuencia que se encuentra en el extremo 3'' hibrida con el segmento a amplificar, mientras que el dominio genérico que se encuentra en el extremo 5'' no hibrida; #c) se lleva a cabo una primera reacción de amplificación mediante una polimerasa, #d) hibrida con el producto amplificado un oligonucleótido…
Sección de la CIP Química y metalurgia
(01/04/2009). Ver ilustración. Inventor/es: DISTLER, JURGEN, DR., SCHUSTER, MATTHIAS, TETZNER,REIMO, LESCHE,RALF, LOFTON-DAY,CATHERINE, SLEDZIEWSKI,ANDREW, HILDMANN,THOMAS, MODEL,FABIAN, SONG,XIAOLING. Clasificación: C12Q1/68.
Un procedimiento para detectar y/o clasificar trastornos de proliferación de células hepatocelulares o colorrectales mediante la detección de la presencia o ausencia de metilación de CpG en el gen Septina 9 y/o su promotor o elementos reguladores en un sujeto en el que la metilación de CpG es indicio de la presencia o clase de ese trastorno.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(01/12/2008). Ver ilustración. Inventor/es: TETZNER,REIMO, DIETRICH,DIMO. Clasificación: C12Q1/68.
Un método para proporcionar un ácido nucleico descontaminado adecuado para análisis de metilación del DNA, caracterizado por a) incubar un ácido nucleico con una solución que contiene reactivo bisulfito, con lo cual las citosinas no metiladas en dicho ácido nucleico se sulfonan y/o se desaminan, pero en donde no tiene lugar reacción de desulfonación alguna, y b) añadir a esta mezcla una enzima, que degrada los ácidos nucleicos que contienen uracilo no sulfonado y no degrada los ácidos nucleicos que contienen uracilo sulfonado, e incubar la mezcla, con lo cual los ácidos nucleicos que contienen uracilos no sulfonados se degradan.
(01/12/2008) Procedimiento para la detección simultánea de 5-metilcitosina y de polimorfismos de un único nucleótido (del inglés Single Nucleotide Polymorphisms = SNP''s) o mutaciones en muestras de ADN genómico, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas: (a) se hace reaccionar químicamente un ADN genómico, procedente de una muestra de ADN, con un reactivo, reaccionando de manera diferente la 5-metilcitosina y la citosina, y por consiguiente éstas, después de la reacción, muestran un diferente comportamiento de apareamiento de bases en el dúplex de ADN; (b) se amplifica el ADN tratado previamente mediando utilización de una polimerasa y de por lo menos un oligonucleótido (tipo A) como cebador; (c) se hibrida el ADN genómico amplificado con por lo menos un oligonucleótido (del tipo B) mediando formación…
(01/11/2008) Procedimiento para el análisis del grado de metilación dentro de un islote de CpG en muestras de ADN, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas de procedimiento: a) a partir de una muestra se extrae el ADN, b) el ADN se trata, preferiblemente con un bisulfito (= disulfito, hidrógeno-sulfito), de tal manera que la citosina es transformada en una base diferente en cuanto al comportamiento de apareamiento de bases en el dúplex de ADN, mientras que la 5-metilcitosina permanece inalterada, c) uno o varios cebadores de oligonucleótidos se hibridan con el ADN tratado, d) los cebadores hibridados se prolongan en una reacción de polimerasa, siendo incorporados nucleótidos marcados en lo esencial solamente cuando en el ADN tratado, después de la etapa…
(01/07/2008) Procedimiento para la detección de 5-metilcitosina o para la detección de 5-metilcitosina y de SNP''s en muestras de ADN genómico, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas: (a) se hace reaccionar químicamente un ADN genómico, procedente de una muestra de ADN, con un reactivo, reaccionando de manera diferente la 5-metilcitosina y la citosina, y por consiguiente éstas, después de la reacción, muestran un diferente comportamiento de apareamiento de bases en el dúplex de ADN; (b) se amplifica un ADN tratado previamente mediando utilización de una polimerasa y de por lo menos un cebador oligonucleótido; (c) se hibrida el ADN genómico amplificado, en condiciones rigurosas, con por lo menos un oligonucleótido que tiene…
Secciones de la CIP Física Química y metalurgia Necesidades corrientes de la vida Técnicas industriales diversas y transportes
(01/06/2008). Ver ilustración. Inventor/es: OLEK, ALEXANDER, BERLIN, KURT, PIEPENBROCK, CHRISTIAN, GITIG,DAVID. Clasificación: G01N33/58, C12N15/09, A61K31/70, C12Q1/68, G01N33/53, C12N15/11, G01N33/50, G01N33/566, C12P19/34, C12M1/00, B01J19/00, G01N21/78, G01N27/62.
Proceso para la detección del grado de metilación de una citosina determinada en el contexto secuencial 5''- CpG-3'' de una muestra de DNA genómico, caracterizado porque a) se trata químicamente el DNA genómico, transformándose las bases citosina en uracilo, pero no las bases 5-metilcitosina; b) se amplifican fragmentos definidos, que contienen dicha citosina determinada, conservando los amplificados una marcación detectable; c) se hibridan los amplificados en dos clases de oligonucleótidos y/u oligómeros PNA en cada caso con un miembro de dicha citosina determinada; d) se determina la magnitud de la hibridación de los amplificados en las dos clases de oligonucleótidos y/u oligómeros PNA por detección de la marcación de los amplificados; e) se deduce de la relación de las marcaciones detectadas en las dos clases de oligonucleótidos y/u oligómeros PNA como consecuencia de la hibridación el grado de metilación de dicha citosina determinada en la muestra de DNA genómico.
Secciones de la CIP Necesidades corrientes de la vida Física Química y metalurgia
(16/04/2008). Ver ilustración. Inventor/es: ADORJAN,PETER, BURGER,MATTHIAS, MAIER,SABINE, LESCHE,RALF, COTTRELL,SUSAN, DE VOS,THEO. Clasificación: A61P35/00, G01N33/543, A61K48/00, G01N33/58, C12N15/09, C12Q1/68, G01N33/53, A61P43/00, G01N33/574, C12Q1/02, C12M1/00, G01N37/00, G01N21/78, G01N27/62.
Un procedimiento in vitro de diagnosticar un trastorno de proliferación de células de colon en un sujeto, que comprende las etapas de: a) obtener o más muestras de prueba de tejido o suero de colon o ambos, sangre o heces de dicho sujeto; y b) detectar un descenso de la cantidad o expresión de un polipéptido que se expresa a partir del gen EYA4 o la presencia o ausencia de ARNm que codifica un polipéptido EYA4.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(01/02/2008). Ver ilustración. Inventor/es: DISTLER, JURGEN, DR., TETZNER,REIMO. Clasificación: C12Q1/68.
Procedimiento para la detección de metilaciones de citosina en un ADN procedente de muestras de tejidos o líquidos corporales, caracterizado porque a) el ADN que se ha de investigar se hace reaccionar con un agente químico o con una enzima de tal manera que la 5-metilcitosina permanezca inalterada mientras que una citosina no metilada sea transformada en uracilo o en otra base distinta, que se diferencia de la citosina en el comportamiento de apareamiento de bases, b) el ADN previamente tratado se amplifica mediante una polimerasa y por lo menos un cebador, cuyo extremo 5'' está unido a través de un engarzador con una sonda (cebador de Escorpión) c) el producto de prolongación de cebador es separado con respecto de la cadena de matriz, d) la sonda se hibrida intramolecularmente con el producto de prolongación de cebador, efectuándose la hibridación en dependencia del estado de metilación del ADN, e) se detecta si ha tenido lugar una hibridación de la sonda.
(16/12/2007) Procedimiento para la detección de una metilación de citosina en muestras de ADN, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas a) se trata una muestra de ADN genómico, que comprende un ADN que se ha de investigar y un ADN de fondo, por medios químicos, de tal manera que todas las bases de citosina no metiladas se transforman en uracilo, mientras que las bases de 5-metilcitosina permanecen inalteradas, b) la muestra de ADN tratada químicamente se amplifica mediando utilización de por lo menos 2 oligonucleótidos cebadores, de una polimerasa así como de por lo menos un oligonucleótido adicional o de un oligómero de ANP, que se fija a un dinucleótido 5''-CG-3'' o a un dinucleótido 5''-TG-3'' o a un dinucleótido 5''-CA-3'', fijándose el otro…
Sección de la CIP Química y metalurgia
(16/12/2007). Ver ilustración. Inventor/es: BERLIN, KURT. Clasificación: C12N15/09, C12Q1/68.
Agrupación de oligómeros, con oligómeros de ANP (ácidos nucleicos peptídicos) y/o de ADN sobre una superficie, que comprende oligómeros a base en cada caso de entre 6 y 20 monómeros o nucleobases, comprendiendo la agrupación de oligómeros por lo menos 100 diferentes oligómeros, y comprendiendo a) por lo menos un 50 % de los oligómeros unas secuencias de las fórmulas generales DDCGDD y DDTGDD o b) por lo menos un 50 % de los oligómeros unas secuencias de las fórmulas generales HHCGHH y HHCAHH; significando H una de las bases adenina (A), citosina (C) o timina (T), y representando D una de las bases adenina (A), guanina (G) o timina (T), y estando correlacionado el sitio de los oligómeros sobre la superficie con la secuencia de los oligómeros.
(01/05/2007) Procedimiento para la determinación del grado de metilación de una citosina que se ha de investigar, dentro de un dinucleótido CpG, que se encuentra dentro de una zona de secuencia del genoma, cuya secuencia es conocida, en el genoma de por lo menos una célula o de un organismo, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas: a) tratamiento de una muestra de ADN con un bisulfito y subsiguiente amplificación de un fragmento seleccionado de este ADN tratado, b) realización de un análisis de secuencias del material amplificado, en el cual el resultado se representa en forma de un electroferograma, c) determinación de una tasa de transformación de citosina no metilada en uracilo, como consecuencia de un tratamiento con un bisulfito, caracterizado porque las intensidades de señales…
Sección de la CIP Química y metalurgia
(01/05/2007). Inventor/es: BERLIN, KURT. Clasificación: C12Q1/68.
Procedimiento para la detección de metilaciones de citosinas en un ADN, caracterizado porque se realizan las siguientes etapas: a) una muestra de ADN genómico se incuba con una solución de un bisulfito (= hidrógeno-sulfito, disulfito) en el intervalo de concentraciones comprendidas entre 0, 1 y 6 mol/l, estando presente un disolvente desnaturalizante así como por lo menos un agente captador de radicales; b) la muestra tratada de ADN se diluye con agua o con una solución acuosa; c) la muestra de ADN se amplifica en una reacción con una polimerasa; d) realizándose antes de la etapa c) una desulfonación del ADN; e) se detecta en qué grado se ha modificado la secuencia mediante el tratamiento según la etapa a) con respecto a la muestra de ADN genómico y se saca una conclusión acerca del estado de metilación de por lo menos un locus en la muestra de ADN genómico.
(16/01/2007) Un procedimiento in vitro para cribar en al menos un fármaco, sustancia química y/o composición farmacéutica un efecto biológico y/o actividad en el tratamiento de una enfermedad, que comprende las etapas de: (a) proporcionar una muestra biológica A que contiene ADN de al menos un individuo, tejido, célula u otro material biológico que contiene ADN, que se ha expuesto a dicho al menos un fármaco, sustancia química y/o composición farmacéutica; (b) proporcionar una muestra biológica B que contiene ADN de al menos un individuo, tejido, célula u otro material biológico que contiene ADN, que no se ha expuesto a dicho al menos un fármaco, sustancia química o composición farmacéutica; (c) seleccionar sitios que sean relevantes para la expresión del(de los) gen(es) conocido(s) por estar relacionado(s) con dicha enfermedad, (d) analizar el nivel de metilación…
Sección de la CIP Química y metalurgia
(01/06/2006). Ver ilustración. Inventor/es: BERLIN, KURT, SLEDZIEWSKI, ANDRZEJ. Clasificación: C12Q1/68.
Un procedimiento para detectar la presencia o ausencia de una patología en un tejido u órgano de un individuo, que comprende las siguientes etapas: a) determinar la cantidad de ADN total que flota libre en una muestra de fluido corporal obtenida de dicho individuo; b) determinar la cantidad de ADN que flota libre que se origina de dicho tejido u órgano en dicha muestra; c) determinar la presencia o ausencia de una patología en base a la cantidad total de ADN que flota libre y la fracción de ADN que flota libre que se origina de dicho tejido u órgano.
(16/02/2006) Procedimiento para la distinción de modificaciones de metilación en la posición 5 de bases de citosina y mutaciones de citosina en timina y para la detección de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) (single nucleotide polymorphisms) o mutaciones puntuales en el ADN genómico, que se caracteriza porque a) se realiza un tratamiento de una muestra genómica de ADN con sulfito o bisulfito u otros productos químicos de modo que se modifiquen de tal forma todas las bases de citosina no metiladas en la posición 5 de la base, que se forme una base distinta en lo que respecta al comportamiento de apareamiento de las bases, en tanto que se mantengan invariables las citosinas metiladas en la…
Secciones de la CIP Técnicas industriales diversas y transportes Física
(01/02/2005). Ver ilustración. Inventor/es: HOWE, ANDRE. Clasificación: B01L3/00, G02B21/34, G01N1/31.
Dispositivo para unir sustancias biológicas inmovilizadas en una superficie con una solución de sustancias biológicas, que comprende una cámara para alojar esta solución, cuya parte inferior está formada por la superficie , su parte superior, por una tapa y sus paredes laterales por una junta; y en el que la tapa es desmontable, puede bloquearse en la posición de cierre y consta de dos partes: la primera es desmontable sin necesidad de herramienta alguna y comprende perforaciones para colocar la solución, una superficie de contacto con la cámara y una ranura para alojar la junta hermética ; la segunda sirve para alojar y bloquear la primera parte de la tapa y comprende resortes que regulan la presión de contacto de la primera parte de la tapa con la junta hermética.
(16/06/2004) Método para la identificación de patrones de metilación de citosina en muestras genómicas de ADN, que se caracteriza porque: a) se trata de tal forma una muestra genómica de ADN que reaccionan de forma distinta la citosina y la 5-metilcitosina y se obtiene en el Duplex (DNA de doble hebra) un comportamiento distinto de apareamiento de bases de los dos productos; b) se amplifican enzimáticamente partes de la muestra de ADN así tratada; c) se unen a una superficie las partes amplificadas de la muestra de ADN así tratada; d) se hibridiza en las muestras inmovilizadas de ADN un conjunto de sondas de distintas secuencias de bases nucleicas que contienen como mínimo en cada caso el dinucleótido 5-CpG-3; e) se separan…
