Sistemas y composiciones para diagnosticar el esófago de Barrett y métodos para usarlos.

Un método para determinar el riesgo de progresión del esófago de Barrett en un sujeto,

que comprende:

a) detectar un subconjunto de biomarcadores en una muestra del sujeto, en donde dos o más biomarcadores en dicho subconjunto se seleccionan del grupo que consiste en p53, HIF-1alfa, beta-catenina y COX-2; y

b) determinar al menos una o más características descriptivas asociadas con cada uno de dichos dos o más biomarcadores, en donde las características descriptivas se seleccionan de:

percentil 1, 5, 95, 99 de la intensidad media de p53 en células; percentil 95, 99 de la intensidad media de p53 en ácidos nucleicos; percentil 95, 99 de la intensidad media del p53 en citoplasma; percentil 1 de la relación entre citoplasma:membrana nuclear de p53;

percentil 50, 99 de la intensidad media de HIF-1alfa en ácidos nucleicos; percentil 99 de la intensidad media del HIF-1alfa en citoplasma; percentil 50, 99 de la intensidad media de HIF-1alfa en células; percentil 1 de la membrana de HIF-1alfa; percentil 5 de la relación entre citoplasma:membrana plasmática de HIF-1alfa;

percentil 1, 5 de la intensidad media de beta-catenina en células; percentil 1, 5 de la intensidad media de beta-catenina en ácidos nucleicos; percentil 1, 5 de la intensidad media de beta-catenina en citoplasma; percentil 5 de la relación entre célula:citoplasma de la beta-catenina;

percentil 50, 95, 99 de la relación membrana plasmática:núcleo de COX-2; percentil 50, 95, 99 de la relación membrana:núcleo de COX-2; percentil 1, 5, 50 de la relación citoplasma:membrana plasmática de COX-2; percentil 5 de la relación célula:citoplasma de COX-2;

y en donde la característica descriptiva y su presencia, ausencia, ubicación, relación o cantidad determina un valor numérico, en relación con un control, donde el valor numérico para cada característica descriptiva y su presencia, ausencia, ubicación, relación o cantidad se proporciona en la Tabla 4 o Tabla 5 como Efecto; combinando los valores numéricos determinados de cada uno de los dos o más biomarcadores seleccionados a través de una función de interpretación o algoritmo para determinar una puntuación de riesgo que se correlaciona con el riesgo de progresión del esófago de Barrett en el sujeto, en donde la puntuación de riesgo es una puntuación de 1-100, donde 1 indica el menor riesgo de progresión y 100 indica el mayor riesgo de progresión del esófago de Barrett en el sujeto.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2012/029198.

Solicitante: Cernostics, Inc.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1401 Forbes Avenue, Suite 302 Pittsburgh, PA 15219 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: THORNE,REBECCA JANE, CAMPBELL,BRUCE B.

Fecha de Publicación: 8 de Mayo de 2019.

Clasificación Internacional de Patentes:

G01N33/52 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Utilización de compuestos o de composiciones para investigaciones colorimétricas, espectrofotométricas o fluorométricas, p. ej. utilización de cintas de papel indicador.
G01N33/53 G01N 33/00 […] › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
G01N33/574 G01N 33/00 […] › para el cáncer.
G01N33/68 G01N 33/00 […] › en los que intervienen proteínas, péptidos o aminoácidos.

PDF original: ES-2739623_T3.pdf

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