Métodos para etiquetar bibliotecas con codificación de ADN.

Un método para marcar una primera biblioteca que comprende una entidad química codificada por oligonucleótidos,

comprendiendo dicho método:

(i) proporcionar una cabeza de dominio que consiste en un oligonucleótido de cadena sencilla que tiene un primer grupo funcional y un segundo grupo funcional, comprendiendo dicha cabeza de dominio al menos un nucleótido sustituido en 2' terminal que comprende dicho segundo grupo funcional, en el que dicha cabeza de dominio comprende un nucleótido 2' - sustituido en el extremo 5' y/o el extremo 3';

(ii) unir dicho primer grupo funcional de dicha cabeza de dominio a un primer componente de dicha entidad química, en el que dicha cabeza de dominio está conectada directamente a dicho primer componente o dicha cabeza de dominio está conectada indirectamente a dicho primer componente mediante un ligador bifuncional; y

(iii) ligar dicho segundo grupo funcional de dicha cabeza de domino a una primera etiqueta de bloque de construcción que consiste en un oligonucleótido de cadena sencilla para formar un complejo, en el que la primera etiqueta de bloque de construcción comprende un nucleótido 2'-sustituido terminal en el extremo 5' y 3' y la ligación comprende ligación enzimática;

en la que dichas etapas (ii) y (iii) pueden realizarse en cualquier orden y en donde dicha primera etiqueta de bloque de construcción codifica la reacción de unión de dicha etapa (ii), proporcionando de ese modo una biblioteca etiquetada.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2012/054228.

Solicitante: X-Chem, Inc.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 100 Beaver Street, Suite 101 Waltham, Massachusetts 02453 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: ZHANG,YING, WAGNER,RICHARD,W, CLARK,Matthew, CENTRELLA,Paolo A, KEEFE,ANTHONY D, LITOVCHICK,ALEXANDER, CUOZZO,JOHN W, HUPP,CHRISTOPHER D.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N15/10 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
  • C40B50/14 C […] › C40 TECNOLOGIA COMBINATORIA.C40B QUIMICA COMBINATORIA; BIBLIOTECAS, p. ej. QUIMIOTECAS (bibliotecas combinatorias in silico de ácidos nucleicos, proteínas o péptidos G16B 35/00; química combinatoria in silico G16C 20/60). › C40B 50/00 Procedimientos de creación de bibliotecas, p. ej. síntesis combinatoria. › Síntesis en fase sólida, es decir, en la que uno o más elementos que conforman la biblioteca están unidos a un soporte sólido durante la creación de la biblioteca; Procedimientos particulares de escisión del soporte sólido.
  • C40B50/16 C40B 50/00 […] › comprendiendo etapas de codificación.

PDF original: ES-2675111_T3.pdf

 

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