Filtración automática de variantes de enzimas.
Un método, implementado usando un sistema informático que incluye uno o más procesadores y memoria del sistema,
para seleccionar una pluralidad de diferentes variantes de enzima para actividad con un sustrato, donde la pluralidad de diferentes variantes de enzima comprende al menos diez variantes diferentes, y las variantes de enzima comprenden sitios activos que difieren de otro por al menos una mutación en la secuencia de aminoácidos del sitio activo, comprendiendo el método:
(a) crear o recibir un modelo estructural para cada una de la pluralidad de diferentes variantes de enzima, en donde cada modelo estructural contiene una representación computacional tridimensional de un sitio activo de una variante de enzima;
(b) para cada variante enzimática, acoplamiento, por el sistema informático, una representación computacional del sustrato a la representación computacional tridimensional del sitio activo de la variante enzimática, en donde el acoplamiento (i) genera una pluralidad de posiciones del sustrato en el sitio activo, en donde una posición comprende una posición u orientación del sustrato con respecto al sitio activo de la variante enzimática, e (ii) identifica posiciones energéticamente favorables del sustrato en el sitio activo, en donde una posición energéticamente favorable es una posición que tiene una energía que sea favorable para la unión entre el sustrato y la variante enzimática;
(c) para cada posición energéticamente favorable, determinar si la posición está activa, en donde una posición activa cumple una o más restricciones para que el sustrato experimente una reacción catalítica en el sitio activo;
y
(d) seleccionar al menos una de las variantes de enzima que tiene un sitio activo en el que el sustrato tiene una o más posiciones activas como se determina en (c).
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/057899.
Solicitante: Codexis, Inc.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 200 Penobscot Drive Redwood City, CA 94063 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: ZHANG,XIYUN, SARMIENTO,RUSSELL JAVINIAR, BASKERVILLE,DONALD SCOTT, HUISMAN,GJAIT W.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- G06F19/00
- G06F19/16
PDF original: ES-2693150_T3.pdf
Patentes similares o relacionadas:
Sistemas y métodos para tratar, diagnosticar y predecir la aparición de una afección médica, del 15 de Julio de 2020, de Fundação D. Anna Sommer Champalimaud E Dr. Carlos Montez Champalimaud: Aparato para evaluar si es probable que un paciente tenga un estadio patológico favorable de cáncer de próstata, el aparato comprende: (a) un dispositivo de obtención […]
Dispositivo de procesamiento de datos para el procesamiento de valores de medición, del 22 de Abril de 2020, de F. HOFFMANN-LA ROCHE AG: Dispositivo de procesamiento de datos para el procesamiento de valores de medición de un equipo de medición médico, con una unidad de entrada , una […]
Sistema de análisis apuntador de acontecimientos y de gestión de medicación, del 30 de Octubre de 2019, de CAREFUSION 303, INC: Un método para reducir el riesgo de errores de medicación, el método comprende las etapas de: recibir en un dispositivo móvil un primer valor de un parámetro […]
Sistema y método de visualización en 2D y 3D para la inspección de un tubo de horno, del 11 de Septiembre de 2019, de Quest Integrity USA, LLC: Un sistema para la visualización de datos de inspección recogidos de un horno con una geometría física especificada, en donde dicho horno comprende […]
Reconocimiento anatómico y análisis dimensional para asistir en la cirugía de mama, del 25 de Julio de 2019, de ALLERGAN, INC.: Método implementado por ordenador de determinación de mediciones de la mama de manera automática a partir de una representación tridimensional (3-D) de la parte superior […]
Sistemas y métodos para tratar, diagnosticar y predecir la aparición de una afección médica, del 24 de Julio de 2019, de Fundação D. Anna Sommer Champalimaud E Dr. Carlos Montez Champalimaud: Un aparato para evaluar un riesgo de fallo clínico en un paciente después de que el paciente se haya sometido a una prostatectomía radical, y el aparato […]
Aparato médico controlado remotamente, del 24 de Julio de 2019, de GAMBRO LUNDIA AB: Una unidad de diálisis adaptada para tratar la sangre de un paciente (P) según una terapia prescrita, la unidad de diálisis presenta una interfaz inalámbrica […]
Interfaces de usuario gráficas (IUG), procedimientos y aparato para la presentación de datos, del 10 de Julio de 2019, de DUNE MEDICAL DEVICES LTD.: Un sistema de análisis de sustrato, comprendiendo el sistema: (a) una sonda que está configurada y operable para explorar un sustrato y determinar uno o más parámetros […]