Detección y cuantificación de VPH por amplificación múltiple en tiempo real.

Un conjunto de cebadores que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº:

10 y el oligonucleótido de SEC ID Nº: 15;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº: 30 o 31 y el oligonucleótido de SEC ID Nº: 35;

iii. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº: 68-70 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº: 79-81; y

iv. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº: 231-239 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº: 256-259 y 261-265,

donde el conjunto de los oligonucleótidos de i.-iv. es adecuado para la amplificación de VPH16, VPH31, VPH33, VPH18, VPH45, VPH56 y VPH51.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E11153531.

Solicitante: Bio-Rad Innovations.

Nacionalidad solicitante: Francia.

Dirección: 3, BOULEVARD RAYMOND POINCARÉ 92430 MARNES-LA-COQUETTE FRANCIA.

Inventor/es: RIHET,STÉPHANE, ZERYOUH,FATIMA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/70 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen virus o bacteriófagos.

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Fragmento de la descripción:

Detección y cuantificación de VPH por amplificación múltiple en tiempo real

Campo La invención se refiere a la detección de virus del papiloma humano (VPH) , más particularmente de VPH que tiene un tropismo para el epitelio mucoso (VPH de tipo mucoso) , aún más particularmente de VPH que puede ser oncogénico para el epitelio mucoso. La invención proporciona cebadores de amplificación y sondas de detección que son útiles para esto, así como composiciones y kits de amplificación.

Antecedentes de la invención El virus del papiloma humano (VPH) contiene un genoma de ADN bicatenario circular de aproximadamente 7.900 15 pb, que se organiza en tres regiones principales, es decir:

-una región codificante temprana que contiene los genes E1, E2, E4, E5, E6 y E7, que están implicados en la

replicación viral y en la transformación neoplásica, -una región codificante tardía, que contiene los genes L1 y L2, que codifican proteínas de la cápsida viral, -una región reguladora no codificante, que se denomina LRC (Región de Control Larga) , que se localiza entre los genes E y los genes L.

El VPH constituye un grupo de virus, que se asocian con lesiones benignas y malignas de epitelio cutáneo o mucoso. Hasta la fecha, se han identificado más de 100 tipos de VPH diferentes.

Más de 40 tipos de VPH que pertenecen al grupo mucoso se han detectado en la mucosa anogenital. El VPH es el principal factor de riesgo en el desarrollo de lesiones intraepiteliales escamosas (SIL) , que se clasifican como de gravedad de grado bajo (LSIL) o de grado alto (HSIL) .

El VPH puede inducir neoplasia intraepitelial del cuello uterino (CIN) , que varía de lesiones benignas (CIN1) , tales como condiloma acuminado, pasando por lesiones precancerosas (CIN2 a CIN3) , hasta carcinoma in situ y cáncer invasivo.

Se ha establecido ahora que el VPH está implicado directamente en la carcinogénesis del cuello uterino. La 35 detección del VPH es esencial para el pronóstico de CIN y cáncer del cuello uterino.

La detección temprana y precisa de VPH es el factor clave para recuperarse de cáncer del cuello uterino.

También se ha mostrado que una carga viral de VPH aumentada dentro de una muestra de ensayo de frotis del cuello uterino se asocia con un riesgo aumentado de CIN3 y de carcinomas del cuello uterino.

Se han clasificado varios genotipos de VPH oncogénicos que infectan el tracto anogenital como genotipos de VPH de riesgo potencialmente alto (VPH RA) , basándose en su aparición o prevalencia en carcinomas de cuello uterino. La presencia, persistencia y/o reaparición de VPH RA es un indicador de mal pronóstico. Hasta la fecha, se ha dicho 45 que trece tipos de VPH son VPH RA, concretamente VPH 56, 51, 58, 33, 52, 35, 31, 16, 68, 39, 59, 45 y 18. Los VPH RA con la mayor prevalencia son los VPH de tipos 33, 31, 16, 45 y 18.

Se considera que otros VPH oncogénicos son VPH de Riesgo Bajo (VPH RB) , por ejemplo, VPH2, VPH3, VPH6, VPH11, VPH13, VPH32, VPH40, VPH42, VPH43, VPH44, VPH57.

La clasificación clínica de los tipos de VPH en el grupo de RA o RB podría evolucionar, o variar ligeramente de un autor a otro, ya que la clasificación de un VPH dado en el grupo de RB solamente se mantiene siempre que no se encuentre este tipo de VPH asociado con un carcinoma del cuello uterino.

Por ejemplo, se contempla ahora que VPH53 y VPH66 probablemente sean VPH RA (van Ham et al. 2005, J. Clin. Microbiol. Vol. 43, nº 6, p. 2662-2667) . Por lo tanto, el grupo inicial de trece VPH RA podría aumentarse adicionalmente a un número de al menos 15 tipos de VPH.

Se han descrito otros VPH como VPH oncogénicos, pero sin ningún acuerdo definitivo sobre el asunto de su estado RA o RB, tal como sucede para VPH67, VPH82, VPH85. Se requieren medios de detección apropiados para analizar su oncogenicidad.

Pueden surgir adicionalmente tipos de VPH oncogénicos de mucosa nuevos, o aún no identificados. Además, la infección múltiple por VPH, que implica varios tipos de VPH, es una situación común: se cree que la multiinfección 65 representa aproximadamente el 20 % de los casos de infección por VPH. Un caso de multiinfección por VPH puede implicar tipos de VPH que son todos VPH oncogénicos, o que comprenden al menos un VPH oncogénico y al menos un VPH no oncogénico. Un caso multiinfección de VPH puede implicar tipos de VPH que son todos tipos de VPH mucosos, o puede implicar al menos un tipo mucoso y al menos un tipo cutáneo.

Además, también puede producirse coinfección, que implica al menos VPH y al menos un virus distinto de VPH, por 5 ejemplo, una coinfección con al menos un VPH y al menos un VIH.

Dichas situaciones de multi y/o coinfección hacen la detección de VPH precisa mucho más difícil.

Se han desvelado en la técnica anterior cebadores y sondas de VPH, que son adecuados para la detección de VPH oncogénico mucoso.

Las primeras técnicas que se desarrollaron implicaron sondas específicas de tipo, que se diseñaron para detectar VPH oncogénico por hibridación directa en una sonda específica de tipo para un genoma de VPH no amplificado, por ejemplo, por transferencia de Southern o transferencia puntual.

Se han desarrollado después ensayos de señal amplificada, tales como el ensayo de Captura Híbrida (HC2®) de Digene Corporation, Gaithersburg, MD, Estados Unidos. El ensayo HC2® se ha aprobado por la FDA, y es en la actualidad el ensayo de referencia para diagnóstico clínico.

El sistema HC2® es un sistema de microplacas de fase líquida que usa el ensayo de hibridación de ADN/ARN, que no comprenden ninguna amplificación de diana: el ADN viral hibrida en fase líquida con una sonda de ARN que se dirige al VPH RA 13, detectándose los híbridos formados de este modo por anticuerpos anti ADN/ARN y visualizándose por quimioluminiscencia.

El ensayo HC2® es un ensayo sensible. Sin embargo tiene solamente valor cualitativo. Las cargas virales evaluadas por el ensayo HC2® no aumentan con grado creciente de SIL, y no son suficientemente fiables en el caso de múltiples infecciones de VPH. Por lo tanto, el ensayo HC2® no es un ensayo cuantitativo.

Dado que el ensayo HC2® no refleja la carga viral inicialmente contenido en la muestra analizada, se recomienda combinarlo con citología clásica, para distinguir los casos con lesiones de grado alto de los que no tienen lesiones de grado alto.

Se han desarrollado por lo tanto métodos de amplificación, donde la diana o las dianas de VPH se amplifican por al menos un par de cebadores, detectándose el amplicón producido de este modo por este par de cebadores (marcado) o por un sonda.

Dichos cebadores de la técnica anterior se han diseñado en primer lugar como cebadores consenso generales, que se pretende que amplifiquen varios VPH, habitualmente varios de los trece VPH RA, así como otros VPH (RB oncogénicos y en ocasiones también VPH no oncogénicos) .

Dichos cebadores consenso también se denominan cebadores “universales”. Estos cebadores consenso se dirigen a regiones conservadas en el gen de VPH L1 (por ejemplo, los cebadores MY09/MY11/HMB01, los cebadores GP5+/GP6+, los cebadores PGMY09/PGMY11 y los cebadores SPF1/SPF2 o SPF10) o la región ORF E1 (por ejemplo, los cebadores CPIIG/CPI descritos en Tieben et al. 1993, J. Virol. Methods 42: 265-279) .

Para hacer la PCR consenso aplicable a diagnóstico clínico, se han desarrollado sondas de VPH para detectar y tipificar amplicones de VPH generados por conjuntos de cebadores consenso. Habitualmente se realiza detección de los amplicones de VPH generados por cebadores consenso por un ensayo de transferencia lineal de hibridación inversa, o por inmunoensayo de enzimas basado en placas de microtitulación colorimétricas.

Son ilustrativos de dichos métodos de PCR consenso el ensayo de VPH INNO-LiPA (Innogenetics, Gante, Bélgica) , y el ensayo de VPH Amplicor (Roche Molecular Systems, Branchburg, NJ, Estados Unidos) .

El ensayo de VPH INNO-LiPA es un ensayo de sonda lineal de hibridación inversa, cuya versión de investigación 55 prototípica se ha descrito en Kleter et al., 1999 (Journal of Clinical Microbiology, vol. 37, nº 8, p. 2508-2517) y Kleter et al. 1998 (American Journal of Pathology, vol. 153, nº 6, p. 1731-1739) .

Brevemente, se usa un conjunto de cebadores de PCR para generar un fragmento de PCR corto (SPF PCR) de 65 pb de la fase abierta de lectura de L1. El conjunto de cebadores INNO-LiPA de investigación prototípico consiste en 10 cebadores biotinilados (denominados el conjunto de cebadores de SPF10r) , concretamente los seis cebadores del sistema SPF1/2 (descrito en Kleter et al. 1998)... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un conjunto de cebadores que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 30 o 31 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35;

iii. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

6. 70 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 81; y

iv. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

23. 239 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265,

donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH16, VPH31, VPH33, VPH18, VPH45, VPH56 y VPH51.

2. El conjunto de la reivindicación 1, que comprende al menos 4, al menos 6 o al menos 8 de dichos pares de oligonucleótidos.

3. El conjunto de la reivindicación 1 o 2, donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH 56, VPH 51, VPH 58, VPH 33, VPH 52, VPH 35, VPH 31, VPH 16, VPH 68, VPH 39, VPH 59, VPH 45 y VPH 18.

4. El conjunto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 30 o 31 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35;

iii. los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

6. 70 y los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 81; y

iv. al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

23. 239 y al menos cuatro oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265.

5. El conjunto de la reivindicación 4, donde dichos al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº : 231239 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 232, 234 y 235 y dichos al menos cuatro oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 258, 261, 264 y 265.

6. Un conjunto de cebadores y sondas, que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 19 o 24;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 30 o 31, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 38 o 41;

iii. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

6. 70, al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 81 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

8. 92 .

10. 110; y

iv. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

23. 239, al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

27. 282 .

30. 319,

donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH16, VPH31, VPH33, VPH18, VPH45, VPH56 y VPH51.

7. El conjunto de la reivindicación 6, que comprende los siguientes oligonucleótidos:

i. SEC ID Nº : 10, SEC ID Nº : 15, la sonda de SEC ID Nº : 19 o de SEC ID Nº : 24,

ii. SEC ID Nº : 30, SEC ID Nº : 35, la sonda de SEC ID Nº : 38 o de SEC ID Nº : 41,

iii. al menos una de SEC ID Nº .

6. 70, al menos una de SEC ID Nº .

7. 81, y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

8. 92 o de SEC ID Nº .

10. 106, y

iv. al menos una de SEC ID Nº .

23. 239, al menos una de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265, y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

27. 282 o de SEC ID Nº .

30. 319.

8. El conjunto de la reivindicación 6, que comprende los siguientes oligonucleótidos:

i. SEC ID Nº : 10, SEC ID Nº : 15, y la sonda de SEC ID Nº : 19 o de SEC ID Nº : 24,

ii. SEC ID Nº : 31, SEC ID Nº : 35, y la sonda de SEC ID Nº : 38 o de SEC ID Nº : 41,

iii. al menos una de SEC ID Nº .

6. 70, al menos una de SEC ID Nº .

7. 81, y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

8. 92 o de SEC ID Nº .

10. 106, y

iv. al menos una de SEC ID Nº .

23. 239, al menos una de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265, y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

27. 282 o de SEC ID Nº .

30. 319.

9. El conjunto de una cualquiera de las reivindicaciones 6-8, donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH 56, VPH 51, VPH 58, VPH 33, VPH 52, VPH 35, VPH 31, VPH 16, VPH 68, VPH 39, VPH 59, VPH 45 y VPH 18.

10. El conjunto de una cualquiera de las reivindicaciones 6-9, que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 19 o 24;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 30 o 31, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 38 o 41;

iii. los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

6. 70, los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 81 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

8. 92 .

10. 106; y

iv. al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

23. 239, al menos cuatro oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

27. 282 .

30. 319.

11. El conjunto de la reivindicación 10, donde dichos al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

23. 239 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 232, 234, 235 y dichos al menos cuatro oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 258, 261, 264 y 265.

12. Un conjunto de cebadores que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 31 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35;

iii. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

6. 70 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 81; o al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 73 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

8. 83; o al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 76 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

8. 85; o al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 78 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

8. 87; y

iv. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

21. 217 y al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

24. 241,

donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH16, VPH31, VPH33, VPH18, VPH45, VPH56 y VPH51.

13. El conjunto de la reivindicación 12, que comprende al menos cuatro o al menos seis o al menos ocho de dichos pares de oligonucleótidos.

14. El conjunto de la reivindicación 12 o 13, donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH 56, VPH 51, VPH 58, VPH 33, VPH 52, VPH 35, VPH 31, VPH 16, VPH 68, VPH 39, VPH 59, VPH 45 y VPH 18.

15. El conjunto de una cualquiera de las reivindicaciones 12-14, que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 30 o 31 y el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35;

iii. los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

6. 70 .

7. 81; o los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 73 .

8. 83; o los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 76 .

8. 85; o los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 78 .

8. 87; y

iv. al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

21. 217 y los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 240 y 241.

16. El conjunto de la reivindicación 15, donde dichos al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

21. 217 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 212, 214 y 216.

17. Un conjunto de cebadores y sondas, que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 19 o 24;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 31, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 38 o 41;

iii. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

6. 70, al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 81 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

8. 92 .

10. 106; o al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 73, al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº : 8283 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

9. 95 .

10. 110; o al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 76, al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

8. 85 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

8. 91, 96, 105 .

11. 114; o al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

7. 78, al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

8. 87 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

9. 101 .

11. 121; y

iv. al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

21. 217, al menos un oligonucleótido seleccionado de SEC ID Nº .

24. 241 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

26. 271 .

28. 295,

donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH16, VPH31, VPH33, VPH18, VPH45, VPH56 y VPH51.

18. El conjunto de la reivindicación 17, que comprende los siguientes oligonucleótidos:

i. SEC ID Nº : 10, SEC ID Nº : 15, y la sonda de SEC ID Nº : 19 o de SEC ID Nº : 24,

ii. SEC ID Nº : 31, SEC ID Nº : 35, y la sonda de SEC ID Nº : 38 o de SEC ID Nº : 41,

iii. al menos una de SEC ID Nº .

6. 70, al menos una de SEC ID Nº .

7. 81, y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

8. 92 o de SEC ID Nº .

10. 106, y

iv. al menos una de SEC ID Nº .

21. 217, al menos una de SEC ID Nº .

24. 241, y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

26. 271 o de SEC ID Nº .

28. 295.

19. El conjunto de la reivindicación 17, que comprende los siguientes oligonucleótidos:

i. SEC ID Nº : 10, SEC ID Nº : 15, y la sonda de SEC ID Nº : 19 o de SEC ID Nº : 24,

ii. SEC ID Nº : 31, SEC ID Nº : 35, y la sonda de SEC ID Nº : 38 o de SEC ID Nº : 41,

iii. al menos una de SEC ID Nº .

7. 76, al menos una de SEC ID Nº .

8. 85 y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

8. 91 y 96 o de SEC ID Nº .

11. 114 y 105, y

iv. al menos una de SEC ID Nº .

21. 217, al menos una de SEC ID Nº .

24. 241 y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

26. 271 o de SEC ID Nº .

28. 295.

20. El conjunto de la reivindicación 17, que comprende los siguientes oligonucleótidos:

i. SEC ID Nº : 10, SEC ID Nº : 15, y la sonda de SEC ID Nº : 19 o de SEC ID Nº : 24,

ii. SEC ID Nº : 31, SEC ID Nº : 35, y la sonda de SEC ID Nº : 38 o de SEC ID Nº : 41,

iii. al menos una de SEC ID Nº .

7. 73, al menos una de SEC ID Nº .

8. 83 y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

9. 95 o de SEC ID Nº .

10. 110, y

iv. al menos una de SEC ID Nº .

21. 217, al menos una de SEC ID Nº .

24. 241 y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

26. 271 o de SEC ID Nº .

28. 295.

21. El conjunto de la reivindicación 17, que comprende los siguientes oligonucleótidos:

i. SEC ID Nº : 10, SEC ID Nº : 15, y la sonda de SEC ID Nº : 19 o de SEC ID Nº : 24,

ii. SEC ID Nº : 31, SEC ID Nº : 35, y la sonda de SEC ID Nº : 38 o de SEC ID Nº : 41,

iii. al menos una de SEC ID Nº .

7. 78, al menos una de SEC ID Nº .

8. 87 y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

9. 101 o de SEC ID Nº .

11. 121, y

iv. al menos una de SEC ID Nº .

21. 217, al menos una de SEC ID Nº .

24. 241 y al menos una de las sondas de SEC ID Nº .

26. 271 o de SEC ID Nº .

28. 295.

22. El conjunto de una cualquiera de las reivindicaciones 17-21, donde el conjunto de los oligonucleótidos de i. iv. es adecuado para la amplificación de VPH 56, VPH 51, VPH 58, VPH 33, VPH 52, VPH 35, VPH 31, VPH 16, VPH 68, VPH 39, VPH 59, VPH 45 y VPH 18.

23. El conjunto de una cualquiera de las reivindicaciones 17-22, que comprende:

i. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 10, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 15 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 19 o 24;

ii. el oligonucleótido de SEC ID Nº : 31, el oligonucleótido de SEC ID Nº : 35 y al menos una sonda de SEC ID Nº : 38 o 41;

iii. los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

6. 70 .

7. 81 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

8. 92 .

10. 106; o los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 73 .

8. 83 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

9. 95 .

10. 110; o los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 76 .

8. 85 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

8. 91, 96, 105 .

11. 114; o los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 78 .

8. 87 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

9. 101 .

11. 121; y

iv. al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

21. 217 y los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 240 y 241 y al menos una sonda seleccionada de SEC ID Nº .

26. 271 .

28. 295.

24. El conjunto de la reivindicación 23, donde dichos al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

21. 217 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 212, 214, 216.

25. Uso del conjunto de cebadores de una cualquiera de las reivindicaciones 1-5 y 12-16, o del conjunto de cebadores y sondas de un cualquiera de las reivindicaciones 6-11 y 17-24 en la detección in vitro de VPH, que puede ser oncogénico para el epitelio mucoso.

26. El uso de la reivindicación 25, donde dicho VPH es VPH 56, VPH 51, VPH 33, VPH 31, VPH 16, VPH 45 o VPH

18.

27. El uso de la reivindicación 25 o 26, donde dicho VPH es VPH 56, VPH 51, VPH 58, VPH 33, VPH 52, VPH 35, VPH 31, VPH 16, VPH 68, VPH 39, VPH 59, VPH 45 o VPH 18.

28. El uso de una cualquiera de las reivindicacione.

2. 27, donde los oligonucleótidos de dicho conjunto de cebadores o de dicho conjunto de cebadores y sondas se usan en el mismo tubo de amplificación.

29. Uso de los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

6. 70 .

7. 81, o de los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 73 .

8. 83,

o de los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 76 .

8. 85, o de los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 78 .

8. 87, en la detección in vitro de VPH del grupo filogenético A7, que puede ser oncogénico para el epitelio mucoso.

30. Uso de al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

23. 239 y al menos cuatro oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265, o al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

21. 217 y los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 240 y 241, en la detección in vitro de VPH del grupo filogenético A9, que pueden ser oncogénicos para el epitelio mucoso.

31. El uso de la reivindicación 30, donde dichos al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº : 231239 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 232, 234 y 235 y dichos al menos cuatro oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 258, 261, 264 y 265, o donde dichos al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

21. 217 son los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 212, 214 y 216.

32. Composición de amplificación que comprende al menos un amplicón que puede obtenerse por amplificación de al menos un ácido nucleico de un VPH del grupo filogenético A6, A5, A9 o A7 por medio de al menos un conjunto de cebadores de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-5 y 12-16, donde dicha composición de amplificación comprende además al menos un conjunto de cebadores de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-5 y 12-16.

33. Composición de amplificación que comprende al menos un amplicón que puede obtenerse por amplificación de ácido nucleico de al menos un VPH oncogénico del grupo filogenético A7 por medio de:

los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

6. 70 .

7. 81, los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 73 .

8. 83, los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 76 .

8. 85, o los oligonucleótidos de SEC ID Nº .

7. 78 .

8. 87,

donde dicha composición de amplificación comprende además dichos oligonucleótidos.

34. Composición de amplificación que comprende al menos un amplicón que puede obtenerse por amplificación de ácido nucleico de al menos un VPH oncogénico del grupo filogenético A9 por medio de al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

23. 239 y al menos cuatro oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

25. 259 .

26. 265, o por medio de al menos tres oligonucleótidos seleccionados de SEC ID Nº .

21. 217 y los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 240 y 241, donde dicha composición de amplificación comprende además dichos oligonucleótidos.

35. La composición de amplificación de la reivindicación 34, donde dicho al menos un amplicón puede obtenerse por medio de los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 232, 234 y 235, y los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 258, 261, 264 y 265, o por medio de los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 212, 214 y 216 y los oligonucleótidos de SEC ID Nº : 240 y

241.

36. Kit para el diagnóstico o pronóstico de una neoplasia o un cáncer de cuello uterino, que comprende:

-al menos un conjunto de cebadores de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-5 y 12-16, y/o -al menos un conjunto de cebadores y sondas de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 6-11 y 1724, -opcionalmente, instrucciones para el uso de los mismos y/o nucleótidos.

LOCUS NC_001594 ADN lineal de 7844 pb VRL 25

ENE-2005 DEFINICIÓN Virus del papiloma humano tipo 56, genoma completo. REFERENCIA NC_001594VERSIÓN NC_001594.1 GI: 9627383 PALABRAS CLAVE Gen E1; gen E2; gen E4; gen E6; gen E7; proteína temprana; gen L1; gen L2; proteína tardía.FUENTE Virus del papiloma humano tipo 56

ORGANISMO Virus del papiloma humano tipo 56Virus; virus de ADNbc; sin estadio de ARN; Papillomaviridae;Alphapapillomavirus.

REFERENCIA 1 (bases 1 a 7844) AUTORES Delius, .H. y Hofmann, B.TÃ?TULO Primer-directed sequencing of human papillomavirus types PUBLICACIÓN Curr. Top. Microbiol. Immunol. 186, 13-31 (1994) PUBMED 8205838

REFERENCIA 2 (bases 1 a 7844) AUTORES Delius, H.TÃ?TULO Presentación directa PUBLICACIÓN Presentado (06-AGO-1993) H. Delius, Deutsches

Krebsforschungszentrum, Abteilung ATV, Im Neuenheimer Feld506, W6900 Heidelberg, FRG

COMENTARIO REFSEQ REVISADO: Este registro se ha conservado por personaldel NCBI. La secuencia de referencia derivó de X74483. La fase abierta de lectura de HPV56 E1 está fragmentada.

CARACTERÃ?STICA Localización/CalificadoresS

fuente 1..7844 /organismo = "Virus del papiloma humano tipo 56". /tipo_mol = "ADN genómico" /db_xref = "taxón: 10596" /clon = "inserto en el sitio BamHI de pT713"

gen 102..566 /gen = "E6"

/locus_tag = "HpV56gpl" /db_xref = "GenID:1489330"

CDS 102..>566 /gen = "E6" /locus_tag = "HpV56gpl" /codón_inicio = l /producto = "proteína de envoltura" /protein_id = "NP 041849.1" /db_xref = "GI:9627384" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P24836"

/gen = "E7" /locus_tag = "HpV56gp2" /codón_inicio = l /producto = "proteína de envoltura" /protein_id = "NP 041850.1" /db_xref = "GI:9627385" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Pfot:P36833" /db_xref = "GenID:1489331"

FIGURA 3

gen 895..2804 /locus_tag = "HpV56gp3"/db_xref = "GenID:1724546"

CDS unión (895..1089, 1089..2804) /locus_tag = "HpV56gp3"/excepción = "Desplazamiento de fase artificial"/nota = "Predicho por GeneMark"/codón_inicio = l/producto = "Proteína de replicación E1"/protein_id = "NP 597794.3" /db_xref = "GI:22507279"/db_xref = "GenID:1724546 "

gen 2918..3850 /gen = "E2"/locus_tag = "HpV56gp4"/db_xref = "GenID:1489332"

CDS 2918..3850 /gen = "E2"/locus_tag = "HpV56gp4"/codón_inicio = l/producto = "proteína de envoltura"/protein_id = "NP 041851.1" /db_xref = "GI:9627386"/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P36798" /db_xref = "GenID:1489332 "

gen 4222..5616 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV56gp5"/db_xref = "GenID:1489333"

CDS 4222..5616 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV56gp5"/codón_inicio = l/producto = "proteína tardía"/protein_id = "NP 041852.1"

FIGURA 3 (continuación)

/db_xref = "GI:9627387" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P36765 /db_xref = "GenID:1489333"

gen 5492..7096

/gen = "Ll"

locus_tag = "HpV56gp6"

/db_xref = "GenID:1489334" CDS 5492..7096

/gen = "Ll"

/locus_tag = "HpV56gp6"

/codón_inicio = l

/producto = "proteína tardía"

/protein_id = "NP 041853.1"

/db_xref = "GI:9627388"

/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P36743"

FIGURA 3 (continuación)

/ final de SEC ID Nº : 420

impreso del sitio web del NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) FIGURA 3 (final)

LOCUS NC_001533 ADN lineal de 7808 pb VRL 25ENE-2005

DEFINICIÓN Virus del papiloma humano tipo 51, genoma completo. REFERENCIA NC_001533VERSIÓN NC_01533.1 GI: 9627155 PALABRAS CLAVE FUENTE Virus del papiloma humano -51

ORGANISMO Virus del papiloma humano -51Virus; virus de ADNbc, sin estadio de ARN; Papillomaviridae;Alphapapillomavirus.

REFERENCIA 1 (bases 1 a 7808) AUTORES Lungu, O., Crum, C.P. y Silverstein, S.TÃ?TULO Biologic properties and nucleotide sequence analysis of human

papillomavirus type 51PUBLICACIÓN J. Virol. 65 (8) , 4216-4225 (1991) PUBMED 1649326 COMENTARIO REFSEQ REVISADO: Este registro se ha conservado por personal del

NCBI. La secuencia de referencia derivó de M62877. CARACTERÃ?STICAS Localización/Calificadores

fuente 1..7808 /organismo = "Virus del papiloma humano -51"/tipo_mol = "ADN genómico"/db_xref = "taxón:10595"

gen 97..552 /gen = "E6" /locus_tag = "HpV51gpl" /db_xref = "GenID:1489322"

CDS 97..552 /gen = "E6" /locus_tag = "HpV51gpl" /codón_inicio = l /producto = "proteína E6" /protein_id = "NP 068496.1" /db_xref = "GI:11119520" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P2655"

/db_xref = "GenID:1489322"

/gen = "E7" /locus_tag = "HpV51gp2" /codón_inicio = l /producto = "proteína E7" /protein_id = "NP 068497.1" /db_xref = "GI:11119522" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P26558" /db_xref = "GenID:1489323"

FIGURA 4

gen 874..2778 /gen = "El"

/locus_tag = "HpV51gp3"/db_xref = "GenID:1489324"

CDS 874..2778 /gen = "El"/locus_tag = "HpV51gp3"/codón_inicio = l/producto = "Proteína de replicación E1"/protein_id = "NP 068498.1" /db_xref = "GI:11119519"/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P26544" /db_xref = "GenID:1489324 "

gen 2720..3796 /gen = "E2"/locus_tag = "HpV51gp4"/db_xref = "GenID:1489325"

CDS 2720..3796 /gen = "E2"/locus_tag = "HpV51gp4"/codón_inicio = l/producto = "proteína reguladora E2"/protein_id = "NP 068499.1" /db_xref = "GI:11119523"/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P26547" /db_xref = "GenID:1489325"

gen 3309..3572 /gen = "E4"/locus_tag = "HpV51gp5"/db_xref = "GenID:1489327"

CDS 3309..3572 /gen = "E4"/locus_tag = "HpV51gp5"/codón_inicio = l/producto = "proteína E4 probable"/protein_id = "NP 068500.1" /db_xref = "GI:11119525"/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P26548" /db_xref = "GenID:1489327 "

FIGURA 4 (continuación)

gen 4134..5540 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV51gp6"/db_xref = "GenID:1489326"

CDS 4134..5540 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV51gp6"/codón_inicio = l/producto = "proteína de cápsida menor L2"/protein_id = "NP 068501.1" /db_xref = "GI:11119524"/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P26539" /db_xref = "GenID:1489326"

gen 5521..7035 /gen = "Ll"/locus_tag = "HpV51gp7"/db_xref = "GenID:1489328"

CDS 5521..7035 /gen = "Ll"/locus_tag = "HpV51gp7"/codón_inicio = l/producto = "proteína de cápsida mayor L1"/protein_id = "NP 068502.1" /db_xref = "GI:11119521"/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P26536" /db_xref = "GenID:1489328"

ORIGEN SEC ID Nº : 421:

FIGURA 4 (continuación) FIGURA 4 (continuación)

impreso del sitio web del NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

FIGURA 4 (final)

LOCUS NC_001526 JUL-2005 ADN circular de 7904 pb VR.

2.

DEFINICIÓN REFERENCIA VERSIÓN Virus del papiloma humano -16, genoma completo.NC_001526NC__001526.1 GI: 9627100

PALABRAS

CLAVE

FUENTE ORGANISMO Virus del papiloma humano tipo 16Virus del papiloma humano tipo 16

Virus; virus de ADNbc, sin estadio de ARN; Papillomaviridae;Alphapapillomavirus.

REFERENCIA 1 (sitios) AUTORES Kennedy, I.M., Haddow, J.K. y Clements, J.B.TÃ?TULO A negative regulator y element in the human papillomavirus type

genome acts at the level of late mRNA stabilityPUBLICACIÓN J. Virol. 65 (4) , 2093-2097 (1991) PUBMED 1848319 REFERENCIA 2 (bases 1 a 7904)

AUTORES Seedorf, K., Krammer, G., Durst, M., Suhai, S. y Rowekamp, W.G.

TÃ?TULO Human papillomavirus type 16 DNA sequencePUBLICACIÓN Virology 145 (1) .

18. 185 (1985) PUBMED 2990099 REFERENCIA 3 (bases 1 a 7904)

AUTORES CONSORCIO Proyecto de genoma de NCBITÃ?TULO Presentación directa PUBLICACIÓN Presentado (31-AGO-2004) Centro Nacional para la Información Biotecnológica, NIH, Bethesda, MD 208 94, Estados Unidos (...) CARACTERÃ?STICAS Localización/Calificadoresfuente 1..7904

/organismo = "Virus del papiloma humano tipo 16" /tipo_mol = "ADN genómico" /db_xref = "taxón:333760"

Señal TATA 17..23

Señal TATA 65..71 gen 83..559 /gen = "E6"/locus_tag = "HpV16gpl"/db_xref = "GenID:1489078" CDS 83..559 /gen = "E6"/locus_tag = "HpV16gpl"/nota = "ORF de E6 de 65 a 559; potencial"/codón_inicio = l/producto = "proteína transformante"/protein_id = "NP 041325.1" /db_xref = "GI:9627104"/db_xref = "GenID:1489078"

qen 562..858 /gen = "E7"/locus_tag = "HpV16gp2"/db_xref = "GenID:1489079"

FIGURA 5

CDS 562..858 /gen = "E7"/locus_tag = "HpVlógp2"/nota = "ORF de E7 de 544 a 858; potencial"/codón_inicio = l/producto = "proteína transformante"/protein_id = "NP 041326.1" /db_xref = "GI:9627105"/db_xref = "GenID:1489079 "

gen 865..2813

/gen = "El"

/locus_tag = "HpV16gp3"

/db_xref = "GenID:1489075" CDS unión (865..1140, 1140..2813)

/gen = "El"

/locus_tag = "HpVlógp3"

/nota = "ORF interrumpida por E1 de 859 a 2813; potencial"

/codón_inicio = l

/producto = "proteína de replicación"

/protein_id = "NP 041327.1"

/db_xref = "GI:9627101"

/db_xref = "GenID:1489075 "

gen 2755..3852 /gen = "E2"

/locus_tag = "HpV16gp4"/db_xref = "GenID:1489080"

CDS 2755..3852 /gen = "E2"/locus_tag = "HpV16gp4"/nota = "ORF de E2 de 2725 a 3852; potencial"/codón_inicio = l/producto = "proteína reguladora"/protein_id = "NP 041328.1" /db_xref = "GI:9627106"/db_xref = "GenID:1489080"

FIGURA 5 (continuación)

gen 3332..3619

/gen = "E4"/locus_tag = "HpV16gp5"/db_xref = "GenID:1489076"

CDS <3332..3619 /gen = "E4"/locus_tag = "HpV16gp5"/nota = "ORF de E4 de 3332 a 3619; potencial"/codón_inicio = l/protein_id = "NP 041329.1" /db_xref = "GI:9627102"/db_xref = "GenID:1489076 "

gen 3863..4099 /gen = "E5"/locus_tag = "HpVlógp6"/db_xref = "GenID:1489077"

CDS <3863..4099 /gen = "E5"/locus_tag = "HpV16gp6"/nota = "ORF de E5 de 3863 a 4099; potencial"/codón_inicio = l/protein_id = "NP 041330.1" /db_xref = "GI:9627103"/db_xref = "GenID:1489077 "

señal poliA 4213..4218 /nota = "potencial"

gen 4235..5656 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV16gp7n /db_xref = "GenID:1489081"

CDS 4235..5656 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV16gp7"/nota = "ORF de L2 de 4133 a 5656; potencial"/codón_inicio = l/producto = "proteína de cápsida menor"/protein_id = "NP 041331.1" /db_xref = "GI:9627107"/db_xref = "GenID:1489081 "

Señal TATA 4289..4295

/gen = "L2"

/locus_tag = "HpV16gp7"

FIGURA 5 (continuación)

gen 5559..7154 /gen = "Ll"/locus_tag = "HpV16gp8"/db_xref = "GenID:1489082"

CDS 5559. .7154 /gen = "Ll"/locus_tag = "HpV16gp8"/nota = "ORF de Ll de 5526 a 7154; potencial"/codón_inicio = l/producto = "proteína de cápsida mayor"/protein_id = "NP 041332.1" /db_xref = "GI:9627108"/db_xref = "GenID:1489082"

señal poliA 7260..7265 ORIGEN SEC ID Nº : 422:

FIGURA 5 (continuación) FIGURA 5 (continuación)

// final de SEC ID Nº : 422

impreso del sitio web del NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

FIGURA 5 (final)

LOCUS

DEFINICIÓN

REFERENCIA VERSIÓN PROYECTO PALABRAS CLAVE

FUENTE ORGANISMO

REFERENCIA AUTORES TÃ?TULO

PUBLICACIÓN PUBMED REFERENCIA

AUTORES CONSORCIO TÃ?TULO PUBLICACIÓN

COMENTARIO

CARACTERÃ?STICAS fuente gen CDS

gen CDS NC_001357 ADN lineal de 7867 pb VRL 17-DIC2005 Virus del papiloma humano -18, genoma completo.

NC_001357

NC_001357.1 GI: 9626069 GenomeProject:15506Gen E1; gen E2; gen E5; gen E6; gen E7; gen L1; gen L2. Virus del papiloma humano tipo 18Virus del papiloma humano tipo 18Virus; virus de ADNbc, sin estadio de ARN; Papillomaviridae;Alphapapillomavirus.1 Cole, S.T. y Danos, O.Nucleotide sequence and comparative analysis of the humanpapillomavirus type 18 genome. Phylogeny of papillomaVirusand repeated structure of the E6 and E7 gene products

J. Mol. Biol. 193 (4) .

59. 608 (1987) 3039146 2 (bases 1 a 7857)

Proyecto del genoma del NCBIPresentación directa Presentado (01-AGO-2000) Centro Nacional para la Información Biotecnológica, NIH, Bethesda, MD 20894, EEUUREFSEQ PROVISIONAL: Este registro aún no se ha sometido a revisión final por el NCBI. La secuencia de referenciaderivó de X05015. Datos amablemente revisados (14-AGO-1987) por Danos O.

Localización/Calificadores 1..7857 /organismo = "Virus del papiloma humano tipo 18" /tipo_mol = "ADN genómico" /db_xref = "taxón:333761" 105..581 /gen = "E6" /locus_tag = "HpV18gpl" /db_xref = "GenID:1489088" 105..581 /gen = "E6" /locus_tag = "HpV18gpl" /codón_inicio = l /producto = "proteína E6" /protein_id = "NP 040310.1" /db_xref = "GI:9626070" /db~xref = "GOA:P06463" /db xre.f = “InterPro:IPR001334" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P06463" /db_xref = "GenID:1489088 "

590..907 /gen = "E7" /locus_tag = "HpVl8gp2" /db_xref = "GenID:1489089" 590..907 /gen = "E7" /locus_tag = "HpV18gp2" /codón_inicio = l /producto = "proteína E7" /protein_id = "NP 040311.1" /db_xref = "GI:9626071" /db_xref = "GOA:P06788"

FIGURA 6

/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P06788"

/gen = "El" /locus_tag = "HpV18gp3" /codón_inicio = l /producto = "proteína El" /protein_id = "NP 040312.1" /db_xref = "GI:9626072" /db_xref = "GOA:P06789" /db_xref = "InterPro:IPR001177" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P06789" /db_xref = "GenID:1489084"

gen 2817..3914

/gen = "E2"

/locus_tag = "HpV18gp4"

/db_xref = "GenID:1489085" CDS 2817..3914

/gen = "E2"

/locus_tag = "HpV18gp4"

/codón_inicio = l

/producto = "proteína E2"

/protein_id = "NP 040313.1"

/db_xref = "GI:9626073"

/db_xref = "GOA:P06790"

/db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P06790"

/db_xref = "GenID:1489085"

gen 3418..3684 /gen = "E4"/locus_tag = "HpV18gp5"/db_xref = "GenID:1489086"

CDS 3418..3684 /gen = "E4"/locus_tag = "HpVl8gp5"/codón_inicio = l

FIGURA 6 (continuación)

/producto = "proteína E4" /protein_id = "NP 040314.1" /db_xref = "GI:9626074" /db_xref = "InterPro:IPR003861" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P06791" /db_xref = "GenID:1489086 "

gen 3936..4157 /gen = "E5"/locus_tag = "HpV18gp6"/db_xref = "GenID:1489087"

CDS 3936..4157 /gen = "E5"/locus_tag = "HpV18gp6"/codón_inicio = l/producto = "proteína E5"/protein_id = "NP 040315.1" /db_xref = "GI:9626075"/db_xref = "InterPro:IPR004270" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P06792" /db_xref = "GenID:1489087 "

gen 4244..5632 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV18gp7"/db_xref = "GenID:1489091"

CDS 4244..5632 /gen = "L2"/locus_tag = "HpV18gp7"/codón_inicio = l/producto = "proteína L2"/protein_id = "NP 040316.1" /db_xref = "GI:9626076"/db_xref = "GOA:P06793"/db_xref = "InterPro:IPR000784" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot:P06793" /db_xref = "GenID:1489091"

/gen = "Ll" /locus_tag = "HpV18gp8" /codón_inicio = l /producto = "proteína Ll" /protein_id = "NP 040317.1" /db_xref = "GI:9626077" /db_xref = "GOA:P06794" /db_xref = "InterPro:IPR002210"

FIGURA 6 (continuación)

/db_xref = "InterPro:IPR008975" /db_xref = "UniProtKB/Swiss-Prot: P06794"

ORIGEN SEC ID Nº : 423

FIGURA 6 (continuación) FIGURA 6 (continuación)

// final de SEC ID Nº : 423 impreso del sitio web del NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

FIGURA 6 (final)


 

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