Retrovirus endógeno y proteínas codificadas por env como diana para el tratamiento del cancer.

Utilización de una composición que comprende:

- una proteína inmunosupresora codificada por el gen env de un retrovirus endógeno,

5 mutada o no, o un fragmento de la misma que comprende un dominio inmunosupresor de dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o

- un ácido nucleico que codifica dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o fragmento de dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o

- un ligando tal como anticuerpos, pudiendo dicho ligando unirse específicamente a dicha proteína inmunosupresora codificada por el gen env, o

- un ARN bicatenario, ARNip, ARNc, miARN o un ácido nucleico antisentido que selecciona como diana secuencias de ácido nucleico del retrovirus endógeno y/o de una proteína expresada por dicho retrovirus endógeno, en la que dicho retrovirus endógeno es un retrovirus endógeno humano HERV-K dicha composición

a. inhibiendo la expresión de dicho retrovirus endógeno y/o

b. inhibiendo la expresión, y/o disminuyendo la concentración, y/o inhibiendo la actividad de dicha proteína expresada, y/o

c. estimulando una respuesta inmunitaria contra dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno para la preparación de un fármaco destinado a la prevención y/o el tratamiento del cáncer en un mamífero, en la que las células cancerosas de dicho mamífero expresan dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno.

Retrovirus endógeno y proteínas codificadas por env como diana para el tratamiento del cáncer.

La presente invención se refiere a un método para la prevención y/o el tratamiento del cáncer en un mamífero, en el que las células cancerosas expresan al menos una proteína de retrovirus endógeno, particularmente proteína inmunosupresora tal como proteína codificada por el gen env de HERV-K, particularmente la proteína Np9, comprendiendo dicho método inhibir la expresión y/o la actividad de dicho retrovirus endógeno y/o dicha proteína inmunosupresora codificada por el gen env. La invención también se refiere a composiciones farmacéuticas que comprenden un ácido nucleico que puede inhibir dicha expresión, un ligando tal como anticuerpos que pueden inhibir la actividad de dicha proteína codificada por el gen env, o un inmunógeno o una composición de vacuna que puede inducir una respuesta inmunitaria, respuesta celular o humoral dirigida contra dicha proteína codificada por el gen env. La invención se refiere además a la utilización de tal proteína codificada por el gen env, mutada o no, para la fabricación de un medicamento o composición de vacuna destinada a la prevención o el tratamiento de cánceres.

El genoma humano contiene una gran fracción (aprox. el 8%) de elementos de origen retroviral, con miles de secuencias próximas a la forma proviral integrada de retrovirus infecciosos, con dos repeticiones terminales largas (LTR) bordeando regiones internas homólogas a los genes gag, pol y env (Lower et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 5177-5184; Boeke et al. (1997) en Retroviruses, eds. Coffin, J. M., Hughes, S. H. & Varmus, H. E. (Cold Spring Harbor Laborator y Press, Nueva York) , págs. 343-436; Lander et al. (2001) Nature 409, 860-921) . Estos elementos, denominados retrovirus endógenos humanos (HERV) , son lo más probablemente los remanentes provirales de infecciones de línea germinal ancestrales por retrovirus activos, que se han transmitido después de manera mendeliana. Los HERV pueden agruparse según homologías de secuencia en aproximadamente 100 familias distintas, conteniendo cada una de unos cuantos a varios cientos de elementos.

Pueden deducirse fuertes similitudes entre HERV y retrovirus actuales a partir de análisis filogenéticos en el dominio transcriptasa inversa del gen pol o el resto transmembrana (TM) del gen env, que dan a conocer la intercalación de ambas clases de elementos y sugieren una historia común y ancestros compartidos (Tristem, M. (2000) J. Virol. 74, 3715-3730; Benit et al. (2001) J. Virol. 75 (11709-11719) . También se observan similitudes al nivel funcional.

Como consecuencia de la estrecha relación entre HERV y retrovirus infecciosos, y a pesar del hecho de que la mayoría de HERV han acumulado mutaciones, deleciones y/o truncamientos, sigue siendo posible que algunos elementos presenten todavía funciones de retrovirus infecciosos, que el huésped puede haber desviado a su propio beneficio. En este sentido, se ha propuesto (revisado en la referencia Venables et al. (1995) Virology 211, 589-592, Harris, J. R. (1998) BioEssays 20, 307-316) que las envueltas de HERV podrían desempeñar un papel en varios procesos incluyendo i) protección contra la infección por retrovirus actuales a través de interferencia de receptores (Best et al. (1997) Trends Microbiol. 5, 313-318) , ii) protección del feto contra el sistema inmunitario materno a través de un dominio inmunosupresor ubicado en la subunidad TM de la envuelta (Cianciolo et al. (1985) Science 230, 453455; Mangeney et al. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 14920-14925) y iii) morfogénesis de la placenta a través de efectos fusogénicos que permiten la diferenciación de células citotrofoblásticas para dar el sincitiotrofoblasto (Blond et al. (2000) J. Virol. 74, 3321-3329; Mi et al. (2000) Nature 403, 785-788) .

Por tanto, la proteína de la envuelta de un miembro de la familia HERV-W, sincitina, ha conservado la capacidad para interaccionar con el receptor de los retrovirus de tipo D (Blond et al. (2000) J. Virol. 74, 3321-3329; Lavillette et al. (2002) J. Virol. 76, 6442-6452) y pueden conferir infectividad en partículas retrovirales pseudotipadas (Lavillette et al. (2002) ; An et al. (2001) J. Virol. 75, 3488-3489) .

Según un papel simbiótico para HERV, el documento WO 01/16171 da a conocer que el producto del gen de la envuelta de HERV-W (sincitina) es una glicoproteína altamente fusogénica que se expresa específicamente en la placenta y puede mediar la fusión célula-célula ex vivo. Esta envuelta de HERV-W podría utilizarse en el tratamiento del cáncer promoviendo la formación de sincitios por células cancerosas, conduciendo así a su muerte. Trastornos en la expresión de la envuelta de HERV-W podrían alterar la morfogénesis de la placenta.

El documento WO 2004/087748 da a conocer que el producto del gen de la envuelta de HERV-FRD (denominado sincitina 2) es también una glicoproteína fusogénica que se expresa esencialmente en la placenta y puede mediar la fusión célula-célula ex vivo. También da a conocer que esta envuelta de HERV-FRD es inmunosupresora y puede utilizarse para el tratamiento inmunosupresor de pacientes, tales como pacientes aquejados de alergia, enfermedad autoinmunitaria o rechazo de injerto.

Por tanto, los HERV parecen contener todavía genes activos, que lo más probablemente se han subvertido por el huésped para su propio beneficio y deben considerarse como genes humanos auténticos. También se han revisado algunos de sus rasgos característicos y posibles papeles fisiológicos, así como efectos patológicos potenciales heredados de sus ancestros retrovirales (de Parseval et al., Cytogenet Genome Res. 2005; 110 (1-4) :318-32) .

No obstante, ha de realizarse un análisis exhaustivo de tales genes, con el fin de evaluar su posible papel fisiopatológico en enfermedades humanas incluyendo enfermedades autoinmunitarias o enfermedades cancerígenas. De hecho, recientes estudios que demuestran la expresión de ARNm de HERV en células cancerosas (Wang-Johanning et al., Cancer, 2003, 98 (1) , 187-197; Yi et al., Journal of General Virology, 2004, 85, 1203-1210; Armbruester et al., Clinical Cancer Research, 2002, 8, 1800-1807, J. Virol. Octubre de 2004; 78 (19) :10310-10319) sugieren que estas proteínas codificadas por HERV pueden presentar una función en tumorigénesis y utilizarse como marcadores.

Debido a que actualmente hay una necesidad de nuevos métodos en la lucha contra el cáncer, sería por tanto beneficioso proporcionar procedimientos específicos.

Los inventores han demostrado que los tumores presentan la capacidad de escapar de la vigilancia inmunitaria y pueden saturar el sistema inmunitario expresando la envuelta de un ERV, dando como resultado el bloqueo de la expresión de ERV un rechazo del tumor potenciado y restaurando parcialmente la expresión de la única proteína de la envuelta de ERV el grado inicial de progresión tumoral. También han demostrado que la expresión de la proteína codificada por el gen env de HERV-K tal como la proteína Np9 induce la regulación por disminución de antígenos de del CMH de clase I, un rasgo característico de células tumorales que les permite escapar de la vigilancia inmunitaria.

De ese modo, la selección como diana de tales genes mediante cualquier medio disponible contribuirá a la regresión del tumor restaurando la capacidad natural del sistema inmunitario para rechazar células tumorales, y por tanto contribuirá al tratamiento del cáncer.

Este es el objetivo de la presente invención. La presente invención proporciona la utilización de una composición que comprende:

- una proteína inmunosupresora codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, mutada o no, o un fragmento de la misma que comprende un dominio inmunosupresor de dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o

- un ácido nucleico que codifica para dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o fragmento de dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o

- un ligando tal como anticuerpos, pudiendo dicho ligando unirse específicamente a dicha proteína inmunosupresora codificada por el gen env, o

- un ARN bicatenario, ARNip, ARNc, miARN o un ácido nucleico antisentido que selecciona como diana secuencias de ácido nucleico del retrovirus endógeno y/o de una proteína expresada por dicho retrovirus endógeno,

dicha composición

- inhibiendo la expresión de dicho retrovirus endógeno y/o

- inhibiendo la expresión, y/o disminuyendo... [Seguir leyendo]

1. Utilización de una composición que comprende:

- una proteína inmunosupresora codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, mutada o no, o un fragmento de la misma que comprende un dominio inmunosupresor de dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o

- un ácido nucleico que codifica dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o fragmento de dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno, o

- un ligando tal como anticuerpos, pudiendo dicho ligando unirse específicamente a dicha proteína inmunosupresora codificada por el gen env, o

- un ARN bicatenario, ARNip, ARNc, miARN o un ácido nucleico antisentido que selecciona como diana secuencias de ácido nucleico del retrovirus endógeno y/o de una proteína expresada por dicho retrovirus endógeno,

en la que dicho retrovirus endógeno es un retrovirus endógeno humano HERV-K

dicha composición

a. inhibiendo la expresión de dicho retrovirus endógeno y/o

b. inhibiendo la expresión, y/o disminuyendo la concentración, y/o inhibiendo la actividad de dicha proteína expresada, y/o

c. estimulando una respuesta inmunitaria contra dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno

para la preparación de un fármaco destinado a la prevención y/o el tratamiento del cáncer en un mamífero, en la que las células cancerosas de dicho mamífero expresan dicha proteína codificada por el gen env de un retrovirus endógeno.

2. Utilización según la reivindicación 1, en la que HERV-K es un subtipo de HERV-K caracterizado porque el marco de lectura abierto que codifica la proteína viral ENV codifica una proteína Np9.

3. Utilización según la reivindicación 1 ó 2, en la que HERV-K es un subtipo de HERV-K caracterizado porque dicho subtipo de HERV-K se selecciona del grupo constituido por el subtipo de HERV-K HERV-K1 01, HERV-K1 02, HERV-K1 07 y HERV-K (II) .

4. Utilización según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en la que HERV-K es un subtipo de HERV-K caracterizado porque el marco de lectura abierto codifica una proteína Np9 que presenta una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo constituido por:

a. la secuencia de aminoácidos SEC ID NO: 3 o de una proteína Np9 de un subtipo de HERV-K tal como se representa en Genbank (GenPept) con el número de registro, P61580, P61581, P61582 y P61583; y

b. una secuencia de aminoácidos que presenta una identidad de al menos el 75% con una secuencia de aminoácidos de a) y que presenta una actividad inmunosupresora.

5. Utilización según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en la que la expresión de dicho retrovirus endógeno y/o de dicha proteína inmunosupresora de retrovirus endógeno se inhibe mediante un ARN bicatenario, un ARNip, un ARNc, un miARN o un ácido nucleico antisentido que selecciona como diana secuencias de ácido nucleico de dicho retrovirus endógeno y/o de dicha proteína inmunosupresora de retrovirus endógeno.

6. Utilización según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, en la que dicha proteína es:

a. dicha proteína de retrovirus endógeno inmunosupresora, o un fragmento de la misma, que comprende su dominio inmunosupresor, o

b. una forma mutada de dicha proteína de retrovirus endógeno inmunosupresora que carece de actividad inmunosupresora, o fragmentos de la misma que comprenden un dominio inmunosupresor mutado de dicha proteína de retrovirus endógeno inmunosupresora.

7. Utilización según la reivindicación 6, en la que dicha forma mutada de una proteína inmunosupresora codificada por el gen env de HERV-K privada de actividad inmunosupresora puede generar una respuesta inmunitaria, respuesta inmunitaria celular y/o humoral

- contra células que expresan la forma no mutada de dicha proteína codificada por el gen env de HERV (respuesta inmunitaria celular) o

- contra la forma no mutada de dicha proteína codificada por el gen env de HERV (respuesta inmunitaria humoral) .

8. Utilización según la reivindicación 1, en la que dicho ligando, tal como anticuerpo, puede unirse específicamente a dicha proteína inmunosupresora codificada por el gen env de un retrovirus endógeno.

9. Utilización según la reivindicación 8, en la que dicho ligando es un anticuerpo, en particular anticuerpo monoclonal, fragmento de anticuerpo, tal como fragmentos Fab o F (ab) '2, polipéptidos de scFv, anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados, aptámeros o péptidos de unión.

10. Composición farmacéutica que comprende como principio activo un ARN bicatenario, ARNip, ARNc, miARN o un ácido nucleico antisentido que selecciona como diana secuencias de ácido nucleico de un retrovirus endógeno y/o de una proteína inmunosupresora expresada por un retrovirus endógeno, en asociación con un vehículo farmacéuticamente aceptable, siendo dicho retrovirus endógeno un retrovirus endógeno humano HERV-K.

11. Composición farmacéutica según la reivindicación 10, en la que la proteína es una proteína inmunosupresora codificada por el gen env de HERV, tal como la proteína ENV o una proteína Np9.

12. Composición farmacéutica que comprende como principio activo una proteína inmunosupresora expresada por un retrovirus endógeno, o un fragmento de la misma, siendo dicho retrovirus endógeno un retrovirus endógeno humano HERV-K.

13. Composición farmacéutica según la reivindicación 12, que comprende como principio activo una proteína inmunosupresora de una proteína codificada por el gen env de HERV-K, mutada o no, o un fragmento de la misma que comprende el dominio inmunosupresor de dicha proteína codificada por el gen env de HERV-K, o ácido nucleico que codifica dicho principio activo, en asociación con un vehículo farmacéuticamente aceptable.

14. Composición farmacéutica según la reivindicación 13, en la que el retrovirus endógeno es un subtipo de HERV-K caracterizado porque el marco de lectura abierto que codifica la proteína viral env codifica una proteína Np9.

15. Composición farmacéutica según la reivindicación 13 ó 14, en la que HERV-K es un subtipo de HERV-K seleccionado del grupo constituido por el subtipo de HERV-K HERV-K101, HERV-K1 02, HERV-K1 07 y HERV-K (II) .

16. Composición farmacéutica según la reivindicación 15, en la que HERV-K es un subtipo de HERV-K, caracterizado porque el marco de lectura abierto que codifica la proteína viral env codifica para una proteína Np9 que presenta una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo constituido por

a. la secuencia de aminoácidos SEC ID NO: 3 o de una proteína Np9 de un subtipo de HERV-K tal como se representa en Genbank (GenPept) con el número de registro, P61580, P61581, P61582 y P61583; y

b. una secuencia de aminoácidos que presenta una identidad de al menos el 75% con una secuencia de aminoácidos de a) y que presenta una actividad inmunosupresora.

17. Composición farmacéutica según cualquiera de las reivindicaciones 12 a 16, caracterizada porque dicha composición comprende además como principio activo otra proteína de HERV codificada por la secuencia nucleica de dicho provirus de HERV, o un ácido nucleico que codifica dicha otra proteína de HERV.

18. Composición farmacéutica según cualquiera de las reivindicaciones 12 a 17, caracterizada porque dicha composición comprende además como principio activo al menos una proteína, preferiblemente al menos dos, tres o todas las proteína codificadas por la secuencia nucleica del provirus HERV-K (HML2) consenso ("Phoenix") , presentando dicha secuencia nucleica del provirus HERV-K (HML2) consenso la secuencia SEC ID NO: 4, o un ácido nucleico que codifica dicha al menos una proteína.