DIAGNÓSTICO Y PRONÓSTICO DEL CÁNCER DE MAMA EN PACIENTES.

Diagnóstico y pronóstico del cáncer de mama en pacientes. 1. CAMPO DE APLICACIÓN DE LA INVENCIÓN [0001] La presente invención se refiere a la identificación de genes marcadores que sirven para el diagnóstico y el pronóstico del cáncer de mama. Más concretamente, la invención se refiere a la identificación de un conjunto de genes marcadores asociados al cáncer de mama, un conjunto de genes marcadores expresados diferenciadamente en tumores de receptor de estrógeno (+) frente a receptor de estrógeno (-), un conjunto de genes marcadores expresados diferenciadamente en el BRCA1 frente a tumores esporádicos y un conjunto de genes marcadores expresados diferenciadamente en tumores esporádicos procedentes de pacientes con buen pronóstico clínico (esto es, sin metástasis ni dolencia durante más de 5 años) frente a pacientes con pronóstico clínico deficiente (esto es, sin metástasis ni dolencia durante menos de 5 años). Para cada uno de los conjuntos marcadores mencionados más arriba la invención se refiere además a métodos para distinguir las afecciones que se dan en el cáncer de mama. También se describen métodos para determinar el curso del tratamiento de las pacientes con cáncer de mama. 2. ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN ES 2 366 178 T3 [0002] El número creciente de casos de cáncer declarados en los Estados Unidos, y de hecho en todo el mundo, constituye un grave problema. Actualmente se dispone sólo de unos cuantos tratamientos para tipos específicos de cáncer, pero que no ofrecen garantía alguna de éxito. Para aumentar su eficacia, estos tratamientos tendrían que facilitar no sólo una detección más precoz del carácter maligno del tumor, sino también una valoración fiable de la gravedad de dicho tumor. [0003] La incidencia del cáncer de mama, una de las causas principales de muerte entre las mujeres, ha ido aumentando gradualmente en los Estados Unidos en los treinta últimos años. Su riesgo acumulativo es relativamente alto; se prevé que, en los Estados Unidos, 1 de cada 8 mujeres desarrollará cáncer de mama antes de que cumpla 85 años. De hecho, el cáncer de mama es el cáncer más corriente entre las mujeres y la segunda causa más frecuente de muerte por cáncer en los Estados Unidos. En 1997 se estimó en 181.000 el número de nuevos casos declarados en los Estados Unidos, así como que 44.000 personas morirían de cáncer de mama (Parker et a/., CA Cancer J. Clin. 47:5-27 (1997); Chu et al., J. Nat. Cancer Inst. 88:1571-1579 (1996)). Aunque se conoce en gran medida el mecanismo de oncogénesis de la mayoría de los carcinomas de mama, existen factores genéticos que pueden predisponer a algunas mujeres a desarrollar cáncer de mama ((Miki et al., Science, 266:66-71(1994)). El descubrimiento y la caracterización del BRCA1 y BRCA2 ha ampliado recientemente nuestro conocimiento de los factores genéticos que pueden contribuir al cáncer de mama familiar. Las mutaciones germinales en estos dos loci suponen de un 50 a un 85% del riesgo de cáncer de mama o de ovarios a lo largo de la vida (Casey, Curr. Opin. Oncol. 9:88-93 (1997); Marcus et al., Cancer 77:697-709 (1996)). Solo de un 5% a un 10% de casos de cáncer están relacionados con los genes de susceptibilidad al cáncer de mama, BRCA1 y BRCA2. El riesgo de cáncer acumulado a lo largo de la vida para las mujeres portadoras del BRCA1 mutante se calcula en aproximadamente el 92%, mientras que el riesgo acumulado a lo largo de la vida para la mayoría de no portadoras se estima en aproximadamente un 10%. El BRCA1 es un gen supresor de tumores que interviene en la reparación del ADN y en el control del ciclo celular, ambos de suma importancia para el mantenimiento de la estabilidad genómica. Más del 90% de todas las mutaciones reveladas hasta ahora desembocan en un truncamiento prematuro del producto proteínico con función anormal o suprimida. La histología del cáncer de mama en los portadores de la mutación BRCA1 varía en casos esporádicos, pero el análisis de la mutación es la única manera de hallar a la portadora. Al igual que el BRCA1, el BRCA2 interviene en el desarrollo del cáncer de mama y, al igual que el BRC41, juega su papel en la reparación del ADN. Sin embargo, a diferencia del BRCA1, no está presente en el cáncer de ovarios [0004] En la técnica se conocen marcadores moleculares para diferenciar los tipos de tumores. Perou CM, et al. (Nature 2000 406:747-752) efectúan retratos moleculares de tumores del cáncer de mama humano. Se identificó un subconjunto de genes en el que la variación en expresión era mayor entre tumores diferentes que entre muestras emparejadas del mismo tumor. Alizadeh AA, et al. (Nature 2000 403:503-511) describen dos formas diferentes de linfoma difuso de células B grandes (DLBCL) identificadas sobre la base del patrón de expresión de genes. Se identificó un subconjunto de genes al hallarse expresado de forma selectiva en una de las dos formas de DLBCL. Perou CM, et al. (PNAS 1999 96:9212-9217) describen patrones de expresión de genes diferenciados en las células epiteliales mamarias humanas y cánceres de mama. En respuesta a una serie de perturbaciones experimentales, se identificó un subconjunto de genes en los que se apreciaba claramente una expresión diferenciada en las células epiteliales mamarias humanas. Khan J, et al. (Nature Medicine 2001 7:673-679) describen un criterio de clasificación y predicción diagnóstica de cánceres mediante 2 perfiles de expresión de genes y redes neuronales artificiales. Se usó un subconjunto de genes para clasificar pequeñas muestras de tumores de células redondas y azules en categorías diagnósticas. Hedenfalk I, et al. (New Eng J Med 2001 344:539.548) describen perfiles de expresión de genes en el cáncer de mama hereditario e identificaron un subconjunto de genes que se dividía en tumores mutantes de BRCA1, tumores mutantes de BRCA2 y tumores esporádicos de tejido de cáncer de mama. A diferencia de estos documentos donde se da a conocer métodos para distinguir los tipos de tumores, la presente invención ofrece métodos para determinar si los individuos con cáncer de mama han tenido un pronóstico bueno o deficiente. [0005] Con el cáncer de mama se ha relacionado también otros genes, por ejemplo el c-erb-2 (HER2) y el p53 (Beenken et al., Ann. Surg. 233(5):630-638 (2001). La superexpresión del c-erb-2 (HER2) y del p53 se ha relacionado con pronósticos deficientes (Rudolph et al., Hum. Pathol. 32(3):311-319 (2001), pues ha sido una expresión aberrante de productos de mdm2 (Lukas et al., Cancer Res. 61(7):3212-3219 (2001) y ciclina 1 y p27 (Porter & Roberts, International Publication WO98/33450, publicado el 6 de agosto de 1998). No obstante, no se han identificado otros marcadores clínicamente útiles y estrechamente asociados al cáncer de mama. [0006] Los tumores esporádicos, o sea, aquellos no asociados comúnmente a una mutación germinal conocida, constituyen el cáncer de mama en la mayoría de los casos. También es probable que otros factores, no genéticos, influyan de modo significativo en la etiología de la enfermedad. Independientemente del origen del cáncer, la morbilidad y mortalidad del cáncer de mama aumentan de modo significativo si no se detectan en la fase inicial de su progreso. Por consiguiente, se han dedicado muchos esfuerzos a la detección precoz de la transformación celular y la formación de tumores en el tejido mamario. [0007] La identificación y caracterización del tumor basándose en marcadores hace esperar una mayor fiabilidad del diagnóstico y del pronóstico. Típicamente, para el diagnóstico del cáncer de mama se requiere una prueba histopatológica de la presencia del tumor. Además del diagnóstico, los exámenes histopatológicos también suministran información sobre el pronóstico y la selección de regímenes de tratamiento. El pronóstico se puede basar también en parámetros clínicos, como el tamaño del tumor, el grado del tumor, la edad de la paciente y la metástasis del ganglio linfático. [0008] El diagnóstico y/o el pronóstico se puede determinar en diversos grados de eficacia por observación directa del exterior de la mama, mediante mamografía o por otros métodos de imagen por rayos X (Jatoi, Am. J. Surg. 177:518-524 (1999)). Estos últimos, no obstante, tienen un coste elevado. Cada vez que se le hace una mamografía, la paciente corre un leve riesgo de tener un tumor de mama inducido por las propiedades ionizantes de la radiación usada durante la prueba. Además, el proceso es caro y las interpretaciones subjetivas de un técnico pueden llevar a imprecisión. Por ejemplo, un estudio mostró discrepancias clínicas importantes en aproximadamente un tercio de un conjunto de mamografías que fueron interpretadas individualmente por un grupo de radiólogos a que se encuestó. Asimismo, muchas mujeres opinan que someterse a una mamografía... [Seguir leyendo]

1. Método para clasificar a un individuo aquejado de cáncer de mama como poseedor de buen pronóstico o pronóstico deficiente, en donde dicho individuo es un humano, en donde dicho pronóstico indica que se espera que dicho individuo no tenga metástasis distante dentro de los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama y en donde dicho pronóstico deficiente indica que se espera que dicho individuo tenga metástasis distante dentro de los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama, que comprende (ia) calcular un primer parámetro clasificador entre un primer perfil de expresión y una plantilla de buen pronóstico, o (ib) calcular un segundo parámetro clasificador entre dicho primer perfil de expresión y dicha plantilla de buen pronóstico y un tercer parámetro clasificador entre dicho primer perfil de expresión y una plantilla de pronóstico deficiente; comprendiendo dicho primer perfil de expresión los niveles de expresión de una primera pluralidad de genes en una muestra de células tomada del individuo, comprendiendo dicha plantilla de buen pronóstico, para cada gen en dicha primera pluralidad de genes, el nivel medio de expresión de dicho gen en una pluralidad de pacientes que no tengan metástasis distante dentro de los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama; y comprendiendo dicha plantilla de pronóstico deficiente, para cada gen en dicha primera pluralidad, el nivel medio de expresión de dicho gen en una pluralidad de pacientes que tengan metástasis distante dentro de los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama; consistiendo dicha primera pluralidad de genes en al menos 5 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la Tabla 5, y (iia) clasificar a dicho individuo como poseedor de buen pronóstico si dicho primer parámetro clasificador está por encima de un umbral elegido o si dicho primer perfil de expresión es más parecido a dicha plantilla de buen pronóstico que a dicha plantilla de pronóstico deficiente, o (iib) clasificar a dicho individuo como poseedor de dicho pronóstico deficiente si dicho primer parámetro clasificador está por debajo de dicho umbral elegido o si dicho primer perfil de expresión es más parecido a dicha plantilla de pronóstico deficiente que a dicha plantilla de buen pronóstico. 2. El método de la reivindicación 1, en donde dicha primera pluralidad consiste en al menos 20 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la lista de la Tabla 5. 3. El método de la reivindicación 1, en donde dicha primera pluralidad consiste en al menos 100 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la lista de la Tabla 5. 4. El método de la reivindicación 1, en donde dicha primera pluralidad consiste en al menos 150 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la lista de la Tabla 5. 5. El método de la reivindicación 1, en donde dicha primera pluralidad consiste en cada uno de los genes cuyos marcadores se enumeran en la lista de la Tabla 5. 6. El método de la reivindicación 1, en donde dicha primera pluralidad consiste en al menos 70 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la lista de la Tabla 6. 7. El método de la reivindicación 1, que además comprende los pasos de: (a) generar dicha plantilla de buen pronóstico por hibridación de ácidos nucleicos derivados de dicha pluralidad de pacientes que no tengan metástasis distante dentro de los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama contra ácidos nucleicos derivados de una reserva de tumores de una pluralidad de pacientes que tengan cáncer de mama; (b) generar dicha plantilla de buen pronóstico por hibridación de ácidos nucleicos derivados de dicha pluralidad de pacientes que tengan metástasis distante dentro de los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama contra ácidos nucleicos derivados de una reserva de tumores de dicha pluralidad de pacientes; 93 ES 2 366 178 T3 (c) generar dicho primer perfil de expresión hibridando ácidos nucleicos derivados de dicha muestra de células tomada dicho individuo contra dicha reserva, y (d) calcular (d1) dicho segundo parámetro clasificador entre dicho primer perfil de expresión y la plantilla de buen pronóstico y (d2) dicho tercer parámetro clasificador entre dicho primer perfil de expresión y la plantilla de pronóstico deficiente, en donde si dicho primer perfil de expresión es más parecido a la plantilla de buen pronóstico que a la plantilla de pronóstico deficiente, se clasifica al individuo como poseedor de buen pronóstico, y si dicho perfil de expresión es más parecido a la plantilla de pronóstico deficiente que a la plantilla de buen pronóstico, se clasifica al individuo como poseedor de pronóstico deficiente. 8. El método de la reivindicación 1, que comprende además: iv) clasificar a dicho individuo como ER(+) (receptor positivo de estrógeno) o ER(-) (receptor negativo de estrógeno) basándose en un segundo perfil de expresión que comprende los niveles de expresión de una segunda pluralidad de genes en una muestra de células tomada del individuo, consistiendo dicha segunda pluralidad de genes en al menos 5 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la Tabla 1, en donde dicha clasificación de dicho individuo como ER(+) o como ER(-) se lleva a cabo con un método que comprende: a) calcular una primera medida de semejanza entre dicho segundo perfil de expresión y una plantilla de ER(+) y una segunda medida de semejanza entre dicho segundo perfil de expresión y una plantilla de ER (-); (b) comprendiendo dicha plantilla de ER(+), para cada gen en dicha segunda pluralidad de genes, el nivel medio de expresión de dicho gen en una pluralidad de pacientes ER(+); comprendiendo dicha plantilla de ER(-), para cada gen en dicha segunda pluralidad de genes, el nivel medio de expresión de dicho gen en una pluralidad de pacientes ER(-), y (b) clasificar (b1) a dicho individuo como ER(+) si dicho segundo perfil de expresión tiene una mayor semejanza con dicha plantilla de ER(+) que con dicha plantilla de ER(-), o (b2) como ER(-) si dicho segundo perfil de expresión tiene una menor semejanza con dicha plantilla de ER(+) que con dicha plantilla de ER(-). 9. El método de la reivindicación 1, que comprende además: (iv) clasificar a dicho individuo como BRCA1 o esporádico basándose en un segundo perfil de expresión que comprende los niveles de expresión de una segunda pluralidad de genes en una muestra de células tomada del individuo, consistiendo dicha segunda pluralidad de genes en al menos 5 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la Tabla 3, en donde dicha clasificación de dicho individuo como BRCA1 o esporádico se lleva a cabo con un método que comprende: (a) calcular una primera medida de semejanza entre dicho segundo perfil de expresión y una plantilla de BRCA1 y una segunda medida de semejanza entre dicho segundo perfil de expresión y una plantilla de no-BRCA1; comprendiendo dicha plantilla de BRCA1, para cada gen en dicha segunda pluralidad de genes, el nivel medio de expresión de dicho gen en una pluralidad de pacientes BRCA1; comprendiendo dicha plantilla de no-BRCA1, para cada gen en dicha segunda pluralidad de genes, el nivel medio de expresión de dicho gen en una pluralidad de pacientes no-BRCA1, y (b) clasificar (b1) a dicho individuo como BRCA1 si dicho segundo perfil de expresión tiene una mayor semejanza con dicha plantilla de BRCA1 que con dicha plantilla de no-BRCA1 , o (b2) como esporádico si dicho segundo perfil de expresión tiene una menor semejanza con dicha plantilla de BRCA1 que con dicha plantilla de no-BRCA1. 10. El método de la reivindicación 1, en donde dicho nivel de expresión de cada gen de dicho primer perfil de expresión es un nivel relativo de expresión de dicho gen en dicha muestra de células frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia. 11. El método de la reivindicación 10, en donde dicha reserva de referencia procede de una línea celular de cáncer de mama. 94 ES 2 366 178 T3 12. El método de la reivindicación 10, en donde dicha reserva de referencia procede de una línea celular de una mama normal. 13. El método de la reivindicación 10, en donde dicho nivel relativo de expresión se representa como cociente logarítmico. 14. El método de la reivindicación 1, en donde dicho paso (i) comprende calcular dicho primer parámetro clasificador entre dicho primer perfil de expresión y dicha plantilla de buen pronóstico, y dicho paso (ii) comprende clasificar a dicho individuo como poseedor de buen pronóstico si dicho primer parámetro clasificador se halla por encima de un umbral elegido. 15. El método de la reivindicación 14, en donde dicha media es una media ponderada de error del cociente logarítmico. 16. El método de la reivindicación 14, en donde dicho nivel de expresión de cada gen en dicho primer perfil de expresión es un nivel relativo de expresión de dicho gen en dicha muestra de células frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representado como cociente logarítmico, y en donde el nivel medio de expresión de cada gen en dicha primera pluralidad de genes en dicha plantilla de buen pronóstico es una media de niveles relativos de expresión, siendo cada nivel relativo de expresión el nivel de expresión de dicho gen en una de dicha pluralidad de pacientes que no tienen metástasis distante en los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representado como cociente logarítmico que es una media de los cocientes logarítmicos para dicho gen en dicha pluralidad de pacientes que no tienen metástasis distante en los cinco años siguientes al diagnóstico inicial de cáncer de mama. 17. El método de la reivindicación 14, en donde dicho primer parámetro clasificador es un coeficiente de correlación entre dicho primer perfil de expresión y dicha plantilla de buen pronóstico. 18. El método de la reivindicación 1, que comprende además determinar dicho primer perfil de expresión midiendo los niveles de expresión de dicha primera pluralidad de genes en dicha muestra de células de dicho individuo. 19. El método de la reivindicación 8, en donde dicho nivel de expresión de cada gen en dicho segundo perfil de expresión es un nivel relativo de expresión de dicho gen frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia. 20. El método de la reivindicación 19, en donde dicha reserva de referencia procede de una línea celular de una mama normal. 21. El método de la reivindicación 19, en donde dicha reserva de referencia procede de una línea celular de un cáncer de mama. 22. El método de la reivindicación 19, en donde dicho nivel relativo de expresión se representa como cociente logarítmico. 23. El método de la reivindicación 8, en donde dicha media es una media ponderada de error del cociente logarítmico. 24. El método de la reivindicación 8, en donde dicho nivel de expresión de cada gen en dicho segundo perfil de expresión es un nivel relativo de expresión de dicho gen en dicha muestra de células frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representado como cociente logarítmico; en donde el nivel medio de expresión de cada gen en dicha segunda pluralidad de genes en dicha plantilla de ER (+) es una media de niveles relativos de expresión, siendo cada nivel relativo de expresión el nivel de expresión de dicho gen en una paciente de dicha pluralidad de pacientes ER(+) frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representada como cociente logarítmico que es una media de los cocientes logarítmicos para dicho gen en dicha pluralidad de pacientes ER/+), y en donde el nivel medio de expresión de cada gen en dicha segunda pluralidad de genes en ficha plantilla de ER(-) es una media de los niveles relativos de expresión, siendo cada nivel relativo de expresión el nivel de expresión de dicho gen en una de dicha pluralidad de pacientes ER(-) con respecto al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representado como cociente logarítmico que es una media de los cocientes logarítmicos para dicho gen en dicha pluralidad de pacientes ER(-). 25. El método de la reivindicación 8, en donde dicha primera medida de semejanza entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(+) es un coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(+), en donde dicha segunda medida de semejanza entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(-) es un coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(-) y en donde de dicho segundo perfil de expresión se dice que tiene una semejanza mayor con dicha plantilla de ER(+) que con dicha plantilla de ER(-) si ES 2 366 178 T3 dicho coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(+) es mayor que dicho coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(-), o del que se dice que tiene una semejanza menor con dicha plantilla de ER(+) que con dicha plantilla de ER(-) si dicho coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(+) es menor que dicho coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de ER(-). 26. El método de la reivindicación 8, que comprende además determinar dicho segundo perfil de expresión midiendo los niveles de expresión de dicha segunda pluralidad de genes en dicha muestra de células de dicho individuo. 27. El método de la reivindicación 9, en donde dicho nivel de expresión de cada gen en dicho segundo perfil de expresión es un nivel relativo de expresión de dicho gen en dicha muestra de células frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia. 28. El método de la reivindicación 27, en donde dicha reserva de referencia procede de una línea celular de una mama normal. 29. El método de la reivindicación 27, en donde dicha reserva de referencia procede de una línea celular de cáncer de mama. 30. El método de la reivindicación 27, en donde dicho nivel relativo de expresión se representa como cociente logarítmico. 31. El método de la reivindicación 9, en donde cada una de dichas medias es una media ponderada de error del cociente logarítmico. 32. El método de la reivindicación 9, en donde dicho nivel de expresión de cada gen en dicho segundo perfil de expresión es un nivel relativo de expresión de dicho gen en dicha muestra de células frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representado como cociente logarítmico; en donde el nivel medio de expresión de cada gen en dicha segunda pluralidad de genes en dicha plantilla de BRCA1 es una media de niveles relativos de expresión, siendo cada nivel relativo de expresión el nivel de expresión de dicho gen en una paciente de dicha pluralidad de pacientes BRCA1 frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representado como cociente logarítmico que es una media de cocientes logarítmicos de dicho gen en dicha pluralidad de pacientes BRCA1 y en donde el nivel medio de expresión de cada gen en dicha segunda pluralidad de genes en dicha plantilla de no BRCA1 es una media de niveles relativos de expresión, siendo cada nivel relativo de expresión el nivel de expresión de dicho gen en una paciente de dicha pluralidad de pacientes no-BRCA1 frente al nivel de expresión de dicho gen en una reserva de referencia, representado como un cociente logarítmico que es una media de cocientes logarítmicos de dicho gen en dicha pluralidad de pacientes no-BRCA1. 33. El método de la reivindicación 32, en donde dicha primera medida de semejanza entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de BRCA1 es un coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de BRCA1, en donde dicha segunda medida de semejanza entre segundo perfil de expresión y dicha plantilla de no-BRCA1 es un coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de no-BRCA1 y en donde de dicho segundo perfil de expresión se dice que tiene una semejanza mayor con dicha plantilla de BRCA1 que con dicha plantilla de no-BRCA1 si dicho coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de de BRCA1 es mayor que dicho coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de no-BRCA1, o del que se dice que tiene una semejanza menor con dicha plantilla de no-BRCA1 que con dicha plantilla de BRCA1 si dicho coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de BRCA1 es menor que el coeficiente de correlación entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de no-BRCA1. 34. El método de la reivindicación 9, que comprende además determinar dicho segundo perfil de expresión midiendo los niveles de expresión de dicha segunda pluralidad de genes en dicha muestra de células de dicho individuo. 35. El método de cualquiera de las reivindicaciones 10-14, 15 y 16, en donde dicha pluralidad consiste en al menos 20 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la Tabla 5. 36. El método de cualquiera de las reivindicaciones 10-14, 15 y 16, en donde dicha pluralidad consiste en al menos 50 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la Tabla 5. 37. El método de cualquiera de las reivindicaciones 10-14, 15 y 16, en donde dicha pluralidad consiste en al menos 75 de los genes cuyos marcadores se enumeran en la Tabla 5. 96 ES 2 366 178 T3 38. El método de cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en donde dicho paso (i) comprende calcular dicho segundo parámetro clasificador entre dicho segundo perfil de expresión y dicha plantilla de buen pronóstico y dicho tercer parámetro clasificador entre dicho primer perfil de expresión y dicha plantilla de pronóstico deficiente, consistente dicho paso (ii) en clasificar a dicho individuo como poseedor de buen 5 pronóstico si dicho primer perfil de expresión es más parecido a dicha plantilla de buen pronóstico que a dicha plantilla de pronóstico deficiente, o clasificar a dicho individuo como poseedor de pronóstico deficiente si dicho primer perfil de expresión es más parecido a dicha plantilla de pronóstico deficiente que a dicha plantilla de buen pronóstico. 39. El método de la reivindicación 38, en donde dicho segundo parámetro clasificador es un coeficiente de 10 correlación entre dicho primer perfil de expresión y dicha plantilla de buen pronóstico y en donde dicho tercer parámetro clasificador es un coeficiente de correlación entre dicho primer perfil de expresión y dicha plantilla de pronóstico deficiente. 40. El método de cualquiera de las reivindicaciones 1-6 y 14, en donde dicho cáncer de mama es cáncer de mama esporádico. 15 41. El método de la reivindicación 38, en donde dicho cáncer de mama es cáncer de mama esporádico. 97 ES 2 366 178 T3 98 ES 2 366 178 T3 99 ES 2 366 178 T3 Dendograma para muestras ES 2 366 178 T3 101 ES 2 366 178 T3 102 ES 2 366 178 T3 103 ES 2 366 178 T3 104 ES 2 366 178 T3 ES 2 366 178 T3 106 ES 2 366 178 T3 107 ES 2 366 178 T3 108 ES 2 366 178 T3 109 ES 2 366 178 T3 ES 2 366 178 T3 111 ES 2 366 178 T3 112 ES 2 366 178 T3 113 ES 2 366 178 T3 114 ES 2 366 178 T3 ES 2 366 178 T3 116 ES 2 366 178 T3 117 ES 2 366 178 T3 118 ES 2 366 178 T3 119 ES 2 366 178 T3 ES 2 366 178 T3 121 ES 2 366 178 T3 122 ES 2 366 178 T3 123 ES 2 366 178 T3 124 ES 2 366 178 T3 ES 2 366 178 T3 126 ES 2 366 178 T3 127 ES 2 366 178 T3 128 ES 2 366 178 T3 129