Dirección: INDUSTRIEPARK HÖCHST, GEB. K 801 65926 FRANKFURT AM MAIN ALEMANIA.
Inventor/es: CORDES,ARNO, VAN DEN HEUVEL,Joop, BARTUCH,Jörg.
Fecha de Publicación: .
Fecha Solicitud PCT: 26 de Septiembre de 2005.
Clasificación Internacional de Patentes:
C12N9/48QUIMICA; METALURGIA. › C12BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 9/00 Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas. › actúan sobre los enlaces peptídicos, p. ej. tromboplastina, aminopeptidasa de la leucina (3.4).
Clasificación PCT:
C12N15/57C12N […] › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › que actúan sobre los enlaces peptídicos (3.4).
C12N9/48C12N 9/00 […] › actúan sobre los enlaces peptídicos, p. ej. tromboplastina, aminopeptidasa de la leucina (3.4).
Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Eslovenia, Finlandia, Rumania, Chipre, Lituania, Letonia.
La presente invención se refiere a la procarboxipeptidasa B y a la carboxipeptidasa B, así como a procedimientos para su preparación. La carboxipeptidasa B (CPB) es una exopeptidasa que se escinde mediante la hidrólisis de uniones peptídicas para dar aminoácidos básicos como lisina, arginina y ornitina. La escisión se produce en el extremo C-terminal de los polipéptidos. Se trata de una peptidasa que contiene zinc (EC 3.4.17.2). La carboxipeptidasa B se forma a partir de una preprocarboxipeptidasa B sin actividad enzimática. De la preprocarboxipeptidasa B se obtiene por escisión de un péptido señal para obtener una procarboxipeptidasa B que tampoco presenta actividad enzimática. De esta luego se separa otro péptido para obtener la carboxipeptidasa activa. El peso molecular de la carboxipeptidasa B es de aprox. 35 kD. Se la utiliza para una multiplicidad de fines, en especial para la preparación de péptidos como por ejemplo la insulina y en el análisis de secuencias de proteínas. La carboxipeptidasa B por lo general se procesa a partir del páncreas porcino. Las secuencias de ADNc de la carboxipeptidasa B humana son de conocimiento general. En el documento WO 96/23064 se describe un procedimiento para la preparación de carboxipeptidasa B recombinante de rata. Los ensayos para lograr la expresión del plásmido que se describe allí, no tuvieron el éxito deseado. La carboxipeptidasa comercializada en el mercado (purificada a partir de fuentes naturales) por lo general presenta actividades de aproximadamente 50 a 170 U/mg. 1 U equivale a hidrólisis de 1 mmol de hipuril-L-Arg/min a una temperatura de 25°C y un valor de pH de 7,65. La carboxipeptidasa B siempre presenta impurezas constituidas por pequeñas cantidades de otras proteasas. Por lo tanto aún existe la necesidad de disponer de carboxipeptidasas de alta pureza con una actividad específica lo más elevada posible. El objetivo se cumple poniendo a disposición de una nueva procarboxipeptidasa B (Pro-CPB) y una nueva carboxipeptidasa B (CPB) de acuerdo con las reivindicaciones. Las carboxipeptidasas de acuerdo con la invención presentan una actividad enzimática de al menos 200 U por mg, preferentemente más de 250 U por mg, más preferentemente de más de 270 U por mg. Las carboxipeptidasas B de acuerdo con la invención pueden purificarse mejor. La carboxipeptidasa B obtenida del páncreas de porcinos posee en la HPLC de fase reversa una pureza de 81,6%, mientras que la CPB de acuerdo con la invención presenta una pureza de 97,4%. En la cromatografía de permeación de geles las carboxipeptidasas de acuerdo con la invención presentan una pureza de 99,1% respecto de una carboxipeptidasa purificada obtenida de páncreas de porcinos con una pureza de 77,2%. Mediante la estructura modificada sorpresivamente se logra una mayor estabilidad térmica a 40°C. Además existe una mayor estabilidad a largo plazo durante el almacenamiento en forma líquida a un valor de pH 8. Por lo tanto, por una parte un objeto de la invención es un ácido nucleico, que codifica procarboxipeptidasa B (Pro- CPB) que comprende tres segmentos A, B y C, donde el segmento A presenta la secuencia de acuerdo con la Sec. ID. Nº 1, el segmento B presenta la secuencia de la Sec. ID Nº 2 y el segmento C presenta la secuencia de acuerdo con la Sec. ID Nº 3. Las secuencias de preferencia especial para el ácido nucleico que codifica para la procarboxipeptidasa B son - Sec. ID Nº 1 - Sec. ID Nº 2 - Sec. ID Nº 3 Además es un objeto de la invención la procarboxipeptidasa que puede obtenerse mediante la expresión de un ácido nucleico de acuerdo con la invención así como una carboxipeptidasa B que puede obtenerse por escisión de la prosecuencia de la procarboxipeptidasas B de la invención. Una escisión tal puede realizarse por ejemplo con tripsina. Otro objeto de la invención es un vector de expresión que contiene el ácido nucleico de acuerdo con la invención así como un organismo transformado que contiene el vector de expresión según la invención. Otro objeto de la invención es una proteína que contiene una secuencia de aminoácidos de acuerdo con la Sec. ID Nº 8 con al menos 5 mutaciones seleccionadas del grupo D22H, S24N, E25I, R33T, A63T, E69K, C94V, E115Q, K120E, D135E, D137R, N138T, Q168P, D177E, Y184R, A186I, F191L, N194K, N240D, T245S, V246I, V250R, N254D, I295M, D309N, S314A, G318A, A319T, Y327H, S330K, S337A, N353D, F370Y, A381P, Q384E, V390I, N395S, T397V. 2 En una forma de realización se añadió una Y como aminoácido 402. En una realización preferida la proteína de acuerdo con la invención presenta al menos siete, más preferentemente como mínimo diez y sobre todo preferentemente como mínimo quince de las mutaciones antes indicadas. La proteína de acuerdo con la invención es una proteína recombinante libre de impurezas de otras proteasas naturales. Además se la puede producir con un grado de pureza especialmente alto, en especial con una pureza mayor que 170 U por mg, más preferentemente mayor que 200 U por mg, más preferentemente aún mayor que 250 U por mg y sobre todo preferentemente mayor que 280 por mg. Otro objeto de la invención es un procedimiento para la expresión de pro-CPB que comprende los pasos: - fermentación de un organismo transformado, - inducción de la expresión, - purificación de la pro-CPB así como un procedimiento para la expresión de la carboxipeptidasa B que comprende los pasos de: - fermentación de un organismo transformado de acuerdo con la reivindicación 10, - inducción de la expresión, - activación mediante la escisión de la pro-CPB para dar CPB, - purificación de la CPB. Otro objeto de la invención es una carboxipeptidasa con la secuencia de acuerdo con la Sec. ID Nº 7. Una mutación significa una sustitución de un aminoácido por otro, una inserción que es la introducción adicional de otro aminoácido y una deleción que es la eliminación de un aminoácido. Un sistema de expresión especialmente preferido es Pichia pastoris. Pero en principio también pueden introducirse otros sistemas de expresión usuales como el sistema de baculovirus en células de insectos o una expresión en células de mamíferos. El uso del sistema de expresión Pichia se describe por ejemplo en la patente estadounidense US 5.102.789 a la que se hace referencia aquí. Los ácidos nucleicos de acuerdo con la invención pueden sintetizase, por ejemplo, mediante síntesis química en fragmentos para después ligar los fragmentos. Las proteínas de acuerdo con la invención pueden obtenerse posteriormente mediante la expresión de los correspondientes ácidos nucleicos. El ácido nucleico también puede obtenerse mediante mutagénesis dirigida específica de sitio, a partir de la secuencia de ADNc conocida de la CBP. Las formas de proceder se describen por ejemplo en The Journal of Biological Chemistry, 174 (1999), 19925 - 19933 al que se hace referencia en la presente. La invención se explica en mayor detalle mediante los siguientes ejemplos enunciados a continuación. Los genes se clonaron en los siguientes vectores: Pichia pastoris: pKINTEX, pKEXTEX, pPicz E. coli: Tuner(DE3)pET22-OMPA Arxula adeninovirans: pAL-ALEU2m-GAA 1. Los mayores índices de expresión se obtuvieron en Pichia pastoris pKEXTEX-npproCPB. Procesos de fermentación Se desarrolló un procedimiento fed-batch así como un proceso continuo. Allí se produjo la secreción de aproximadamente 200 mg/l de npproCPB al medio. Fermentación fed-batch Medio de fermentación (para 1 litro): Medio de hexafosfato 25 g de hexametafosfato de sodio 9 g de sulfato de amonio 3 Medio de glicerina y sales 45,6 g de glicerina (86% en peso) 18,2 g de sulfato de potasio 14,9 g de sulfato de magnesio heptahidratado 0,9 g de sulfato de calcio dihidratado PTM1 (oligoelementos) 1 ml/l Alimentación de glicerina (1l) 314 g de glicerina (86% en peso) Alimentación de metanol (1l) 1 l de metanol Condiciones de fermentación en ml de agua destilada Temperatura 28°C Revoluciones de agitación 500 a 1000 rpm Tiempo de fermentación 90,1 a 138,6 h 4 pasar por autoclave después de enfriar añadir 9 ml de PTM1 estéril adición de 12 ml de PTM1 estéril Gaseado 0,8 a 2 vvm aire Volumen inicial de la solución de cultivo 2 a 8 l medio y cultivo inoculado Volumen de inoculación 10% del volumen inicial total cultivo con agitación Presión parcial de oxígeno 6 a 100% Valor de pH 4,4 a 7,3 Desarrollo de la fermentación Alimentación de glicerina Inicio: con densidad óptica DO600 de la solución de cultivo (extinción 600 nm) Velocidad de adición entre 0,4 y 1,8 ml/min de alimentación de glicerina Cantidad de adición: entre 4,2 y 16,6% en relación con el volumen inicial Alimentación de metanol Inicio: con DO600 entre 50 y 195 Velocidad de adición: entre 0,04 y 0,2 ml/min con control de contenido de metanol entre 0,1 y 3% de metanol en la solución de cultivo Fin de... 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Reivindicaciones:
1. Un ácido nucleico que codifica para la procarboxipeptidasa B (Pro-CPB) que comprende tres segmentos A, B y C, donde el segmento A presenta la sec. ID Nº 1, el segmento B presenta la sec. ID Nº 2 y el segmento C presenta la sec. ID Nº 3. 2. Una procarboxipeptidasa que se puede obtener mediante la expresión de un ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 1. 3. Una carboxipeptidasa B que se puede obtener mediante la escisión de la prosecuencia de pro-CPB de acuerdo con la reivindicación 2 utilizando tripsina. 4. La carboxipeptidasa de acuerdo con la reivindicación 3 con una actividad enzimática de al menos 200 U/mg. 5. Un vector de expresión que contiene un ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 1. 6. Un organismo transformado no humano que contiene un vector de expresión de acuerdo con la reivindicación 5. 7. Un procedimiento para la expresión de pro-CPB de acuerdo con la reivindicación 2, que comprende los pasos: - fermentación de un organismo transformado de acuerdo con la reivindicación 6, - inducción de la expresión, - purificación de la pro-CPB. 8. Un procedimiento para la expresión de la carboxipeptidasa B de acuerdo con la reivindicación 3 o 4 que comprende los pasos de: - fermentación de un organismo transformado de acuerdo con la reivindicación 6, - inducción de la expresión, - activación mediante la escisión de la pro-CPB en CPB, - purificación de la CPB. 9. Una procarboxipeptidasa que posee la secuencia de acuerdo con la Sec. ID Nº 7. 10. Una proteína con una secuencia de aminoácidos de acuerdo con la Sec. ID Nº 8 que comprende al menos 5 mutaciones seleccionadas del grupo D22H, S24N, E25I, R33T, A63T, E69K, C94V, E115Q, K120E, D135E, D137R, N138T, Q168P, D177E, Y184R, A186I, F191L, N194K, N240D, T245S, V246I, V250R, N254D, I295M, D309N, S314A, G318A, A319T, Y327H, S330K, S337A, N353D, F370Y, A381P, Q384E, V390I, N395S, T397V. 14
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