Xilanasas, ácidos nucleicos que las codifican y métodos para elaborarlas y usarlas.

Un ácido nucleico aislado, sintético o recombinante que comprende

(a) un ácido nucleico que codifica al menos un polipéptido,

en el que el ácido nucleico comprende (i) SEQ ID NO: 383 o (ii) la secuencia de la SEQ ID NO: 481,

donde el ácido nucleico codifica al menos un polipéptido que tiene una actividad xilanasa,

y, opcionalmente, las identidades de secuencia se determinan mediante análisis con un algoritmo de comparación de secuencias o mediante una inspección visual,

y, opcionalmente, el algoritmo de comparación de secuencias es un algoritmo de BLAST versión 2.2.2 donde una configuración de filtrado se establece en blastall -p blastp -d "nr pataa" -F F, y todas las otras opciones se establecen por defecto;

(b) un ácido nucleico que codifica al menos un polipéptido que tiene una actividad xilanasa, en el que el polipéptido comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 384 o SEQ ID NO: 482;

(c) (i) el ácido nucleico de (a) o (b) y que codifica un polipéptido que tiene al menos una sustitución conservadora de aminoácidos y que conserva su actividad xilanasa; o, (ii) el ácido nucleico de (c) (i), donde la al menos una sustitución conservadora de aminoácidos comprende sustituir un aminoácido por otro aminoácido de características similares; o una sustitución conservadora comprende: reemplazo de un aminoácido alifático por otro aminoácido alifático; reemplazo de una Serina por una Treonina o viceversa; reemplazo de un residuo ácido por otro residuo ácido; reemplazo de un residuo que porta un grupo amida por otro residuo que porta un grupo amida; intercambio de un residuo básico por otro residuo básico; o reemplazo de un residuo aromático por otro residuo aromático;

(d) el ácido nucleico de (a), (b) o (c) que codifica un polipéptido que tiene dicha actividad xilanasa pero que carece de una secuencia señal, un dominio prepro, un dominio de dockerina y/o un módulo de unión a carbohidrato (CBM);

(e) el ácido nucleico de (a), (b), (c) o (d) que codifica un polipéptido que tiene dicha actividad xilanasa que comprende además una secuencia heteróloga;

(f) el ácido nucleico de (e), donde la secuencia heteróloga comprende o consiste en una secuencia que codifica:

(i) una secuencia señal heteróloga, un módulo de unión a carbohidrato heterólogo, un dominio de dockerina heterólogo, un dominio catalítico heterólogo (CD) o una combinación de los mismos; (ii) la secuencia de (i), donde la secuencia señal heteróloga, el módulo de unión a carbohidrato o el dominio catalítico (CD) se deriva de una enzima heteróloga; o (iii) una etiqueta, un epítopo, un péptido de dirección, una secuencia escindible, un resto detectable o una enzima;

(g) el ácido nucleico de (f), donde el módulo de unión a carbohidrato heterólogo (CBM) comprende, o consiste en, un módulo de unión a xilano, un módulo de unión a celulosa, un módulo de unión a lignina, un módulo de unión a xilosa, un módulo de unión a mannanasa, un módulo específico de xiloglucano y/o un módulo de unión a arabinofuranosidasa;

(h) el ácido nucleico de (f), donde la secuencia señal heteróloga dirige la proteína codificada a una vacuola, el retículo endoplásmico, un cloroplasto o un gránulo de almidón; o

(i) una secuencia de ácido nucleico completamente complementaria a (a), (b), (c), (d), (e), (f), (g) o (h).