Método para producir un compuesto de interés en una célula fúngica filamentosa.

Un método para producir una secuencia de nucleótidos que comprende las etapas de:



- proporcionar una secuencia codificadora de nucleótidos sinónima con frecuencia de codones optimizada de manera que un codón natural haya sido intercambiado con un codón sinónimo, codificando dicho codón sinónimo el mismo aminoácido que el codón natural y teniendo una mayor frecuencia en utilización de codones como se define en la Tabla 1 que el codón natural, en la que la frecuencia de codones optimizada es de manera que al menos 10%, 15%, 20%, 25%, 50%, 75%, 80%, 85%, 90% y lo más preferiblemente al menos 95% de los codones naturales ha sido intercambiado con un codón sinónimo, cambiando el codón sinónimo la frecuencia de codones de manera que el valor de la diferencia absoluta entre el porcentaje para dicho codón sinónimo en dicha frecuencia y el porcentaje óptimo enumerado llega a ser más pequeño después de la modificación, aplicando la siguiente lista de porcentajes óptimos: cisteína por TGC (100%); fenilalanina por TTC (100%); histidina por CAC (100%); lisina por AAG (100%); asparagina por AAC (100%); glutamina por CAG (100%); tirosina por TAC (100%); la alanina es codificada por GCT (38%), GCC (51%) o GCG (11%); aspartato por GAC (64%); glutamato por GAG (74%); glicina por GGT (49%), GGC (35%), GGA (16%); isoleucina por ATT (27%), ATC (73%); leucina por TTG (13%), CTT (17%), CTC (38%), CTG (32%); prolina por CCT (36%), CCC (64%); arginina por CGT (49%), CGC (51%); serina por TCT (21%), TCC (44%), TCG (14%), AGC (21%); treonina por ACT (30%), ACC (70%) y/o valina por GTT (27%), GTC (54%), GTG (19%), en la que la adecuación de codones de la secuencia codificadora de nucleótidos sinónima con frecuencia de codones optimizada presenta un valor de adecuación que es al menos 70%, 80%, 90%, 95%, preferiblemente 96%, 97%, 98% y lo más preferible >98%, en el caso de que la adecuación de los codones se calcule por medio de la siguiente función:**Fórmula**

donde g simboliza una secuencia codificadora de nucleótidos, su longitud |g|, c(k) su késimo codón,**Fórmula**

es una relación deseada de codón c(k) y**Fórmula**

una relación real en la secuencia g codificadora de nucleótidos, y opcionalmente

- ligar de manera operable dicha secuencia codificadora de nucleótidos sinónima a una secuencia de control tal como:

- una secuencia de terminación de la traducción orientada en la dirección 5' a 3' seleccionada de la siguiente lista de secuencias: TAAG, TAGA y TAAA, preferiblemente TAAA, y/o

- una secuencia codificadora iniciadora de la traducción orientada en la dirección 5' a 3' seleccionada de la siguiente lista de secuencias:**Fórmula**

y GCTTCCTTC, preferiblemente GCT TCC TTC.

**Tabla**

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E11164234.

Solicitante: DSM IP ASSETS B.V..

Nacionalidad solicitante: Países Bajos.

Dirección: Het Overloon 1 6411 TE Heerlen PAISES BAJOS.

Inventor/es: STAM, HEIN, ROUBOS,JOHANNES ANDRIES, PEIJ,VAN NOËL NICOLAAS MARIA ELISABETH, DONKERS,SERGE PETRUS.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N15/80 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › para hongos.
  • C12N9/20 C12N […] › C12N 9/00 Enzimas, p. ej. ligasas (6.; Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas. › Escisión de triglicéridos, p. ej. por medio de lipasa.
  • C12N9/30 C12N 9/00 […] › de origen fúngico.

PDF original: ES-2601200_T3.pdf

 

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