METODO AUTOMATIZADO PARA IDENTIFICAR SECUENCIAS BIOMOLECULARES RELACIONADAS.

Método para identificar secuencias biomoleculares relacionadas que posean características de interés provenientes de bases de datos, comprendiendo las bases de datos al menos un primer y segundo conjunto de secuencias, procediendo cada conjunto de un tipo diferente de organismo, que comprende las siguientes etapas:
a) establecer, a partir de un primer conjunto de secuencias, una lista no redundante de secuencias de interrogación que poseen características comunes de interés

(miembros de la primera familia), usando un programa de búsqueda en bases de datos;
b) realizar alineamientos de secuencia con los miembros de la primera familia en un segundo conjunto de secuencias procedentes de un segundo tipo de organismo, usando un programa de búsqueda en bases de datos y un umbral de similitud preseleccionado, que de una lista de miembros de la segunda familia;
c) establecer una matriz bidimensional que muestra los miembros de la primera y segunda familia y sus respectivos valores de similitud resultantes de la etapa (b), opcionalmente se muestran sólo aquellos miembros de la segunda familia que poseen valores de similitud que exceden el valor de umbral preseleccionado; y
d) seleccionar en la matriz los pares de miembros de la primera y segunda familia para los que los valores de similitud son los mejores de entre todos los alineamientos que implican uno de los dos miembros del par (ortólogos).

Tipo: Resumen de patente/invención.

Solicitante: APPLIED RESEARCH SYSTEMS ARS HOLDING N.V..

Nacionalidad solicitante: Antillas Holandesas.

Dirección: PIETERMAAI 15, P.O. BOX 4905,CURACAO.

Inventor/es: HOOFT VAN HUIJSDUIJNEN, ROB, COLINGE, JACQUES.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 16 de Noviembre de 2000.

Fecha Concesión Europea: 19 de Enero de 2005.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • SECCION C — QUIMICA; METALURGIA > BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE;... > PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS... > Procesos de medida, investigación o análisis en... > C12Q1/68 (en los que intervienen ácidos nucleicos)

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Mónaco, Irlanda, Eslovenia, Finlandia, Rumania, Chipre, Oficina Europea de Patentes, Lituania, Letonia, Ex República Yugoslava de Macedonia, Albania, Armenia, Azerbayán, Bielorusia, Ghana, Gambia, Kenya, Kirguistán, Kazajstán, Lesotho, República del Moldova, Malawi, Mozambique, Federación de Rusia, Sudán, Sierra Leona, Tayikistán, Turkmenistán, República Unida de Tanzania, Uganda, Zimbabwe, Burkina Faso, Benin, República Centroafricana, Congo, Costa de Marfil, Camerún, Gabón, Guinea, Malí, Mauritania, Niger, Senegal, Chad, Togo, Organización Regional Africana de la Propiedad Industrial, Swazilandia, Guinea-Bissau, Organización Africana de la Propiedad Intelectual, Organización Eurasiática de Patentes.

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