Método para seleccionar genes candidatos estadísticamente validados.

Un método implementado por computadora para identificar un marcador genético asociado con un rasgo de interés en una población anidada de plantas de Zea mays,

que comprende:

a) proporcionar un valor genotípico para cada uno de una pluralidad de marcadores genéticos para cada uno de los miembros de dicha población anidada, en donde dicha población comprende miembros que exhiben dicho rasgo de interés;

b) proporcionar un valor fenotípico para dicho rasgo de interés para cada uno de los miembros de dicha población;

c) determinar si uno o más de dichos marcadores están asociados con el rasgo de interés utilizando una computadora adecuadamente programada para realizar un mapeo de asociación anidado que comprende una combinación de una regresión de marcador único, SMR, y una regresión de marcador múltiple, MMR, en donde:

i) los genotipos no informativos se eliminan antes de evaluar una asociación entre un valor de rasgo y un genotipo marcador utilizando el modelo SMR; y,

ii) la regresión escalonada se utiliza para seleccionar marcadores de cofactores para su inclusión en el modelo MMR;

en donde un marcador genético se considera que está asociado con el rasgo de interés si los dos modelos de regresión detectan una asociación;

d) seleccionar una planta de Zea mays con el marcador genético asociado identificado en la etapa c).

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2010/023312.

Solicitante: SYNGENTA PARTICIPATIONS AG.

Nacionalidad solicitante: Suiza.

Dirección: Rosentalstrasse 67 4058 Basel SUIZA.

Inventor/es: LI,MIN, KISHORE,VENKATA KRISHNA, GUO,ZHIGANG, WANG,DAOLONG, GUTIERREZ ROJAS,LIBARDO ANDRES, CLARKE,JOSEPH DALLAS V, BYRUM,JOSEPH.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G16B20/40 FISICA.G16 TECNOLOGÍAS DE LA INFORMACIÓN Y DE LA COMUNICACIÓN [TIC] ESPECIALMENTE ADAPTADAS PARA ÁREAS DE APLICACIÓN ESPECÍFICAS.G16B BIOINFORMATICA, es decir, TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION Y DE LA COMUNICACION [TIC] ESPECIALMENTE ADAPTADAS PARA EL PROCESAMIENTO DE DATOS GENETICOS O DATOS RELACIONADOS CON PROTEINAS EN LA BIOLOGÍA MOLECULAR COMPUTACIONAL. › G16B 20/00 TIC especialmente adaptadas a la genómica o proteómica funcional, p.ej. asociaciones genotipo o fenotipo. › Genética de poblaciones; Desequilibrio de la unión.

PDF original: ES-2757827_T3.pdf

 

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