SELECCION RACIONAL DE PEPTIDOS PUTATIVOS PROCEDENTES DE SECUENCIAS NUCLEOTIDAS O PEPTIDICAS IDENTIFICADAS.

Método de identificación de precursores de un péptido que comprenden un extremo C-terminal amidado,

que comprende las siguiente etapas: - Extracción de secuencias automatizadas de una fuente pública; - Análisis de los ficheros e importación de los datos en ORACLETM, - Selección de las secuencias a partir de un subconjunto o a partir del banco de datos entero; - Búsqueda de los precursores de un péptido que comprende un extremo C-terminal amidado utilizando la secuencia Y1-Y2-Y3-Y4-Y5 en la cuál Y1 es una secuencia nucleotídica de 1 a 12 nucleótidos o Y1 se suprime, Y2 es un codón para Gly, Y3 e Y4 independientemente son codones para Arg o Lys e Y5 es una secuencia nucleotídica de 1 a 21 nucleótidos o Y5 se suprime; - Verificación de la ausencia de todo codón de DETENCIÓN entre el codón AUG que indica el inicio del marco de lectura y el resto buscado e identificación de dichas secuencias; - Verificación; si se encuentra, el resto es un marco de lectura abierto del tipo de secuenciaconsensus Kozak; - Comparación del medio del emplazamiento del resto con el requerido por búsqueda de estructuras secundarias requeridas alrededor de un sitio de maduración tal como la proximidad de hélices alfa o de hojas beta; - Verificación de la presencia de una semejanza de las secuencias y de otras secuencias conocidas. - 25 -

Tipo: Resumen de patente/invención.

Solicitante: SOCIETE DE CONSEILS DE RECHERCHES ET D'APPLICATIONS SCIENTIFIQUES ( S.C.R.A.S.)
CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CNRS)
.

Nacionalidad solicitante: Francia.

Dirección: 51/53 RUE DU DOCTEUR BLANCHE,75016 PARIS.

Inventor/es: THURIEAU, CHRISTOPHE, MARTINEZ, JEAN, GOZE, CATHERINE, RESIDENCE CH TEAU D\'ALCO, CAMARA Y FERRER,JOSE-ANTONIO, BERGE,GILBERT.

Fecha de Publicación: .

Fecha Concesión Europea: 8 de Agosto de 2007.

Clasificación PCT:

  • C12N15/10 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
  • C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • G06F17/30 SECCION G — FISICA.G06 COMPUTO; CALCULO; CONTEO.G06F TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores en los que una parte del cálculo se efectúa hidráulica o neumáticamente G06D, ópticamente G06E; sistemas de computadores basados en modelos de cálculo específicos G06N). › G06F 17/00 Equipo o métodos de tratamiento de datos o de cálculo digital, especialmente adaptados para funciones específicas. › Recuperación de la información; Estructura de bases de datos a este efecto.
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