SELECCION RACIONAL DE PEPTIDOS PUTATIVOS PROCEDENTES DE SECUENCIAS NUCLEOTIDAS O PEPTIDICAS IDENTIFICADAS.
Método de identificación de precursores de un péptido que comprenden un extremo C-terminal amidado,
que comprende las siguiente etapas: - Extracción de secuencias automatizadas de una fuente pública; - Análisis de los ficheros e importación de los datos en ORACLETM, - Selección de las secuencias a partir de un subconjunto o a partir del banco de datos entero; - Búsqueda de los precursores de un péptido que comprende un extremo C-terminal amidado utilizando la secuencia Y1-Y2-Y3-Y4-Y5 en la cuál Y1 es una secuencia nucleotídica de 1 a 12 nucleótidos o Y1 se suprime, Y2 es un codón para Gly, Y3 e Y4 independientemente son codones para Arg o Lys e Y5 es una secuencia nucleotídica de 1 a 21 nucleótidos o Y5 se suprime; - Verificación de la ausencia de todo codón de DETENCIÓN entre el codón AUG que indica el inicio del marco de lectura y el resto buscado e identificación de dichas secuencias; - Verificación; si se encuentra, el resto es un marco de lectura abierto del tipo de secuenciaconsensus Kozak; - Comparación del medio del emplazamiento del resto con el requerido por búsqueda de estructuras secundarias requeridas alrededor de un sitio de maduración tal como la proximidad de hélices alfa o de hojas beta; - Verificación de la presencia de una semejanza de las secuencias y de otras secuencias conocidas. - 25 -
Tipo: Resumen de patente/invención.
Solicitante: SOCIETE DE CONSEILS DE RECHERCHES ET D'APPLICATIONS SCIENTIFIQUES ( S.C.R.A.S.)
CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CNRS).
Nacionalidad solicitante: Francia.
Dirección: 51/53 RUE DU DOCTEUR BLANCHE,75016 PARIS.
Inventor/es: THURIEAU, CHRISTOPHE, MARTINEZ, JEAN, GOZE, CATHERINE, RESIDENCE CH TEAU D\'ALCO, CAMARA Y FERRER,JOSE-ANTONIO, BERGE,GILBERT.
Fecha de Publicación: .
Fecha Concesión Europea: 8 de Agosto de 2007.
Clasificación PCT:
- C12N15/10 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
- C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
- G06F17/30
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