PROCEDIMIENTO PARA EL ANALISIS DE SECUENCIAS.
Un procedimiento para determinar la secuencia de un ácido nucleico en el que se añaden nucleótidos secuencialmente a un cebador en un molde,
estando dicho molde unido a un soporte sólido, que comprende las etapas de a) hibridar un cebador al molde, comprendiendo dicho molde el ácido nucleico para el que se requiere la secuencia, para formar un complejo de molde-cebador, b) asignar uno o más nucleótidos marcados, que comprenden uno o más de A, C, G o T, y extender el cebador mediante una ADN polimerasa o una ligasa intentando añadir el nucleótido marcado único, proporcionándose el marcaje mediante un resto indicador, c) determinar el tipo o identidad del nucleótido marcado con indicador añadido al cebador, de manera que se identifica un nucleótido en la secuencia del molde, d) eliminar o neutralizar el resto indicador, e) repetir las etapas b) a d) secuencialmente en cada ciclo siguiente y registrar el orden de incorporación de nucleótidos marcados con indicador, f) determinar si un resto indicador puede detectarse en la etapa c) de cada ciclo, g) si el resto indicador no puede detectarse en la etapa c) de cada ciclo, introduciendo un indicador de detención en la secuencia para proporcionar una indicación de una base desconocida, h) si el resto indicador no puede detectarse, determinar si el número de indicadores de detención consecutivos supera un umbral predeterminado y, en ese caso, asignar un señalizador de apareamiento erróneo, i) si el resto indicador puede detectarse en la etapa c) y no se ha identificado en la iteración anterior de las etapas b) a d) o si no se detecta señalizador de apareamiento erróneo, asignar la base correspondiente a la secuencia, j) si el resto indicador puede detectarse en la etapa c) y se ha identificado en la iteración anterior de las etapas b) a d) y si se detecta el señalizador de apareamiento erróneo, sustituir la base previamente asignada con un código IUB para todas las demás bases, y k) si no puede detectarse el resto indicador en la etapa c) y si se observa ausencia del resto indicador para menos de un número umbral predeterminado de una o más iteraciones de las etapas b) a d) entonces el nucleótido correspondiente al indicador en la iteración actual de las etapas b) a d) se incorpora a la secuencia de manera contigua a la base previamente incorporada.
Tipo: Resumen de patente/invención.
Solicitante: AMERSHAM PHARMACIA BIOTECH UK LIMITED.
Nacionalidad solicitante: Reino Unido.
Dirección: AMERSHAM PLACE,LITTLE CHALFONT, BUCKINGHAM.
Inventor/es: ODEDRA,RAJ,AMERSHAM PHARMACIA BIOTECH UK LTD.
Fecha de Publicación: .
Fecha Concesión Europea: 7 de Febrero de 2007.
Clasificación PCT:
- C12M1/00 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12M EQUIPOS PARA ENZIMOLOGIA O MICROBIOLOGIA (instalaciones para la fermentación de estiércoles A01C 3/02; conservación de partes vivas de cuerpos humanos o animales A01N 1/02; aparatos de cervecería C12C; equipos para la fermentación del vino C12G; aparatos para preparar el vinagre C12J 1/10). › Equipos para enzimología o microbiología.
- C12M1/34 C12M […] › C12M 1/00 Equipos para enzimología o microbiología. › Medida o ensayo de detección de las condiciones del medio, p. ej. por contadores de colonias.
- C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
- G01N33/48 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Material biológico, p. ej. sangre, orina (G01N 33/02, G01N 33/26, G01N 33/44, G01N 33/46 tienen prioridad ); Hemocitómetros (cómputo de glóbulos repartidos sobre una superficie por barrido óptico de la superficie G06M 11/02).
- G01N33/50 G01N 33/00 […] › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre o de orina; Ensayos mediante métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Ensayos inmunológicos (procedimientos de medida o ensayos diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto, procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).
- G06F17/00 G […] › G06 CALCULO; CONTEO. › G06F PROCESAMIENTO ELECTRICO DE DATOS DIGITALES (sistemas de computadores basados en modelos de cálculo específicos G06N). › Equipo o métodos de procesamiento de datos o de cálculo digital, especialmente adaptados para funciones específicas (recuperación de la información, estructuras de las bases de datos o estructuras de los sistemas de archivos G06F 16/00).
- G06F17/30
- G06F19/00
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