ISOFORMAS DE PSAP, DETERMINANTES ANTIGENICOS, METODO DE OBTENCION DE ANTICUERPOS Y USOS DE LOS MISMOS.

Isoformas de PSAP, determinantes antigénicos, método de obtención de anticuerpos y usos de los mismos.



La presente invención se refiere a la proteína de membrana PSAPL y a una nueva isoforma de PSAP (PSAPS) generada por splicing alternativo, así como métodos para la obtención de anticuerpos contra estas proteínas. También forman parte de la invención los métodos de detección, así como de obtención de moduladores de la actividad de dichas proteínas y su uso como agentes terapéuticamente activos

Tipo: Patente de Invención. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: P200502840.

Solicitante: UNIVERSIDAD DE ZARAGOZA..

Nacionalidad solicitante: España.

Provincia: ZARAGOZA.

Inventor/es: CARRODEGUAS VILLAR,JOSE ALBERTO, LAMARCA GAY,VIOLETA.

Fecha de Solicitud: 18 de Noviembre de 2005.

Fecha de Publicación: .

Fecha de Concesión: 27 de Enero de 2010.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/47A1A

Clasificación PCT:

  • C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
  • C07K16/28 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra receptores, antígenos celulares de superficie o determinantes celulares de superficie.
  • C12N15/12 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas animales.
  • G01N33/68 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › en los que intervienen proteínas, péptidos o aminoácidos.

Fragmento de la descripción:

Isoformas de PSAP, determinantes antigénicos, método de obtención de anticuerpos y uso de los mismos.

Campo de la invención

La presente invención se refiere a la proteína de membrana PSAP y a una nueva isoforma de PSAP (PSAPS) generada por splicing alternativo, así como métodos para la obtención de anticuerpos. También forman parte de la invención los métodos para la obtención de moduladores de la actividad de dichas proteínas y su uso como agentes terapéuticamente activos.

Estado de la técnica

La enfermedad de Alzheimer es una patología neurodegenerativa que se caracteriza a nivel celular por la acumulación extracelular de agregados de proteína constituidos principalmente por el péptido amiloide beta y ovillos intracelulares formados por proteína tau hiperfosforilada. Todavía no está claro qué evento es el responsable del comienzo de la enfermedad, pero se han encontrado varios factores posibles aparte de la formación de acúmulos de proteínas.

Algunos trabajos han relacionado la mitocondria con la enfermedad de Alzheimer, observándose que algunas de las proteínas implicadas en la enfermedad de Alzheimer, como las presenilinas, que son proteínas que participan en la producción del péptido amiloide beta a partir de su proteína precursora, betaAPP, interaccionan con proteínas implicadas en el proceso de muerte celular apoptótica que ejercen su función en la mitocondria.

Se ha observado que PSAP (presenilin 1- associated protein) o mtch1 (mitochondrial carrier homolog 1) una proteína mitocondrial que interacciona con la presenilina 1, induce el proceso de muerte celular apoptótica cuando sus niveles intracelulares son aumentados por sobreexpresión de la misma en células en cultivo. Esto sugiere que PSAP está relacionada con la muerte celular apoptótica en la enfermedad de Alzheimer y podría jugar un papel importante en diversas enfermedades degenerativas, así como en diversos tipos de cánceres.

PSAP no es la única proteína que interacciona con la Presenilina 1 y que está relacionada con las patologías anteriormente mencionadas. Una de estas proteínas distintas de PSAP, es la HPAP (Human Presenilin-asociated Protein), descrita en la solicitud de patente Norteamericana n° 09/116,640. En este documento se desarrolla un método para la obtención de anticuerpos contra dicha proteína para su uso tanto en el diagnóstico in vivo como in vitro.

En relación a PSAP, la primera referencia conocida a esta proteína y en la que se describe su relación con la Presenilina 1 fue realizada en 1999 (Xuemin Xu, Yong-chang Shi et al.,J Biol Chem, Vol. 274, Issue 46, 32543-32546, November 12, 1999, Identification of a Novel PSD-95/Dlg/ZO-1 (PDZ)-like Protein Interacting with the C Terminus of Presenilin-1). En este artículo se describen experimentos en los que la detección de la proteína PSAP se realiza mediante la adición en su extremo Carboxilo terminal de un marcador ("Myc tag") sobre el cual actúan anticuerpos denominados como "anti-myc".

En 2002, Xuemin Xu et al. (J Biol Chem. 2002 Dec 13;277(50):48913-22. Epub 2002 Oct 10. The novel presenilin-1-associated protein is a proapoptotic mitochondrial protein) describen la relación de PSAP con la apoptosis. En los experimentos la visualización de PSAP se realiza a través de la creación de una proteína quimérica de fusión entre PSAP y GFP (Green Fluorescence Protein). La detección de PSAP también se realiza con anticuerpos, tal y como fueron descritos en el articulo mencionado anteriormente de Xuemin Xu et al. 1999.

Hasta el momento son pocos los anticuerpos desarrollados que reaccionen directamente contra PSAP debido a la dificultad que entraña localizar epítopos o fragmentos antigénicos de esta proteína que funcionen correctamente por diferentes motivos:

i)PSAP es una proteína que resulta muy tóxica cuando fragmentos de ésta o la proteína completa se intenta expresar en sistemas vector-célula huésped. Esta circunstancia hace muy complejo el procedimiento de obtención de anticuerpos contra PSAP, puesto que los fragmentos antigénicos de ésta que se elijan, no sólo deben ser buenos determinantes antigénicos, sino que además no deben de ser tóxicos. ii)No todos los posibles epítopos de la proteína se encuentran expuestos una vez la proteína se encuentra plegada, por lo que es necesario seleccionar aquellos que si lo estén, para los casos en los que los métodos de detección utilicen muestras con proteínas nativas. iii)Aunque con los programas informáticos existentes es posible llegar a saber cual es la configuración terciaria de una proteína, y con ello conocer qué epítopos deberían encontrarse expuestos partiendo de una secuencia de aminoácidos inicial, las modificaciones postraduccionales hacen que muchos de los epítopos candidatos, que a priori son adecuados, en la práctica no sean eficaces para la obtención de anticuerpos.

Estos inconvenientes son solucionados con el método y elementos proporcionados para la obtención de anticuerpos contra PSAP en la presente invención.

Otro de los problemas solucionados por la presente invención radica en la necesidad de encontrar nuevas dianas hasta ahora desconocidas, que mejoren y permitan el estudio, prevención, diagnóstico y tratamiento de enfermedades entre las que se incluyen, pero no se limitan a, el Alzheimer o diferentes tipos de cáncer.

En este sentido, la invención proporciona una nueva isoforma de PSAP (PSAPS) generada por splicing alternativo, métodos para la obtención de agentes que modulen su actividad, además de un método para la generación de anticuerpos contra ésta, junto con los elementos para llevarlo a cabo. Dicha isoforma difiere de la isoforma actualmente incluida en el estado de la técnica, PSAPL, en la longitud de un brazo hidrofílico situado entre los dos dominios transmenbrana de la proteína.

Breve descripción de la invención

Un primer aspecto de la presente invención se refiere a un polinucleótido aislado seleccionado de cualquiera de los siguientes grupos: i) polinucleótido que codifica para la secuencia SEQ ID 2; ii) polinucleótido cuya secuencia comprende la SEQ ID 1 o fragmentos de la misma; iii) polinucleótido cuya secuencia consiste en la SEQ ID 1; iv) polinucleótido que comprenda una secuencia que difiera de la secuencia del polinucleótido (iii) o fragmentos de (ii) debido a la degeneración del código genético; v) polinucleótido que codifique para un polipéptido que al menos muestre un 90% de homología con cualquiera de los polipéptidos codificados por los polinucleótidos (i), (ii), (iii) o (iv); vi) polinucleótido que comprenda la SEQ ID 3 o un fragmento de la misma. En adelante nos referiremos a los polinucleótidos anteriormente mencionados como polinucleótidos de la invención.

En un aspecto de la presente invención el término fragmento se refiere a todas aquellos secuencias nucleotídicas comprendidas en los polinucleotidos de la invención que codifiquen polipéptidos capaces de ser utilizados como determinantes antigénicos para la generación de anticuerpos o como posibles dianas para la generación u obtención de moduladores de la actividad de PSAPS o PSAPL.

Un segundo aspecto de la invención se relaciona con un polipéptido aislado seleccionado de cualquiera de los siguientes grupos: i) polipéptido que consiste en la SEQ ID 2; ii) polipéptido que comprende la secuencia SEQ ID 2; iii) polipéptido codificado por cualquiera de las secuencias de los polinucleotidos de la invención; iv) polipéptido que al menos muestre un 90% de homología con cualquiera de los péptidos (i), (ii), (iii) o (v); v) polipéptido que comprende la SEQ ID 4 o un fragmento de la misma. En adelante nos referiremos a los polipéptidos anteriormente mencionados como polipéptidos de la invención.

En otro aspecto de la presente invención el término fragmento se refiere a todas aquellos secuencias polipeptídicas comprendidas en cualquiera de los polipéptidos de la invención capaces de ser utilizadas como determinantes antigénicos para la generación de anticuerpos o como posibles dianas para la generación u obtención de moduladores de la actividad de PSAPS o PSAPL.

Un tercer aspecto de la invención los constituye una proteína de fusión que comprende al menos un polipéptido de la invención. Preferentemente dicho polipéptido comprende la SEQ ID 6. En adelante...

 


Reivindicaciones:

1. Polinucleótido aislado capaz de codificar para un polipéptido con capacidad inmunogénica frente a la PSAP, incluyendo cualquiera de sus isoformas, donde dicho polinucleótido es seleccionado del grupo que comprende:

a. Polinucleótido que consista en la SEQ ID 3 o un fragmento de la misma, ó
b. Polinucleótido que codifique para un polipéptido que al menos presente un 90% de homología el polipéptido codificado por la SEQ ID 3.

2. Polipéptido con capacidad inmunogénica frente a la proteína PSAP, incluyendo cualquiera de sus isoformas, donde dicho polipéptido es seleccionado del grupo que comprende:

a. Polipéptido que consista en la SEQ ID 4 o un fragmento de la misma, ó
b. Polipéptido que al menos muestre un 90% de homología con el polipéptido del apartados (a).

3. Proteína de fusión que comprende al menos un polipéptido según la reivindicación 2.

4. Proteína de fusión según reivindicación 3, cuya secuencia comprenda la SEQ ID 6.

5. Vector que comprenda cualquiera de los polinucleótidos de la reivindicación 1.

6. Vector según reivindicación 5 que comprenda a un polinucleótido de secuencia SEQ ID 3.

7. Célula huésped transformada con un vector según cualquiera de las reivindicaciones 5 y 6.

8. Anticuerpos frente a PSAP capaces de interaccionar con cualquiera de los polipéptidos según la reivindicación 2.

9. Uso de cualquiera de los polipéptidos de la reivindicación 2 para la generación de anticuerpos capaces de interaccionar con la proteína PSAP.

10. Uso de una proteína de fusión según cualquiera de las reivindicaciones 3-4 para la generación de anticuerpos capaces de interaccionar con la proteína PSAP.


 

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