Análisis de ADN basado en el tamaño para la clasificación del cáncer.
(16/10/2019) Un procedimiento de análisis de una muestra biológica de un sujeto, incluyendo la muestra biológica ADN que se origina a partir de células normales y posiblemente de células asociadas con cáncer, en donde al menos algo del ADN está libre de células en la muestra biológica, comprendiendo el procedimiento:
(a) secuenciar una pluralidad de fragmentos de ADN para obtener una pluralidad de lecturas de secuencia que comprenden los nucleótidos más externos en cada extremo de una pluralidad de fragmentos de ADN;
(b) alinear las lecturas de secuencia de un genoma de referencia, obteniendo de este modo un conjunto de coordenadas…
Análisis de patrones de metilación de tejidos en mezcla de ADN.
(12/06/2019) Un método para analizar una muestra biológica de un organismo, incluyendo la muestra biológica una mezcla de al menos 1.000 moléculas de ADN libre de células de una pluralidad de tipos de tejidos, incluyendo un primer tipo de tejido, comprendiendo el método:
analizar, mediante un sistema informático, una pluralidad de moléculas de ADN libre de células de la muestra biológica, siendo la pluralidad de moléculas de ADN libre de células al menos 1.000 moléculas de ADN libre de células, en donde el análisis de una molécula de ADN libre de células incluye:
identificar una ubicación de la molécula de ADN libre de células en un genoma de referencia correspondiente al organismo;
identificar un primer conjunto de la…
Análisis basado en el tamaño de la fracción de ADN fetal en el plasma materno.
(24/04/2019) Un procedimiento de análisis de una muestra de plasma materno de una mujer embarazada, incluyendo la muestra fragmentos de ADN sin células que se originan de células maternas y de células fetales, comprendiendo el procedimiento:
para cada una de una pluralidad de fragmentos de ADN de la muestra de plasma:
recibir una o más lecturas de secuencia obtenidas de una secuenciación del fragmento de ADN, incluyendo la una o más lecturas de secuencia ambos extremos del fragmento de ADN;
alinear la una o más lecturas de secuencia con un genoma de referencia para obtener localizaciones alineadas para ambos extremos del fragmento de ADN; y
usar las localizaciones alineadas para determinar un tamaño del fragmento de ADN;
para cada tamaño de una pluralidad de tamaños:
determinar una cantidad de un conjunto…
Análisis mutacional de ADN de plasma para la detección de cáncer.
(29/10/2018) Un método para detectar cáncer o cambios premalignos en un sujeto, comprendiendo el método:
obtener una secuencia consenso de un genoma del sujeto, en el que la secuencia consenso se deriva usando etiquetas de secuencia de una muestra del sujeto que contiene más del 50 % de ADN de células sanas;
recibir una o más etiquetas de secuencia para cada una de una pluralidad de fragmentos de ADN en una muestra biológica del sujeto, incluyendo la muestra biológica ADN libre de células;
determinar posiciones genómicas para las etiquetas de secuencia;
comparar las etiquetas de secuencia con la secuencia consenso para determinar un primer número de primeros loci, en el que:
en cada uno de los primeros…
Análisis basado en el tamaño de la fracción de ADN fetal en el plasma materno.
(03/01/2018) Un procedimiento para calcular la concentración fraccionaria de ADN clínicamente relevante en una muestra biológica, incluyendo la muestra biológica el ADN clínicamente relevante y otro ADN, comprendiendo el procedimiento:
para cada tamaño de una pluralidad de tamaños:
medir una cantidad de una pluralidad de fragmentos de ADN de la muestra biológica que corresponden al tamaño:
calcular, con un sistema informático, un primer valor de un primer parámetro basado en las cantidades de fragmentos de ADN de múltiples tamaños, proporcionando el primer parámetro una medida estadística de un perfil de tamaños…
Análisis de transcriptoma de plasma materno por secuenciación masiva en paralelo de ARN.
(16/11/2016) Un método para diagnosticar un trastorno relacionado con el embarazo usando una muestra de una hembra embarazada con un feto, comprendiendo el método:
recibir un gran número de lecturas de secuencias, en donde las lecturas de secuencias se obtienen de un análisis de moléculas de ARN obtenidos de la muestra, muestra que contiene una mezcla de moléculas de ARN maternos y fetales;
identificar, mediante un sistema informático, las ubicaciones de las lecturas de secuencias en una secuencia de referencia;
identificar uno o más locus informativos, cada uno de los cuales es homocigótico en una primera entidad para un primer alelo correspondiente…
Determinación no invasiva de metiloma del feto o tumor de plasma.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(11/05/2016). Solicitante/s: THE CHINESE UNIVERSITY OF HONG KONG. Clasificación: C12Q1/68.
Un método para analizar una muestra biológica de un organismo, incluyendo la muestra biológica ADN sin células que se origina de células normales y potencialmente de células asociadas con cáncer, comprendiendo el método:
analizar una pluralidad de moléculas de ADN sin células de la muestra biológica, donde el análisis de una molécula de ADN incluye:
determinar una localización de la molécula de ADN en un genoma del organismo; y
determinar si la molécula de ADN está metilada en uno o más sitios;
para cada uno de una pluralidad de sitios, determinar un número respectivo de moléculas de ADN que están metiladas en el sitio;
calcular un primer nivel de metilación basándose en los números respectivos de moléculas de ADN metiladas en la pluralidad de sitios;
comparar el primer nivel de metilación con un primer valor de punto de corte; y
determinar una primera clasificación de un nivel de cáncer basándose en la comparación.
PDF original: ES-2665273_T3.pdf