Métodos, modelos, sistemas y aparatos para identificar secuencias diana para enzimas Cas o sistemas CRISPR-Cas para secuencias diana y transmitir resultados de los mismos.
(25/02/2019) Un metodo implementado por computadora para seleccionar un complejo CRISPR para dirigir y/o escindir una secuencia de acido nucleico diana candidata dentro de una celula, que comprende los pasos de:
(a) determinar la cantidad, la ubicacion y la naturaleza de los desapareamientos de la secuencia guia del o de los complejos CRISPR potenciales y la secuencia de acido nucleico diana candidata,
(b) determinar la contribucion de cada cantidad, la ubicacion y la naturaleza del o de los desapareamientos en la energia libre de hibridacion de la union entre la secuencia de acido nucleico diana y la secuencia guia del o de los complejos CRISPR potenciales a partir de un conjunto de datos de capacitacion,
(c) basandose en el analisis de contribucion del paso (b), predecir la escision…
Sistemas, métodos y composiciones de componentes de CRISPR-Cas para manipulación de secuencias.
(26/04/2017) Una composición que no se encuentra en la naturaleza o lograda, que comprende un sistema vector que comprende uno o más vectores que comprenden:
I. un primer elemento regulador ligado de manera operable a una secuencia de polinucleótidos de ARN quimérico (ARNqui) del sistema CRISPR-Cas, en el que la secuencia de polinucleótidos comprende:
(a) una secuencia guía capaz de hibridarse a una secuencia diana en una célula eucariota,
(b) una secuencia de emparejamiento tracr y
(c) una secuencia tracr y
II. un segundo elemento regulador ligado de manera operable a una secuencia codificadora de enzima que codifica dicha enzima CRISPR que comprende al menos una o más secuencias de localización nuclear (las NLS) en la proximidad de un extremo de la enzima CRISPR,
en la que (a), (b) y…
Ingeniería de sistemas, métodos y composiciones de guía optimizadas para manipulación de secuencias.
(13/07/2016) Un sistema vector relacionado con Repeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Interespaciadas (CRISPR)-CRISPR asociado a (Cas) (CRISPR-Cas) de ingeniería, que no está presente en la naturaleza, que comprende uno o más vectores que comprenden:
a) un primer elemento regulador unido de manera operable a dos o más secuencias de nucleótidos, que codifican cada una de ellas un ARN guía del sistema CRISPR-Cas que comprende una secuencia de polinucleótidos que comprende una secuencia guía, un ARNtracr y una secuencia de emparejamiento tracr, donde cada ARN guía se hibrida con una secuencia objetivo diferente en los sitios de los polinucleótidos en una célula eucariota,
b) un segundo elemento regulador unido de manera operable a la secuencia de nucleótidos que codifica una proteína Cas9 de Tipo II,
en…
Ingeniería de sistemas, métodos y composiciones de guía optimizadas para manipulación de secuencias.
(11/12/2015) Un sistema vector relacionado con Repeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Interespaciadas (CRISPR)-CRISPR asociado a (Cas) (CRISPR-Cas) de ingeniería, que no está presente en la naturaleza, que comprende uno o más vectores que comprenden:
a) un primer elemento regulador unido de manera operable a una secuencia de nucleótidos que codifica una secuencia de polinucleótidos del sistema CRISPR-Cas que comprende una secuencia guía, un ARNtracr y una secuencia de emparejamiento tracr, en la que la secuencia guía se hibrida con una o más secuencias objetivo en los sitios de los polinucleótidos…
Ingeniería de sistemas, métodos y composiciones de guía optimizadas para manipulación de secuencias.
(01/10/2014) Un sistema vector asociado a CRISPR - Repeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Interespaciadas (CRISPR) (Cas) (CRISPR-Cas) que no se encuentran en la naturaleza, de ingeniería, que comprende uno o más vectores que comprenden:
a) un primer elemento regulador unido de manera operable a una o más secuencias de nucleótidos que codifican una o más secuencias de polinucleótidos del sistema CRISPR-Cas que comprende una secuencia guía, un ARNtracr y una secuencia de emparejamiento tracr, en la que la secuencia guía se hibrida con una o más secuencias objetivo en los sitios de los polinucleótidos…
Ingeniería de sistemas, métodos y composiciones de guía optimizadas para manipulación de secuencias.
(19/06/2014) Una composición de origen no natural u obtenida por ingeniería que comprende:
una secuencia de polinucleótidos de ARN quimérico (ARNchi) del sistema de Repeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Espaciadas (CRISPR)-(Cas) asociado a CRISPR (CRISPR-Cas), en donde la secuencia de polinucleótidos comprende
(a) una secuencia guía con entre 10 - 30 nucleótidos de longitud, capaz de hibridarse a una secuencia diana en una célula eucariota,
(b) una secuencia de emparejamiento de tracr, y
(c) una secuencia de ARNtracr en la que (a), (b) y (c) se colocan en una orientación de 5' a 3', en la que cuando se transcribe, la secuencia de emparejamiento de tracr se hibrida a la secuencia de ARNtracr…