Selección automática de microorganismos e identificación usando MALDI.

Un método para localizar y seleccionar una colonia de microorganismos en una placa de cultivo e identificar microorganismos en dicha colonia seleccionada usando MALDI,

en donde dicho método comprende las etapas automáticas de:

- localizar y seleccionar una colonia de microorganismos (4) en una placa de cultivo (3);

- obtener una muestra de dicha colonia de microorganismos seleccionada;

en donde las etapas de obtener una muestra de dicha colonia de microorganismos seleccionada se realizan mediante las etapas automáticas de:

- proporcionar una primera herramienta de selección (6) y proporcionar un dispositivo de colocación (8) con un soporte de la herramienta de selección (9 ) para sostener una herramienta de selección (6), donde dicho dispositivo de colocación (8) se dispone para colocar una herramienta de selección (6) en una posición inicial por encima de una ubicación obtenida de la colonia de microorganismos seleccionada (4) en la placa de cultivo (3) y para hacer descender y elevar de forma automática una herramienta de selección (6) hacia y en sentido contrario a la placa de cultivo (3) y para colocar una herramienta de selección (6) en una posición de transferencia, respectivamente;

- colocar dicha primera herramienta de selección (6) en dicho soporte de la herramienta de selección (9) del dispositivo de colocación (8);

- mediante la colocación de dicho dispositivo de colocación (8) de la primera herramienta de selección (6) en la posición inicial por encima de la ubicación obtenida de la colonia de microorganismos seleccionada (4) en la placa de cultivo (3), hacer descender de forma automática la primera herramienta de selección (6) hacia la placa de cultivo (3) para que entre en contacto con el microorganismo (4) para seleccionar una muestra de dicho microorganismo, elevar de forma automática la primera herramienta de selección (6) con dicha muestra del microorganismo (4) en sentido contrario a la placa de cultivo (3) hacia la posición de transferencia; y

- depositar al menos una parte de dicha muestra de dicha colonia de microorganismos seleccionada (4) en una placa diana;

en donde la etapa de depositar al menos una parte de dicha muestra de dicha colonia de microorganismos seleccionada en una placa diana se realiza mediante las etapas automáticas de:

- proporcionar un soporte del tubo de suspensión (10) para sostener un tubo de suspensión (11);

- colocar un tubo de suspensión (11) en el soporte del tubo de suspensión (10);

- proporcionar un dispensador del medio de suspensión automático (12) para dispensar automáticamente un medio de suspensión (14) en un tubo de suspensión (11) sostenido por el soporte del tubo de suspensión (10);

- al suministrar de forma automática el dispensador automático (12) una cantidad inicial de medio de suspensión (14) en el tubo de suspensión (11) sostenido por el soporte del tubo de suspensión (10);

- proporcionar un dispositivo de transferencia (15) para transferir de forma automática una herramienta de selección de la posición de transferencia del dispositivo de colocación (8) a una posición por encima de un tubo de suspensión (11) sostenido por el soporte del tubo de suspensión (10), y para hacer descender y elevar una herramienta de selección (6) hacia y en sentido contrario a un medio de suspensión (14) contenido en un tubo de suspensión (11), y para colocar una herramienta de selección (6) en una posición de espera por encima de un tubo de suspensión (11) sostenido por el soporte del tubo de suspensión (10), respectivamente;

- al transferir de forma automática dicho dispositivo de transferencia (15) dicha primera herramienta de selección (6) con la muestra del microorganismo de la posición de transferencia del dispositivo de colocación (8) a una posición por encima del tubo de suspensión (11) sostenido por el soporte del tubo de suspensión (10), hacer descender dicha primera herramienta de selección (6) con la muestra del microorganismo hacia el interior del medio de suspensión (14) contenido en el tubo de suspensión (11); al hacer oscilar el dispositivo de transferencia (15) la primera herramienta de selección (6) en un movimiento vertical lineal durante un período de tiempo mientras que la primera herramienta de selección (6) con la muestra de dicho microorganismo se sumerge en el medio de suspensión (14); y después de que ha transcurrido dicho período de tiempo, elevar la primera herramienta de selección (6) en sentido contrario al medio de suspensión (14) contenido en el tubo de suspensión (11) hacia la posición de espera;

- proporcionar un medidor de turbidez (20) para realizar mediciones de la turbidez de un medio de suspensión (14) contenido en un tubo de suspensión (11) sostenido por el soporte del tubo de suspensión (10);

- al menos después de transcurrido el período de tiempo durante el cual la herramienta de selección (6) oscila medir la turbidez del medio de suspensión (14) contenido en el tubo de suspensión (11) sostenido por el soporte del tubo de suspensión (10) mediante el medidor de turbidez (20) y proporcionar un valor de medición final que indica la turbidez medida;

- proporcionar un controlador (23) conectado de forma comunicativa al dispositivo de colocación (8), el dispositivo de transferencia (15), el dispensador del medio de suspensión automático (12) y el medidor de turbidez (20) para controlar de forma automática el movimiento del dispositivo de colocación (8), el movimiento del dispositivo de transferencia (15), el funcionamiento del dispensador del medio de suspensión automático (12) y el funcionamiento del medidor de turbidez (20), respectivamente;

- en donde dicho controlador (23) realiza las etapas de:

a) determinar si el valor de medición final se encuentra por encima de un primer valor umbral previamente almacenado en una memoria del controlador (23), en caso afirmativo, realizar la etapa b); o si el valor de medición final es idéntico o superior al segundo valor de umbral previamente almacenado en la memoria del controlador (23), donde dicho primer valor de umbral es igual o superior al segundo valor de umbral, en caso afirmativo, realizar la etapa c); o si el valor de medición final es inferior al segundo valor de umbral, en caso afirmativo, realizar la etapa d);

b) controlar el dispensador del medio de suspensión automático (12) para suministrar una cantidad adicional de medio de suspensión (14) en el tubo de suspensión (11);

c) proporcionar una señal de que se puede retirar el tubo de suspensión (11) con la suspensión del soporte del tubo de suspensión (10) para el procesamiento adicional; o

d) proporcionar una herramienta de selección adicional (7) en donde proporcionar la herramienta de selección adicional (7) comprende colocar dicha herramienta de selección adicional (7) en dicho soporte de la herramienta de selección (9) del dispositivo de colocación (8);

y el método comprende además las etapas automáticas de:

- obtener una gota de dicha suspensión de muestra; y

- transferir dicha gota de suspensión de muestra a dicha placa diana

- transferir dicha placa diana con dicha muestra a un aparato para realizar MALDI para la identificación de dicha muestra de dicha colonia de microorganismos seleccionada en donde el método comprende además las etapas automáticas de:

- obtener una segunda gota de dicha suspensión de muestra;

- depositar dicha segunda gota de suspensión de muestra en una placa de cultivo de prueba; y

- transferir dicha placa de cultivo de prueba a un aparato para realizar una prueba de susceptibilidad u otro análisis adicional.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/NL2013/050239.

Solicitante: BD Kiestra B.V.

Nacionalidad solicitante: Países Bajos.

Dirección: Marconilaan 6 9207 JC Drachten PAISES BAJOS.

Inventor/es: KLEEFSTRA,Martijn, BOTMA,Jetze, VAN DER ZEE,TINO WALTER.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12M1/22 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12M EQUIPOS PARA ENZIMOLOGIA O MICROBIOLOGIA (instalaciones para la fermentación de estiércoles A01C 3/02; conservación de partes vivas de cuerpos humanos o animales A01N 1/02; aparatos de cervecería C12C; equipos para la fermentación del vino C12G; aparatos para preparar el vinagre C12J 1/10). › C12M 1/00 Equipos para enzimología o microbiología. › Caja de tipo Petri.
  • C12M1/26 C12M 1/00 […] › Inoculador o preparador de muestras.
  • C12M1/36 C12M 1/00 […] › que incorporan un mecanismo de control en función del tiempo o de las condiciones del medio, p. ej. fermentadores controlados automáticamente.
  • G01N1/04 SECCION G — FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 1/00 Muestreo; Preparación de muestras para la investigación (manipulación de materiales para un análisis automático G01N 35/00). › en estado sólido, p. ej. por corte con herramienta.
  • G01N35/00 G01N […] › Análisis automático no limitado a procedimientos o a materiales tratados en uno sólo de los grupos G01N 1/00 - G01N 33/00; Manipulación de materiales a este efecto.
  • G01N35/10 G01N […] › G01N 35/00 Análisis automático no limitado a procedimientos o a materiales tratados en uno sólo de los grupos G01N 1/00 - G01N 33/00; Manipulación de materiales a este efecto. › Dispositivos para transferir las muestras hacia, en, o desde el aparato de análisis, p. ej. dispositivos de aspiración, dispositivos de inyección.
  • H01J49/16 SECCION H — ELECTRICIDAD.H01 ELEMENTOS ELECTRICOS BASICOS.H01J TUBOS DE DESCARGA ELECTRICA O LAMPARAS DE DESCARGA ELECTRICA (espinterómetros H01T; lámparas de arco, con electrodos consumibles H05B; aceleradores de partículas H05H). › H01J 49/00 Espectrómetros de partículas o tubos separadores de partículas. › que utilizan una ionización de superficie, p. ej. emisión termoiónica o fotoeléctrica.

PDF original: ES-2642340_T3.pdf

 

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