Método y kit para determinar la integridad del genoma y/o la calidad de una biblioteca de secuencias de ADN obtenidas por amplificación de genoma completo mediante sitios de restricción determinísticos.

Un método para determinar la integridad del genoma humano de una muestra a ser analizada por amplificación de genoma completo (WGA) y/o la calidad de una biblioteca de secuencias de ADN obtenidas por amplificación de genoma completo mediante sitios de restricción determinísticos (DRS-WGA) del genoma humano de la muestra que comprende los pasos de:



(a) proveer la biblioteca de secuencias de ADN,

(b) amplificar la biblioteca de secuencias de ADN por PCR usando:

- por lo menos un primer par de cebadores que hibridiza con una secuencia de ADN de la biblioteca que tiene una longitud entre 1000 pb y 5000 pb y que abarca la región D5S2117 del cromosoma 5q del genoma,

- por lo menos un segundo par de cebadores que hibridiza con una secuencia de ADN de la biblioteca que tiene una longitud entre 1000 pb y 5000 pb y que abarca los a los exones 2 y 3 del gen TRP53 del genoma, y

- por lo menos un tercer par de cebadores que hibridiza con una secuencia de ADN de la biblioteca que tiene una longitud entre 1000 pb y 5000 pb y que abarca al pseudogén 1 de KRT19 del genoma,

en donde el paso de amplificación da origen a un primer producto de PCR de entre 50 pb y 1000 pb, un segundo producto de PCR de entre 50 pb y 1000 pb que tiene un tamaño distinto al primer producto de PCR, y un tercer producto de PCR de entre 50 pb y 1000 pb que tiene un tamaño distinto que el primero y el segundo producto de PCR;

(c) detectar el primero, el segundo y el tercer producto de PCR;

(d) correlacionar la presencia del primero, del segundo y del tercer producto de PCR con la integridad del genoma de la muestra y/o la calidad de la biblioteca de secuencias de ADN.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E13195770.

Solicitante: Menarini Silicon Biosystems S.p.A.

Nacionalidad solicitante: Italia.

Dirección: Via G. di Vittorio, 21 B/3 40013 Castel Maggiore (BO) ITALIA.

Inventor/es: MANARESI,NICOLO, KLEIN,CHRISTOPH ANDREAS, POLZER,BERNHARD MICHAEL.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G01N33/574 SECCION G — FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › para el cáncer.

PDF original: ES-2637385_T3.pdf

 

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