UN PROCEDIMIENTO PARA SELECCIONAR OLIGONUCLEOTIDOS CON UNA BAJA HIBRIDCION CRUZADA.

Un procedimiento para proporcionar un conjunto de sondas para una matriz para secuestrar un conjunto deseado de objetivos en el que las sondas hibridan con sus objetivos pretendidos pero no hibridan sustancialmente con objetivos no pretendidos en una mezcla de muestra de objetivos pretendidos y objetivos no pretendidos, que comprende las etapas de:

(a) determinar un conjunto de objetivos; (b) determinar un objetivo actual en particular de entre el conjunto de objetivos para sondear; (c) elegir una subcadena de una secuencia del objetivo actual y proporcionar su secuencia complementaria, que se convierte en la sonda candidata; (d) determinar que una sonda candidata satisface cualquier criterio deseado o requerido para las sondas; (e) calcular la Tm para la sonda candidata usando un modelo de hibridación; (f) calcular sustancialmente todas las posibles Tm de cruzamiento de la sonda candidata hibridando con todos los objetivos no pretendidos, y hallar la Tm de cruzamiento máximo; (g) calcular la delta Tm; (h) determinar si la delta Tm es de al menos 5°C; y (i) repetir las etapas (b) hacia delante hasta que se encuentren las sondas deseadas.

Tipo: Resumen de patente/invención.

Solicitante: COMBIMATRIX CORPORATION.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: SUITE 210, 887 MITTEN ROAD,BURLINGAME, CA 94010.

Inventor/es: ANDERSON, BROOKE, P., MONTGOMERY, DONALD, D.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 25 de Enero de 2000.

Fecha Concesión Europea: 22 de Marzo de 2006.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • SECCION G — FISICA > COMPUTO; CALCULO; CONTEO > TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores... > G06F19/00 (Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas (G06F 17/00  tiene preferencia; sistema o métodos de procesamiento de datos especialmente adaptados para propósitos administrativos, comerciales, financieros, de gestión, supervisión o predicción G06Q))

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Eslovenia, Finlandia, Rumania, Chipre, Oficina Europea de Patentes, Lituania, Letonia, Ex República Yugoslava de Macedonia, Albania, Armenia, Azerbayán, Bielorusia, Ghana, Gambia, Kenya, Kirguistán, Kazajstán, Lesotho, República del Moldova, Malawi, Federación de Rusia, Sudán, Sierra Leona, Tayikistán, Turkmenistán, República Unida de Tanzania, Uganda, Zimbabwe, Burkina Faso, Benin, República Centroafricana, Congo, Costa de Marfil, Camerún, Gabón, Guinea, Malí, Mauritania, Niger, Senegal, Chad, Togo, Organización Regional Africana de la Propiedad Industrial, Swazilandia, Guinea-Bissau, Organización Africana de la Propiedad Intelectual, Organización Eurasiática de Patentes.

google+ twitter facebook