Sistema automatizado para la selección y provisión de células biológicas alógenas almacenadas para trasplante, terapia e investigación.

Procedimiento implementado por ordenador para la selección de una preparación de sangre de cordón umbilical adecuada para el trasplante alógeno, caracterizado por que el procedimiento comprende:

- tratamiento de datos, que comprende la detección y el registro de características físicas y de información de las preparaciones de sangre de cordón umbilical en un banco de datos, que comprende:

- nombre e identificación del banco de sangre de cordón umbilical

(banco de SCU) de almacenamiento,

- estado del banco de SCU de almacenamiento en relación con certificaciones internacionales,

- fiabilidad de la tramitación del banco de SCU según la clasificación,

- interlocutor en el respectivo banco con datos de contacto,

- número de identificación de la preparación,

- anamnesis de la madre, del niño y de la familia de acuerdo con formularios de anamnesis del hospital del nacimiento,

- etnia de la madre, del padre y/o del niño,

- sexo del niño,

- momento de almacenamiento de la preparación,

- informaciones para el tratamiento de la preparación,

- grupo sanguíneo de la preparación,

- tipo de CPH de la preparación,

- número de células (CNT) de la preparación,

- número de células (CD34+) de la preparación,

- estado de virus de la preparación y/o

- expresiones alélicas de la preparación,

- preajuste de los criterios de orden que comprenden:

- nombre e identificación de la clínica o del centro de trasplantes,

- nombre del coordinador y del médico a cargo del caso con datos de contacto,

- estado de la clínica en relación con certificaciones internacionales (por ejemplo Fact),

- cantidad promedio de trasplantes de SCU en la clínica consultante en los últimos tres años,

- nombre del paciente, número del seguro y otros datos de contabilidad,

- anamnesis del paciente,

- indicación y propuesta de terapia del médico a cargo del caso,

- urgencia según clasificación definida,

- tipo de CPH del paciente,

- grupo sanguíneo del paciente,

- peso del paciente,

- etnia del paciente,

- sexo del paciente,

- edad del paciente,

- expresiones alélicas conocidas del paciente y/o datos de un tipado de ADN y/o

- primer tratamiento o tratamiento de repetición,

- búsqueda de paciente, comprendiendo la búsqueda de paciente un establecimiento de preparaciones compatibles con el paciente de manera correspondiente a los criterios de orden, comparándose los datos de un paciente con los datos almacenados en un banco de datos de SCU de la preparación y proporcionándose información acerca de si la preparación es compatible con el paciente,

- encargo de una preparación de sangre de cordón umbilical y

- seguimiento posterior que comprende la detección y el registro del desarrollo del trasplante en el banco de datos de SCU, seleccionado del grupo que comprende arraigo del trasplante, duración hasta la funcionalidad del trasplante y/o posibles reacciones de rechazo,

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2009/006053.

Solicitante: Cytolon AG.

Nacionalidad solicitante: Alemania.

Dirección: Am Karlsbad 15 10785 Berlin ALEMANIA.

Inventor/es: KLEIN, THOMAS, KELLER, FRANK.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • SECCION G — FISICA > COMPUTO; CALCULO; CONTEO > TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores... > G06F19/00 (Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas (G06F 17/00  tiene preferencia; sistema o métodos de procesamiento de datos especialmente adaptados para propósitos administrativos, comerciales, financieros, de gestión, supervisión o predicción G06Q))

PDF original: ES-2477883_T3.pdf

 

google+ twitter facebook

Fragmento de la descripción:

E09778014

DESCRIPCIÓN

Sistema automatizado para la selección y provisión de células biológicas alógenas almacenadas para trasplante, terapia e investigación La invención se refiere a un sistema para proporiconar de manera automática, rápida y dinámica células biológicas para el trasplante, la terapia o fines de investigación entre centros de extracción o bancos (depósitos) y clínicas, centros de trasplantes o instalaciones de investigación así como la supervisión y el respaldo de los procesos de la transmisión de solicitud de la entrega de una preparación celular adecuada para el trasplante alógeno pasando por la aplicación de las preparaciones provistas hasta el seguimiento posterior de los resultados en el paciente y la facilitación de estos datos con fines estadísticos y otros. El sistema está en disposición de proponer por primera vez, en línea y automáticamente, propuestas completas de solución para trasplantes almacenados específicamente.

En los últimos años se han perfeccionado distintos procedimientos y métodos para proveer preparaciones de sangre de cordón umbilical (SCU) entre centros de extracción o bancos de sangre de cordón umbilical por un lado y las clínicas o los centros de trasplantes por otro lado. Todos los procedimientos y métodos tienen su origen en los procesos que se requieren para la provisión de médula ósea. Hasta ahora no existen procesos automatizados. Una clínica que necesita para un paciente/receptor una preparación de SCU para el trasplante consulta en registros si tienen una preparación de SCU pertinente correspondientemente a distintas características y médicas para su paciente. Los datos registrados se refieren a la denominada correspondencia de CPH, al número de células existente en la preparación y otros datos médicos o biológicos (por ejemplo, grupo sanguíneo) .

Las clínicas y los centros de trasplantes tienen los denominados coordinadores que llevan a cabo la selección de un trasplante de SCU mediante los datos transmitidos. Estos coordinadores proponen al médico a cargo del caso una selección de preparaciones. El médico decide si y qué trasplante es empleado. Para que las clínicas puedan encargar la unidad correcta de sangre de cordón umbilical, la clínica tiene que consultar para cada preparación todos los datos esenciales acerca de la respectiva preparación. Para las informaciones que están almacenadas en un denominado informe de unidad, sin embargo, hasta ahora no se ha definido ningún estándar a nivel mundial. Hasta ahora tampoco se ha registrado la correlación entre sí de los datos de preparaciones individuales. Los coordinadores están sometidos durante la selección de las preparaciones a un proceso iterativo que requiere tiempo y está afectado por errores.

Este problema se intensifica debido a que muchas preparaciones de SCU almacenadas que serían pertinentes, por ejemplo, según la correspondencia de CPH, son demasiado pequeñas para el trasplante, es decir, el número de células de la preparación es demasiado reducido. La investigación clínica de los últimos cinco años ha demostrado que la cantidad de las células nucleadas (TC) contenidas en la sangre de cordón umbilical y, en menor grado, las denominadas células CD34+ (tienen la capacidad de formar sangre) son de importancia decisiva para el éxito del trasplante. La pertinencia genética (correspondencia de CPH) con un gran número de células puede ser sustancialmente menor que, comparativamente, la correspondencia necesaria de CPH en trasplantes de médula ósea. Los números de células requeridos y su correlación con la correspondencia de CPH ciertamente están descritos en el estado de la técnica, pero todavía no se han incluido sistemáticamente en los procedimientos establecidos. Actualmente, los coordinadores y los bancos de cordón umbilical tienen la tarea de identificar preparaciones pertinentes entre sí en exámenes individuales y compararlas con los datos de los pacientes. Esto es tanto más complicado cuanto que las preparaciones en cuestión, la mayoría de las veces, están distribuidas en varios bancos y están descritas con distintos procedimientos y estándares.

En el estado de la técnica, por ejemplo, el documento US 2002/0132343 A1, se desvela que para el tratamiento exitoso de pacientes (con leucemia, etc.) con preparaciones pertinentes de sangre de cordón umbilical es necesario un elevado número de células y una calidad de producto elevada/garantizada (incluyendo certificación de FDA, etc.) y que las mismas adicionalmente se puedan poner a disposición para el uso sencillo y directo en la clínica de trasplantes. Se describe un sistema global (SCBS) para células madre expandidas y "con correspondencia" (no solo sangre de cordón umbilical) que comprende todo el ciclo de vida y de producción (obtención de material fuente, producción, aseguramiento certificado de la calidad y suministro) . El sistema global cumple los requisitos y los estándares de calidad reguladores de acuerdo con FDA etc., tales como: FACT, CGTP, AAB y de una reserva existente (alógena) de sangre de cordón umbilical se seleccionó una preparación que es pertinente en relación con el tejido del paciente (correspondencia) . El documento US 2002/0132343 A1 describe que los métodos conocidos para el tipado (tipado de CPH de al menos seis loci) de las células del donante y del paciente se han de emplear cumpliendo los estándares reguladores. Adicionalmente se describe que se puede emplear un sistema automatizado de trazabilidad para seguir las preparaciones/muestras individuales así como para el seguimiento posterior. Las células de donante (material fuente) proceden de una fuente certificada (banco de sangre de cordón umbilical) que registra las informaciones relevantes (por ejemplo CNT, loci de CPH, cantidad de células CD34+) por muestra de manera correspondiente a los estándares de calidad. Según el documento US 2002/0132343 A1 se prepara el material fuente, de tal manera que solamente se pueden continuar procesando las células relevantes y las células deseadas (por ejemplo, células CD34+) se expanden ex vivo. Los productos de células madre producidos de este modo se terminan para su uso como "kit de tratamiento de paciente". A este respecto incluyen una característica definida y se pueden usar directamente por el médico a cargo del caso. Un producto de SCBS encargado se

E09778014

corresponde con al menos 4/6 antígenos o 3/6 alelos con 2*107 células/kg en niños (ï?12 años) o pacientes con ï?50 kg de peso corporal así como 1*107 células/kg de peso corporal en todos los demás pacientes. El documento US 2002/0132343 A1 describe como elemento central la capacidad del suministro directo de los productos de SCBS a los centros de trasplantes que han encargado el producto. Para esto, los productos de SCBS se envasan en recipientes especiales que se despachan a través de servicios de mensajería. A este respecto se conservan los estándares de calidad. El sistema de SCBS descrito y los métodos no consideran la problemática de la selección automatizada de preparaciones adecuadas. Se describe el estado actual de la técnica para la selección manual de preparaciones de células madre (coincidencia de CPH, correlación de número de células/peso, etc.) . El documento US 2002/0132343 A1 no muestra cómo se puede reducir el tiempo necesario para la identificación de material adecuado de donante o cómo se pueden automatizar las etapas manuales necesarias para la selección entre varias preparaciones potencialmente adecuadas.

Además, el documento US 2002/0168639 A1 desvela que debido al rendimiento limitado de los aparatos de análisis es difícil comparar una muestra de tejido con una pluralidad de muestras comparativas.... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

E09778014

1. Procedimiento implementado por ordenador para la selección de una preparación de sangre de cordón umbilical adecuada para el trasplante alógeno, caracterizado por que el procedimiento comprende:

- tratamiento de datos, que comprende la detección y el registro de características físicas y de información de las preparaciones de sangre de cordón umbilical en un banco de datos, que comprende:

- nombre e identificación del banco de sangre de cordón umbilical (banco de SCU) de almacenamiento, -estado del banco de SCU de almacenamiento en relación con certificaciones internacionales, -fiabilidad de la tramitación del banco de SCU según la clasificación, -interlocutor en el respectivo banco con datos de contacto, -número de identificación de la preparación, -anamnesis de la madre, del niño y de la familia de acuerdo con formularios de anamnesis del hospital del nacimiento, -etnia de la madre, del padre y/o del niño, -sexo del niño, -momento de almacenamiento de la preparación, -informaciones para el tratamiento de la preparación, -grupo sanguíneo de la preparación, -tipo de CPH de la preparación, -número de células (CNT) de la preparación, -número de células (CD34+) de la preparación, -estado de virus de la preparación y/o -expresiones alélicas de la preparación, -preajuste de los criterios de orden que comprenden:

- nombre e identificación de la clínica o del centro de trasplantes, -nombre del coordinador y del médico a cargo del caso con datos de contacto, -estado de la clínica en relación con certificaciones internacionales (por ejemplo Fact) , -cantidad promedio de trasplantes de SCU en la clínica consultante en los últimos tres años, -nombre del paciente, número del seguro y otros datos de contabilidad, -anamnesis del paciente, -indicación y propuesta de terapia del médico a cargo del caso, -urgencia según clasificación definida, -tipo de CPH del paciente, -grupo sanguíneo del paciente, -peso del paciente, -etnia del paciente, -sexo del paciente, -edad del paciente, -expresiones alélicas conocidas del paciente y/o datos de un tipado de ADN y/o -primer tratamiento o tratamiento de repetición, 45 -búsqueda de paciente, comprendiendo la búsqueda de paciente un establecimiento de preparaciones compatibles con el paciente de manera correspondiente a los criterios de orden, comparándose los datos de un paciente con los datos almacenados en un banco de datos de SCU de la preparación y proporcionándose información acerca de si la preparación es compatible con el paciente, -encargo de una preparación de sangre de cordón umbilical y -seguimiento posterior que comprende la detección y el registro del desarrollo del trasplante en el banco de datos de SCU, seleccionado del grupo que comprende arraigo del trasplante, duración hasta la funcionalidad del trasplante y/o posibles reacciones de rechazo, 55 ordenándose y seleccionándose las potenciales preparaciones de cordón umbilical según una correspondencia de CPH, un peso del paciente, una cantidad de las células nucleadas (CNT) y una cantidad de las células hematopoyéticas (CD34+) , excluyéndose preparaciones en las que menos del 75 % de las células CD34+ han sobrevivido o se han activado en un experimento de ensayo de colonias, habiéndose establecido del siguiente modo el orden de las potenciales preparaciones de cordón umbilical:

- creación de una lista larga de preparaciones por un nivel de correspondencia (NCprep) correspondiente a las coincidencias de CPH entre preparación y paciente y compatibilidad de grupos sanguíneos, donde 65 6:

** (Ver fórmula) **

CPHprep y CPHpat se corresponden en 6 de 6 valores y compatibilidad de grupos sanguíneos NCprep := 5: CPHprep y CPHpat se corresponden en 5 de 6 valores y compatibilidad de grupos sanguíneos 18

E09778014

4: CPHprep y CPHpat se corresponden en 4 de 6 valores y compatibilidad de grupos sanguíneos, excluyéndose de la lista larga las preparaciones en las que coinciden menos de 4 de 6 tipados de CPH, -creación de una lista corta (LCsencillo) , donde y realizándose el orden de las preparaciones en la lista corta según orden 1 u orden 2, donde NCp1> NCp2 15 Orden 1 (LC) :=

** (Ver fórmula) **

p1ï?LC, p2ï?LC o NCp1 = NCp2 ï NOp1 > NOp2

o NCp1 = NCp2 ï NOp1 = NOp2 ï CD34p1 ï³ CD34p2

** (Ver fórmula) **

NOp1> NOp2 20 Orden 2 (LC) :=

** (Ver fórmula) **

p1ï?LC, p2ï?LC o NOp1 = NOp2 ï NCp1 > NCp2

o NOp1 = NOp2 ï NCp1 = NCp2 ï CD34+ p1 ï³ CD34+ p2

donde Prep = preparación de sangre de cordón umbilical Pat = paciente CPHpat = valores de CPH del paciente CPHprep = valores de CPH de una preparación CNTprep = cantidad de las células nucleadas de una preparación PCpat = peso corporal del paciente en kg CD34+prep = cantidad de las células CD34+ de una preparación NCprep = nivel de correspondencia correspondiente a la coincidencia de CPH entre preparación y paciente FCprep = el factor celular define el número de células necesario por kg de peso corporal con un nivel de correspondencia correspondiente NOprep = número de orden de una preparación con el que se pueden ordenar las preparaciones de manera correspondiente a CNT y nivel de correspondencia LCsencillo = lista corta de las preparaciones a tener en cuenta para trasplantes sencillos Orden 1 = alineación primero según nivel de correspondencia, después según número de orden, después según CD34+

Orden 2 = alineación primero según número de orden, después según nivel de correspondencia, después según CD34+.

2. Procedimiento implementado por ordenador según la reivindicación 1, caracterizado por que se recurre a los siguientes criterios de orden y/o criterios de exclusión:

-preparaciones con un número de células CD34+ superior al 10 % del número de células CNT, -exclusión de preparaciones en las que en el EC (ensayo de colonias) han sobrevivido o se han activado menos del 75 % de las células CD34+, -identidad de grupo sanguíneo, 50 -identidad étnica, -sexo, -edad de la preparación, -estándar de acreditación y/o -ranking del banco de SCU.

3. Procedimiento implementado por ordenador de acuerdo con una de las reivindicaciones anteriores, caracterizado por que el procedimiento se emplea para la provisión de trasplantes dobles o múltiples (multicordón) .

4. Procedimiento implementado por ordenador de acuerdo con la reivindicación anterior, caracterizado por que la 60 selección de las preparaciones multicordón se realiza según los siguientes criterios de orden:

E09778014

NCP1P2 = Compatibilidad de 2 preparaciones entre sí:

** (Ver fórmula) **

6: CPHprep1 y CPHprep2 se corresponden en 6 de 6 valores y compatibilidad de grupos sanguíneos 5: CPHprep1 y CPHprep2 se corresponden en 5 de 6 valores y compatibilidad de grupos sanguíneos NCP1P2 := 4: CPHprep1 y CPHprep2 se corresponden en 4 de 6 valores y compatibilidad de grupos sanguíneos Preparación no se tiene en cuenta: resto LBmulti = lista básica para establecer la lista de selección para preparaciones múltiples

** (Ver fórmula) **

LCmulti = lista corta de las preparaciones a tener en cuenta para trasplantes múltiples

** (Ver fórmula) **

5. Procedimiento implementado por ordenador de acuerdo con una o varias de las reivindicaciones anteriores, caracterizado por que el procedimiento comprende la coordinación entre clínica, centro de trasplantes y médico a cargo del caso.

6. Procedimiento implementado por ordenador de acuerdo con una o varias de las reivindicaciones anteriores, caracterizado por que el procedimiento se usa para la selección automática y completa de trasplantes de cordón 20 único o multicordón.

7. Procedimiento implementado por ordenador de acuerdo con una o varias de las reivindicaciones anteriores, caracterizado por que el procedimiento para la representación de los resultados obtenidos a través de los criterios de búsqueda usa una matriz y representa visualmente los resultados.

8. Procedimiento implementado por ordenador de acuerdo con una o varias de las reivindicaciones anteriores, caracterizado por que el procedimiento se usa para la valoración del estado del establecimiento de criterios de orden mediante estadísticas acerca de los costes esperados y el tiempo necesario.