SELECCION RACIONAL DE PEPTIDOS PUTATIVOS PROCEDENTES DE SECUENCIAS NUCLEOTIDAS O PEPTIDICAS IDENTIFICADAS.

Método de identificación de precursores de un péptido que comprenden un extremo C-terminal amidado

, que comprende las siguiente etapas: - Extracción de secuencias automatizadas de una fuente pública; - Análisis de los ficheros e importación de los datos en ORACLETM, - Selección de las secuencias a partir de un subconjunto o a partir del banco de datos entero; - Búsqueda de los precursores de un péptido que comprende un extremo C-terminal amidado utilizando la secuencia Y1-Y2-Y3-Y4-Y5 en la cuál Y1 es una secuencia nucleotídica de 1 a 12 nucleótidos o Y1 se suprime, Y2 es un codón para Gly, Y3 e Y4 independientemente son codones para Arg o Lys e Y5 es una secuencia nucleotídica de 1 a 21 nucleótidos o Y5 se suprime; - Verificación de la ausencia de todo codón de DETENCIÓN entre el codón AUG que indica el inicio del marco de lectura y el resto buscado e identificación de dichas secuencias; - Verificación; si se encuentra, el resto es un marco de lectura abierto del tipo de secuenciaconsensus Kozak; - Comparación del medio del emplazamiento del resto con el requerido por búsqueda de estructuras secundarias requeridas alrededor de un sitio de maduración tal como la proximidad de hélices alfa o de hojas beta; - Verificación de la presencia de una semejanza de las secuencias y de otras secuencias conocidas. - 25 -

Tipo: Resumen de patente/invención.

Solicitante: SOCIETE DE CONSEILS DE RECHERCHES ET D'APPLICATIONS SCIENTIFIQUES ( S.C.R.A.S.)
CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CNRS).

Nacionalidad solicitante: Francia.

Dirección: 51/53 RUE DU DOCTEUR BLANCHE,75016 PARIS.

Inventor/es: THURIEAU, CHRISTOPHE, MARTINEZ, JEAN, GOZE, CATHERINE, RESIDENCE CH TEAU D\'ALCO, CAMARA Y FERRER,JOSE-ANTONIO, BERGE,GILBERT.

Fecha de Publicación: .

Fecha Concesión Europea: 8 de Agosto de 2007.

Clasificación PCT:

  • SECCION C — QUIMICA; METALURGIA > BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE;... > PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS... > Procesos de medida, investigación o análisis en... > C12Q1/68 (en los que intervienen ácidos nucleicos)
  • SECCION C — QUIMICA; METALURGIA > BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE;... > MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS... > Técnicas de mutación o de ingeniería genética;... > C12N15/10 (Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34))
  • SECCION G — FISICA > COMPUTO; CALCULO; CONTEO > TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores... > Equipo o métodos de tratamiento de datos o de cálculo... > G06F17/30 (Recuperación de la información; Estructura de bases de datos a este efecto)
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