Complementos de medio y métodos para cultivar microorganismos anaerobios gastrointestinales humanos.

Un método para preparar un complemento de medio para cultivar bacterias anaerobias,

en el que dicho método comprende las etapas de:

a) cultivar un ecosistema bacteriano diana en medio de cultivo en un quimiostato de fase única en condiciones de un tiempo de retención del sistema de aproximadamente 20 a aproximadamente 70 horas, una temperatura de aproximadamente 37 ºC, un pH de aproximadamente 6,9 a 7 y mantenimiento de las condiciones anaerobias en el quimiostato;

b) recoger el efluente del quimiostato; y

c) filtrar el efluente a través de un filtro de 0,2 μm para eliminar las células bacterianas, a fin de producir el complemento de medio,

en el que el medio de cultivo comprende peptona al 0,4 % p/v; extracto de levadura al 0,4 % p/v; NaHCO3 al 0,4 % p/v; pectina al 0,4 % p/v; xilano al 0,4 % p/v; Arabinogalactano al 0,4 % p/v; caseína al 0,6 % p/v; almidón de trigo no modificado al 1 % p/v; inulina al 0,2 % p/v; sales biliares al 0,1 % p/v; L-cisteína HCl al 0,1 % p/v; p/v CaCl2 al 0,0002 %; NaCl al 0,0002 % p/v; K2HPO4 al 0,0008 % p/v; KH2PO4 al 0,0008 % p/v; MgSO4 al 0,0002 % p/v; Hemina al 0,0001 % p/v; y menadiona al 0,00002 % p/v, y en el que el ecosistema bacteriano diana comprende:

(a) Acidaminococcus intestinalis, Bacteroides ovatus, Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium longum, Blautia producta, Clostridium cocleatum, Collinsella aerofaciens, Dorea longicatena, Escherichia coli, Eubacterium desmolans, Eubacterium eligens, Eubacterium limosum, Eubacterium rectale, Eubacterium ventriosum, Faecalibacterium prausnitzii, Lachnospira pectinoshiza, Lactobacillus casei/paracasei, Lactobacillus casei, Parabacteroides distasonis, Raoultella sp., Roseburia faecalis, Roseburia intestinalis, Ruminococcus torques, Ruminococcus obeum, y Streptococcus mitis;

(b) Acetobacterium sp., Acidaminococcus intestinalis, Anaerostipes hadrus, Atopobium minutum, Bacteroides fragilis, Bacteroides ovatus, Bacteroides vulgatus, Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium longum, Blautia coccoides, Blautia producta, Clostridium aldenense, Clostridium citroniae, Clostridium cocleatum, Clostridium hathewayi, Clostridium lactatifermentans, Clostridium orbiscindens, Collinsella aerofaciens, Dorea longicatena, Escherichia coli, Eubacterium desmolans, Eubacterium eligens, Eubacterium fissicatena, Eubacterium limosum, Eubacterium rectale, Eubacterium sp., Eubacterium ventriosum, Faecalibacterium prausnitzii, Lachnospira pectinoshiza, Lactobacillus casei, Lactobacillus paracasei, Parabacteroides distasonis, Raoultella sp., Roseburia faecalis, Roseburia hominis, Roseburia intestinalis, Roseburia inulinivorans, Ruminococcus torques, Ruminococcus obeum, y Streptococcus mitis;

(c) Adlercreutzia equolifaciens, Akkermansia muciniphila, Alistipes finegoldii, Alistipes putredinis, Alistipes shahii, Alistipes sp., Bacteroides capillosus, Bacteroides cellulosilyticus, Bacteroides eggerthii, Bacteroides ovatus, Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides uniformis, Bacteroides vulgatus, Bacillus circulans, Bacillus simplex, Bifidobacterium longum, Blautia hydrogenotrophica, Blautia sp., Blautia/Clostridium coccoides, Brevibacillus parabrevis, Catabacter hongkongensis, Catabacter sp., Catenibacterium mitsuokai, Clostridium aldenense 1, Clostridium aldenense 2, Clostridium asparagiforme, Clostridium bolteae, Clostridium celerecrescens, Clostridium hathewayi 1, Clostridium hathewayi 2, Clostridium hathewayi 3, Clostridium hathewayi 4, Clostridium hylemonae 1, Clostridium hylemonae 2, Clostridium inocuum, Clostridium lavalense, Clostridium leptum, Clostridium orbiscindens, Clostridium ramosum, Clostridium scindens, Clostridium staminisolvens, Clostridium sulfatireducens, Clostridium symbiosum, Clostridium thermocellum, Clostridium sp. 1, Clostridium sp. 2, Clostridium sp. 3, Clostridium sp. 4, Clostridium sp. 5, Clostridium sp. 6, Collinsella aerofaciens, Coprococcus catus, Coprococcus comes, Coprococcus eutactus, Dorea formicigenerans, Dorea longicatena, Escherichia coli, Eubacterium biforme, Eubacterium callanderi, Eubacterium dolichum, Eubacterium eligens, Eubacterium fissicatena, Eubacterium limosum, Eubacterium rectale, Eubacterium siraeum, Eubacterium ventriosum, Eubacterium xylanophilum 1, Eubacterium xylanophilum 2, Eubacterium sp., Faecalibacterium prausnitzii, Gemmiger/Subdoligranulum formicilis/variabile 1, Gemmiger/Subdoligranulum formicilis/variabile 2, Holdemania filiformis, Microbacterium schleiferi, Micrococcus luteus, Odoribacter splanchnicus, Oscillibacter valericigenes, Oscillibacter sp., Parabacteroides gordonii, Parabacteroides merdae, Parasutterella excrementihominis, Phascolarctobacterium sp., Roseburiafaecalis 1, Roseburia faecalis 2, Roseburia hominis, Roseburia intestinalis, Roseburia sp., Ruminococcus albus, Ruminococcus bromii 1, Ruminococcus bromii 2, Ruminococcus lactaris, Ruminococcus luti, Ruminococcus obeum, Ruminococcus torquves 1, Ruminococcus torques 2, Ruminococcus torques 3, Ruminococcus torques 4, Ruminococcus torques 5, Ruminococcus sp. 1, Ruminococcus sp. 2, Ruminococcus sp. 3, Staphylococcus epidermidis, Streptococcus mitis, Streptococcus thermophilus, Synergistes sp., y Turicibacter sanguinis; o

(d) una comunidad de cepas bacterianas que representa un enterotipo de intestino humano, en donde el enterotipo es el enterotipo Bacteroides, Prevotella o Ruminococcus.