Un método para pronosticar el cáncer de próstata en una muestra biológica de un paciente que comprende:

(a)evaluar la cantidad de ARNm de PCA3 específico del cáncer de próstata y la cantidad de PSA en dicha muestra biológica;

(b)determinar un valor de la razón entre dicha cantidad de ARNm de PCA3 específico del cáncer de próstata y dicha cantidad de PSA; y

(c)comparar dicho valor de la razón con al menos un valor umbral predeterminado,

en donde un valor de la razón superior a dicho valor umbral predeterminado, es indicativo de mayor riesgo de mortalidad por cáncer de próstata, que comparado con un valor de la razón inferior a dicho valor umbral predeterminado

Razones de ARNm en sedimentos urinarios y/o orina como pronóstico y/o marcador para el tratamiento y el diagnóstico de cáncer de próstata.

Campo de la invención

La presente invención se refiere, en general, al cáncer de próstata. Más específicamente, la presente invención se refiere no sólo a un método para detectar el cáncer de próstata sino también para pronosticarlo y determinar el estadio del mismo. La presente invención se refiere a la estadificación y el pronóstico del cáncer de próstata, determinando en una muestra de un paciente la razón entre los ARNm expresados en sedimentos urinarios de pacientes. La invención se refiere adicionalmente al uso de las razones entre los ARNm prostáticos como un marcador para el tratamiento y el diagnóstico del cáncer de próstata.

Antecedentes de la invención

A lo largo de la última década, el cáncer de próstata se ha vuelto el cáncer diagnosticado con mayor frecuencia entre los varones y la segunda causa principal de muerte masculina por cáncer, en la población occidental, después del cáncer de pulmón (Landis y col., 1998, CA Cancer J. Clin. 48(1):6-29). De todos los cánceres, la incidencia del cáncer de próstata se incrementa mucho más rápido con la edad. Como la longevidad se está incrementando entre la población occidental, continúa habiendo un aumento correspondiente en el número de cánceres de próstata, con un aumento esperado del 60%, solamente en esta década. La mortalidad se ha incrementado con una tasa más lenta, pero globalmente se ha duplicado en los últimos 50 años. Aunque la enfermedad se diagnostica típicamente en hombres con una edad superior a 65, su impacto sigue siendo significativo porque la esperanza de vida media de un hombre que muere por cáncer de próstata, se reduce en 9-10 años. Si se ha descubierto, el cáncer de próstata temprano se puede curar ahora quirúrgicamente en aproximadamente el 90% de los casos. Sin embargo, la enfermedad es lentamente fatal una vez que el tumor se expande fuera del área de la glándula y forma metástasis distantes. La detección precoz y la estadificación correcta tienen, por tanto, una gran importancia para la correcta elección de la terapia y deben mejorar la tasa de éxito de los tratamientos y reducir el índice de mortalidad asociado con el cáncer de próstata.

A pesar de numerosos avances en estos últimos años, la precisión con la que se puede determinar el estadio de una persona que padece cáncer de próstata, sigue siendo mejorable. La razón principal de ello es la falta de ensayos moleculares muy específicos y sensibles para determinar de forma adecuada el estadio y el hecho de que el tumor se expanda más allá de la próstata, es generalmente microscópico más que macroscópico y, por lo tanto, difícil detectar. El examen rectal digital de la próstata ha sido la piedra angular para determinar el estadio local del cáncer de próstata durante muchas décadas, pero a menudo se subestima la extensión de la enfermedad. Los ultrasonidos transrectales, por sí mismos, sólo tienen un valor limitado como medio para determinar el estadio del cáncer de próstata. La tomografía por ordenador y la formación de imágenes por resonancia magnética no han sido generalmente satisfactorias para determinar el estadio del cáncer de próstata (Kirby, 1997, "Prostate Cancer and Prostatic Diseases" 1:2-10). Unas aproximaciones recientes y prometedoras para determinar el estadio del cáncer de próstata, implican el uso de tecnologías bioquímicas y moleculares, centradas en marcadores proteicos o en sus ácidos nucleicos correspondientes que se expresan preferentemente en las células de la próstata (Lange, 1997, en "Principles and Practice of Genitourinary Oncology" compiladores Lippincott-Raven, Ch. 41:417-425).

Los marcadores tumorales se encuentran frecuentemente en una muestra biológica de pacientes con cáncer, en concentraciones elevadas comparados con los de personas sanas. Estos marcadores son frecuentemente proteínas o ácidos nucleicos que codifican tales proteínas. Los marcadores tumorales también pueden ser moléculas de ácido nucleico no codificadoras. A veces tienen el potencial de ser útiles para determinar el estadio, vigilar y realizar un seguimiento de los pacientes con tumor.

El cambio de nivel del marcador tumoral, así como su valor comparado con una persona sana promedio, tiene el potencial de ser utilizado para vigilar la terapia del cáncer. Una subida persistente o un valor superior a un umbral definido, puede ser indicativo de un cáncer recurrente o de un estadio concreto del cáncer. En algunos casos, los marcadores tumorales también se pueden utilizar para detectar las personas sospechosas de tener cáncer, estando frecuentemente dichos marcadores tumorales en un número elevado, antes de la aparición de cualquier prueba clínica de la enfermedad.

La identificación de los marcadores o de los antígenos tumorales asociados con el cáncer de próstata, ha estimulado un interés considerable debido a su uso en la detección, el diagnóstico, el pronóstico, la gestión clínica y el tratamiento potencial del cáncer de próstata. De hecho, pacientes con la enfermedad confinada localmente, se pueden curar frecuentemente mediante prostatectomía radical o terapia de radiación, pero para pacientes con una enfermedad extendida de forma distante, no hay un tratamiento curativo disponible. Esto acentúa la necesidad de nuevas dianas terapéuticas específicas para la próstata (cáncer). Se han descrito distintos genes que se expresan específicamente en la próstata, p. ej., PSA (Sokoll y col., 1997, "Prostate-specific antigen. Its discovery and biochemical characteristics". Urol. Clin. North. Am. 24:253-259), el antígeno de la membrana específico de la próstata (PSM: Fair y col., 1997, "Prostatete-specific membrane antigen". Prostate 32:140-148), el antígeno de células pluripotenciales de la próstata (Reiter y col., 1998. "Prostate stem cell antigen: a cell surface marker overexpressed in prostate cancer". Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:1735-1740), TMPRSS2 (Lin y col., 1999. "Prostate-localized and androgen-regulated expression of the membrane-bound serine protease TMPRSS2". Cancer Res. 59:4180-4184), PDEF (Oettgen y col., 2000. "PDEF, a novel prostate epithelium-specific ets transcription factor, interacts with the androgen receptor and activates prostate-specific antigen gene expression". J. Biol. Chem. 275:1216-1225), el gen-1 específico de la próstata (Herness, 2003. "A novel human prostate-specific gene-1 (HPG-1): molecular cloning, sequencing, and its potencial involvement in prostate carcinogenesis". Cancer Res. 63:329-336), e incluso algunos ARN no codificantes (ncARN), tales como PCA3 (Bussemakers y col., 1999. "DD3: a new prostate-specific gene, highly overexpressed in prostate cancer" [Cancer Res. 59:5975-5979], documentos de patentes WO98/045420, WO01/0235, WO2004/070056, WO2005/003387), PCGEM1 (Srikantan y col., 2000. "PCGEM1, a prostate-specific gene, is overexpressed in prostate cancer". Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97:12216-12221) y la agrupación de los genes P704P, P712P y P775P (Stolk y col. 2004. P704P, P712P y P775P: "A genomic cluster of prostate-specific genes". Prostate 60:214-226). Solamente una fracción de estos genes se ha asociado con el pronóstico, la progresión y/o la capacidad metastásica del cáncer de próstata y con potencial para ser dianas terapéuticas valiosas. Los marcadores tumorales de la próstata más conocidos, utilizados para la vigilancia, el seguimiento, la supervisión y la elección de la terapia para el cáncer de próstata, son el antígeno PSA (antígeno específico de la próstata) y el antígeno PSM (membrana específica de la próstata).

PSA es una proteasa de serina codificada por el gen PSA situado en el cromosoma 19. Esta glicoproteína se expresa bajo control andrógeno en las células epiteliales glandulares de la próstata y es secretada en el plasma seminal para licuarla. La proteína PSA está confinada normalmente en la próstata, pero en el caso de enfermedad prostática, tal como cáncer o BPH (hiperplasia benigna de la próstata), la PSA se filtra a la sangre en donde está presente en diferentes formas, incluyendo una forma que está unida a complejos proteicos y una forma no unida a los mismos (EL-Shirbiny, 1994, Adv. Clin. Chem. 31:99). La medición de las concentraciones totales en suero de PSA es uno de los ensayos bioquímicos empleados más frecuentemente y aprobados por la FDA, para la detección y el tratamiento de pacientes con cáncer de próstata. Los estudios realizados hasta la fecha han sugerido que la detección con PSA, conjuntamente con exámenes rectales digitales y ultrasonidos transrectales,...

1. Un método para pronosticar el cáncer de próstata en una muestra biológica de un paciente que comprende:

en donde un valor de la razón superior a dicho valor umbral predeterminado, es indicativo de mayor riesgo de mortalidad por cáncer de próstata, que comparado con un valor de la razón inferior a dicho valor umbral predeterminado.

2. El método según la reivindicación 1, en donde dicha muestra biológica se selecciona entre el grupo consistente en: orina, resecciones del tejido de la próstata, biopsias del tejido de la próstata, semen o lavados vesicales.

3. El método según la reivindicación 2, en donde dicha muestra biológica es una muestra de orina obtenida después de un examen rectal digital.

4. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en donde dicha cantidad de PSA es la cantidad de ARNm de PSA.

5. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende:

en donde un valor de la razón superior a dicho valor umbral predeterminado es indicativo de la presencia de un cáncer de próstata más agresivo, que comparado con un valor de la razón inferior a dicho valor umbral predeterminado que es indicativo de la presencia de un cáncer de próstata menos agresivo.

6. Un método para determinar el volumen tumoral de un cáncer de próstata en una muestra biológica que comprende:

en donde un valor de la razón superior a dicho valor umbral predeterminado, es indicativo de un volumen tumoral mayor del cáncer de próstata, que comparado con un valor de la razón inferior a dicho valor umbral predeterminado.

7. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, que comprende:

en donde un valor superior de la razón en la etapa (b) comparado con el valor de la razón obtenido en la etapa (c), es indicativo de la progresión del cáncer de próstata y de un volumen tumoral mayor a lo largo del tiempo.

8. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, que comprende:

en donde un valor de la razón superior en la etapa (e) comparado con el valor de la razón obtenido en la etapa (d), es indicativo de la progresión del cáncer de próstata a lo largo del tiempo.

9. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, en donde se utiliza una reacción de amplificación para determinar la cantidad de ácido nucleico de PCA3 específico del cáncer de próstata.

10. El método según la reivindicación 9, en donde dicha reacción de amplificación se selecciona entre el grupo consistente en:

11. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 5 a 8, en donde la cantidad de dicho ácido nucleico de PCA3 específico del cáncer de próstata y dicho ácido nucleico de PSA se determinan empleando un ensayo de hibridación.

12. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, en donde la cantidad de dicho ácido nucleico de PCA3 específico del cáncer de próstata se evalúa empleando al menos un oligonucleótido que se hibrida con una secuencia de ácido nucleico de PCA3 seleccionada entre el grupo consistente en:

13. El método según la reivindicación 12, en donde la cantidad de dicho PSA se evalúa empleando al menos un oligonucleótido que se hibrida bajo condiciones muy rigurosas con una secuencia de ácido nucleico de PSA seleccionada entre el grupo consistente en:

14. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1, 2, 6, 7 y 12, en donde se evalúa la cantidad de proteína PSA contenida en dicha muestra biológica.

15. El método según la reivindicación 14, en donde se emplea un anticuerpo para evaluar dicha cantidad de proteína PSA.

16. Un método para la estadificación de un cáncer de próstata en una muestra biológica de un paciente que comprende:

en donde un valor de la razón superior a un valor umbral predeterminado, indica un estadio más avanzado del cáncer de próstata que comparado con un valor de la razón inferior a dicho valor umbral predeterminado, determinando de este modo el estadio del cáncer de próstata.

17. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 16, que comprende adicionalmente determinar la puntuación de Gleason de una muestra de la próstata procedente de dicho paciente y correlacionar dicho valor de la razón PCA3/PSA y dicha puntuación de Gleason con un riesgo de mortalidad asociado con dicha enfermedad.

18. El método según la reivindicación 17, en donde dicho valor de la razón PCA3/PSA y dicha puntuación de Gleason se correlacionan con una predicción de la eficacia de un medicamento, las consecuencias para el paciente y/o un pronóstico del riesgo de enfermedad.

19. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 7 y 8, en donde dicha muestra biológica se obtiene a partir de un paciente que está en tratamiento de cáncer de próstata, entre dicho primer momento y dicho momento posterior, vigilando de este modo el efecto de dicho tratamiento sobre el crecimiento tumoral del cáncer o la progresión del cáncer de próstata.

20. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13 y 17 a 19, que comprende:

en donde dicha razón normalizada entre PCA3 y PSA se correlaciona positivamente con un grado o un estadio del cáncer de próstata.

21. El método según la reivindicación 20, en donde dicha razón normalizada es superior a aproximadamente 200 x 10^-3, entre aproximadamente 75 x 10^-3 y aproximadamente 200 x 10^-3, o entre aproximadamente 0 y aproximadamente 75 x 10^-3.

22. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en donde dicho valor umbral se selecciona entre 132 x 10^-3 y 200 x 10^-3.

23. El método según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 18, 20 y 21, que comprende adicionalmente el uso de un valor umbral de 3 ng/ml de proteína PSA sérica.