PROTEINA RECEPTORA DE HEMATOPOYETINA NOVEDOSA, NR10.

ADN aislado seleccionado del grupo que consiste en:

(a) ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO:

2, 4 y 17;

(b) ADN que comprende la región codificante de la secuencia de nucleótidos de cualquiera de SEQ ID NO: 1, 3 y 16;

(c) ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17; en la que de uno o dos a 30 aminoácidos se modifican mediante deleción, adición y/o substitución por otro aminoácido, en el que dicha proteína es funcionalmente equivalente a la proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 como receptor de factor hematopoyético en forma soluble o unida a la membrana;

(d) ADN que codifica para una proteína que tiene una identidad del 70% o superior con la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17, en el que dicha proteína es funcionalmente equivalente a la proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 como receptor de factor hematopoyético en forma soluble o unida a la membrana; y

(e) ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 de la cual se elimina la secuencia señal, en la que la secuencia señal es desde la 1ª Met hasta la 32ª Ala

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/JP00/03556.

Solicitante: CHUGAI RESEARCH INSTITUTE FOR MOLECULAR MEDICINE INC.

Nacionalidad solicitante: Japón.

Dirección: 153-2, NAGAI NIIHARI-MURA,NIIHARI-GUN, IBARAKI 300-41.

Inventor/es: MAEDA,M.,CHUGAI RES. INST. FOR MOLEC. MEDIC. INC, YAGUCHI,NORIKO.

Fecha de Publicación: .

Fecha Concesión Europea: 20 de Enero de 2010.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/715 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › para citoquinas; para linfoquinas; para interferones.

Clasificación PCT:

  • C07K14/715 C07K 14/00 […] › para citoquinas; para linfoquinas; para interferones.
  • C07K16/28 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra receptores, antígenos celulares de superficie o determinantes celulares de superficie.
  • C12N15/12 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas animales.
  • C12N5/10 C12N […] › C12N 5/00 Células no diferenciadas humanas, animales o vegetales, p. ej. líneas celulares; Tejidos; Su cultivo o conservación; Medios de cultivo para este fin (reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00). › Células modificadas por introducción de material genético extraño, p. ej. células transformadas por virus.
  • C12P21/02 C12 […] › C12P PROCESOS DE FERMENTACION O PROCESOS QUE UTILIZAN ENZIMAS PARA LA SINTESIS DE UN COMPUESTO QUIMICO DADO O DE UNA COMPOSICION DADA, O PARA LA SEPARACION DE ISOMEROS OPTICOS A PARTIR DE UNA MEZCLA RACEMICA.C12P 21/00 Preparación de péptidos o de proteínas (proteína monocelular C12N 1/00). › que tienen una secuencia conocida de varios aminoácidos, p. ej. glutation.
  • G01N33/53 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
  • G01N33/566 G01N 33/00 […] › utilizando un soporte específico o proteínas receptoras como reactivos para la formación de uniones por ligando.

Clasificación antigua:

  • C07K14/715 C07K 14/00 […] › para citoquinas; para linfoquinas; para interferones.
  • C07K16/28 C07K 16/00 […] › contra receptores, antígenos celulares de superficie o determinantes celulares de superficie.
  • C12N15/12 C12N 15/00 […] › Genes que codifican proteínas animales.
  • C12N5/10 C12N 5/00 […] › Células modificadas por introducción de material genético extraño, p. ej. células transformadas por virus.
  • C12P21/02 C12P 21/00 […] › que tienen una secuencia conocida de varios aminoácidos, p. ej. glutation.
  • G01N33/53 G01N 33/00 […] › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
  • G01N33/566 G01N 33/00 […] › utilizando un soporte específico o proteínas receptoras como reactivos para la formación de uniones por ligando.

Fragmento de la descripción:

Proteína receptora de hematopoyetina novedosa, NR10.

Campo técnico

La presente invención se refiere a proteínas receptoras de hematopoyetina novedosas, y a genes que las codifican, así como a métodos para producir y usar las mismas.

Antecedentes de la técnica

Se conoce un gran número de citocinas como factores humorales que están implicados en la proliferación/ diferenciación de diversas células y la activación de funciones de células maduras diferenciadas así como la muerte celular. Existen receptores específicos para estas citocinas, que se clasifican en varias familias basándose en sus similitudes estructurales (Hilton D.J., en "Guidebook to Cytokines and Their Receptors" editado por Nicola N.A. (una publicación de Sambrook & Tooze en Oxford University Press), págs. 8-16 (1994)).

Por otro lado, en comparación con las similitudes de sus receptores, la homología de la estructura primaria entre las citocinas es bastante baja. No se ha observado homología de aminoácidos significativa, incluso entre miembros de citocinas que pertenecen a la misma familia de receptores. Esto explica la especificidad funcional de las respectivas citocinas, así como las similitudes entre las reacciones celulares inducidas por cada citocina.

Ejemplos representativos de las familias de receptores mencionadas anteriormente son la familia de receptores de tirosina cinasa, la familia de receptores de hematopoyetina, la familia de receptores del factor de necrosis tumoral (TNF) y la familia de receptores del factor de crecimiento transformante ß (TGF ß). Se ha notificado que diferentes rutas de transducción de señales están implicadas en cada una de estas familias. Entre estas familias de receptores, muchos receptores de la familia de receptores de hematopoyetina, en particular, se expresan en células sanguíneas o inmunocitos, y sus ligandos, las citocinas, se denominan con frecuencia factores hematopoyéticos o interleucinas. Algunos de estos factores hematopoyéticos o interleucinas existen en la sangre y se cree que están implicados en la regulación humoral sistémica de funciones hematopoyéticas o inmunitarias.

Esto contrasta con la creencia de que citocinas que pertenecen a otras familias están implicadas con frecuencia solamente en regulaciones tópicas. Algunas de estas hematopoyetinas pueden considerarse como factores similares a hormona, y hormonas peptídicas representativas, tales como receptores de leptina, prolactina u hormona del crecimiento, también pertenecen a la familia de receptores de hematopoyetina. Debido a estas características reguladoras sistémicas similares a hormona, se anticipa que la administración de estas hematopoyetinas puede aplicarse al tratamiento de diversas enfermedades.

Entre el gran número de citocinas, aquellas que actualmente están aplicándose clínicamente incluyen eritropoyetina, G-CSF, GM-CSF e IL-2. En combinación con IL-11, LIF e IL-12 que actualmente se están considerando para ensayos clínicos, y las hormonas peptídicas mencionadas anteriormente, tales como la hormona del crecimiento y la prolactina, puede preverse que buscando citocinas novedosas que se unen a los receptores de hematopoyetina entre las diversas familias de receptores mencionadas anteriormente, es posible encontrar una citocina que pueda aplicarse clínicamente con una mayor eficacia.

Tal como se mencionó anteriormente, los receptores de citocinas comparten similitudes estructurales entre los miembros de la familia. Usando estas similitudes, muchas investigaciones se dirigen a encontrar receptores novedosos. En particular, ya se han clonado muchos receptores de la familia de receptores de tirosina cinasa, usando su secuencia altamente conservada en el sitio catalítico (Matthews W. et al., Cell, 65 (7): págs. 1143-52 (1991)). En comparación, los receptores de hematopoyetina no tienen un dominio de actividad enzimática similar a tirosina cinasa en sus regiones citoplasmáticas, y se conoce que sus transducciones de señales están mediadas mediante asociaciones con otras proteínas de tirosina cinasa que existen libremente en el citoplasma.

Aunque los sitios en los receptores que se unen con estas tirosina cinasas citoplasmáticas (cinasas JAK) se conservan entre los miembros de la familia, la homología no es muy alta (Murakami. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88: 11349-11353 (1991)). En realidad, la secuencia que mejor caracteriza estos receptores de hematopoyetina existe en la región extracelular. En particular, un motivo de cinco aminoácidos, Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser (en el que "Xaa" es un aminoácido arbitrario), se conserva en casi todos los receptores de hematopoyetina. Por tanto, pueden obtenerse receptores novedosos buscando miembros de la familia novedosos usando esta secuencia.

En realidad, estos enfoques ya han conducido a la identificación del receptor de IL-11 (Robb, L. et al., J. Biol. Chem., 271 (23): 13754-13761 (1996)), el receptor de leptina (Gainsford T. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93 (25): págs. 14564-8 (1996)) y el receptor de IL-13 (Hilton D. J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93 (1): págs. 497-501 (1996)).

Además, pudieron identificarse dos secuencias de EST:

BASE DE DATOS EMBL [en línea] 8 de septiembre de 1998 (08-09-1998), "qa50c06.x1 Soares_NhHMPu_S1 Clon de ADNc de Homo sapiens IMAGE: 1690186 3', secuencia de ARNm". XP002311247 recuperado del número de registro de EBI EM_PRO: AI123586 Número de registro de la base de datos AI123586.

BASE DE DATOS EMBL [en línea] 4 de mayo de 1996 (04-05-1996), "zb93e11.s1 Soares_parathyroid_tumor_NbHPA clon de ADNc de Homo sapiens IMAGE: 320396 3', secuencia de ARNm". XP002311248 recuperado del número de registro de EBI EM_PRO: W16834 Número de registro de la base de datos W16834.

El documento EP 0411946 da a conocer la proteína gp130 humana, idéntica en un 29% a SEQ ID NO: 2.

Descripción de la invención

La presente invención proporciona proteínas receptoras de hematopoyetina novedosas codificadas por un ADN aislado seleccionado del grupo que consiste en:

(a) un ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17;
(b) un ADN que comprende la región codificante de la secuencia de nucleótidos de cualquiera de SEQ ID NO: 1, 3 y 16;
(c) un ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17; en la que de uno o dos a 30 aminoácidos se modifican mediante deleción, adición y/o substitución por otro aminoácido, en el que dicha proteína es funcionalmente equivalente a la proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 como receptor de factor hematopoyético en forma soluble o unida a la membrana;
(d) un ADN que codifica para una proteína que tiene una identidad del 70% o superior con la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17, en el que dicha proteína es funcionalmente equivalente a la proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 como receptor de factor hematopoyético en forma soluble o unida a la membrana; y
(e) un ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 de la cual se elimina la secuencia señal, en la que la secuencia señal es desde la 1ª Met hasta la 32ª Ala.

La presente invención también proporciona un vector dentro del que se ha insertado el ADN. La presente invención también proporciona métodos para seleccionar compuestos que se unen a la proteína de la presente invención.

Inicialmente, los inventores intentaron encontrar un receptor novedoso usando oligonucleótidos que codificaban para el motivo Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser (motivo WS) como la sonda mediante hibridación en placas, método de RT-PCR, etcétera. Sin embargo, era sumamente difícil seleccionar estrictamente sólo aquellos a los que los 15 nucléotidos que codificaba para el motivo se hibridaban completamente en las condiciones de hibridación habituales, porque el oligonucleótido tggag(t/c)nnntggag(t/c) (en el que "n" es un nucleótido arbitrario) que codificaba para el motivo era corto, teniendo tan sólo 15 nucleótidos, y tenía un alto contenido en g/c. Adicionalmente, secuencias similares están contenidas en ADNc que codifica para proteínas diferentes de...

 


Reivindicaciones:

1. ADN aislado seleccionado del grupo que consiste en:

(a) ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17;
(b) ADN que comprende la región codificante de la secuencia de nucleótidos de cualquiera de SEQ ID NO: 1, 3 y 16;
(c) ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17; en la que de uno o dos a 30 aminoácidos se modifican mediante deleción, adición y/o substitución por otro aminoácido, en el que dicha proteína es funcionalmente equivalente a la proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 como receptor de factor hematopoyético en forma soluble o unida a la membrana;
(d) ADN que codifica para una proteína que tiene una identidad del 70% o superior con la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17, en el que dicha proteína es funcionalmente equivalente a la proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 como receptor de factor hematopoyético en forma soluble o unida a la membrana; y
(e) ADN que codifica para una proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NO: 2, 4 y 17 de la cual se elimina la secuencia señal, en la que la secuencia señal es desde la 1ª Met hasta la 32ª Ala.

2. Vector dentro del cual se inserta el ADN descrito en la reivindicación 1.

3. Proteína o péptido que se codifica por el ADN descrito en la reivindicación 1.

4. Método de selección de un compuesto que se une a la proteína de la reivindicación 3, que comprende las etapas de:

(a) poner en contacto una muestra con la proteína de la reivindicación 3 o un péptido parcial de la misma;
(b) detectar la actividad de unión de la muestra con la proteína de la reivindicación 3 o un péptido parcial de la misma; y
(c) seleccionar el uno o más compuestos que se unen a la proteína de la reivindicación 3 o un péptido parcial de la misma.

5. Anticuerpo que se une a la proteína de la reivindicación 3.

6. Método para detectar o medir la proteína de la reivindicación 3, que comprende las etapas de: exponer el anticuerpo de la reivindicación 5 a una muestra que se espera que contenga la proteína de la reivindicación 3; y detectar o medir la producción del inmunocomplejo entre dicho anticuerpo y dicha proteína.


 

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