Inmunización contra Chlamydia trachomatis.

Una proteína para su uso en el tratamiento o la prevención de infección debida a Chlamydia trachomatis,

en laque la proteína es (a) una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos SEC ID 255, (b) una proteína quecomprende una secuencia de aminoácidos que tiene una identidad de secuencia del 50 % o más con la secuenciade aminoácidos de (a), o (c) una proteína que comprende un fragmento de al menos 7 aminoácidos consecutivos deSEC ID 255.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E08075729.

Solicitante: NOVARTIS VACCINES AND DIAGNOSTICS S.R.L..

Nacionalidad solicitante: Italia.

Dirección: VIA FIORENTINA 1 53100 SIENA (SI) ITALIA.

Inventor/es: GRANDI, GUIDO, RATTI, GIULIO.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • A61K38/16 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 38/00 Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00). › Péptidos que tienen más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados.
  • A61K39/118 A61K […] › A61K 39/00 Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53). › Chlamydiaceae, p. ej. Chlamydia trachomatis o Chlamydia psittaci.
  • A61K48/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen material genético que se introduce en las células del cuerpo vivo para tratar enfermedades genéticas; Terapia génica.
  • A61P31/04 A61 […] › A61P ACTIVIDAD TERAPEUTICA ESPECIFICA DE COMPUESTOS QUIMICOS O DE PREPARACIONES MEDICINALES.A61P 31/00 Antiinfecciosos, es decir antibióticos, antisépticos, quimioterápicos. › Agentes antibacterianos.
  • C07K14/295 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de Chlamydiales (O).
  • C12N15/09 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Tecnología del ADN recombinante.
  • G01N33/53 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
  • G01N33/569 G01N 33/00 […] › para microorganismos, p. ej. protozoarios, bacterias, virus.

PDF original: ES-2386386_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Inmunización contra Chlamydia trachomatis

CAMPO TÉCNICO

La presente invención está en el campo de la inmunización contra la infección por clamidia, en particular contra la infección por Chlamydia trachomatis.

TÉCNICA ANTERIOR

Chlamydiae son parásitos intracelulares estrictos de células eucariotas que son responsables de infecciones sexualmente transmitidas endémicas y diversos otros síndromes de enfermedad. Ocupan una rama filogénica eubacteriana exclusiva que no tiene estrecha relación con ningún otro organismo conocido - se clasifican en su propio orden (Chlamydiales) que contiene una única familia (Chlamydiaceae) que a su vez contiene un único género (Chlamydia, también denominado en lo sucesivo Chlamydophila) . Una característica particular de las Chlamydiae es su ciclo vital único, en el que la bacteria alterna entre dos formas morfológicamente distintas: una forma infecciosa extracelular (cuerpos elementales, CE) y una forma no infecciosa intracelular (cuerpos reticulados, CR) . El ciclo vital se completa con la reorganización de CR en CE, que deja la célula huésped alterada lista para infectar más células.

Actualmente se conocen cuatro especies de clamidia - C. trachomatis, C. pneumoniae, C. pecorum y C. psittaci {por ejemplo, refs. 1, 2} - y están disponibles secuencias del genoma {refs. 3 a 9}.

Las serovariantes humanas (“serovares”) de C. trachomatis se dividen en dos biovariantes (“biovares”) . Las serovares A-K provocan infecciones epiteliales, principalmente en el tejido ocular (A-C) o aparato genitourinario (DK) . Las serovares L1, L2 y L3 son los agentes del linfogranuloma venéreo invasivo (LGV) .

Aunque la propia infección por clamidia produce enfermedad, se cree que, en algunos pacientes, la gravedad de los síntomas es en realidad debida a una respuesta inmunitaria huésped anómala. El fallo en eliminar la infección produce estimulación inmunitaria persistente y, en vez de ayudar al huésped, esto produce infección crónica con consecuencias graves que incluyen esterilidad y ceguera {10}. Además, la protección conferida por la infección por clamidia natural es normalmente incompleta, transitoria y específica para cepa.

Debido a la grave naturaleza de la enfermedad, hay un deseo por proporcionar vacunas adecuadas. Éstas pueden ser útiles (a) para la inmunización contra la infección por clamidia o contra enfermedad inducida por clamidia (vacunación profiláctica) o (b) para la erradicación de una infección por clamidia crónica establecida (vacunación terapéutica) . Sin embargo, como es un parásito intracelular, la bacteria puede evadir generalmente respuestas inmunitarias mediadas por anticuerpo.

El documento WO 00/34483 investigó diversos polipéptidos para su eficacia en provocar una respuesta inmunitaria contra infección por Chlamydia y sugirió que podía obtenerse protección específica para SWIB.

Se han descrito diversas proteínas antigénicas para C. trachomatis, y la superficie celular en particular ha sido el objetivo de la investigación detallada {por ejemplo, 1, 11}. Estas incluyen, por ejemplo, pgp3 {12, 13, 14}, MOMP {15, documento WO 95/12411}, Hsp60 (GroEL) {16} y Hsp70 (similar a DnaK) {17}. No todas éstas han demostrado ser vacunas eficaces; sin embargo, un objeto de la invención es identificar antígenos de C. trachomatis que provoquen una respuesta inmunitaria durante la infección natural con el fin de proporcionar antígenos e inmunógenos adecuados para su uso en el desarrollo de vacunas. Otro objeto es identificar antígenos útiles para diagnosticar (por ejemplo, inmunodiagnóstico) C. trachomatis.

DIVULGACIÓN DE LA INVENCIÓN

La referencia 18 desvela diversas proteínas de C. pneumoniae que se verificaron empíricamente como inmunorreactivas, inmunoaccesibles y/o presentes en cuerpos elementales. Estas propiedades de las proteínas no pudieron derivarse de la información de la secuencia genómica. La referencia 18 desvela que estas proteínas pueden usarse en el tratamiento o la prevención de infección debida a bacterias Chlamydia, siendo C. pneumoniae el foco principal. Las proteínas de C. pneumoniae también pueden usarse para tratar o prevenir infección por otras especies de Chlamydia debido a la reactividad cruzada entre especies. C. pneumoniae está estrechamente relacionada con C. trachomatis, como se muestra por las comparaciones del genoma completo {3, 4, 5}.

La presente invención se refiere a la proteína de C. trachomatis CT456 que tiene SEC ID Nº: 255 para su uso en el tratamiento o la prevención de infección debida a bacterias Chlamydia.

Proteínas de C. trachomatis

La invención proporciona una proteína para su uso en el tratamiento o la prevención de infección debida a Chlamydia trachomatis, en la que la proteína es (a) una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos SEC ID 255, (b) una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos que tienen el 50 % o mayor identidad de secuencias con la secuencia de aminoácidos de (a) , o (c) una proteína que comprende un fragmento de al menos 7 aminoácidos consecutivos de SEC ID 255.

Se describen proteínas que comprenden una o más de las secuencias de aminoácidos de número impar SEC ID 1

261. Una proteína hipotética de secuencia SEC ID Nº 255 se desvela en la base de datos Uniprot número de acceso 084462, 16 de octubre de 2001. También se describen proteínas que comprenden secuencias que comparten al menos el x % de identidad de secuencias con una o más de las secuencias de aminoácidos de número impar (SEC ID 1-261) . Dependiendo de la secuencia particular, x es preferentemente el 50 % o más (por ejemplo, 60 %, 70 %, 80 %, 90 %, 95 %, 99 % o más) . Éstas incluyen mutantes y variantes alélicas. Normalmente, el 50 % de identidad o más entre dos proteínas se considera que es una indicación de equivalencia funcional. La identidad entre proteínas se determina preferentemente por la homología del algoritmo de búsqueda de Smith-Waterman como se implementa en el programa MPSRCH (Oxford Molecular) usando una búsqueda de huecos afín con los parámetros penalización por hueco abierto=12 y penalización por extensión de hueco=1.

Adicionalmente se describen proteínas que comprenden fragmentos de secuencias de aminoácidos de número impar SEC ID 1-261. Los fragmentos deben comprender al menos n aminoácidos consecutivos de las secuencias y, dependiendo de la secuencia particular, n es 7 o más (por ejemplo, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 30, 40, 50, 75, 100, 150, 200 o más) . Preferentemente, los fragmentos comprenden uno o más epítopes de la secuencia. Otros fragmentos preferidos omiten un péptido señal.

Las proteínas de la invención pueden prepararse por diversos medios, por ejemplo, por síntesis química (al menos en parte) , digiriendo polipéptidos más largos usando proteasas, por traducción de ARN, por purificación de cultivo celular (por ejemplo, de expresión recombinante o de cultivo de C. trachomatis) , etc. La expresión heteróloga en E. coli es una vía preparativa preferida.

Las proteínas de la invención pueden tomar diversas formas, por ejemplo, nativas, fusiones, glicosiladas, no glicosiladas, lipidadas, etc.

Las proteínas de la invención se preparan preferentemente en forma sustancialmente pura (es decir, sustancialmente libres de otras proteínas de C. trachomatis o de células huésped) .

Las proteínas de la invención pueden unirse a un soporte sólido. Pueden comprender una marca detectable (por ejemplo, una marca radiactiva o fluorescente, o una marca de biotina) .

Ácidos nucleicos de C. trachomatis

La invención proporciona un ácido nucleico para su uso en el tratamiento o la prevención de infección debida a Chlamydia trachomatis, en el que el ácido nucleico es (a) un ácido nucleico que comprende la secuencia de nucleótidos SEC ID 256, (b) un ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótidos que tiene una identidad de secuencia del 50 % o más con la secuencia de nucleótidos de (a) , o (c) un ácido nucleico que comprende un fragmento de al menos 10 nucleótidos consecutivos de SEC ID 256.

Se describen ácidos nucleicos que comprenden una o más de las secuencias de nucleótidos de número par SEC ID 2-262.

También se describen secuencias que comprenden ácidos que comparten al menos el x % de identidad de secuencias con las secuencias... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Una proteína para su uso en el tratamiento o la prevención de infección debida a Chlamydia trachomatis, en la que la proteína es (a) una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos SEC ID 255, (b) una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene una identidad de secuencia del 50 % o más con la secuencia de aminoácidos de (a) , o (c) una proteína que comprende un fragmento de al menos 7 aminoácidos consecutivos de SEC ID 255.

2. Un ácido nucleico para su uso en el tratamiento o la prevención de infección debida a Chlamydia trachomatis, en el que el ácido nucleico es (a) un ácido nucleico que comprende la secuencia de nucleótidos SEC ID 256, (b) un ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótidos que tiene una identidad de secuencia del 50 % o más con la secuencia de nucleótidos de (a) , o (c) un ácido nucleico que comprende un fragmento de al menos 10 nucleótidos consecutivos de SEC ID 256.

3. Una proteína de la reivindicación 1 o un ácido nucleico de la reivindicación 2, en la que el tratamiento o la prevención comprende provocar una respuesta inmunitaria que es específica para un cuerpo elemental de Chlamydia.

4. Una proteína como se define en la reivindicación 1 o un ácido nucleico como se define en la reivindicación 2, en la que el tratamiento o la prevención comprende neutralizar cuerpos elementales de Chlamydia trachomatis.

5. Una composición inmunogénica que comprende una proteína y un adyuvante, en la que la proteína es (a) una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos SEC ID 255, (b) una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene una identidad de secuencia del 50 % o más con la secuencia de aminoácidos de (a) , o (c) una proteína que comprende un fragmento de al menos 7 aminoácidos consecutivos de SEC ID 255.

6. Una composición inmunogénica que comprende un ácido nucleico y un adyuvante, en la que el ácido nucleico es

(a) un ácido nucleico que comprende la secuencia de nucleótidos SEC ID 256, (b) un ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótidos que tiene una identidad de secuencia del 50 % o más con la secuencia de nucleótidos de (a) , o (c) un ácido nucleico que comprende un fragmento de al menos 10 nucleótidos consecutivos de SEC ID

256.

7. La composición de la reivindicación 5 o la reivindicación 6 para su uso como producto farmacéutico.

8. Una composición de la reivindicación 5 o la reivindicación 6, o un anticuerpo que reconoce una proteína como se define en la reivindicación 1 para su uso en un procedimiento de neutralización de infectividad de C. trachomatis en un paciente.

9. Una composición de la reivindicación 5 o la reivindicación 6 para su uso en un procedimiento de inmunización de un paciente contra Chlamydia trachomatis.

10. Una composición de la reivindicación 5 o la reivindicación 6 para su uso en un procedimiento de producción de anticuerpos específicos para cuerpos elementales de Chlamydia trachomatis.

11. Un cuerpo elemental de Chlamydia trachomatis para su uso en un procedimiento de producción de anticuerpos en un paciente que reconocen una proteína como se define en la reivindicación 1.

12. Un procedimiento para detectar un cuerpo elemental de Chlamydia trachomatis en una muestra biológica, que comprende la etapa de poner en contacto la muestra con un anticuerpo que reconoce una proteína como se define en la reivindicación 1.

13. Uso de una proteína como se define en la reivindicación 1 o un ácido nucleico como se define en la reivindicación 2 en la preparación de un medicamento para el tratamiento o la prevención de infección debida a

Chlamydia trachomatis.


 

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