ADN polimerasas mutantes con capacidad mejorada de polimerización activada por pirofosforolisis (PAP).
Sección de la CIP Química y metalurgia
(14/12/2015). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12N9/12.
ADN polimerasa, que comprende R-X1-X2-X3-K-L-X4-X5-X6-Y-X7-X8-X9-X10-X11, en la que: X1 se selecciona de entre el grupo que consiste de E, Q, G, K y T,
X2 es L, I o Y,
X3 se selecciona de entre el grupo que consiste de T, M, D, S, G, A, Q y L,
X4 es K, R o Q,
X5 es N, S o G,
X6 es S,
X7 se selecciona de entre el grupo que consiste de V, I, L, A, T,
X8 es D o E,
X9 se selecciona de entre el grupo que consiste de P, A, G, K, T y S,
X10 es L o I,
X10 es P o L,
en la que la polimerasa presenta una actividad mejorada de polimerización activada por pirofosforolisis (PAP) respecto a una polimerasa de otro modo idéntica en la que X6 es T.
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ADN polimerasas mutantes y métodos relacionados.
(20/08/2014) Una ADN polimerasa que comprende al menos el siguiente motivo en el dominio polimerasa:
T-G-R-L-S-S-Xb7-Xb8-P-N-L-Q-N (SEC ID Nº 32);
en la que
Xb7 es un aminoácido seleccionado entre S o T;
Xb8 es un aminoácido seleccionado entre G, T, R, K o L; y
la ADN polimerasa tiene al menos un 95% de identidad de secuencia con una polimerasa seleccionada entre el grupo que consiste en:
(a) una ADN polimerasa CS5 (SEC ID Nº 18);
(b) una ADN polimerasa CS6 (SEC ID Nº 9);
(c) una ADN polimerasa de Thermotoga maritima;
(d) una ADN polimerasa de Thermus aquaticus;
(e) una ADN polimerasa de Thermus thermophilus;
(f) una ADN polimerasa de Thermus flavus;
(g) una ADN polimerasa de Thermus filiformis;
(h) una ADN polimerasa de Thermus sp. sps17;
(i) una ADN polimerasa de Thermus sp. Z05;
(j)…
ADN polimerasas mutantes y métodos relacionados.
(20/05/2013) ADN polimerasa, que comprende A-G-X1-X2-F-X3-X4-X5-S-X6-X7-Q-X8- X9- X10-X11-L-X12-X13-X14X15, en la que:
X1 es E,
X2 es P,
X3 es N,
X4 es I,
X5 es N,
X6 es P,
X7 es K,
X8 es V,
X9 es S,
X10 es R,
X11 es I,
X12 es F,
X13 es G,
X14 es K, y
X15 es L,
en la que la polimerasa presenta una tasa mejorada de extensión de ácidos nucleicos en comparación con una ADNpolimerasa de otro modo idéntica con la excepción de que X13 es E.
Polimerización activada por pirofosforólisis relativa a un extremo en 2''.
(28/05/2012) Método para retirar un nucleótido extremo en 2' de un oligonucleótido que comprende:
incubar al menos un ácido nucleico diana con:
pirofosfato al menos un primer biocatalizador que comprende una actividad de pirofosforólisis, y al menos un oligonucleótido que comprende un nucleótido extremo en 2', siendo dicho oligonucleótido al menos parcialmente complementario a al menos una primera subsecuencia del ácido nucleico diana, bajo condiciones en las que el primer biocatalizador retira al menos el nucleótido extremo en 2' del oligonucleótido produciendo un nucleótido extremo en 2' retirado y un oligonucleótido acortado, retirando de…
TRANCRIPCION REVERSA A TEMPERATURA ELEVADA UTILIZANDO POLIMERASAS DE DNA MUTANTES.
(16/04/2007) Un método para la transcripción reversa y la amplifi- cación de un RNA en una reacción acoplada de transcripción reversa y amplificación en un único tubo, con una sola en- zima, que comprende: (a) proporcionar una mezcla de reacción de transcrip- ción reversa que comprende dicho RNA, un cebador, Mg2+ y una polimerasa de DNA termoactiva mutante, en la que dicha po- limerasa de DNA mutante se caracteriza porque i) en su forma nativa, dicha polimerasa de DNA en su dominio polimerasa de DNA comprende una secuencia de aminoácidos que es la del ID de SEC Nº:1; ii) el aminoácido en la posición 2 de dicha se- cuencia de aminoácidos es S o A y el aminoácido en la posición 5 de dicha secuencia de aminoácidos es L o I; y iii) el aminoácido en la posición 4 de dicha se- cuencia de aminoácidos está mutado en relación con di- cha secuencia…
DNA POLIMERAS QUIMERICAS MUTANTES.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(01/12/2006). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12Q1/68, C12N9/12, C12N15/54.
LA INVENCION PROPORCIONA ENZIMAS ADN POLIMERASAS TERMOESTABLES QUIMERICAS, QUE ESTAN FORMADAS POR UNA REGION N-TERMINAL DERIVADA DEL DOMINIO 5'-NUCLEASA DE UNA ESPECIE THERMUS DE ADN POLIMERASA Y DE UNA REGION C-TERMINAL DE LOS DOMINIOS DE EXONUCLEASA 3'-5' Y DE POLIMERASA DE LA ADN POLIMERASA DE TMA. DICHAS ENZIMAS MUTANTES QUIMERICAS DE ADN POLIMERASA TERMOESTABLES PRESENTAN PROPIEDADES MEJORADAS EN REACCIONES DE SECUENCIACION DE ACIDOS NUCLEICOS. ASIMISMO, SE PROPORCIONAN ACIDOS NUCLEICOS QUE CODIFICAN PARA LAS MISMAS, VECTORES QUE COMPRENDEN DICHOS ACIDOS NUCLEICOS Y CELULAS HUESPED TRANSFORMADAS CON DICHOS VECTORES. IGUALMENTE, SE PROPORCIONAN COMPOSICIONES QUE COMPRENDEN DICHAS ENZIMAS DE ADN POLIMERASA TERMOESTABLE QUIMERICA Y DETERGENTES POLIMERICOS NO IONICOS. TAMBIEN SE PROPORCIONAN METODOS DE PRODUCCION DE DICHAS ENZIMAS Y METODOS Y EQUIPAMIENTOS PARA LA UTILIZACION DE LAS MISMAS.
POLIMERASA DE ADN TERMOESTABLE MODIFICADA.
(01/04/2005) LA INVENCION PROPORCIONA ENZIMAS DNA POLIMERASAS TERMOESTABLES QUE COMPRENDEN LA SECUENCIA AMINOACIDICA SER GLN ILE XAA LEU ARG XAA (SEQ ID NUM: 1), EN LA QUE XAA EN LA POSICION 4 DE ESTA SECUENCIA ES CUALQUIER RESIDUO AMINOACIDICO, EXCEPTO UN RESIDUO DE ACIDO GLUTAMICO (GLU), PREFERENTEMENTE UN RESIDUO DE GLICINA, Y XAA EN LA POSICION 7 DE ESTA SECUENCIA ES UN RESIDUO DE VALINA (VAL) O UN RESIDUO DE ISOLEUCINA (ILE). LAS DNA POLIMERASAS TERMOESTABLES DE LA INVENCION POSEEN UNA EFICIENCIA AUMENTADA EN LA INCORPORACION DE NUCLEOTIDOS NO CONVENCIONALES, TALES COMO RIBONUCLEOTIDOS, EN PRODUCTOS DE DNA, Y PRESENTAN VENTAJAS EN NUMEROSAS APLICACIONES DE SINTESIS IN VITRO. TALES ENZIMAS SON PARTICULARMENTE UTILES…
ENZIMA TERMOESTABLE PURIFICADA Y PROCESO PARA AMPLIFICAR, DETECTAR Y/O CLONAR SECUENCIAS DE ACIDO NUCLEICO UTILIZANDO DICHA ENZIMA.
(16/10/1997) SE OBTIENE UNA ENZIMA TERMOESTABLE PURIFICADA QUE TIENE UNAS CARACTERISTICAS UNICAS. PREFERENTEMENTE LA ENZIMA SE SEPARA DE LA ESPECIE THERMUS AQUATICUS Y TIENE UN PESO MOLECULAR DE 86.000 A 90.000 DALTONS APROXIMADAMENTE. LA ENZIMA TERMOESTABLE PUEDE SER NATIVA O RECOMBINANTE Y SE PUEDE UTILIZAR EN UNA REACCION EN CADENA DE CICLADO DE TEMPERATURA EN DONDE SE AMPLIFICA LA CANTIDAD DE POR LO MENOS UNA SECUENCIA DE ACIDO NUCLEICO A PARTIR DE UNA SECUENCIA YA EXISTENTE CON LA AYUDA DE CEBADORES SELECCIONADOS Y DE TRIFOSFATOS NUCLEOTIDOS. EL PROCESO DE AMPLIFICACION CONSISTE EN TRATAR CEPAS COMPLEMENTARIAS INDEPENDIENTES DEL ACIDO NUCLEICO CON UN EXCESO MOLAR DE DOS CEBADORES OLIGONUCLEOTIDOS, EXTENDER LOS CEBADORES CON UNA ENZIMA TERMOESTABLE PARA FORMAR…