Determinación de novedosas funcionalidades enzimáticas utilizando nubes de puntos tridimensionales que representan propiedades fisicoquímicas de cavidades proteínicas.

Un metodo para seleccionar un catalizador de una reaccion quimica predeterminada,

que comprende los pasos de:

a) determinar las propiedades fisicoquimicas en las ubicaciones de los voxeles de la cuadricula, en donde la cuadricula incluye la cavidad del sitio activo de una primera enzima, para obtener nubes de puntos de consulta para cada tipo de propiedad fisicoquimica,

en donde las propiedades fisicoquimicas son

energias potenciales de atomos sin enlaces H, seleccionados entre azufre, cloro, calcio, manganeso, hierro, zinc, bromo, yodo, fluor, magnesio, fosforo, carbono alifatico, carbono aromatico, nitrogeno e hidrogeno,

energias potenciales de aceptores de enlaces H, seleccionados entre nitrogeno, azufre y oxigeno,

energias potenciales de donantes de enlaces H, como hidrogeno, potencial electrostatico,

hidrofobicidad, y

accesibilidad,

b) crear una base de datos de nube de puntos de nubes de puntos correspondientes para cavidades de sitios activos de proteinas predeterminadas;

c) buscar en la base de datos con las nubes de puntos de consulta para identificar de ese modo una de las proteinas predeterminadas que tiene una cavidad del sitio activo que coincide con la cavidad del sitio activo de la primera enzima, identificando asi una segunda enzima como catalizador, comparando las nubes de puntos de consulta con las nubes de puntos correspondientes de la base de datos de nubes de puntos,

en donde

el paso d) comprende superponer las nubes de puntos de consulta y las nubes de puntos correspondientes de la base de datos de nubes de puntos,

la comparacion comprende comparar las propiedades fisicoquimicas en los voxeles de cuadricula de las nubes de puntos de consulta con las propiedades fisicoquimicas en los voxeles de cuadricula mas cercanos de las nubes de puntos correspondientes de la base de datos de nubes de puntos y generar una puntuacion de identidad individual que representa la calidad de la coincidencia para cada propiedad fisicoquimica y generar un puntaje de identidad como una suma ponderada de los puntajes de identidad individuales.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2013/074556.

Solicitante: Innophore GmbH.

Nacionalidad solicitante: Austria.

Dirección: Am Eisernen Tor 3 8010 Graz AUSTRIA.

Inventor/es: GRUBER,KARL, GRUBER,CHRISTIAN, STEINKELLNER,GEORG.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G16B15/20

PDF original: ES-2811698_T3.pdf

 

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