Identificación de antígenos asociados a tumores para el diagnóstico y la terapia.

Una composición farmacéutica para utilizar en un método de terapia,

que comprende uno o más componentes seleccionados de entre el grupo que consiste en:

(i) un antígeno asociado a un tumor o una parte extracelular del mismo,

(ii) un ácido nucleico que codifica para un antígeno asociado a un tumor o una parte extracelular del mismo, y

(iii) una célula huésped que expresa un antígeno asociado a un tumor o una parte extracelular del mismo, en la que dicha parte es un fragmento inmunogénico que comprende al menos 6 aminoácidos consecutivos del antígeno asociado al tumor,

teniendo dicho antígeno asociado al tumor una secuencia codificada por un ácido nucleico que se selecciona de entre el grupo que consiste en:

(a) un ácido nucleico que comprende la secuencia de ácido nucleico de SEC ID nº: 1, y

(b) un ácido nucleico que es al menos un 95% idéntico al ácido nucleico de (a).

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E11003883.

Solicitante: BioNTech AG.

Nacionalidad solicitante: Alemania.

Dirección: An der Goldgrube 12 55131 Mainz ALEMANIA.

Inventor/es: TURECI, OZLEM, SAHIN, UGUR, USENER,DIRK, KOSLOWSKI,MICHAEL.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/47 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02;   proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
  • C07K16/30 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › de células tumorales.
  • C12Q1/68 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2535500_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Identificación de antigenos asociados a tumores para el diagnóstico y la terapia

A pesar de los enfoques ¡nterdisciplinarios y el uso exhaustivo de procedimientos terapéuticos clásicos, el cáncer todavía se encuentra entre las principales causas de muerte. Los conceptos terapéuticos más recientes están dirigidos a Incorporar el sistema inmunitario del paciente en el concepto terapéutico global utilizando vacunas tumorales recomblnantes y otras medidas específicas como la terapia con anticuerpos. Un requisito previo para el éxito de este tipo de estrategias es el reconocimiento de antígenos específicos de tumores o antígenos asociados a tumores o epftopos por parte del sistema inmunitario del paciente cuyas funciones del efector se mejoran mediante una Intervención. Las células tumorales se diferencian sustancialmente de sus células de origen no malignas. Estas diferencias se deben a alteraciones genéticas adquiridas durante el desarrollo del tumor y dan como resultado también, entre otras, la formación de estructuras moleculares cualitativa o cuantitativamente alteradas en las células cancerosas. Las estructuras de este tipo asociadas a tumores que son reconocidas por el sistema inmunitario específico del huésped que aloja el tumor se denominan antígenos asociados a tumores. El reconocimiento específico de antígenos asociados a tumores implica mecanismos celulares y humorales que son dos unidades funclonalmente ¡nterconectadas: los linfocitos T CD4+ y CD8+ reconocen los antígenos procesados presentados en las moléculas del CMH (complejo mayor de histocompatibilidad) de las clases II y I, respectivamente mientras que los linfocitos B producen moléculas de anticuerpos circulantes que se unen directamente a los antígenos sin procesar. La Importancia clfnicoterapéutica potencial de los antígenos asociados a tumores reside en el hecho de que el reconocimiento de antígenos en células neoplásicas por parte del sistema inmunitario conduce al inicio de los mecanismos efectores cltotóxicos y, en presencia de células T cooperadores, puede producir la eliminación de las células cancerosas (Pardoll, Nat. Med. 4: 525-31, 1998). Consecuentemente, un objetivo principal de la inmunología de los tumores es definir estas estructuras molecularmente. La naturaleza molecular de estos antígenos ha sido un enigma durante mucho tiempo. Sólo tras el desarrollo de técnicas de clonación adecuadas ha sido posible cribar las librerías de expresión del ADNc de tumores de forma sistemática para encontrar antígenos asociados a tumores mediante el análisis de las estructuras diana de los linfocitos T citotóxicos (LTC) (van der Bruggen et al., Science 254: 1643-7, 1991) o utilizando anticuerpos circulantes (Sahin et al., Curr. Opin. Immunol. 9: 709-16, 1997) como sondas. Con este propósito, se prepararon librerías de expresión de ADNc a partir de tejido tumoral fresco y se expresaron de forma recombinante como proteínas en sistemas adecuados. Se utilizaron inmunoefectores aislados de pacientes, principalmente clones de LTC con patrones de lisis específicos de tumor, o anticuerpos circulantes para clonar los antígenos respectivos.

Durante los últimos años se han definido muchos antígenos en varias neoplasias mediante estos enfoques.

Sin embargo, las sondas utilizadas para la Identificación de antígenos en los procedimientos clásicos son inmunoefectores (anticuerpos circulantes o clones de LTC) habltualmente de pacientes que ya presentan un cáncer avanzado. Algunos datos indican que los tumores pueden conducir a, por ejemplo, la tolerancia y la anergia de las células T, y que, durante el trascurso de la enfermedad, especialmente estas especificidades que podrían provocar un reconocimiento inmunitario eficaz se pierden del repertorio ¡nmunoefector. Los estudios actuales con pacientes todavía no han proporcionado una evidencia sólida de una acción real de los antígenos asociados a tumores encontrados previamente y que se han utilizado. Por consiguiente, no se puede descartar que las proteínas que provocan respuestas inmunitarias espontáneas sean las estructuras diana incorrectas.

Un objetivo de la presente invención es proporcionar estructuras diana para un diagnóstico y una terapia para el cáncer.

Este objetivo se consigue mediante el contenido que se proporciona en las reivindicaciones.

Según la invención, se identifican los genes que se expresan de forma selectiva o aberrante en las células tumorales y, por consiguiente, proporcionan antígenos asociados a tumores. Estos genes y/o sus productos genéticos y/o los derivados y/o sus fragmentos resultan útiles como estructuras diana para los enfoques terapéuticos y de diagnóstico.

Los antígenos asociados a tumores identificados según la Invención tienen una secuencia de aminoácidos codificada por un ácido nucleico que se selecciona de entre el grupo que consiste en (a) un ácido nucleico que comprende una secuencia de ácido nucleico según la SEC ID n°: 1, y (b) un ácido nucleico que es al menos un 95% Idéntico al ácido nucleico de (a). El antígeno asociado a un tumor identificado según la invención comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre el grupo que consiste en las SEC ID NOs: 2, 58, 59, 60, 68 y 69 del listado de secuencias.

La presente invención se refiere generalmente al uso de antígenos asociados a tumores Identificados según la Invención o de sus partes extracelulares, de ácidos nucleicos que codifican para los antígenos asociados a un tumor identificados según la invención o de partes extracelulares y/o de células huésped que expresan los antígenos asociados a tumores identificados según la invención o sus partes para la terapia o profilaxis, por ejemplo, de enfermedades neoplásicas. Generalmente, la terapia puede también implicar el uso de una combinación de dos o más de estos antígenos, ácidos nucleicos, anticuerpos, células T y/o células huésped, en una realización también en combinación con antígenos asociados a tumores distintos de los Identificados según la Invención, ácidos nucleicos

que los codifican o ácidos nucleicos dirigidos contra dichos ácidos nucleicos que codifican, anticuerpos o células T dirigidos contra dichos antígenos asociados a tumores y/o células huésped que expresan dichos antígenos asociados a tumores.

Especialmente adecuados para la terapia, profilaxis, el diagnóstico y/o seguimiento es una parte de los antígenos asociados a tumores identificados según la invención que corresponde a la porción no transmembranaria, en particular la porción extracelular de los antígenos asociados a un tumor, o que está comprendida de los mismos. Por lo tanto, para la terapia y/o profilaxis se prefiere una parte de los antígenos asociados a tumores identificados según la invención que corresponde a la porción no transmembranaria, en particular la porción extracelular de los antígenos asociados a tumores, o que está comprendida de los mismos, o una parte correspondiente de los ácidos nucleicos que codifican para los antígenos asociados a tumores identificados según la invención. De forma similar, se prefiere el uso de anticuerpos que están dirigidos contra una parte de los antígenos asociados a tumores identificados según la invención, que corresponde a la porción no transmembranaria, en particular la porción extracelular de los antígenos asociados a tumores o que está comprendida de los mismos.

Las enfermedades preferidas para una terapia y/o profilaxis son aquellas en las que el antígeno asociado a tumores identificado según la invención se expresa selectivamente o se expresa de forma anormal.

El empalme alterado de un gen puede dar lugar a una secuencia de transcripción alterada (variante de empalme). La traducción de una variante de empalme en la región de su secuencia alterada resulta en una proteína alterada que puede ser claramente diferente en la estructura y la función de la proteína original. Las variantes de empalme asociadas a tumores pueden producir transcriptos asociados a tumores y proteínas/antígenos asociados a tumores. Estos pueden ser utilizados como marcadores moleculares, tanto para la detección de células tumorales como para el enfoque terapéutico de los tumores. La detección de células tumorales en una muestra de un paciente puede llevarse a cabo, por ejemplo, después de la extracción de los ácidos nucleicos mediante amplificación por PCR con oligonucleótidos de empalme específicos de la variante.

Como se describe aquí a continuación, todos los sistemas de detección que dependen de la secuencia son adecuados para la detección de antígenos asociados a tumores. Estos son, aparte de la PCR, por ejemplo sistemas de chips/microarreglos de genes, transferencias tipo Northern,... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Una composición farmacéutica para utilizar en un método de terapia, que comprende uno o más componentes seleccionados de entre el grupo que consiste en:

(i) un antígeno asociado a un tumor o una parte extracelular del mismo,

(ii) un ácido nucleico que codifica para un antígeno asociado a un tumor o una parte extracelular del mismo, y

(iii) una célula huésped que expresa un antígeno asociado a un tumor o una parte extracelular del mismo,

en la que dicha parte es un fragmento inmunogénlco que comprende al menos 6 aminoácidos consecutivos del antígeno asociado al tumor,

teniendo dicho antígeno asociado al tumor una secuencia codificada por un ácido nucleico que se selecciona de 10 entre el grupo que consiste en:

(a) un ácido nucleico que comprende la secuencia de ácido nucleico de SEC ID n°: 1, y

(b) un ácido nucleico que es al menos un 95% idéntico al ácido nucleico de (a).

2. La composición farmacéutica para su utilización según se reivindica en la reivindicación 1, en la que el método de terapia es un método de tratamiento o prevención de un cáncer caracterizado por la expresión del antígeno asociado

a un tumor según la reivindicación 1, en la que el cáncer es un tumor esofágico, un tumor ovárico, un tumor de cabeza y cuello, un tumor de riñón, un tumor de hígado, un tumor de pulmón, un tumor de mama, un tumor de próstata, un tumor de colon, un tumor gástrico, un cáncer de estómago, un tumor pancreático, un carcinoma de las células renales, un carcinoma de colon o un carcinoma de mama.

3. La composición farmacéutica para su utilización según se reivindica en las reivindicaciones 1 o 2, en la que el 20 antígeno asociado a un tumor comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre el grupo que

consiste en las SEC ID NOs: 2, 58, 59, 60, 68 y 69.


 

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