Polimorfismos genéticos en degeneración macular relacionada con la edad.

Un método para predecir si un paciente con DME húmeda tiene mayor probabilidad de beneficiarse del tratamiento con un anticuerpo anti-VEGF, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para el polimorfismo I802V genómico en el gen del componente del complemento C5

(C5) que es rs17611, en donde el paciente tiene mayor probabilidad de beneficiarse de dicho tratamiento si el genotipo correspondiente comprende AA o AG.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E12185155.

Solicitante: GENENTECH, INC..

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1 DNA WAY SOUTH SAN FRANCISCO, CA 94080 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: GRAHAM,ROBERT R, BEHRENS,TIMOTHY W, IANCHULEV,TSONTCHO, SHAPIRO,HOWARD.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • SECCION C — QUIMICA; METALURGIA > BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE;... > PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS... > Procesos de medida, investigación o análisis en... > C12Q1/68 (en los que intervienen ácidos nucleicos)

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Fragmento de la descripción:

Polimorfismos genéticos en degeneración macular relacionada con la edad

Campo de la invención Esta invención se refiere en líneas generales al tratamiento de enfermedades humanas. Más específicamente, la invención se refiere a degeneración macular relacionada con la edad (DME) húmeda.

Antecedentes de la invención La DME es una causa principal de pérdida de visión severa e irreversible entre los ancianos. Bressler (2004) JAMA 291:1900-01. Se caracteriza por un amplio espectro de hallazgos clínicos y patológicos, incluyendo manchas amarillas pálidas conocidas como drusas, alteración del epitelio pigmentado de la retina (RPE) , neovascularización coroidea (CNV) , y degeneración macular disciforme. Las manifestaciones de la enfermedad se clasifican en dos formas: no exudativa (seca) y exudativa (húmeda o neovascular) . Recientemente, se han aprobado varias terapias para el tratamiento de DME húmeda -terapia fotodinámica usando verteporfina (Visudyne®) ; un aptámero a unión a VEGF, pegaptantib (Macugen®) ; y un fragmento de anticuerpo anti-VEGF, ranibizumab (Lucentis®) .

Existen polimorfismos genéticos en una población cuando diferentes alelos en genes particulares producen diferentes fenotipos, incluyendo el desarrollo o progresión de enfermedades y sensibilidad a fármacos terapéuticos. Se han identificado múltiples polimorfismos que están asociados con el desarrollo o progresión de DME (por ejemplo, Despriet et al. (2007) Arch. Ophthalmol. 125:1270-71; Seddon et al. (2007) JAMA 297:1793-99, 2585; Boon et al. (2008) Ana. J. Human Genet. 82:516-23) . Los trabajos previos han demostrado que polimorfismos particulares en la posición del aminoácido 402 del gen del factor del complemento H (CFH) están asociados con respuesta a PDT con terapia con verteporfina o bevacizumab fuera de lo indicado para DME (Brantley et al. (2008) publicado online en Eye el 22 de febrero, pág. 1-6; Brantley et al. (2007) Ophthalmology 114:2168-73) . La identificación de polimorfismos predictivos de la eficacia o seguridad de terapias particulares puede usarse para adaptar mejor las terapias a aquellos pacientes que se beneficiarían más de ellas.

Sumario de la invención La presente invención se basa en parte en la identificación de polimorfismos genéticos que son predictivos de riesgo de DME o una probabilidad aumentada de que tratamiento con anticuerpos anti-VEGF de alta afinidad beneficie a pacientes con DME.

Se describe un método para predecir si un paciente con DME húmeda tiene probabilidad aumentada de beneficiarse del tratamiento con un anticuerpo anti-VEGF de alta afinidad, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para un polimorfismo genómico en el alelo Y402H del gen del factor del complemento H (CFH) correspondiente a rs1061170, donde el paciente tiene una probabilidad aumentada de beneficiarse de dicho tratamiento si el genotipo correspondiente comprende CC o CT. La invención proporciona un método para predecir si un paciente con DME húmeda tiene probabilidad aumentada de beneficiarse del tratamiento con un anticuerpo anti-VEGF, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para un polimorfismo genómico en el alelo 1802V del gen del componente del complemento C5 (C5) correspondiente a rs17611, donde el paciente tiene probabilidad aumentada de beneficiarse de dicho tratamiento si el genotipo correspondiente comprende AA o AG. También se describe un método para predecir si un paciente con DME húmeda tiene probabilidad aumentada de beneficiarse de tratamiento con un anticuerpo anti-VEGF, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para un polimorfismo genómico en el alelo A69S de la serina proteasa 1 HrtA (HTRA1) correspondiente a rs10490924, donde el paciente tiene probabilidad aumentada de beneficiarse de dicho tratamiento si el genotipo correspondiente comprende GT. En alginas realizaciones, el método comprende adicionalmente tratar al paciente con un anticuerpo anti-VEGF.

En algunas realizaciones, el anticuerpo anti-VEGF se une al mismo epítopo que el anticuerpo monoclonal anti-VEGF A4.6.1 producido por el hibridoma ATCC® HB 10709. En algunas realizaciones, el anticuerpo anti-VEGF tiene un dominio variable de cadena pesada que comprende las siguientes secuencias de aminoácidos de regiones determinantes de complementariedad (CDR) de cadena pesada: CDRH1 (GYDFTHYGMN; SEC ID Nº 1) , CDRH2 (WINTYTGEPTYAADFKR; SEC ID Nº 2) y CDRH3 (YPYYYGTSHWYFDV; SEC ID Nº 3) y un dominio variable de cadena ligera que comprende las siguientes secuencias de aminoácidos de CDR de cadena ligera: CDRL1 (SASQDISNYLN; SEC ID Nº 4) , CDRL2 (FTSSLHS; SEC ID Nº 5) y CDRL3 (QQYSTVPWT; SEC ID Nº 6) . En algunas realizaciones, el anticuerpo anti-VEGF tiene el dominio variable de cadena pesada y el dominio variable de cadena ligera de Y0317. En algunas realizaciones, el anticuerpo anti-VEGF es ranibizumab.

Se describe un kit para predecir si un paciente con DME húmeda tiene probabilidad aumentada de beneficiarse de tratamiento con ranibizumab, que comprende un primer oligonucleótido y un segundo oligonucleótido específicos para un polimorfismo C/T en el alelo Y402H de CFH correspondiente a rs1061170. En algunas realizaciones, los oligonucleótidos pueden usarse para amplificar una parte del gen CFH que comprende un polimorfismo C/T en el

alelo Y402H de CFH.

Los métodos de la invención pueden emplear un kit que comprende un primer oligonucleótido y un segundo oligonucleótido específicos para un polimorfismo A/G en el alelo 1802V de C5 correspondiente a rs17611. En algunas realizaciones, los oligonucleótidos pueden usarse para amplificar una parte del gen C5 que comprende un polimorfismo A/G en el alelo I802V de C5.

También se describe un kit para predecir si un paciente con DME húmeda tiene probabilidad aumentada de beneficiarse de tratamiento con un anticuerpo anti-VEGF, que comprende un primer oligonucleótido y un segundo oligonucleótido específicos para un polimorfismo G/T en el alelo A69S de HTRA1 correspondiente a rs10490924. En algunas realizaciones, los oligonucleótidos pueden usarse para amplificar una parte del gen CFH que comprende un polimorfismo G/T en el alelo A69S de HTRA1.

Se describe un método para predecir si un individuo tiene probabilidad aumentada de desarrollar DME, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para un polimorfismo genómico en el alelo I145V de C5 correspondiente a rs17216529, donde el paciente tiene probabilidad aumentada de desarrollar DME si el genotipo correspondiente comprende GG o AG.

En otro aspecto, la invención proporciona un método para predecir si un individuo tiene probabilidad aumentada de desarrollar DME húmeda o DME seca con GA, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para un polimorfismo genómico en el alelo I802V de C5 correspondiente a rs17611, donde el paciente tiene probabilidad aumentada de desarrollar DME si el genotipo correspondiente comprende el alelo para ile.

Descripción detallada de las realizaciones preferidas La práctica de la presente invención empleará, salvo que se indique de otro modo, técnicas convencionales de biología molecular (incluyendo técnicas recombinantes) , microbiología, biología celular, bioquímica, e inmunología, que pertenecen a las habilidades de la técnica. Dichas técnicas se explican completamente en la bibliografía, tal como, "Molecular Cloning: A Laborator y Manual", segunda edición (Sambrook et al., 1989) ; "Oligonucleotide Synthesis" (M. J. Gait, cd., 1984) ; "Animal Cell Culture" (R. I. Freshney, ed., 1987) ; "Methods in Enzymology" (Academic Press, Inc.) ; "Current Protocols in Molecular Biology" (F. M. Ausubel et al., eds., 1987, y actualizaciones periódicas) ; "PCR: The Polymerase Chain Reaction",... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un método para predecir si un paciente con DME húmeda tiene mayor probabilidad de beneficiarse del tratamiento con un anticuerpo anti-VEGF, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para el

polimorfismo I802V genómico en el gen del componente del complemento C5 (C5) que es rs17611, en donde el paciente tiene mayor probabilidad de beneficiarse de dicho tratamiento si el genotipo correspondiente comprende AA

o AG.

2. El método de la reivindicación 1, en el que dicho anticuerpo anti-VEGF se une al mismo epítopo que el anticuerpo 10 monoclonal anti-VEGF A4.6.1 producido por el hibridoma ATCC® HB 10709.

3. El método de la reivindicación 2, en el que dicho anticuerpo anti-VEGF tiene un dominio variable de cadena pesada que comprende las siguientes secuencias de aminoácidos de la región determinante de complementariedad (CDR) de cadena pesada: CDRH1 (GYDFTHYGMN; SEC ID Nº 1) , CDRH2 (WINTYTGEPTYAADFKR; SEC ID Nº 2)

and CDRH3 (YPYYYGTSHWYFDV; SEC ID Nº 3) y un dominio variable de cadena ligera que comprende las siguientes secuencias de aminoácidos de CDR de cadena ligera: CDRL1 (SASQDISNYLN; SEC ID Nº 4) , CDRL2 (FTSSLHS; SEC ID Nº 5) and CDRL3 (QQYSTVPWT; SEC ID Nº 6) .

4. El método de la reivindicación 1, en el que dicho anticuerpo anti-VEGF es ranibizumab. 20

5. El método de cualquier reivindicación anterior, en el que el genotipo correspondiente comprende AA.

6. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que el genotipo correspondiente comprende AG.

7. Un método para predecir si un individuo tiene una mayor probabilidad de desarrollar DME húmeda o DME seca con GA, que comprende cribar una muestra aislada de dicho paciente para el polimorfismo I802V genómico en el C5 que es rs17611, en donde el paciente tiene una mayor probabilidad de desarrollar DME si el genotipo correspondiente comprende el alelo que codifica Ile.