Marcadores en la orina para la detección del cáncer de vejiga.

Un método para la detección del cáncer de vejiga en un sujeto,

que comprende:

detectar en la orina la acumulación de un ácido nucleico que codifica un marcador tumoral de vejiga urinaria ("UBTM"), siendo dicha acumulación en dicho sujeto mayor de aproximadamente 1,2 veces la acumulación de dicho UBTM en la orina de un grupo de sujetos normales que no padecen un cáncer de vejiga maligno, característico porque el UBTM es Homeocaja A13 (HOXA13).

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E11188990.

Solicitante: Pacific Edge Limited.

Nacionalidad solicitante: Nueva Zelanda.

Dirección: Level 13, Otago House 481 Moray Place Dunedin, 9016 NUEVA ZELANDA.

Inventor/es: GUILFORD,Parry,John, KERR,NATALIE JANE, POLLOCK,ROBERT.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
  • C12Q1/68 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • G01N33/574 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › para el cáncer.

PDF original: ES-2538504_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Marcadores en la orina para la detección del cáncer de vejiga Campo de la invención

Esta invención se refiere al uso de marcadores en la orina para la detección del cáncer de vejiga.

Antecedentes

Introducción

La supervivencia de los pacientes oncológicos mejora en gran medida cuando el cáncer se trata precozmente. En el caso del cáncer de vejiga, los pacientes diagnosticados en una fase precoz de la enfermedad tienen unas tasas de supervivencia a los 5 años de > 90%, en comparación con aproximadamente el 15 - 30% para los pacientes diagnosticados con la enfermedad avanzada. Por lo tanto, los desarrollos que permitan un diagnóstico precoz del cáncer de vejiga pueden dar lugar a un pronóstico mejorado para los pacientes. El método establecido para la detección del cáncer de vejiga mediante el uso de muestras de orina es una citología. Sin embargo, se sabe que la citología sólo es sensible en aproximadamente un 75 % para la detección del cáncer de vejiga invasivo, y sólo es sensible en aproximadamente un 25 % para la detección del cáncer de vejiga superficial (Lotan y Roehrborn, Urology 61, 109- 118 (2003)).

El cáncer de vejiga se divide ampliamente en dos clases, invasivo y superficial. El tipo invasivo penetra en las capas de tejido subyacente, mientras que el tipo superficial tiende a desarrollarse principalmente en forma de un pólipo que crece en la luz de la vejiga.

La identificación de marcadores específicos para el cáncer en la orina puede proporcionar una metodología valiosa para el diagnóstico precoz del cáncer, dando lugar a un tratamiento precoz y a un pronóstico mejorado. Los marcadores específicos del cáncer también proporcionan un medio para monitorizar la progresión de la enfermedad, permitiendo monitorizar la eficacia de los tratamientos quirúrgicos, radioterapéuticos y quimioterapéuticos. Sin embargo, para diversos cánceres importantes, los marcadores disponibles adolecen de una sensibilidad y una especificidad insuficientes.

Actualmente el método más fiable para la detección del cáncer de vejiga es la cistoscopia acompañada por una histología de las lesiones biopsiadas. Sin embargo, esta técnica es larga, invasiva y su sensibilidad es sólo de aproximadamente el 90 %, lo que significa que aproximadamente el 10 por ciento de los cánceres no son detectados mediante el uso de estos métodos. De entre las metodologías no invasivas, la citología en orina, que detecta las células malignas exfoliadas microscópicamente, es el método preferido actualmente. Aunque la citología tiene una especificidad de aproximadamente el 95 %, tiene una baja sensibilidad (del 9-25 %) para las lesiones de bajo grado, es extremadamente dependiente de la calidad de la muestra y adolece de una elevada variabilidad entre observadores.

Más recientemente se han realizado intentos para detectar marcadores genéticos en las biopsias de vejiga. El método usado más habitualmente es el análisis con micromatriz, en el que se expone una matriz que contiene oligonucleótidos complementarios a las porciones de un posible marcador genético, a una muestra de ARNm o de ADNc obtenida a partir de la muestra del paciente. Mediante el uso de estos métodos, numerosos informes recientes han identificado diversos posibles marcadores para el cáncer de vejiga. Sin embargo, la tecnología de matriz es relativamente no cuantitativa y es muy variable.

La detección de marcadores en sangre o en orina que indiquen la presencia de cáncer de vejiga proporciona un potencial método para la detección mejorada de esta enfermedad. Aunque se han realizado pocos progresos en el desarrollo de marcadores sanguíneos para el cáncer de vejiga, hay disponibles varios marcadores de proteínas en orina. Los ensayos de estos marcadores ofrecen una mejor sensibilidad que la citología pero tienden a adolecer de una especificidad subóptima debido a que los elevados niveles de estos marcadores también se observan habitualmente en los pacientes con enfermedades no malignas, que incluyen inflamación, urolitiasis e hiperplasia prostática benigna. Por ejemplo, NMP22, que detecta una proteína de la matriz nuclear específica, tiene una sensibilidad del 47 - 87 % y una especificidad del 58 - 91 %. La elevada variabilidad del NMP22 significa que no es ideal para una detección fácil y rápida del cáncer de vejiga.

Otros ensayos en orina incluyen la amplificación mediante una RT-PCR de los transcritos génicos, tales como la enzima telomerasa hTERT a partir de sedimentos celulares de muestras de orina. Los ensayos de RT-PCR ofrecen el potencial de una elevada sensibilidad, aunque la especificidad de los marcadores existentes para la RT-PCR sigue sin estar clara.

El documento US2004/0076955 y el documento US 2004/0043436 divulgan métodos para la detección del cáncer de vejiga mediante el análisis de los niveles de expresión de marcadores, por ejemplo, en muestras de orina. Hay una necesidad de herramientas adicionales para la detección y el diagnóstico precoz del cáncer. Esta divulgación proporciona métodos, composiciones, kits y dispositivos basados en marcadores del cáncer, específicamente en

marcadores del cáncer de vejiga, para ayudar a realizar tanto la detección como el diagnóstico precoz del cáncer. Resumen de la invención

Mediante el uso de una combinación de un análisis con micromatrlz y una reacción en cadena de la pollmerasa cuantitativa (qPCR), hemos sido capaces de identificar marcadores genéticos específicos que son selectivos para el cáncer de vejiga. En algunas formas de realización, hemos averiguado los marcadores que pueden usarse para diferenciar la fase de un tumor de vejiga, y en otras formas de realización, hemos identificado los marcadores que pueden distinguir los tipos de tumores. En otras formas de realización, hemos averiguado inesperadamente que las combinaciones de dos o más marcadores pueden proporcionar una detección altamente fiable y sensible del cáncer de vejiga. En otras formas de realización adicionales más, hemos Identificado marcadores que son muy expresados por las células del cáncer de vejiga pero no por las células sanguíneas. Por lo tanto, en muchas formas de realización, los ensayos del cáncer de vejiga son inesperadamente mejores que los ensayos de la técnica anterior.

En ciertas formas de realización, se usa un análisis con micromatriz para identificar los genes que son altamente expresados en el tejido tumoral de vejiga en comparación con un tejido de vejiga no maligno. Estos genes, y las proteínas codificadas por esos genes, se denominan en el presente documento marcadores tumorales de vejiga (BTM). Debe apreciarse que el término BTM no requiere que el marcador sea específico únicamente para los tumores de vejiga. Más bien, la expresión de los BTM puede estar aumentada en otros tipos de tumores, incluyendo los tumores malignos. También debe entenderse que los BTM incluyen marcadores que no son altamente expresados en las células sanguíneas. En virtud de la toma de muestras de la orina, la expresión de otros tipos de células habitualmente presentes en las muestras de biopsias de la técnica anterior no están presentes. El término BTM también incluye combinaciones de marcadores individuales que son útiles para la detección del cáncer de vejiga.

En otras formas de realización, se proporcionan métodos para la identificación de la presencia de marcadores en muestras, que incluyen una ¡nmunohlstoquímica y una reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (qPCR). Los métodos de qPCR tienen una menor tendencia a los artefactos que son habituales en los análisis con micromatriz. Dichos artefactos incluyen diferencias en el número de oligonucleótidos del ligando colocados en los puntos de la matriz, una unión no uniforme e impredecible de los colorantes a los oligonucleótidos hibridados en un punto de la matriz, un lavado no uniforme de los materiales no específicos de los puntos de la matriz, y otros problemas.

Algunos de los genes divulgados en el presente documento codifican proteínas que son secretadas por la célula, escindidas de la célula o liberadas desde una célula tras la muerte celular. Estos transcritos de ARNm y sus proteínas tienen la utilidad añadida como marcadores para el diagnóstico del cáncer de vejiga, o como marcadores para la monitorización de la progresión de una enfermedad establecida. Estos marcadores pueden usarse solos o combinados entre sí. Además, otros genes, transcritos de ARN y las proteínas codificadas permanecen dentro o asociadas a la célula, y pueden usarse solos o junto con los demás como marcadores en la orina.

Las estrategias para el tratamiento del cáncer de vejiga superficial y del invasivo pueden ser diferentes. El cáncer... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un método para la detección del cáncer de vejiga en un sujeto, que comprende:

detectar en la orina la acumulación de un ácido nucleico que codifica un marcador tumoral de vejiga urinaria ("UBTM"), siendo dicha acumulación en dicho sujeto mayor de aproximadamente 1,2 veces la acumulación de dicho UBTM en la orina de un grupo de sujetos normales que no padecen un cáncer de vejiga maligno, característico porque el UBTM es Homeocaja A13 (HOXA13).

2. El método de la reivindicación 1, en el que dicho UBTM no está presente en la sangre en un grado sustancial.

3. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 2, que comprende la detección de la acumulación de al menos un UBTM adicional, en el que el UBTM se elige de entre el grupo que consiste en GGH, SPP1, NRN1, SPARC, ADAMTS10, CNTN1, TLL2, PDIR, FBN1, el producto del gen KIAA0100, CALR, ITGBL1, ELA3B, SMOC2, HEXA, IGFBP7, MFAP2, CILP, OLFM1, LUM, SEM2, PRSS11, SULF1, SERPINH1, MGP, TIMP1, EGFL6, SPAG11, IGFBP5, SEMA3F, CDC2, TOP2A, UBE2C, MDK, STMN1, TU B A4, HIST1H1B, HMGB2, CCNA2, CDCA1, la proteína hipotética MGC5576, DEK, MLFLIP, CDCA8, la proteína hipotética FLJ20647, TYMS, SMC4L1, LYN, HMGB3, PTGIR, DONSON, HMMR, CLDN6, HIST1H1D, C10orf3, KNTC1, CKS1B, RRM2, HIST1H2BH, STK6, MPHOSPH1, CCNB2, GPR32, ENG, MFHAS1, HIST1H1C, AVPR2, CENPF,, el miembro g de la familia de histonas h4, el gen MGC27121, NP, ASPM, la proteína hipotética FLJ11871, LBH, NUDT1, HELLS, ASB9, MCM5, IMP-2, DKFZP566M1046, TUBA2, GAS2L3, la proteína hipotética FLJ12442, MCM6, DOK3, WDR18, CKAP2, KIF20A, la posible proteína fap, C6orf32, NEK2, CRY1, TGM2, DLG7, EIF2C2, DEPDC1, HIST2H4, MCM7, MTAP, KNTC2, HSPC150, SMC6L1, HIST1H2BC, ASF1B, ARH, LMNB1, la proteína hipotética FLJ10719, la proteína hipotética FLJ 10706, MAD2L1, SLC22A2, la proteína hipotética MGC34923, SPAG5, ACVRL1, DSCR1, PRSS15, S100A9, MCM4, ST7L, PLEKHA4, EPHB1, CALD1, SMC1L1, el co-transcrito Thy-1, RAMP, FKBP11, C20orf129, HIST1H4H, CDKN3, MCAM, SNCAIP, NIPSNAP1, AP1M1, ANLN, C6orf69, TORC3, MAZ, TXNRD1, la proteína hipotética xp 096695, C22orf4, VSNL1, similar a la cadena N de 83 kDa de la carboxipeptidasa, KIAA1598, la proteína hipotética FLJ13501, DKFZP4340047, la proteína hipotética FLJ38716, similar a la proteína hipotética (región L1H3), la proteína hipotética KIAA1875, PRIM1, la proteína hipotética BC001096, MCM2, GJA3, C11orf30, similar a la proteína hipotética FLJ30672, THY1, LRP3, LASS2, C18orf8, ZNF81, NARF, MTHFD2, D6T, SIAT7D, MMPL1, KLK11, KPNA2, FGFR10P2, VIM, la proteína FLJ44108, PAPOLG, FHOD1, RASL12, HMGN2, PITPNM2, DER1, EPHA4, VSIG1, RGS5, la proteína KIAA1639, SH2B, PGLYRP4, CDC45L, MLSTD1, la proteína hipotética MGC11266, TNFRSF13B, NET1, LHFPL5, MX2, SPHK1, ABCG4, SERPINB2, GALNT10, LEPR, MXD4, FAPP2, NUP210, CSK, NRP1, MGAT1, el producto del gen KIAA0100, LCN7, BMP7, ADAMTS10, PM5, N0M03, CPA6, NPPC, la proteína hipotética FLJ23221, ERP70, GALNT14, ITIH3, PAPPA2, LOXL1, TNFRSF6B, SPARC, MSMB, CLDN6, PT-MA, AVPR2, similar al transportador de creatina dependiente de sodio y de cloruro, TMEM19, la proteína hipotética xp 047287, la proteína hipotética FLJ11871, PROSC, el gen MGC27121, NQ01, CKAP4, la proteína hipotética BC001096, PDPK1, el regulador del ensamblaje del huso mitótico 1, MIRAB13, PORCN, SIX6, GJB2, la proteína FLJ35784, SLC37A3, SPRY4, LHX3, C7orf27, SLC39A1, ZNF307, MIF, BST2, PSTPIP1, SOX4, NCOA5, la proteína hipotética FLJ31438, ODD, SLC23A2, SHFM1, SRPK2, RAMP2, BPGM, RGS5, CXADR, MEIS2, TENS1, SNAI2, CHST2, HCA127, el co-transcrito Thy-1 (LOC94105), LRFN3, la proteína hipotética FLJ22390, TRIB2, KRTHA3B, KIF21A, ANKRD17, RAG1, NUBP2, la proteína hipotética FLJ20489, CASK, HIP1, PRKCD-BP, TIE, C5orf15, CGI-72. ENTPD8, SFI3BGRL3, el homólogo de la subunidad MLRQde la óxidorreductasa de NADH:ubiquinona, VG5Q, BG1, BCL2L11, ARK5, TLE3, ITIH5, RGS11, TM7SF3, SCRN3, PLXNA1, GJA4, la proteína hipotética DKFZp434G1415, WSB2. CDA, GART, ZMPSTE24, TMEM33, GPI, la proteína hipotética FLJ 11000, CAMK1D, PTPN21 y TNS.

4. El método de cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en el que dicha etapa de detección se lleva a cabo mediante la detección de la acumulación del ARNm de un marcador tumoral de la vejiga urinaria ("UBTM") o UBTM.

5. El método de cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en el que dicha detección se lleva a cabo mediante el uso de una micromatrlz.

6. El método de cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en el que dicha detección se lleva a cabo mediante el uso de una reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa o de métodos de hibridación.

7. El método de cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que el método incluye la detección de la acumulación de dos o más UBTM en dicha muestra.

8. El método de cualquiera de las reivindicaciones 1-7, que comprende la detección de uno o más pares de marcadores seleccionados del grupo que consiste en TOP2A-HOXA13 y CDC2- HOXA13.

9. Un método para la detección del cáncer de vejiga, que comprende:

detectar la acumulación de ácidos nucleicos que codifican una combinación de dos o más UBTM elegidos de entre el grupo que consiste en, TOP2a- HOXA13, SPAG5-HOXA13, CDC2-HOXA13, SPAG5-TOP2a-HOXA13, TOP2a-CDC2-HOXA13, SPAG5-CDC2-HOXA13, TOP2a-NRP1-HOXA13, TOP2a-CHGA-HOXA13, CDC2- NRP1-HOXA13, SPAG5-CHGA-HOXA13, TOP2a-SEM2-HOXA13, CDC2-CHGA-HOXA13, TOP2a TOP2a-

HOXA13-THY1, TOP2a-HOXA13-SMC4L1, SPAG5-SEM2-HOXA13, TOP2a-MGP-HOXA13, TOP2a-HOXA13- MDK, TOP2a-ENG-HOXA13, SPAG5-HOXA13-THY1, TOP2a-UBE2c- HOXA13, SPAG5-HXOA13-SMC4L1, SPAG5-MGP-HOXA13, SPAG5-HOXA13-MDK.SPAG5-ENG-HOXA13, TOP2a-EGFL6-HOXA13, SPAG5- UBE2C-HOXA13, TOP2a- BIRC5-HOXA13, SPAG5-EGFL6-HOXA13, CDC2-SEM2-HOXA13, SPAG5-BIRC5- HOXA13, CDC2-HOXA13-THY 1, CDC2-HOXA13-SMC4L1, CDC2-MGP-HOXA13, CDC2-HOXA13-MDK, CDC2- ENG-HOXA13, CDC2-UBE2c-HOXA13, CDC2-EGFL6-HOXA13, CDC2-BIRC5-HOXA13, NRP1- CHGA- HOXA13, HOXA13-CDC2-TOP2a, HOXA13-TOP2a-CHGA, HOXA13-CDC2-CHGA, HOXA13-TOP2a-NRP1, HOXA13- CDC2-NRP1, HOXA13-TOP2a-SPAG5, HOXA13-TOP2a-ENG, HOXA13-CDC2- SPAG5, HOXA13- CDC2-ENG, HOXA13- TOP2a-SEM2, HOXA13-CDC2-SEM2, HOXA13-TOP2a-MDK, HOXA13-TOP2a- IGFBP5, HOXA13-CDC2-MDK, HOXA13-CDC2-IGFBP5HOXA13-TOP2a-SEMA3F, HOXA13-NRP1-CHGA, HOXA13- CDC2-SEMA3F y HOXA13-TOP2a-EGFL6, en una muestra de orina de un paciente que se sospecha que padece cáncer de vejiga, siendo dicha acumulación de cada uno de dichos marcadores mayor de aproximadamente 1,2 veces la acumulación de cada uno de dichos marcadores en un grupo de sujetos normales que no padecen cáncer de vejiga maligno.

10. Un método para la detección de la presencia de cáncer de vejiga en un sujeto, que comprende:

determinar, en una muestra de orina, la cantidad de un ácido nucleico que codifica HOXA13junto con uno o más primeros marcadores seleccionados del grupo que consiste en BIRC2, IGFBP5, MGP, NOV, NRP1, SEMA3F, SPAG5, TOP2A, y en el que dicho primer marcador no está sustancialmente presente en la sangre de dicho sujeto.

11. Un método para distinguir la enfermedad maligna de vejiga de la enfermedad no maligna de vejiga, que comprende:

determinar, en la orina de dicho paciente, la acumulación de un ácido nucleico que codifica HOXA13junto con uno o más marcadores seleccionados del grupo que consiste en IGFBP5, MDK, MGP, NRP1, SEMA3F, SMC4L1, TOP2A y UBE2C; y

determinar en dicha muestra las proporciones de la expresión de HOXA13 con respecto a dicho uno o más marcadores, estando la proporción asociada con la presencia del cáncer de vejiga.

12. Un método para la determinación de la eficacia de la terapia para el cáncer de vejiga que comprende la detección de la acumulación de un ácido nucleico que codifica Homeocaja A13 (HOXA13) en una primera muestra de orina de un paciente, y la comparación con la cantidad de dicho HOXA13 en una segunda muestra de orina de un paciente después de un periodo de tratamiento, siendo la cantidad de dicho marcador después de dicho periodo de tratamiento menor que la cantidad de dicho marcador antes del tratamiento.

13. Un método de acuerdo con la reivindicación 12, que comprende la detección de la cantidad de al menos un marcador adicional elegido de entre el grupo que consiste en GGH, SPP1, NRN1, SPARC, ADAMTS10, CNTN1, TLL2, PDIR, FBN1, el producto del gen KIAA0100, CALR, ITGBL1, ELA3B, SMOC2, HEXA, IGFBP7, MFAP2, CILP, OLFM1, LUM, SEM2, PRSS11, SULF1, SERPINH1, MGP, TIMP1, EGFL6, SPAG11, IGFBP5, SEMA3F, CDC2, TOP2A, UBE2C, STMN1, TUBA4, HIST1H1B, HMGB2, CCNA2, CDCA1, la proteína hipotética MGC5576, DEK, MLF1IP, CDCA8, la proteína hipotética FLJ20647, TYMS, SMC4L1, LYN, HMGB3, PTGIR, DONSON, HMMR, CLDN6, HIST1H1D, C10orf3, KNTC1, CKS1B, RRM2, HIST1H2BH, STK6, MPHOSPH1, CCNB2, GPR32, ENG, MFHAS1, HIST1H1C, AVPR2, CENPF, el miembro g de la familia de histonas h4, MGC27121 el gen, NP, ASPM, la proteína hipotética FLJ11871, LBH, NUDT1, HELLS, ASB9, MCM5, IMP-2, DKFZP566M1046, TUBA2, GAS2L3, la proteína hipotética FLJ12442, MCM6, DOK3, WDR18, CKAP2, KIF20A, la posible proteína fap, C6orf32, NEK2, CRY1, TGM2, DLG7, EIF2C2, DEPDC1, HIST2H4, MCM7, MTAP, KNTC2, HSPC150, SMC6L1, HIST1H2BC, ASF1B, ARH, LMNB1, la proteína hipotética FLJ10719, la proteína hipotética FLJ 10706, MAD2L1, SLC22A2, la proteína hipotética MGC34923, SPAG5, ACVRL1, DSCR1, PRSS15, S100A9, MCM4, ST7L, PLEKHA4, EPHB1, CALD1, SMC1L1, el co-transcrito Thy-1, RAMP, FKBP11, C20orf129, HIST1H4H, CDKN3, MCAM, SNCAIP, NIPSNAP1, AP1M1, ANLN, C6orf69, TORC3, MAZ, TXNRD1, la proteína hipotética xp 096695, C22orf4, VSNL1, similar a la cadena N de 83 kDa de la carboxipeptidasa, KIAA1598, la proteína hipotética FLJ13501, DKFZP4340047, la proteína hipotética FLJ38716, similar a la proteína hipotética (región L1H3), la proteína hipotética KIAA1875, PRIM1, la proteína hipotética BC001096, MCM2, GJA3, C11orf30, similar a la proteína hipotética FLJ30672, THY1, LRP3, LASS2, C18orf8, ZNF81, NARF, MTHFD2, D6T, SIAT7D, MMPL1, KLK11, KPNA2, FGFR10P2, VIM, la proteína FLJ44108, PAPOLG, FHOD1, RASL12, HMGN2, PITPNM2, DER1, EPHA4, VSIG1, RGS5, la proteína KIAA1639, SH2B, PGLYRP4, CDC45L, MLSTD1, la proteína hipotética MGC11266, TNFRSF13B, NET1, LHFPL5, MX2, SPHK1, ABCG4, SERPINB2, GALNT10, LEPR, MXD4, FAPP2, NUP210, CSK, NRP1, MGAT1, el producto del gen KIAA0100, LCN7, BMP7, ADAMTS10, PM5, N0M03, CPA6, NPPC, la proteína hipotética FLJ23221, ERP70, GALNT14, ITIH3, PAPPA2, LOXL1, TNFRSF6B, SPARC, MSMB, CLDN6, PT- MA, AVPR2, similar al transportador de creatina dependiente de sodio y de cloruro, TMEM19, la proteína hipotética xp 047287, la proteína hipotética FLJ11871, PROSC, MGC27121 el gen, NQ01, CKAP4, la proteína hipotética BC001096, PDPK1, el regulador del ensamblaje del huso mitótico 1, MIRAB13, PORCN, SIX6, GJB2, la proteína FLJ35784, SLC37A3, SPRY4, LHX3, C7orf27, SLC39A1, ZNF307, MIF, BST2, PSTPIP1, SOX4, NCOA5, la proteína hipotética FLJ31438, ODD, SLC23A2, SHFM1, SRPK2, RAMP2, BPGM, RGS5, CXADR, MEIS2, TENS1, SNAI2, CHST2, HCA127, el co-transcrito Thy-1 (LOC94105), LRFN3, la proteína hipotética FLJ22390, TRIB2, KRTHA3B,

KIF21A, ANKRD17, RAG1, NUBP2, la proteína hipotética FLJ20489, CASK, HIP1, PRKCD- BP, TIE, C5orf15, CGI- 72. ENTPD8, SH3BGRL3, el homólogo de la subunidad MLRQ de la óxidorreductasa de NADH:ubiquinona, VG5Q, BG1, BCL2L11, ARK5, TLE3, ITIH5, RGS11, TM7SF3, SCRN3, PLXNA1, GJA4, la proteína hipotética DKFZp434G1415, WSB2. CDA, GART, ZMPSTE24, TMEM33, GPI, la proteína hipotética FLJ11000, CAMK1D, 5 PTPN21 y TNS, en una primera muestra de un paciente, y compararla con la cantidad de dicho uno o más marcadores en una segunda muestra de un paciente después de un periodo de tratamiento, siendo la cantidad de dicho marcador después de dicho periodo de tratamiento menor que la cantidad de dicho marcador antes del tratamiento.


 

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