CINASA DE TIPO HUMANO DEPENDIENTE DE CICLINA (HPNQALRE).

Un polipéptido aislado seleccionado entre el grupo que consiste en:

(a)un polipéptido que comprende al menos 223 aminoácidos contiguos de una proteína hPNQALRE que consiste en una secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID N: 6); (b)una polipéptido cinasa dependiente de la ciclina PNQALRE que comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 65% idéntica a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6); (c)un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707 en la figura 1 (SEQ ID NO: 6); y (d)un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos que consiste en la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6)

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E08006175.

Solicitante: NOVARTIS VACCINES AND DIAGNOSTICS, INC..

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 4560 HORTON STREET EMERYVILLE, CA 94608 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: REINHARD,CHRISTOPH.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 16 de Diciembre de 1999.

Clasificación PCT:

  • C12N9/12 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 9/00 Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas. › transfieren grupos que contienen fósforo, p. ej. Quinasas (2.7).

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Finlandia, Chipre.

PDF original: ES-2369502_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Cinasa de tipo humano dependiente de ciclina (hPNQALRE).

Campo técnico

La invención se refiere al área de las proteínas cinasa. Más particularmente, la invención se refiere a proteínas cinasas dependientes de ciclina.

Antecedentes de la invención

No se han descrito en su totalidad las rutas responsables de regular la mitosis y la migración y de transducir las señales del estrés ambiental en las células. Dichas proteínas se pueden manipular, por ejemplo, para proteger las células frente al estrés debido a enfermedad o a condiciones ambientales y para tratar los trastornos que implican alteraciones en la mitosis o migración, tales como las neoplasias. Por tanto, existe una necesidad en la técnica de la identificación de proteínas que estén implicadas en estas rutas.

Resumen de la invención

A lo largo de la presente memoria descriptiva, la referencia a SeqIdNo:1 hace referencia a la secuencia marcada con3703.seq en la Figura 2 de la presente memoria descriptiva, la referencia a SeqIdNo:2 hace referencia a la secuencia marcada con3703.pep en la Figura 1 de la presente memoria descriptiva, la referencia a la SeqIdNo:3 hace referencia a la secuencia marcada con3702.seq en la Figura 2 de la presente memoria descriptiva, la referencia a SeqIdNo:4 hace referencia a la secuencia marcada con 3702.pep en la Figura 1 de la presente memoria descriptiva, la referencia a SeqIdNo:5 hace referencia a la secuencia marcada con3707.seq en la Figura 2 de la presente memoria descriptiva, la referencia a SeqIdNo:6 hace referencia a la secuencia marcada con3707.pep en la Figura 1 de la presente memoria descriptiva, la referencia a SeqIdNo:7 hace referencia a la secuencia marcada con3705.seq en la Figura 2 de la presente memoria descriptiva 2, la referencia a SeqIdNo:8 hace referencia a la secuencia marcada con3705.pep en la Figura 1 de la presente memoria descriptiva.

El documento WO9835015 describe una cdk humana que tiene un motivo PNQALRE (cdk 10), su implicación en la regulación del ciclo celular y la potencial aplicación médica en el cáncer (p.5 In.7; Ejemplo 8: "Tratamiento de enfermedades del ciclo celular"). El documento WO9835015 menciona composiciones diagnósticas basadas en cdk10 (p.24 último párrafo). En el documento WO9835015 no se hace mención de la sobreexpresión de cdk10 en líneas de células cancerosas.

La base de datos EMBL E.B.I. Hinxton Reino Unido, 1 de octubre de 1996, Nº de Acceso P50613 se refiere a la proteína cinasa 7 de la división celular (EC 2.7.11.22) (EC 2.7.11.23) (cinasa activadora de CDR) (CAR) (CAR1) (subunidad cinasa del complejo del factor de transcripción \hbox{basal TFIIH) (proteína cinasa de 39 kDa) (P39 Mo19) (STR1).}

La base de datos EMBL E.B.I. Hinxton Reino Unido, 29 De enero de 1999, Nº de Acceso AI386000 se refiere a mIS4n11.yl de testículo de ratón de Stratagene (nº 937308) del clon IMAGE:SIS 877 S' de ADNc de Mus musculus similar a la Proteína Cinasa R2 relacionada con SW:KC47-ORYSA P29620 CDC2+/CDC28-; secuencia de ARNm.

La presente invención proporciona, en varias formas de realización, reactivos y procedimientos para diagnosticar la neoplasia.

Una forma de realización de la invención proporciona un polipéptido aislado seleccionado entre el grupo que consiste en:

(a)un polipéptido que comprende al menos 223 aminoácidos contiguos de una proteína hPNQALRE que consiste en una secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID N: 6); (b)una polipéptido cinasa de pendiente de la ciclina PNQALRE que comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 65% idéntica a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6); (c)un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707 en la figura 1 (SEQ ID NO: 6); y (d)un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos que consiste en la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6).

Otras formas de realización relacionadas proporciona polipéptidos cinasa aislados dependientes de la ciclina PNQALRE que comprenden las secuencias de aminoácidos que son al menos un 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% idénticas a los aminoácidos 26-38 de la SEQ ID NO: 6. Los mencionados polipéptidos pueden tener también dicha identidad con los aminoácidos 181-201 de la SEQ ID NO: 3. Se proporcionan también polipéptidos \hbox{aislados que comprenden una secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 6.}

Otras formas de realización de la presente invención proporcionan una proteína de fusión que comprende un primer segmento de proteína y un segundo segmento de proteína en el que dicho primer segmento de proteína se fusiona a dicho segundo segmento de proteína por medio de un enlace peptídico y en el que dicho primer segmento de proteína comprende un polipéptido aislado de la invención.

Las primeras proteínas de la presente invención incluyen por ejemplo al menos 223 aminoácidos contiguos de la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 6. Se proporcionan también proteínas de fusión en las que el primer segmento de proteína comprende una secuencia de aminoácidos de la cinasa dependiente de la ciclina PNQALRE que es al menos un 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% idéntica a los aminoácidos 26-38 o a los aminoácidos 181-201 de la SEQ ID NO: 6.

Otras formas de realización adicionales de la presente invención incluyen preparaciones de anticuerpos que se unen específicamente con una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 6. Las formas de realización relacionadas incluyen preparaciones de anticuerpos que se unen específicamente a un epítopo definido en todo o en parte por los aminoácidos 26-38 de la SEQ ID NO: 6.

La presente invención proporciona una molécula de ADNc que codifica un polipéptido aislado de la invención. Una molécula de ADNc que comprende una secuencia de nucleótidos seleccionada entre el grupo que consiste en:

(a)una secuencia de nucleótidos que es al menos un 65% idéntica a los nucleótidos 76-114 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); (b)una secuencia de nucleótidos que es idéntica a los nucleótidos 76-114 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); (c)una secuencia de nucleótidos que es al menos un 90% idéntica a los nucleótidos 542-603 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); (d)una secuencia de nucleótidos que es idéntica a los nucleótidos 542-602 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); y (e)una secuencia de nucleótidos que consiste en la secuencia d ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5).

Realizaciones adicionales proporcionan moléculas de ADNc que codifican polipéptidos que comprenden al menos 223 aminoácidos contiguos de una proteína hPNQALRE de la SEQ ID NO: 6. Las formas de realización similares incluyen moléculas de ADNc que codifican una polipéptido cinasa dependiente de la ciclina PNQALRE que comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 65%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% idéntica a los aminoácidos 26-38 de la SEQ ID NO:6. La presente invención proporciona también los ADNc que codifican polipéptidos que comprenden una secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 6. Se proporcionan también moléculas de ADNc inventivas que comprenden una secuencia de ácido nucleico que es al menos un 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% idéntica a los nucleótidos 76-114 de la SEQ ID NO:5 y/o que es al menos 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% idéntica a los nucleótidos... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un polipéptido aislado seleccionado entre el grupo que consiste en:

(a)un polipéptido que comprende al menos 223 aminoácidos contiguos de una proteína hPNQALRE que consiste en una secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID N: 6); (b)una polipéptido cinasa dependiente de la ciclina PNQALRE que comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 65% idéntica a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6); (c)un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707 en la figura 1 (SEQ ID NO: 6); y (d)un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos que consiste en la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6).

2. El polipéptido aislado de la reivindicación 1 que es una polipéptido cinasa dependiente de la ciclina PNQALRE que comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 65% idéntica a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6).

3. Una proteína de fusión que comprende un primer segmento de proteína y un segundo segmento de proteína en el que dicho primer segmento de proteína se fusiona a dicho segundo segmento de proteína por medio de un enlace peptídico y en el que dicho primer segmento de proteína comprende un polipéptido aislado de la reivindicación 1.

4. Una molécula de ADNc que codifica el polipéptido aislado de la reivindicación 1.

5. Una molécula de ADNc que codifica el polipéptido aislado de la reivindicación 2.

6. Una molécula de ADNc que comprende una secuencia de nucleótidos seleccionada entre el grupo que consiste en:

(a)una secuencia de nucleótidos que es al menos un 65% idéntica a los nucleótidos 76-114 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); (b)una secuencia de nucleótidos que es idéntica a los nucleótidos 76-114 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); (c)una secuencia de nucleótidos que es al menos un 90% idéntica a los nucleótidos 542-603 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); (d)una secuencia de nucleótidos que es idéntica a los nucleótidos 542-602 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); y (e)una secuencia de nucleótidos que consiste en la secuencia d ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5).

7. Un polinucleótido subgenómico aislado o su complemento que comprende una secuencia de nucleótidos que se hibrida en condiciones muy rigurosas con una secuencia de nucleótidos seleccionada entre el grupo que consiste en:

(a)nucleótidos 76-114 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); y (b)nucleótidos 542-603 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5).

8. Una construcción que comprende:

un promotor; y

un segmento de polinucleótido que comprende un ADNc de la reivindicación 4, en el que dicho segmento de polinucleótido se localiza corriente abajo de dicho promotor y en el que la transcripción de dicho segmento de polinucleótido se inicia en el promotor.

9. Una construcción que comprende:

un promotor; y

un segmento de polinucleótido que comprende un ADNc de la reivindicación 6, en el que dicho segmento de polinucleótido se localiza corriente abajo de dicho promotor y en el que la transcripción de dicho segmento de polinucleótido se inicia en el promotor.

10. Una célula huésped que comprende la construcción de la reivindicación 8.

11. Una célula huésped que comprende la construcción de la reivindicación 9.

12. Una célula homólogamente recombinante que tiene incorporada en la misma una nueva unidad de inicio de la transcripción, en la que dicha nueva unidad de inicio de la transcripción comprende:

(a)una secuencia reguladora exógena; (b)un exón exógeno; y (c)un sitio donante de corte y empalmen, en el que se localiza la nueva unidad de inicio de la transcripción corriente arriba de una secuencia de codificación de un gen, en el que dicho gen tiene una secuencia de codificación que consiste en una secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5) y en el que dicha secuencia reguladora exógena dirige la transcripción de la secuencia de codificación del gen.

13. Un procedimiento in vitro de diagnóstico o pronóstico de la neoplasia, que comprende la etapa de comparar la expresión de un gen hPNQALRE en un primer tejido sospechoso de ser neoplásico con la expresión del gen hPNQALRE en un segundo tejido que es normal, en el que dicho gen hPNQALRE comprende una secuencia de codificación seleccionada entre el grupo que consiste en:

(a)una secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); (b)los nucleótidos 76-114 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5); y (c)los nucleótidos 542-603 de la secuencia de ácido nucleico marcada con3707.seq en la figura 2 (SEQ ID NO: 5),

en el que la sobreexpresión de dicho gen hPNQALRE en dicho primer tejido indica neoplasia en dicho primer tejido.

14. Una construcción que comprende: un promotor; y un segmento de polinucleótido que comprende un ADNc de la reivindicación 5; en el que dicho segmento de polinucleótido se localiza corriente abajo de dicho promotor y en el que la transcripción de dicho segmento de polinucleótido se inicia en el promotor.

15. Una célula huésped que comprende la construcción de la reivindicación 14.

16. Un anticuerpo o un fragmento del mismo que se une a un epítopo que comprende una secuencia de aminoácidos que es (i) idéntica, o (ii) al menos un 65% idéntica, a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6).

17. Un anticuerpo o un fragmento del mismo de la reivindicación 16, en el que dicho epítopo está que consiste en una secuencia de aminoácidos que es (i) idéntica, o (ii) al menos un 65% idéntica, a los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6).

18. Un anticuerpo o un fragmento del mismo que proporciona una señal de detección al menos 5 veces mayor para un epítopo que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica a los aminoácidos 26-38 marcados con3707.pep en la figura I (SEQ ID NO: 6) que una señal de detección de otros epítopos que carecen de los aminoácidos 26-38 de la secuencia de aminoácidos marcada con3707.pep en la figura 1 (SEQ ID NO: 6) cuando se usa en pruebas inmunoquímicas.


 

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