APTÁMEROS ESPECÍFICOS PARA HISTONAS DE LEISHMANIA.

La invención se relaciona con oligonucleótidos de cadena sencilla (aptámeros) que son capaces de unirse de forma específica a las proteínas histona de microorganismos del género Leishmanla,

así como a los usos de dichos oligonucleótidos para la diagnosis y el tratamiento de las leishmaniasis

Tipo: Patente de Invención. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: P200802395.

Solicitante: FUNDACION PARA LA INVESTIGACION BIOMEDICA DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO RAMON Y CAJAL.

Nacionalidad solicitante: España.

Provincia: MADRID.

Inventor/es: GONZALEZ MUÑOZ,VICTOR MANUEL, RAMOS MUÑOZ,EDURNE, PIÑEIRO DEL RIO,DAVID, SALINAS ARACIL,MATILDE, MARTIN PALMA,MARIA ELENA.

Fecha de Solicitud: 7 de Agosto de 2008.

Fecha de Publicación: .

Fecha de Concesión: 10 de Febrero de 2012.

Clasificación PCT:

  • A61K31/711 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 31/00 Preparaciones medicinales que contienen ingredientes orgánicos activos. › Acidos desoxirribonucleicos naturales, es decir conteniendo unicamente 2'-desoxirribosas unidas a la adenina, la guanina, la citosina o la timina y teniendo enlaces 3'-5' fosfodiester.
  • C12N15/115 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Aptámeros, p.ej. ácidos nucleicos que unen una molécula diana específicamente y con alta afinidad sin hibridar entre ellos.
  • G01N33/569 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › para microorganismos, p. ej. protozoarios, bacterias, virus.

PDF original: ES-2356439_A1.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Aptámeros específicos para histonas de Leishmania.

Campo técnico de la invención

La invención se relaciona con oligonucleótidos de cadena sencilla (aptámeros) que son capaces de unirse de forma específica a las proteínas histona de microorganismos del género Leishmania, así como a los usos de dichos oligonucleótidos para la diagnosis y el tratamiento de las leishmaniasis.

Antecedentes de la invención

Leishmania es un protozoo que, en el vertebrado, desarrolla un ciclo de vida intracelular, utilizando el macrófago como célula hospedadora. Dentro de estas células, el parásito se desarrolla en los fagolisosomas donde es capaz de soportar tanto el pH ácido como la presencia de las numerosas enzimas hidrolíticas que contiene este orgánulo. Los protozoos del género Leishmania son el agente causante de la leishmaniasis, una enfermedad que incluye un amplio espectro de síntomas clínicos que varían desde lesiones cutáneas que curan espontáneamente hasta infecciones viscerales que pueden llegar a conducir a la muerte del paciente. Datos recientes de la OMS indican que la leishmaniasis es ahora endémica en 88 países de cinco continentes -África, Asia Europa, Norteamérica y América del Sur- con un total de 350 millones de personas con riesgo de padecerla. Se calcula que esta enfermedad afecta a más de 15.000.000 de personas en todo el mundo, localizándose su máxima incidencia en aproximadamente 15 naciones entre las que se incluyen varios países del área mediterránea. En lo que a América se refiere, se estima que cada año se producen 60.000 nuevos casos de leishmaniasis tegumentaria americana (LTA), todos ellos localizados en una región habitada por unos 59 millones de personas. Además, desde 1993, las regiones en las que la leishmaniosis es endémica se han expandido significativamente lo que está acompañado por un incremento en el número de casos registrados de la enfermedad. Además, el SIDA y otras enfermedades inmunosupresivas alimentan el riesgo de personas infectadas por Leishmania que desarrollan leishmaniasis visceral (WHO 2000).

Hasta el momento, los métodos de diagnóstico de la leishmaniasis se han basado en la detección de la respuesta humoral a la infección en pacientes. Así, la solicitud de patente americana US2005287176 describe un polipéptido quimérico formado por varios determinantes antigénicos de distintas proteínas de Leishmania dispuestos en tándem, incluyendo determinantes antigénicos de la histona 2A, de las proteínas ácidas ribosomales LiP2 y LiP2b, así como de la proteína ribosomal PO. La solicitud de patente internacional WO2005044301 describe la secuencia de histona 2A y sugiere su uso para la identificación de anticuerpos en suero de pacientes. La solicitud de patente europea EP0997734 describe un método diagnóstico para la diagnosis de la leishmaniasis visceral en el que se investiga la aglutinación de un preparado de promastigotes de Leishmania tripsinizados y teñidos con azul brillante de Coomassie tras su adición a una muestra de suero.

Sin embargo, estos ensayos son dependientes de la aparición de una respuesta humoral en el paciente. Por ello, este tipo de ensayos no resultan de utilidad para la detección de muchas las leishmaniasis humanas, ya que estas ocurren fundamentalmente en individuos inmunodeprimidos, que no desarrollan una respuesta humoral completa. Por otro lado, es frecuente que aparezcan animales que desarrollan los signos de la enfermedad pero en los que el título de anticuerpos no es lo suficientemente alto como para que los anticuerpos puedan ser detectados.

Por ello, es necesario disponer de ensayos que permitan detectar el parásito en sí en lugar de ensayos dirigidos a detectar la presencia de la respuesta humoral en el paciente. Sin embargo, este tipo de ensayos se enfrenta al problema de que no existen anticuerpos comerciales contra muchos de los antígenos de Leishmania. La solicitud de patente EP0819766 describe varios polinucleótidos de Leishmania que pueden servir de base para su detección en muestras mediante la amplificación mediante PCR usando cebadores específicos así como para distinguir distintas especies de Leishmania. La solicitud de patente ES216996 describe un método para la detección de L. infantum mediante la amplificación por PCR de un marcador específico del kinetoplasto seguido de la detección mediante ELISA del amplicón generado en la PCR. Por otro lado, Moreno, M. et al. (Biochem. Biophys. Res. Commun., 2003, 308:214-218) han descrito aptámeros de ADN específicos para la proteína KMP-11 de L. infantum y han sugerido su posible uso como herramienta diagnóstica. Sin embargo, existe aún una necesidad en la técnica de proporcionar métodos adicionales para el diagnóstico de la leishmaniasis y, más concretamente, de agentes capaces de unirse a antígenos de Leishmania con la suficiente rapidez y afinidad como para poder ser utilizados con fines diagnósticos.

Compendio de la invención

La presente invención se basa en la identificación por parte de los inventores de aptámeros de Leishmania que son capaces de unirse a la proteína histona 2A con alta afinidad, de forma que permiten la detección específica de dicha proteína sin mostrar ninguna reactividad cruzada con la histona 2A de especies en las que L. infantum habitualmente se hospeda, abriendo la puerta a un método alternativo para la diagnosis de la leishmaniasis.

En un primer aspecto, la invención se relaciona con un ácido nucleico de cadena sencilla que es capaz de unirse específicamente a una histona de un organismo perteneciente al género Leishmania.

En otro aspecto, la invención se relaciona con un aptámero definido por la fórmula

5'-GCGGATGAAGACTGGTGT-X-GCCCTAAATACGAGCAAC-3'

en donde X es un oligonucleótido seleccionado del grupo de SEQ ID NO: 8 a 14 o una variante funcionalmente equivalente del mismo o bien que comprende una secuencia seleccionada del grupo de SEQ ID NO: 1 a 7 o una variante funcionalmente equivalente de la misma.

En otro aspecto, la invención se relaciona al uso de al menos un aptámero de la invención para la detección de Leishmania.

En otro aspecto, la invención se relaciona con un método de diagnóstico de una infección por Leishmania que comprende

(i) poner en contacto una muestra biológica de un paciente con al menos un aptámero de la invención y (ii) detectar la unión entre el aptámero y la muestra la cuál es indicativa de la presencia de Leishmania en la muestra.

En otro aspecto, la invención se relaciona con un aptámero o una mezcla de aptámeros de la invención para su uso en medicina.

En otro aspecto, la invención se relaciona con una composición farmacéutica que comprende al menos un aptámero según la invención opcionalmente en combinación con uno o más soportes, excipientes o solventes farmacéuticamente aceptables.

En otro aspecto, la invención se relaciona con el uso de al menos un aptámero de la invención para la preparación de un medicamento para el tratamiento de una infección por Leishmania.

En otro aspecto, la invención se relaciona con un método para la identificación de aptámeros específicos para una histona de un organismo del género Leishmania que comprende

(i) poner en contacto una histona de una especie del género Leishmania o un fragmento peptídico de la misma con una biblioteca de oligonucleótidos de ADN, (ii) seleccionar aquellos miembros de la biblioteca de oligonucleótidos ADN que se unen específicamente a dicha histona o péptido y (iii)amplificar los oligonucleótidos que se han seleccionado en la etapa (ii) para obtener una población enriquecida de oligonucleótidos que se unen a la histona o péptido y (iv)opcionalmente, repetir las etapas (i) a (iii) una o más veces usando como material de partida en la etapa (i) la población enriquecida obtenida en la etapa (iii).

Breve descripción de las figuras

La figura 1 muestra la secuencia de los 7 clones recuperados del screening mediante... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un aptámero que comprende un ácido nucleico de cadena sencilla que es capaz de unirse específicamente a una histona de un organismo perteneciente al género Leishmania.

2. Un aptámero según la reivindicación 1 en el que la histona a la que se une el aptámero es la histona H2A.

3. Un aptámero según las reivindicaciones 1 ó 2 en el que el organismo perteneciente al género Leishmania es Leishmania infantum.

4. Un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 en el que el ácido nucleico es ADN.

5. Un aptámero según la reivindicación 4, en el que aptámero comprende una secuencia definida por la siguiente fórmula:

5'-GCGGATGAAGACTGGTGT-X-GCCCTAAATACGAGCAAC-3'

en donde X es un oligonucleótido seleccionado del grupo de SEQ ID NO: 8 a 14 o una variante funcionalmente equivalente del mismo.

6. Un aptámero según la reivindicación 4, en el que el aptámero comprende una secuencia seleccionada del grupo de SEQ ID NO: 1 a 7 o una variante funcionalmente equivalente de la misma.

7. Uso de un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 o una mezcla de dichos aptámeros en un método in vitro para la detección de Leishmania.

8. Método de diagnóstico de una infección por Leishmania que comprende

(i) poner en contacto una muestra biológica de un paciente con al menos un aptámero tal que definido en cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 (ii) detectar la unión entre el aptámero y la muestra lo cual es indicativo de la presencia de Leishmania en la muestra.

9. Método según la reivindicación 8 en el que la infección por Leishmania es una leishmaniasis visceral, cutánea o mucocutánea.

10. Una composición farmacéutica que comprende al menos un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 opcionalmente en combinación con uno o más soportes, excipientes o solventes farmacéuticamente aceptables.

11. Uso de al menos un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 para la preparación de un medicamento para el tratamiento de una infección por Leishmania.

12. Uso según la reivindicación 11 en el que la infección por Leishmania es una leishmaniasis visceral, cutánea o mucocutánea.


 

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