ANTIGENO DE GLUCOPROTEINA SIMA 135 EXPRESADO EN CELULAS DE TUMOR HUMANAS METASTASICAS.

Una proteína que comprende la secuencia de aminoácido SEQ ID NO: 1, en donde la proteína es una proteína de fosfotirosina

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2004/001556.

Solicitante: NOVARTIS AG
THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE
.

Nacionalidad solicitante: Suiza.

Dirección: LICHTSTRASSE 35 4056 BASEL SUIZA.

Inventor/es: QUIGLEY,JAMES,P, TESTA,JACQUELINE,E, HOOPER,JOHN,D.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 18 de Febrero de 2004.

Fecha Concesión Europea: 7 de Julio de 2010.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/47A34
  • C07K16/30 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › de células tumorales.

Clasificación PCT:

  • A61K39/395 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 39/00 Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53). › Anticuerpos (aglutininas A61K 38/36 ); Inmunoglobulinas; Inmunosuero, p. ej. suero antilinfocitario.
  • C07K14/47 C07K […] › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
  • C07K16/30 C07K 16/00 […] › de células tumorales.
  • C12N15/12 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas animales.
  • G01N33/53 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.

Clasificación antigua:

  • A61K39/395 A61K 39/00 […] › Anticuerpos (aglutininas A61K 38/36 ); Inmunoglobulinas; Inmunosuero, p. ej. suero antilinfocitario.
  • C07K14/47 C07K 14/00 […] › de mamíferos.
  • C07K16/30 C07K 16/00 […] › de células tumorales.
  • C12N15/12 C12N 15/00 […] › Genes que codifican proteínas animales.
  • G01N33/53 G01N 33/00 […] › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Eslovenia, Finlandia, Rumania, Chipre, Lituania, Letonia, Ex República Yugoslava de Macedonia, Albania.


Fragmento de la descripción:

Campo de la Invención

10 La invención se relaciona generalmente con métodos para diagnosticar cáncer y para reducir la metástasis por células de cáncer en un mamífero, tal como un humano. Más específicamente, la invención se relaciona con el uso de una proteína marcadora de tumor para crear anticuerpos que se pueden utilizar para detectar la producción incrementada de la proteína en una célula, y uso de los anticuerpos para reducir la metástasis por células de cáncer que producen la proteína marcadora de tumor.

15 Antecedente de la Invención Un tumor maligno muda células que migran a nuevos tejidos y crean tumores secundarios mientras que un tumor benigno no genera tumores secundarios. El proceso de generar tumores secundarios se denomina metástasis y es un proceso complejo en el que las células de tumor colonizan los lugares distintos del tumor principal. La metástasis de tumor sigue siendo la causa principal de la muerte de los pacientes con

20 cáncer, aún no se entienden claramente los mecanismos moleculares que subyacen a la diseminación de células de tumor. La metástasis es un proceso multi-etapas en el que las células de tumor de se desprenden del tumor principal, invaden la matriz celular, penetran a través de los vasos sanguíneos, entran así en el sistema circulatorio (intravasado), se detienen en un lugar distante, salen del torrente circulatorio (extravasado), y crecen. Ver, por ejemplo, G. L. Nicolson (1982) Biochim. Biophis. Acta. 695: 113-176; G. L. Nicolson y G. Poste (1983) In. Rev. Exp. Pathol. 25: 77-181; G. Poste y I. J. Fidler (1980) Nature 283: 139-145; y E. Roos (1984) Biochim. Biophis. Acta. 738: 263-284. Dada la complejidad del proceso, se piensa que numerosos genes median la metástasis de células de tumor. De hecho, se ha correlacionado el fenotipo metastásico con la expresión de una variedad de proteínas, que incluyen proteasas, moléculas de adhesión, y similares. Sin

30 embargo, falta evidencia o es difícil de probar que una proteína dada está involucrada directamente en la diseminación. L. A. Liotta y W. Stetler-Stevenson (1989) J. Natl. Cancer Inst. 81: 556-557. El carcinoma epidermoide humano, HEp-3, proporciona un único sistema que se puede utilizar para detectar y caracterizar los genes que afectan la diseminación metastásica. Las células HEp-3 que se propagan mediante pasaje serial en la membrana corioalantoidea de pollo (CAM), son cancerígenas y espontáneamente metastásicas (T+M+). L. Ossowski y E. Reich (1980a) Cancer Res. 40: 2300-2309. Sin embargo, cuando tales células se hacen crecer continuamente in vitro, forman fácilmente tumores principales, pero llegan con el tiempo a ser progresivamente no metastásicas (T+M-). L. Ossowski y E. Reich (1980b) Cancer Res. 40: 2310-2315. Con el cultivo prolongado in vitro, ellas eventualmente también llegan a ser no cancerígenas (T-M-). La pérdida de la capacidad metastásica es reversible. Las células T+M

40 llevadas en la membrana corioalantoidea para dos o tres pasajes recuperan la capacidad de formar metástasis espontánea. Así, al alterar las condiciones de crecimiento, el potencial metastásico de estas células se puede manipular por el investigador.

Se muestra que el activador de plasminógeno tipo urocinasa humano (uPA) está involucrado directamente en la diseminación de HEp-3, cuando la metástasis espontánea de las células HEp-3 en los 45 embriones de pollo se inhibe por los anticuerpos que son específicos para el uPA humano. L. Ossowski y E. Reich (1983b) Cell 35: 611-619. Posteriormente, se observa que la inhibición de la actividad de uPA bloquea la infiltración del mesénquima CAM mediante las células HEp-3 individuales. L. Ossowski (1988a) Cell 52: 321-328. Sin embargo, el uPA activo parece ser requerido por la intravasación de células de tumor pero no la extravasación. L. Ossowski (1988a). Así, también algunos otros factores deben estar

involucrados en la diseminación de HEp-3 y en la diseminación de células de cáncer en general. J. P. Quigley et al. (1988) Ciba Foundation Symposium 141: 22-47, Brooks et al. (1993) J. Cell Biol. 122 (6): 1351-1359 y Testa, et al. En las Patentes Estadounidenses Nos 6,245,898 y 6,498,014 se describen la generación de anticuerpos monoclonales (mAbs), utilizando “inmunización sustractiva”, que reconoce los antígenos de la superficie celular expresados en células HEp-3 e inhibe la metástasis de tumor en el modelo de membrana corioalantoidea. No obstante, esos antígenos no se han correlacionado a metástasis in vivo ni han mostrado estar directamente involucrados en el proceso de metástasis in vivo.

Por consiguiente, hay una necesidad de identificar las moléculas biológicas que están involucradas funcionalmente en la diseminación de células de cáncer con el fin de desarrollar terapias que se puedan utilizar para inhibir la migración de las células de tumor a nuevos tejidos. También, son necesarios los métodos para inhibir metástasis de células de tumor y para diagnosticar cáncer para ayudar en la batalla para el control del cáncer al reducir o eliminar la propagación de células neoplásicas a través del cuerpo de un mamífero afligido con cáncer.

Resumen de la Invención

La presente invención se refiere a la identificación y caracterización de una proteína (SIMA135) (SEQ ID NO:1) que se produce en las células metastásicas. La SEQ ID NO:1 se describe como “NCSG135” en la base de datos EBI número de acceso AF 468010. Estas difieren en dos posiciones (residuos 525 & 827) de “B345” descritas en la WO 02/04508.

La invención se define en las reivindicaciones.

Breve Descripción del Dibujo

La Figura 1 ilustra la secuencia de aminoácido de SIMA135. La secuencia de señal está en letras minúsculas y el dominio de transmembrana está encerrado en un recuadro. Doce motivos de Nglucosilación consensos se indican con los triángulos sólidos. Los residuos de tirosina citoplasmáticos se encierran en círculos. Se subrayan los dominios CUB que se considera abarcan los residuos 221 a 348 y 417 a 544. Se sobrerrayan los tres péptidos identificados de la digestión y secuenciación de tripsina. El residuo Arg que precede el péptido 2 y el Lys que precede el péptido 3 se encierran en recuadros para resaltar la consistencia con la especificidad de tripsina para los sustratos que contienen Arg/Lys. Se subrayan las secuencias PXXP del dominio citoplasmático. Un motivo de palmitilación de consenso, seguido por el dominio de transmembrana putativo, se indica por círculos sólidos.

Descripción Detallada de la Invención

La invención se relaciona con el descubrimiento de una proteína glucosilada que se purifica a partir de células HEp3 metastásicas a través de inmunización sustractiva que utiliza un anticuerpo monoclonal designado 41-2. La proteína se designa SIMA135 (inmunización sustractiva de proteína 135 kDa asociada M+ HEp3).

La SIMA135 se refiere a una proteína que puede estar físicamente aislada de las células, en lugar de ser una proteína putativa predicha de traducción de una secuencia de ácido nucleico. El aislamiento físico de la proteína SIMA135 es significativo por un número de razones. Una razón es que el aislamiento de la proteína indica que el mARN se traduce actualmente en un polipéptido. En segundo lugar, el aislamiento y la caracterización de la proteína como se reporta aquí indica que la proteína es glucosilada. El aislamiento físico de la proteína glucosilada confirma que los lugares de glucosilación dentro del polipéptido están disponibles para glucosilación y no se entierran dentro de la proteína plegada para llegar a ser inaccesibles a las glucosiltransferasas. Tal conformación es importante debido a la función conocida que cumple la glucosilación en el plegado de la proteína y la inmunogenicidad. Por lo tanto, el aislamiento de la proteína SIMA135 es un avance significativo cuando se compara con una secuencia de polipéptido predicha de una secuencia de ácido nucleico.

Se muestra aquí que el cADN SIMA135 codifica una proteína de superficie celular de transmembrana tipo I de 135 kDA que inmunorreacciona específicamente con mAb 41-2. La inmunopurificación y secuenciación de aminoácido confirma que la proteína madura comienza en Phe30 luego de la remoción de un péptido de señal de aminoácido 29. El análisis inmunocitoquímico confirma la localización de la proteína en la superficie celular y la orientación tipo I de esta proteína. Adicionalmente, consistente...

 


Reivindicaciones:

1. Una proteína que comprende la secuencia de aminoácido SEQ ID NO: 1, en donde la proteína es una proteína de fosfotirosina.

2. Un fragmento inmunorreactivo soluble de la SEQ ID NO: 1 con un peso molecular de aproximadamente 110 kDa al reducir SDS-PAGE, y obtenible de medio acondicionado de un cultivo celular HEp3.

3. Un anticuerpo monoclonal que se une específicamente al fragmento de la reivindicación 2, en donde dicho anticuerpo no es el anticuerpo monoclonal 41-2.

4. El anticuerpo monoclonal de la reivindicación 3, en donde el anticuerpo reconoce una proteína glucosilada que consiste de la secuencia de aminoácido SEQ ID NO: 1, pero no reconoce una proteína no glucosilada que consiste de la secuencia de aminoácido SEQ ID NO: 1.

5. Un anticuerpo monoclonal que se une específicamente a una proteína que consiste de la secuencia de aminoácido SEQ ID NO: 1, para uso en el tratamiento de carcinoma epidermoide o cáncer de próstata, en donde dicho anticuerpo no es el anticuerpo monoclonal 41-2.

6. Una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo de acuerdo con la reivindicación 3 o 4 y un portador farmacéuticamente aceptable.

7. Un equipo que comprende el anticuerpo de acuerdo con la reivindicación 3 o 4 y material de empaque.

8. El anticuerpo de acuerdo con la reivindicación 3 o 4 para uso en un método diagnóstico del cáncer que comprende (a) visualizar la unión de un anticuerpo de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones con una sección de tejido y (b) determinar si el anticuerpo que origina el teñido heterólogo de la muestra de tejido, indica expresión extensa de SIMA 135 de la SEQ ID No: 1 durante toda la muestra de tejido o glándulas malignas teñidas en la serosa colónica.

 

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