ÁCIDO NUCLEICO Y PROTEÍNA CORRESPONDIENTE, DENOMINADA 184P1E2, ÚTILES EN EL TRATAMIENTO Y LA DETECCIÓN DE CÁNCER.

Un procedimiento in vitro para detectar la presencia de una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos que se muestra en la figura 2A,

2B o 2C en una muestra de ensayo que comprende: poner en contacto la muestra con un anticuerpo que se une específicamente a la proteína; y detectar la unión de la proteína de la muestra al mismo, proporcionando la presencia elevada de proteína en la muestra de ensayo con relación a la muestra de tejido normal una indicación de la presencia de cáncer de riñón, vejiga y pulmón

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2002/011643.

Solicitante: AGENSYS, INC..

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 2225 COLORADO AVENUE SANTA MONICA CA 90404 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: JAKOBOVITS, AYA, HUBERT, RENE, S., RAITANO, ARTHUR, B., FARIS, MARY, GE,WANGMAO, MORRISON,KAREN, MORRISON,ROBERT,KENDALL, CHALITTA-EID,Pia,M.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 9 de Abril de 2002.

Clasificación PCT:

  • C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
  • C07K16/18 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra materiales animales o humanos.
  • C12N15/12 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Genes que codifican proteínas animales.
  • C12N15/55 C12N 15/00 […] › Hidrolasas (3).
  • C12N9/78 C12N […] › C12N 9/00 Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas. › actúan sobre los enlaces carbono-nitrógeno distintos a los enlaces peptídicos (3.5).
  • G01N33/53 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
  • G01N33/574 G01N 33/00 […] › para el cáncer.

Clasificación antigua:

  • C12Q1/00 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones.

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Suecia, Mónaco, Portugal, Irlanda, Eslovenia, Finlandia, Rumania, Chipre, Lituania, Letonia, Ex República Yugoslava de Macedonia, Albania.

PDF original: ES-2366204_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Ácido nucleico y proteína correspondiente, denominada 184P1E2, útiles en el tratamiento y la detección de cáncer Campo de la invención La invención que se describe en el presente documento se refiere a un gen y a su proteína codificada, denominada 184P1E2, expresada en determinados tipos de cáncer, y a procedimientos de diagnóstico y terapéuticos y a composiciones útiles en el tratamiento de tipos de cáncer que expresan 184P1E2. Antecedentes de la invención ES 2 366 204 T3 El cáncer es la segunda causa más importante de muerte en seres humanos después de las enfermedades coronarias. En todo el mundo, millones de personas mueren por cáncer cada año. Sólo en los Estados Unidos, tal como informa la Sociedad Estadounidense del Cáncer, el cáncer causa anualmente la muerte de más de medio millón de personas, diagnosticándose cada año más de 1,2 millones de casos nuevos. Mientras que las muertes por enfermedades cardiacas han disminuido significativamente, las provocadas por cáncer, en general, están en aumento. Se ha predicho que el cáncer se convertira en la primera causa de muerte en la primera parte del próximo siglo. A nivel mundial, destacan varios tipos de cáncer como las principales causas de muerte. En particular, los carcinomas de pulmón, próstata, mama, colon, páncreas y ovarios representan las causas principales de muerte por cáncer. Éstos, y virtualmente todos los demás, carcinomas comparten unas características comunes letales. Con muy pocas excepciones, la enfermedad metastática producida por un carcinoma tiene consecuencias fatales. Además, incluso para los pacientes con cáncer que sobrevivien inicialmente al cáncer primario, experiencias comunes han mostrado que sus vidas se han visto alteradas de forma drástica. Muchos pacientes de cáncer sufren una ansiedad intensa provocada por la toma de conciencia del potencial de recurrencia o de fracaso en el tratamiento. Muchos pacientes de cáncer sufren debilidad física después del tratamiento. Además, muchos pacientes de cáncer sufren una recurrencia. A nivel mundial, el cáncer de próstata es el cuarto cáncer más prevalente en varones. En Norteamérica y en el Norte de Europa, es de lejos el cáncer más común en varones y es la segunda causa principal de muerte por cáncer en varones. Sólo en los Estados Unidos, más de 30.000 varones mueren anualmente por esta enfermedad, segunda mortal después del cáncer de pulmón. A pesar de la magnitud de estas cifras, no existe aún un tratamiento eficaz contra el cáncer de próstata metastático. La prostatectomía quirúrgica, terapia de radiación, terapia de ablación hormonal, castración quirúrgica y quimioterapia continua son las modalidades de tratamiento principales. Desafortunadamente, estos tratamientos no son eficaces en muchos pacientes y están asociados a menudo con consecuencias no deseadas. En el frente diagnóstico, la falta de un marcador tumoral prostático que pueda detectar con exactitud tumores localizados en su etapa temprana continúa siendo una limitación significativa en el diagnóstico y el tratamiento de esta enfermedad. Aunque el ensayo de antígeno específico prostático (PSA) en suero ha sido un instrumento útil, se considera generalmente que su especificidad y utilidad general, no obstante, presenta carencias en varios aspectos importantes. El progreso en la identificación adicional de marcadores específicos para el cáncer de próstata ha mejorado mediante la generación de xenoinjertos de cáncer de próstata que pueden dar lugar a diferentes etapas de la enfermedad en ratones. Los xenoinjertos de LAPC (Cáncer de Próstata de Los Angeles) son xenoinjertos de cáncer de próstata que han sobrevivido al paso en ratones con inmunodeficiencia combinada grave (SCID) y que han mostrado la capacidad de imitar la transición de dependencia andrógena a independencia andrógena (Klein y col., 1997, Nat. Med. 3:402). Márcadores de cáncer de próstata identificados más recientemente incluyen PCTA-1 (Su y col., 1996, Proc. NatI. Acad. Sci. USA 93: 7252), antígeno de membrana específico de la próstata (PSM) (Pinto y col., Clin Cancer Res 1996 Sep 2(9): 1445-51), STEAP (Huberty col., Proc NatI Acad Sci USA. 1999 Dic 7; 96(25): 14523-8) y antígeno de células madre prostáticas (PSCA) (Reiter y col., 1998, Proc. NatI. Acad. Sci. USA 95: 1735). Mientras que los marcadores identificados previamente tales como PSA, PSM, PCTA y PSCA han facilitado los esfuerzos para diagnosticar y tratar cáncer de próstata, existe la necesidad de identificar marcadores adicionales y dianas terapéuticas para cáncer de próstata y cánceres relacionados con el fin de mejorar el diagnóstico y la terapia. El carcinoma celular renal (RCC) es responsable de aproximadamente el 3 por ciento de los tumores malignos en adultos. Cuando los adenomas alcanzan un diámetro de 2 a 3 cm, existe un cáncer potencial. En el adulto, los dos tumores malignos renales principales son el adenocarcinoma celular renal y el carcinoma celular transicional de la pelvis renal o la uretra. La incidencia del adenocarcinoma celular renal se estima en más de 29.000 casos en los Estados Unidos, y más de 11.600 pacientes muertos por esta enfermedad en el año 1998. El carcinoma celular transicional es menos frecuente, con una incidencia de aproximadamente 500 casos por año en los Estados Unidos. Durante muchas décadas, la cirugía ha sido la terapia principal para el adenocarcinoma celular renal. Hasta tiempos recientes, la enfermedad metastática se ha resistido a cualquier terapia sistémica. Con los descubrimientos recientes 2 ES 2 366 204 T3 en terapias sistémicas, en particular las inmunoterapias, el carcinoma celular renal metastático puede tratarse de forma agresiva en pacientes apropiados con posibilidad de respuestas duraderas. No obstante, existe todavía la necesidad de terapias eficaces para estos pacientes. De todos los casos nuevos de cáncer en los Estados Unidos, el cáncer de vejiga representa aproximadamente el 5 por ciento en varones (el quinto neoplasma más común) y el 3 por ciento en mujeres (el octavo neoplasma más común). La incidencia está aumentando lentamente, paralelamente al aumento de la población de edad avanzada. En 1998, hubo 54.500 casos estimados: 39.500 en varones y 15.000 en mujeres. La incidencia en función de la edad en los Estados Unidos es de 32 por cada 100.000 en varones y de 8 por cada 100.000 en mujeres. La relación histórica varon/mujer de 3:1 puede disminuir en función de los índices de tabaquismo en mujeres. Hubo un número estimado de 11.000 muertes por cáncer de vejiga en 1998 (7.800 en varones y 3.900 en mujeres). La incidencia de cáncer de vejiga y la mortalidad aumentan de manera considerable con la edad y será un problema creciente con el aumento de edad de la población. La mayor parte de los cánceres de vejiga vuelven a aparecer en la vejiga. El cáncer de vejiga se trata con una combinación de resección transuretral de la vejiga (TUR) y quimioterapia o inmunoterapia intervesical. La naturaleza multifocal y recurrente del cáncer de vejiga muestra las limitaciones de la TUR. Los cánceres más invasivos del músculo no se curan usando únicamente TUR. La cistectomía radical y la diversión urinaria son los medios más eficaces para eliminar el cáncer, pero no se puede negar el efecto que conllevan sobre la función urinaria y sexual. Existe todavía una necesidad significativa de modalidades de tratamiento que sean beneficiosas para pacientes con cáncer de vejiga. En el año 2000 se estimaron 130.200 casos de cáncer colorrectal en los Estados Unidos, que incluían 93.800 casos de cáncer de colon y 36.400 casos de cáncer rectal. Los cánceres colorrectales son los térceros cánceres más comunes en hombres y mujeres. Las tasas de incidencia disminuyeron significativamente durante el periodo 1992­ 1996 (-2,1 % por año). Las investigaciones sugieren que esta disminución se ha debido al aumento de la detección y la eliminación de pólipos, previniendo la progresión de pólipos a cánceres invasivos. Se estimaron 56.300 muertes (47.700 por cáncer de colon, 8.600 por cáncer rectal) en el año 2000, lo que se traduce en el 11 % de todas las muertes por cáncer en los Estados Unidos. Actualmente, la cirugía es la forma más común de terapia para el cáncer colorrectal y para cánceres que no se han expandido, y es frecuentemente curativa. La quimioterapia o la quimioterapia más radiación se administran antes o después de la cirugía a la mayor parte de los pacientes con cáncer que haya perforado profundamente la pared intestinal o se haya extendido a los ganglios linfáticos. Ocasionalmente es necesaria una colostomía permanente (creación de una abertura abdominal para eliminar desechos corporales) para el cáncer de colon, que es necesaria con poca frecuecia para el cáncer rectal. Existe todavía la... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un procedimiento in vitro para detectar la presencia de una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos que se muestra en la figura 2A, 2B o 2C en una muestra de ensayo que comprende: poner en contacto la muestra con un anticuerpo que se une específicamente a la proteína; y detectar la unión de la proteína de la muestra al mismo, proporcionando la presencia elevada de proteína en la muestra de ensayo con relación a la muestra de tejido normal una indicación de la presencia de cáncer de riñón, vejiga y pulmón. 2. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la etapa de determinación comprende comparar una cantidad de unión del anticuerpo que se une específicamente a la proteína con la presencia de la proteína en una muestra normal correspondiente. 3. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 2, en el que el anticuerpo es monoclonal. 4. El procedimiento de la reivindicación 3, en el que el anticuerpo monoclonal es una proteína recombinante. 5. El procedimiento de la reivindicación 4, en el que el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal monocatenario. 6. El procedimiento de la reivindicación 4, en el que el anticuerpo es un anticuerpo humano. 7. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en el que el anticuerpo se etiqueta con un marcador detectable. 8. El procedimiento de la reivindicación 7, en el que el marcador detectable se selecciona del grupo constituido por un isótopo radioactivo, un compuesto fluorescente, un compuestos bioluminiscente, un compuesto quimioluminiscente, un quelador de metales o una enzima. 9. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, en el que el anticuerpo comprende adicionalmente un vehículo farmacéuticamente aceptable. 10. Un anticuerpo o fragmento del mismo que se une inmunoespecíficamente a un epítopo de una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos que se muestra en la figura 2A, 2B o 2C, para su uso en el diagnóstico de cáncer de vejiga, de riñón o de pulmón. 314 ES 2 366 204 T3 Figura 1: Secuencia SHH de 184P1E2 de 132 nucleótidos ES 2 366 204 T3 Figura 2A. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.1. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 316 ES 2 366 204 T3 317 ES 2 366 204 T3 318 ES 2 366 204 T3 319 ES 2 366 204 T3 Figura 2B. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.2. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. ES 2 366 204 T3 321 ES 2 366 204 T3 322 ES 2 366 204 T3 Figura 2C. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.3. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 323 ES 2 366 204 T3 324 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 Figura 2D. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.4. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 326 ES 2 366 204 T3 327 ES 2 366 204 T3 328 ES 2 366 204 T3 Figura 2E. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.5. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 329 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 331 ES 2 366 204 T3 Figura 2F. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.6. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 332 ES 2 366 204 T3 333 ES 2 366 204 T3 334 ES 2 366 204 T3 Figura 2G. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.7. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. ES 2 366 204 T3 336 ES 2 366 204 T3 337 ES 2 366 204 T3 Figura 2H. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.8. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 338 ES 2 366 204 T3 339 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 Figura 2I. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.9. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 341 ES 2 366 204 T3 342 ES 2 366 204 T3 343 ES 2 366 204 T3 Figura 2J. La secuencia de ADNc y aminoácidos de 184P1E2 v.10. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 42-2036 incluido el codón de detención. 344 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 346 Figura 3A. Secuencia de aminoácidos de 184P1E2 v.1. La proteína 184P1E2 v.1 tiene 664 aminoácidos. Figura 3B. Secuencia de aminoácidos de 184P1E2 v.2. La proteína 184P1E2 v.2 tiene 664 aminoácidos. ES 2 366 204 T3 347 Figura 3C. Secuencia de aminoácidos de 184P1E2 v.3. La proteína 184P1E2 v.3 tiene 664 aminoácidos. ES 2 366 204 T3 348 Figura 4A. Alineamiento de la secuencia de ácidos nucleicos de 184P1E2v.1 con peptidilarginina deiminasa tipo III humana. Las diferencias de ácidos nucleicos están subrayadas. Recuento = 6294 bits (3175), Esperado = 0,0 Identidades = 3181/3183 (99 %) Cadena = plus/plus ES 2 366 204 T3 349 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 351 ES 2 366 204 T3 352 ES 2 366 204 T3 353 ES 2 366 204 T3 354 Figura 4B. Alineamiento de la secuencia de aminoácidos de 184P1E2 v.1 con peptidilarginina deiminasa tipo III humana. La variación de aminoácidos en la posición 480 está subrayada. Recuento = 1396 bits (3613), Esperado = 0,0 ES 2 366 204 T3 Identidades = 663/664 (99 %), Positivos = 663/664 (99 %) Figura 4C. Alineamiento de la secuencia de aminoácidos de 184P1E2 v.1 con peptidilarginina deiminasa tipo III de ratón. Recuento = 1237 bits (3200), Esperado = 0,0 ES 2 366 204 T3 Identidades = 582/664 (87 %), Positivos = 624/664 (93 %) 356 Figura 4D. Alineamiento de la secuencia de aminoácidos de 184P1E2 con peptidilarginina deiminasa tipo III de rata. Recuento = 1233 bits (3189), Esperado = 0,0 ES 2 366 204 T3 Identidades = 580/664 (87 %), Positivos = 622/664 (93 %) 357 Figura 12. Composiciones Exon de 184P1E2 v.1 ES 2 366 204 T3 358 ES 2 366 204 T3 359 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 361 ES 2 366 204 T3 362 ES 2 366 204 T3 363 ES 2 366 204 T3 364 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 366 ES 2 366 204 T3 367 ES 2 366 204 T3 368 ES 2 366 204 T3 369 ES 2 366 204 T3 ES 2 366 204 T3 371 ES 2 366 204 T3 372

 

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