Proteínas de enlazamiento a la metaloproteinasa.

Una proteína aislada que comprende una secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de cadena pesada (HC) y una secuencia de dominio variable de inmunoglobulina cadena ligera (LC),

en donde las secuencias de dominio variable de inmunoglobulina de HC y LC forman un sitio de enlazamiento al antígeno que se enlaza a, e inhibe una MMP-14; en donde la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de HC comprende una región determinante de complementariedad de HC (CDR) 1, CDR2, y CDR3 y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende una CDR1, CDR2, y CDR3 de LC, y en donde las secuencias de dominio variable de inmunoglobulina comprenden lo siguiente

(i) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 156, la secuencia de CDR2 de HC comprende los residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 156, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 104 de la SEQ ID NO: 156; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 25 - 35 de la SEQ ID NO: 157, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuos 51 - 57 de la SEQ ID NO: 157, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 90 - 99 de la SEQ ID NO: 157;

(ii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 144, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 144, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 115 de la SEQ ID NO: 144; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 25 - 40 de la SEQ ID NO: 145, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuos 56 - 62 de la SEQ ID NO: 145, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 95 - 103 de la SEQ ID NO: 145;

(iii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 146, la secuencia de CDR2 de HC comprende los residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 146, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 114 de la SEQ ID NO: 146; la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 23 - 35 de la SEQ ID NO: 147, la secuencia de CDR2 de LC comprende residuos 51 - 57 de la SEQ ID NO: 147, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 90 - 101 de la SEQ ID NO: 147;

(iv) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 148, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 148, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 109 de la SEQ ID NO: 148; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 25 - 35 de la SEQ ID NO: 149, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuos 51 - 57 de la SEQ ID NO: 149, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 90 - 98 de la SEQ ID NO: 149;

(v) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 150, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 150, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 114 de la SEQ ID NO: 150; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 25 - 40 de la SEQ ID NO: 151, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuos 56 - 62 de la SEQ ID NO: 151, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 95 - 103 de la SEQ ID NO: 151;

(vi) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 152, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 152, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 114 de la SEQ ID NO: 152; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 25 - 35 de la SEQ ID NO: 153, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuos 51 - 57 de la SEQ ID NO: 153, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 90 - 98 de la SEQ ID NO: 153;

(vii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 154, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 154, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 107 de la SEQ ID NO: 154; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 25 - 36 de la SEQ ID NO: 155, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuos 52 - 58 de la SEQ ID NO: 155, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 91 - 99 de la SEQ ID NO: 155;

(viii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuos 31 - 35 de la SEQ ID NO: 158, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuos 50 - 66 de la SEQ ID NO: 158, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 - 108 de la SEQ ID NO: 158; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuos 25 - 36 de la SEQ ID NO: 159, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuos 52 - 58 de la SEQ ID NO: 159, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuos 91 - 98 de la SEQ ID NO: 159.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2006/049566.

Solicitante: DYAX CORPORATION.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 300 TECHNOLOGY SQUARE, 8TH FLOOR CAMBRIDGE, MA 02139 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: LADNER, ROBERT, C., WOOD, CLIVE, R., HOET,René, DRANSFIELD,DANIEL T, DEVY,LAETITIA, PIETERS,HENK, HENDERIKX,MARIA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K16/40 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra enzimas.

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Fragmento de la descripción:

Proteínas de enlazamiento a la metaloproteinasa Antecedentes Las metaloproteinasas de matriz (MMP) del tipo asociado a la membrana (MT) constituyen un subgrupo de las MMP ancladas a la membrana que son los mediadores principales de la proteólisis pericelular y activadores fisiológicos de la pro-MMP-2. Las MT-MMP activan la forma zimogénica de MMP-2 (pro-MMP-2 o pro-gelatinasa A) (Hernández-Barrantes et al., 2002, Semin. Cancer Biol, 12: 131 -8; Zucker et al, 2003, Curr Top Dev Biol, 54: 1 -74) . La MMP-2, a su vez, puede activar la pro-MMP-9 (Toth et al., 2003, Biochem Biophys Res Commun, 308: 386 -95) . Las MT-MMP comprenden seis miembros de las MMP atadas al plasma, que incluyen cuatro enzimas transmembrana de tipo I (MMP-14, MMP-15, MMP-16 y MMP-24) y dos enzimas ancladas a glicosilfosfatidilinositol (MMP-17 y MMP-25) (Zhao et al., 2004, J Biol Chem, 279: 8592 -8601) . Además de ser potentes enzimas degradadoras de la matriz extracelular (ECM) , las MT-MMP transmembrana de tipo I también pueden iniciar una cascada de activación de zimógeno en la superficie celular.

Gálvez et al. (2001) J. Biol. Chem. 276: 37491 -37500 describen la generación de anticuerpos monoclonales de ratón contra MMP-14 y su uso en ensayos in vitro para estudiar la función de MMP-14 en la motilidad endotelial y la remodelación de la matriz.

Resumen Esta descripción se refiere, entre otras cosas, a las proteínas que se enlazan a MMP-14, denominadas en el presente documento como "proteínas de enlazamiento a la MMP-14", y a métodos de identificación y utilización de tales proteínas. Estas proteínas incluyen anticuerpos y fragmentos de anticuerpos (por ejemplo, anticuerpos de primates y los Fab, especialmente anticuerpos humanos y los Fab) que se enlazan a y/o inhiben la MMP-14 (por ejemplo, la MMP-14 humana) . Las proteínas de enlazamiento a la MMP-14 se pueden utilizar en el tratamiento de enfermedades, particularmente enfermedades humanas, tales como el cáncer, en las que existe una actividad excesiva o inapropiada de la MMP-14. En muchos casos, las proteínas tienen una toxicidad baja tolerable o ninguna toxicidad. Entre estas proteínas de enlazamiento a la MMP-14, las proteínas aisladas de acuerdo con la invención se definen como en las reivindicaciones.

Algunas de estas proteínas de enlazamiento también se enlazan a y/o inhiben otras enzimas transmembrana de tipo I, tales como la MMP-16 y la MMP-24. La capacidad de inhibir dos o más de las MMP-14, MMP-16, y MMP-24 es útil para tratar enfermedades y condiciones a las que contribuyen estas MMP colectivamente.

En un aspecto, la divulgación presenta una proteína (por ejemplo, una proteína aislada) que se enlaza a la MMP-14 (por ejemplo, MMP-14 humana) e incluye al menos una región variable de inmunoglobulina. Por ejemplo, la proteína incluye una secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de cadena pesada (HC) y una secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de cadena ligera (LC) . En una realización, la proteína se enlaza a, e inhibe la MMP-14, por ejemplo, la MMP-14 humana.

La proteína puede incluir una o más de las siguientes características: (a) una CDR humana o región marco humana;

(b) la secuencia del dominio variable de inmunoglobulina de HC comprende una o más CDR que son al menos 85, 88, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98, 99, o 100% idénticas a una CDR de un dominio variable de LC descrito en el presente documento; (c) la secuencia del dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende una o más CDR que son al menos 85, 88, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98, 99, o 100% idénticas a una CDR de un dominio variable de HC descrito en el presente documento; (d) la secuencia del dominio variable de inmunoglobulina de LC es al menos 85, 88, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98, 99, o 100% idéntica a un dominio variable de LC descrito en este documento; (e) la secuencia del dominio variable de inmunoglobulina de HC es de al menos 85, 88, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98, 99, o 100% idéntica a un dominio variable de HC descrito en el presente documento; (f) la proteína se enlaza a un epítopo enlazado por una proteína descrita en este documento, o un epítopo que se traslapa con tale epítopo; y (g) una CDR de primate o región marco de primate.

La proteína puede enlazarse a la MMP-14, por ejemplo, la MMP-14 humana, con una afinidad de enlazamiento de al menos 105, 106, 107, 108, 109, 1010 y 1011 M-1. En una realización, la proteína se enlaza a la MMP-14 con una Kno activada más lenta que 1 X 10-3, 5 X 10-4 s-1 o 1 X 10-4 s-1. En una realización, la proteína se enlaza a la MMP-14 con una Kactivada más rápida que 1 X 102, 1 X 103, o 5 x 103 M-1 s-1. En una realización, la proteína inhibe la actividad de la MMP-14 humana, por ejemplo, con una Ki de menos de 10-5, 10-6, 10-7, 10-8, 10-9, y 10-10 M. La proteína puede tener, por ejemplo, una IC50 de menos de 100 nM, 10 nM o 1 nM. Por ejemplo, la proteína modula en enlazamiento de la MMP-14 a proMMP-2, por ejemplo, mediante la inhibición de la activación de proMMP-2. La proteína puede inhibir la activación de la MMP-14 de pro-MMP2 in vitro en células HT-1080 activadas con PMA. La afinidad de la proteína por la MMP-14 se puede caracterizar por una KD de menos de 100 nm, menos de 10 nM, o menos de 2, 4 nM.

En una realización, la proteína se enlaza el dominio catalítico de la MMP-14 humana, por ejemplo, los residuos de los contactos de proteínas en o cerca del sitio activo de la MMP-14.

En una realización, la proteína también se enlaza a la MMP-16 y/o la MMP-24, por ejemplo, con una afinidad de enlazamiento de al menos 105, 106, 107, 108, 109, 1010 y 1011 M-1. Por ejemplo, la proteína se enlaza tanto a la MMP14 como a la MMP-16 o la MMP-24 con una afinidad de enlazamiento de al menos 105, 106, 107, 108, 109, 1010 y 1011

M-1 .

En una realización preferida, la proteína es un anticuerpo humano que tiene las cadenas ligera y pesada de anticuerpos escogidos de la lista que comprende M0031-C02, M0031-F01, M0033-H07, M0037-C09, M0037-D01, M0038-E06, M0038-F01, M0038-F08, M0039-H08, M0040-A06, M0040-A11 Y M0043-G02. En una realización preferida, la proteína es un anticuerpo humano que tiene su cadena pesada escogida de la lista que comprende M0031-C02, M0031-F01, M0033-H07, M0037-C09, M0037-D01, M0038-E06, M0038-F01, M0038-F08, M0039-H08, M0040-A06, M0040-A11 y M0043-G02. En una realización preferida, la proteína es un anticuerpo humano que tiene su cadena ligera escogida de la lista que comprende M0031-C02, M0031-F01, M0033-H07, M0037-C09, M0037-D01, M0038-E06, M0038-F01, M0038-F08, M0039-H08, M0040-A06, M0040-A11 y M0043-G02. En una realización preferida, la proteína es un anticuerpo humano que tiene una o más CDR de cadena pesada escogidas de las CDR correspondientes de la lista de cadenas pesadas que comprende M0031-C02, M0031-F01, M0033-H07, M0037-C09, M0037-D01, M0038-E06, M0038-F01, M0038-F08, M0039-H08, M0040-A06, M0040-A11 y M0043-G02. En una realización preferida, la proteína es un anticuerpo humano que tiene una o más CDR de cadena ligera escogidas de las CDR correspondientes de la lista de cadenas pesadas que comprende M0031-C02, M0031-F01, M0033-H07, M0037-C09, M0037-D01, M0038-E06, M0038-F01, M0038-F08, M0039-H08, M0040-A06, M0040-A11 y M0043-G02.

En una realización, las secuencias de dominio variable de LC y de HC son componentes de la misma cadena polipeptídica. En otra, las secuencias de dominio variable de LC y de HC son componentes de diferentes cadenas polipeptídicas. Por ejemplo, la proteína es una IgG, por ejemplo, IgG1, IgG2, IgG3, o IgG4. La proteína puede ser un Fab soluble. En otra implementación la proteína incluye un Fab2', scFv, minicuerpo, la fusión scFv::Fc, la fusión Fab::HSA, la fusión HSA::Fab, la fusión Fab::HSA::Fab, u otra molécula que comprende al sitio de combinación del antígeno de una de las proteínas de enlazamiento de la presente invención. Las regiones VH y VL de estos Fab se pueden proveer como IgG, Fab, Fab2, Fab2', scFv, Fab PEGilado, scFv PEGilado, Fab2 PEGilado, VH::CH1::HSA + LC, HSA::VH::CH1 + LC , LC::HSA + VH::CH1, HSA::LC + VH::CH1, u otra construcción apropiada.

En una realización, la proteína es un anticuerpo humano o humanizado o es no inmunogénico en un ser humano. Por ejemplo, la proteína incluye una o más regiones marco de anticuerpo humano, por ejemplo, todas las regiones marco humanas. En una realización, la proteína incluye un dominio de Fc humano, o un dominio de Fc que es al menos 95, 96, 97, 98, o 99% idéntico a un dominio de Fc humano.

En una realización, la proteína es un anticuerpo de primate o primatizado o es no inmunogénico en un ser humano. Por ejemplo, la proteína incluye una o más regiones marco de anticuerpo de primate, por ejemplo, todas las regiones marco de primates.... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Una proteína aislada que comprende una secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de cadena pesada (HC) y una secuencia de dominio variable de inmunoglobulina cadena ligera (LC) , en donde las secuencias de dominio variable de inmunoglobulina de HC y LC forman un sitio de enlazamiento al antígeno que se enlaza a, e inhibe una MMP-14; en donde la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de HC comprende una región determinante de complementariedad de HC (CDR) 1, CDR2, y CDR3 y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende una CDR1, CDR2, y CDR3 de LC, y en donde las secuencias de dominio variable de inmunoglobulina comprenden lo siguiente

(i) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 156, la secuencia de CDR2 de HC comprende los residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 156, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuo.

99. 104 de la SEQ ID NO: 156; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 35 de la SEQ ID NO: 157, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

51. 57 de la SEQ ID NO: 157, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

90. 99 de la SEQ ID NO: 157;

(ii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 144, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 144, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 115 de la SEQ ID NO: 144; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 40 de la SEQ ID NO: 145, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

56. 62 de la SEQ ID NO: 145, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

95. 103 de la SEQ ID NO: 145;

(iii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 146, la secuencia de CDR2 de HC comprende los residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 146, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuo.

99. 114 de la SEQ ID NO: 146; la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

23. 35 de la SEQ ID NO: 147, la secuencia de CDR2 de LC comprende residuo.

51. 57 de la SEQ ID NO: 147, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

90. 101 de la SEQ ID NO: 147;

(iv) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 148, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 148, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 109 de la SEQ ID NO: 148; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 35 de la SEQ ID NO: 149, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

51. 57 de la SEQ ID NO: 149, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

90. 98 de la SEQ ID NO: 149;

(v) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 150, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 150, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 114 de la SEQ ID NO: 150; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 40 de la SEQ ID NO: 151, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

56. 62 de la SEQ ID NO: 151, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

95. 103 de la SEQ ID NO: 151;

(vi) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 152, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 152, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 114 de la SEQ ID NO: 152; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 35 de la SEQ ID NO: 153, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

51. 57 de la SEQ ID NO: 153, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

90. 98 de la SEQ ID NO: 153;

(vii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 154, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 154, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 107 de la SEQ ID NO: 154; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 36 de la SEQ ID NO: 155, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

52. 58 de la SEQ ID NO: 155, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

91. 99 de la SEQ ID NO: 155;

(viii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 158, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 158, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 108 de la SEQ ID NO: 158; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 36 de la SEQ ID NO: 159, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

52. 58 de la SEQ ID NO: 159, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

91. 98 de la SEQ ID NO: 159;

(ix) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 160, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 160, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 106 de la SEQ ID NO: 160; la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 35 de la SEQ ID NO: 161, la secuencia de CDR2 de LC comprende residuo.

51. 57 de la SEQ ID NO: 161, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

90. 99 de la SEQ ID NO: 161;

(x) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 162, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 162, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 113 de la SEQ ID NO: 162; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 40 de la SEQ ID NO: 163, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

56. 62 de la SEQ ID NO: 163, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

95. 103 de la SEQ ID NO: 163;

(xi) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 164, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 164, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 111 de la SEQ ID NO: 164; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

23. 36 de la SEQ ID NO: 165, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

52. 58 de la SEQ ID NO: 165, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

91. 101 de la SEQ ID NO: 165; o

(xii) la secuencia de CDR1 de HC comprende los residuo.

31. 35 de la SEQ ID NO: 166, la secuencia de CDR2 de HC comprende residuo.

50. 66 de la SEQ ID NO: 166, y la secuencia de CDR3 de HC comprende los residuos 99 117 de la SEQ ID NO: 166; y la secuencia de CDR1 de LC comprende los residuo.

25. 36 de la SEQ ID NO: 167, la secuencia de CDR2 de LC comprende los residuo.

52. 58 de la SEQ ID NO: 167, y la secuencia de CDR3 de LC comprende los residuo.

91. 95 de la SEQ ID NO: 167,

en donde la proteína aislada inhibe la actividad de MMP-14 con una IC50 de menos de 25 nM, según se mide en un ensayo in vitro para la inhibición de la actividad MMP-14 cuando la MMP-14 es de 2 pM, y Mca-Pro-Leu-Ala-Cys (Mob) -Trp-Ala-Arg-Dap (Dnp) -NH2 se utiliza como un sustrato.

2. La proteína aislada de la reivindicación 1, en donde la secuencia del dominio variable de inmunoglobulina de HC comprende

(a) la secuencia de la SEQ ID NO: 156, SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 154, SEQ ID NO: 158, SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 164, o SEQ ID NO: 166, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 156, SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 154, SEQ ID NO: 158, SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 164, o SEQ ID NO: 166;

(b) la secuencia de la SEQ ID NO: 156 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 156, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 157 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 157;

(c) la secuencia de la SEQ ID NO: 144, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 144, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 145 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 145;

(d) la secuencia de la SEQ ID NO: 146, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 146, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 147 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 147;

(e) la secuencia de la SEQ ID NO: 148, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 148, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 149 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 149;

(f) la secuencia de la SEQ ID NO: 150, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 150, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 151 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 151;

(g) la secuencia de la SEQ ID NO: 152, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 152, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 153 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 153;

(h) la secuencia de la SEQ ID NO: 154, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 154, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 155 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 155;

(i) la secuencia de la SEQ ID NO: 158, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 158, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 159 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 159;

(j) la secuencia de la SEQ ID NO: 160, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 160, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 161 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 161;

(k) la secuencia de la SEQ ID NO: 162, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 162, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 163 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 163;

(l) la secuencia de la SEQ ID NO: 164, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 164, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 165 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 165; o

(m) la secuencia de la SEQ ID NO: 166, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 166, y la secuencia de dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 167 o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 167.

3. La proteína aislada de la reivindicación 1, en donde la secuencia del dominio variable de inmunoglobulina de LC comprende la secuencia de la SEQ ID NO: 157, SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 155, SEQ ID NO: 159, SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 163, o SEQ ID NO: 165 o la SEQ ID NO: 167, o una secuencia que es al menos 85% idéntica a la SEQ ID NO: 157, SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 155, SEQ ID NO: 159, SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 163, o SEQ ID NO: 165 o la SEQ ID NO: 167.

4. La proteína de la reivindicación 1,

i) en donde la proteína se enlaza a la MMP-14 humana, en particular con una constante de disociación (KD) de menos de 100 nM, o menos de 10 nM; ii) en donde la proteína inhibe la actividad de una MMP-14 humana con una IC50 de menos de 10 nM; iii) en donde la proteína se enlaza al dominio catalítico de MMP-14 humana; iv) en donde la proteína inhibe el enlazamiento a la MMP-14 con proMMP-2; v) en donde la proteína inhibe la activación con MMP-14 de proMMP-2; vi) en donde la proteína se une a la MMP-16 o MMP-24; vii) en donde las secuencias de dominio variable de HC y LC son componentes de la misma cadena de polipéptido; viii) en donde las secuencias de dominio variable de HC y LC son componentes de diferentes cadenas de

polipéptidos; ix) en donde la proteína es una IgG; x) en donde la proteína es un fragmento Fab soluble; xi) en donde la proteína es un anticuerpo de primate o primatizado, o un anticuerpo humano o humanizado o no

provoca una respuesta inmunogénica en un ser humano normal; xii) en donde la proteína comprende una región marco de un anticuerpo de primate o de humano; xiii) en donde la proteína comprende un dominio Fc humano; xiv) en donde la proteína inhibe la activación con MMP-14 de pro-MMP-2 in vitro en células HT-1080 activadas con

PMA; xv) en donde la proteína es capaz de enlazarse a células tumorales que expresan MMP-14; o xvi) en donde la proteína es capaz de enlazar células tumorales que son células HT-1080, LNCaP, MDA-MB-231 o

PC3.

5. La proteína de la reivindicación 1, en donde la proteína es un anticuerpo de primate que tiene una afinidad por MMP-14 que se caracteriza por una KD de menos de 1, 2 nM.

6. Una composición farmacéutica que comprende la proteína de la reivindicación 1 y un portador farmacéuticamente aceptable.

7. Un anticuerpo de MMP-14 para su uso en la detección de MMP-14 en una muestra, que comprende la proteína de la reivindicación 1 y una etiqueta detectable.

8. Un método in vitro de inhibición de la actividad de MMP-14, comprendiendo el método: poner en contacto una MMP-14 con la proteína de la reivindicación 1, inhibiendo así la actividad de la MMP 14.

9. La proteína de acuerdo con la reivindicación 1, para uso en la detección de MMP 14 en un sujeto, en donde se formula la proteína para administración al sujeto

i) en donde la proteína comprende un marcador detectable, y

ii) en donde la detección comprende la formación de imágenes del sujeto.

10. La proteína de acuerdo con la reivindicación 1 para uso en un método para tratar el cáncer, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en una cantidad suficiente para tratar un cáncer en el sujeto, y opcionalmente, el cáncer es cáncer de cabeza y cuello, cáncer de la cavidad oral, cáncer de laringe, condrosarcoma, cáncer de mama, cáncer de ovario, carcinoma de testículo, melanoma, un tumor o tumores cerebrales.

11. La proteína de acuerdo con la reivindicación 1 para su uso en el tratamiento de un tumor metastásico en un sujeto, en donde se formula la proteína para administración al sujeto, en una cantidad suficiente para modular la actividad metastásica, en donde la proteína inhibe uno o más de: el crecimiento del tumor, embolismo del tumor, movilidad del tumor, invasividad del tumor, y proliferación celular del cáncer.

12. La proteína para uso de la reivindicación 10 u 11, donde la proteína es para uso con una segunda terapia que es un terapia contra el cáncer, y opcionalmente la segunda terapia comprende

i) un agente quimioterapéutico;

ii) un agente que antagoniza la señalización a través de una ruta de VEGF;

iii) bevacizumab;

iv) 5-FU, leucovorina o irinotecano;

v) un inhibidor de Tie1;

vi) un inhibidor de plasmina; o vii) un inhibidor de plasmina que comprende un dominio de Kunitz.

13. La proteína para uso de la reivindicación 10 u 11, donde la proteína es para uso con una segunda terapia que es un terapia contra el cáncer, en donde la terapia contra el cáncer se selecciona a partir de i) agentes antitubulina / antimicrotubulo, preferiblemente seleccionados a partir de paclitaxel, vincristina, vinblastina, vindesina, vinorelbina, taxotere;

ii) inhibidores de topoisomerasa, preferiblemente inhibidores de topoisomerasa I, más preferiblemente seleccionados a partir de irinotecano, topotecano, camptotecina, doxorubicina, etopósido, mitoxantrona, daunorubicina, idarrubicina, tenipósido, amsacrina, epirubicina, merbarona, clorhidrato de piroxantrona;

iii) antimetabolitos, preferiblemente seleccionados a partir de 5 fluorouracilo (5 FU) , metotrexato, 6-mercaptopurina, 6-tioguanina, fosfato de fludarabina, citarabina / Ara C, trimetrexato, gemcitabina, acivicina, alanosina, pirazofurina, N-fosforacetil-L-aspartato = PALA, pentostatina, 5 azacitidina, 5 Aza 2' desoxicitidina, ara A, cladribina, 5 fluorouridina, FUDR, tiazofurina, N-[5-[N- (3, 4-dihidro-2-metil-4-oxoquinazolin-6-ilmetil) -N-metilamino]-2-tenoil]-ácido L-glutámico;

iv) agentes alquilantes, o agentes de intercalación, preferiblemente seleccionados a partir de cisplatino, carboplatino, mitomicina C, BCNU = Carmustina, melfalán, tiotepa, busulfán, clorambucil, plicamicina, dacarbazina, fosfato de ifosfamida, ciclofosfamida, mostaza de nitrógeno, mostaza de uracilo, pipobromán, 4 ipomeanol;

v) agentes que producen apoptosis, preferiblemente en donde el agente apoptótico es actinomicina D;

vi) radiación;

vii) anticuerpos contra antígenos asociados a tumores, seleccionados preferiblemente a partir de anticuerpos desnudos, inmunotoxinas, y radioconjugados;

viii) agentes seleccionados del grupo que consiste de interferón, dihidrolenperona, espiromustina, y desipeptido; y

ix) anti-hormonas, preferentemente seleccionadas a partir de antiestrógenos y antiandrógenos, más preferiblemente seleccionadas a partir de tamoxifeno, .

4. ciano-3- (4-fluorofenilsulfonil) -2-hidroxi-2-metil-3'- (trifluorometil) propionanilida.

14. La proteína de la reivindicación 1 para su uso en i) el tratamiento de una enfermedad inflamatoria, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en una cantidad suficiente para tratar la enfermedad inflamatoria;

ii) el tratamiento de una enfermedad de la córnea seleccionada del grupo que consiste de infección corneal y queratocono, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en una cantidad suficiente para tratar la enfermedad de la córnea seleccionada del grupo que consiste de infección corneal y queratocono;

iii) el tratamiento de la artritis reumatoide, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en una cantidad suficiente para tratar la artritis reumatoide;

iv) el tratamiento de la osteoartritis, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en una cantidad suficiente para el tratamiento de la osteoartritis;

v) el tratamiento de la diabetes, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en una cantidad suficiente para tratar la diabetes; o vi) el tratamiento de un tumor, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en una cantidad suficiente para tratar el tumor.

15. La proteína de acuerdo con la reivindicación 1, para uso en la formación de imágenes de un sujeto, en donde la proteína se asocia físicamente con un marcador detectable, y opcionalmente el sujeto tiene o se sospecha que tiene un tumor.

16. La proteína para uso de la reivindicación 10, 11 o 14, en donde la proteína de la reivindicación 1 se administra en combinación con uno o más inhibidores de MMP, y opcionalmente

i) los uno o más inhibidores de MMP son inhibidores de molécula pequeña,

ii) los uno o más inhibidores de MMP son uno o más de neovastat, marmastat, BAY 12-9566, o prinomastat; o iii) los uno o más inhibidores de MMP incluyen una segunda proteína de enlazamiento a la MMP 14 de la reivindicación 1.

17. La proteína de la reivindicación 1 para su uso en i) el tratamiento de una enfermedad inflamatoria, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en combinación con una segunda terapia que es una terapia antiinflamatoria;

ii) el tratamiento de artritis reumatoide, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en combinación con una segunda terapia que comprende uno o más de los siguientes agentes: aspirina, naproxeno, ibuprofeno, etodolac, cortisona, un antiácido, sucralfato, inhibidores de la bomba de protones, misoprostol, oro, metotrexato, sulfasalazina, D-penicilamina, azatioprina, ciclofosfamida, clorambucil, ciclosporina, leflunomida, etanercept, infliximab, anakinra, adalimumab, o hidroxicloroquina;

iii) el tratamiento de la osteoartritis, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en combinación con una terapia anti-osteoartritis;

v) el tratamiento de la diabetes, en donde se formula la proteína para administración a un sujeto en combinación con un segunda terapia que comprende uno o más de los siguientes agentes: una sulfonilurea, una meglitinida, una biguanida, metformina, troglitazona, pioglitazona, rosiglitazona, acarbosa, pramlintida, exenatida, gliburida / metformina (Glucovance) , rosiglitazona / metformina (Avandamet) , o glipizida / metformina (Metaglip) ; o vi) el tratamiento de un tumor, en donde la proteína está acoplada a un agente que es una toxina o un fármaco quimioterapéutico.

FIGURA 1A

FIGURA 1B FIGURA 2 FIGURA 3 FIGURA 4 FIGURA 5


 

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