ADN polimerasas con actividad mejorada.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(07/03/2018). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12Q1/68, C12N15/10, C12N9/12.
Una ADN polimerasa que tiene al menos un 80 % de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 1 y que tiene una eficacia de transcriptasa inversa incrementada en comparación con una ADN polimerasa de control, en la que el aminoácido de la ADN polimerasa correspondiente a la posición 616 de la SEQ ID NO: 1 es M y en la que el aminoácido correspondiente a la posición 709 de SEQ ID NO: 1 se selecciona del grupo que consiste en K, R, S, G y A, y en la que la ADN polimerasa de control tiene la misma secuencia de aminoácidos que la ADN polimerasa, excepto que el aminoácido de la ADN polimerasa de control correspondiente a la posición 616 de la SEQ ID NO: 1 es I y el aminoácido correspondiente a la posición 709 de la SEQ ID NO: 1 es I.
PDF original: ES-2668448_T3.pdf
(23/08/2017) Un procedimiento para amplificar simultáneamente al menos un primer y un segundo ácidos nucleicos diana que pueden estar presentes en una muestra de fluido, comprendiendo dicho procedimiento las etapas automatizadas de:
d. poner en contacto ácidos nucleicos de dicha muestra con uno o más reactivos de amplificación que comprenden una polimerasa con actividad de transcriptasa inversa en al menos dos recipientes de reacción para la amplificación de al menos un primer y un segundo ácidos nucleicos diana en los al menos dos recipientes de reacción;
e. incubar en dichos recipientes de reacción dichos ácidos nucleicos con dichos uno o más reactivos de…
Sección de la CIP Química y metalurgia
(07/06/2017). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12Q1/70.
Un procedimiento para amplificar simultáneamente los genotipos 1, 2, 3 y/o 4 del virus de la hepatitis E si están presentes en una muestra biológica, que comprende las etapas de
(a) aislar ácidos nucleicos presentes en la muestra biológica;
(b) amplificar los ácidos nucleicos aislados en la etapa (a) usando un cebador directo no degenerado y una mezcla de dos cebadores inversos, en el que los cebadores directo e inverso son capaces de amplificar los genotipos 1, 2, 3 y 4 del virus de la hepatitis E, en el que la secuencia de ácido nucleico del cebador directo comprende la SEQ ID NO: 6 y la secuencia de ácido nucleico de la mezcla de dos cebadores inversos comprende la SE ID NO: 13 y la SEQ ID NO: 14.
PDF original: ES-2637489_T3.pdf
Supresión de amplificación no específica.
(24/08/2016) Un método para diseñar un oligonucleótido supresor para su uso en una reacción de amplificación de ácido nucleico para reducir la amplificación no específica, comprendiendo el método
(a) identificar una o más regiones de interés en el genoma de un organismo diana;
(b) para cada región de interés, realizar una búsqueda de la secuencia de genoma diana usando la región de interés como una consulta para identificar regiones de homología entre la región de interés y el genoma diana;
(c) seleccionar secciones de la región de interés que tienen las mayores regiones de homología en el genoma diana;
(d) diseñar uno o más oligonucleótidos en las secciones…
Polimerasas de DNA con actividad mejorada.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(10/02/2016). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12N9/12.
Un polimerasa de DNA que tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con Id. de Sec. Nº 1 y que tiene aumentada la eficiencia de la transcriptasa inversa en comparación con una polimerasa de DNA control, en el que el aminoácido de la polimerasa de DNA correspondiente a la posición 640 de Id. de Sec. Nº 1 es F, y en el que la polimerasa de DNA control tiene la misma secuencia de aminoácidos que la polimerasa de DNA, excepto que el aminoácido de la polimerasa de DNA control correspondiente a la posición 640 de Id. de Sec. Nº 1 es I.
PDF original: ES-2569723_T3.pdf
ADN polimerasas con discriminación incrementada de no correspondencia 3''.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(13/01/2016). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12N15/10, C12N9/12, C12N15/54.
ADN polimerasa que presenta una identidad de por lo menos 80% respecto a SEC ID nº 1 o a SEC ID nº 2 y que presenta una actividad de discriminación de no correspondencias 3' en comparación con una ADN polimerasa de control, en la que la ADN polimerasa comprende un motivo en el dominio de polimerasa que comprende:
A-G-H-P-F-N-L-N-S-R-D-Q-L-X10-R-V-L-F-D-E-L, en el que:
X10 es A, G, K o R (SEC ID nº 10), en el que la ADN polimerasa de control presenta la misma secuencia de aminoácidos que la ADN polimerasa excepto en que el aminoácido X10 de la ADN polimerasa de control es E.
PDF original: ES-2564692_T3.pdf
ADN polimerasas de actividad mejorada.
(16/12/2015) ADN polimerasa que presenta una eficiencia de transcriptasa inversa, tolerancia a no correspondencias, tasa de extensión y/o tolerancia de la TI y de inhibidores de polimerasa reducidas en comparación con una ADN polimerasa de control, en la que la ADN polimerasa presenta una identidad de secuencias de aminoácidos de por lo menos 80% respecto a una polimerasa seleccionada de entre el grupo que consiste de:
(a) SEC ID nº 1,
(b) SEC ID nº 2,
(c) SEC ID nº 3,
(d) SEC ID nº 4,
(e) SEC ID nº 5,
(f) SEC ID nº 6,
(g) SEC ID nº 7,
(h) SEC ID nº 32,
(i) SEC ID nº 33,
(j) SEC ID nº 34,
(k) SEC ID nº 35,
(l) SEC ID nº 36, y
(m) SEC ID nº 37,
y en la que el aminoácido de la ADN polimerasa correspondiente a la posición 709 de SEC ID nº 1 es cualquier aminoácido diferente de I, L o M, y en la que…
ADN polimerasas con actividad mejorada.
(09/12/2015) ADN polimerasa que tiene una mayor eficiencia de transcriptasa inversa, en comparación con una ADN polimerasa de control, en la que el aminoácido de la ADN polimerasa correspondiente a la posición 522 de la SEC ID Nº: 1 es cualquier aminoácido distinto de E y en la que la ADN polimerasa de control tiene la misma secuencia de aminoácidos que la ADN polimerasa, excepto que el aminoácido de la ADN polimerasa de control correspondiente a la posición 522 de la SEC ID Nº: 1 es E.
ADN polimerasas con diferenciación de desapareamientos 3'' aumentada.
(18/03/2015) Un ADN polimerasa que tiene al menos 80 % de identidad de secuencia con la SEC ID Nº: 1 y que tiene actividad de diferenciación de desapareamientos 3' aumentada en comparación con un ADN polimerasa de control, en la que la ADN polimerasa comprende un motivo en el dominio de polimerasa que comprende
A-G-H-P-F-N-L-N-S-R-D-Q-L-E-R-V-L-X13-D-E-L, en el que:
X13 es A, G, S, T, Y, D o K (SEC ID Nº: 11), y en el que la ADN polimerasa de control tiene la misma secuencia de aminoácidos que la ADN polimerasa excepto que el aminoácido X13 de la ADN polimerasa de control es F.
ADN polimerasas con discriminación incrementada de no correspondencias 3''.
(25/02/2015) ADN polimerasa que presenta una identidad de secuencia de por lo menos 80% respecto a SEC ID nº 1 y que presenta una actividad incrementada de discriminación de no correspondencias 3' en comparación con una ADN polimerasa de control, en la que la ADN polimerasa comprende un motivo en el dominio de polimerasa que comprende K-L-K-X2-T-X3-X4-D-P-L-P, en la que:
X2 es S o N,
X3 es C o N,
y X4 es V o I (SEC ID nº 11),
y en la que el aminoácido de la ADN polimerasa correspondiente a la posición 580 de SEC ID nº 1 es G y en la que la ADN polimerasa de control presenta la misma secuencia de aminoácidos que la ADN polimerasa excepto en que el aminoácido X3 de la ADN polimerasa de control es Y.
ADN polimerasas mutantes y métodos relacionados.
(20/08/2014) Una ADN polimerasa que comprende al menos el siguiente motivo en el dominio polimerasa:
T-G-R-L-S-S-Xb7-Xb8-P-N-L-Q-N (SEC ID Nº 32);
en la que
Xb7 es un aminoácido seleccionado entre S o T;
Xb8 es un aminoácido seleccionado entre G, T, R, K o L; y
la ADN polimerasa tiene al menos un 95% de identidad de secuencia con una polimerasa seleccionada entre el grupo que consiste en:
(a) una ADN polimerasa CS5 (SEC ID Nº 18);
(b) una ADN polimerasa CS6 (SEC ID Nº 9);
(c) una ADN polimerasa de Thermotoga maritima;
(d) una ADN polimerasa de Thermus aquaticus;
(e) una ADN polimerasa de Thermus thermophilus;
(f) una ADN polimerasa de Thermus flavus;
(g) una ADN polimerasa de Thermus filiformis;
(h) una ADN polimerasa de Thermus sp. sps17;
(i) una ADN polimerasa de Thermus sp. Z05;
(j)…
ADN polimerasa termoestable o termoactiva con actividad exonucleasa 3'' a 5'' atenuada.
(09/05/2012) AON polimerasa termoestable o termoactiva aislada que comprende un dominio de exonucleasa 3' a 5'derivada de una eubacteria termofílica del género Thermotoga, en la que dicho dominio de exonucleasa 3' a 5'comprende un motivo de secuencia que presenta la fórmula X5X6X7XSX9XlOX11X12X13X14 (SEC ID nº 1), en la que:X5 es un residuo alanina, X6 es un residuo alanina o un residuo asparagina, X7 es un residuo leucina, Xs es unresiduo lisina, Xg es un residuo fenilalanina, XlO es un residuo aspartato, X11 es un residuo tirosina, X12 es un residuolisina, X13 es un residuo valina y X14 es un residuo leucina, en la que dicha AON polimerasa muestra una actividad deexonucleasa 3' a 5' atenuada, de aproximadamente 6,5 ó inferior, aunque superior a O U/pmol, en la…
POLIMERASAS DE ADN TERMOESTABLES MODIFICADAS PARA SECUENCIACIÓN.
(23/02/2012) SE PROPORCIONAN POLIMERASAS TERMOESTABLES Y MODIFICADAS DE DNA QUE TIENEN UNA MAYOR EFICIENCIA PARA INCORPORAR NUCLEOTIDOS NO CONVENCIONALES, TALES COMO LOS MARCADOS CON COLORANTES DE LA FAMILIA DE LA FLUORESCEINA. ESTAS POLIMERASAS TERMOESTABLES MODIFICADAS DE DNA PUEDEN PREPARARSE POR PROCEDIMIENTOS CORRESPONDIENTES A LA TECNOLOGIA DEL DNA RECOMBINANTE. LAS POLIMERASAS DE DNA TERMOESTABLES RECOMBINANTES PREPARADAS DE ACUERDO CON LA PRESENTE INVENCION SON VENTAJOSAS EN MUCHAS APLICACIONES DE SINTESIS DEL DNA IN VITRO, TALES COMO EL SECUENCIAMIENTO DEL DNA, LA SINTESIS DEL DNA MARCADO Y LA PRODUCCION DE PRODUCTOS DE EXTENSION DE INICIADOR MARCADOS. LOS CITADOS…
REACTIVOS Y METODOS PARA LA TRANSCRIPCION INVERSA ACOPLADA A ALTA TEMPERATURA Y REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(16/12/2001). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12Q1/68.
SE PRESENTAN METODOS PARA LA REPLICA Y AMPLIFICACION DE SECUENCIAS DE ARN MEDIANTE POLIMERASAS DE ADN TERMOACTIVAS. LA REACCION DE TRANSCRIPCION INVERSA SE LLEVA A CABO EN UN TAMPON APROPIADO QUE CONTIENE UN TAMPON METALICO QUE TAMPONA LA CONCENTRACION DE CATIONES DIVALENTES Y CUYO TAMPON TAMPONA PREFERENTEMENTE TANTO EL PH COMO LA CONCENTRACION DE CATIONES DIVALENTES. DICHO CATION DIVALENTE ES PREFERENTEMENTE MN2+. EN UN ASPECTO PREFERENTE DE LA INVENCION, SE COPULA UNA TRANSCRIPCION INVERSA DE ALTA TEMPERATURA A UNA AMPLIFICACION DE ACIDO NUCLEICO EN UN TUBO, UN PROCESO ENZIMATICO EN EL QUE SE UTILIZA UNA POLIMERASA DE ADN TERMOESTABLE. TAMBIEN SE PRESENTAN LOS METODOS PARA ELIMINAR LA CONTAMINACION ARRASTRADA DE LAS AMPLIFICACIONES QUE SE FORMO EN REACCIONES DE TRANSCRIPCION INVERSA ANTERIORES. SE PRESENTAN LOS REACTIVOS Y KITS PARTICULARMENTE ADECUADOS PARA LOS METODOS DE LA PRESENTE INVENCION.
TRANSCRIPTASAS REVERSAS DE ALTA TEMPERATURA.
Sección de la CIP Química y metalurgia
(01/07/1997). Solicitante/s: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG. Clasificación: C12Q1/68, C12N15/10.
TRANSCRIPTASAS INVERSAS DE TEMPERATURA ALTA. SE PROPORCIONAN METODOS PARA LA REPLICA Y AMPLIFICACION DE SECUENCIAS DE RNA MEDIANTE POLIMERASAS DEL ADN TERMOACTIVAS. LA TRANSCRIPCION INVERSA DEL RNA ES CATALIZADA POR, POR EJEMPLO, 94 KDA TAQ, 62 KDA TAQ, NTTH Y POLIMERASA DEL ADN RECOMBINANTE TTH. LA TRANSCRIPCION INVERSA SE ACOPLA A LA AMPLIFICACION PCR EN UN PROCEDIMIENTO DE ENZIMA QUE UTILIZA UNA POLIMERASA TERMOESTABLE.