UN PROCEDIMIENTO PARA SELECCIONAR OLIGONUCLEOTIDOS CON UNA BAJA HIBRIDCION CRUZADA.

Resumen: Un procedimiento para proporcionar un conjunto de sondas para una matriz para secuestrar un conjunto deseado de objetivos en el que las sondas hibridan con sus objetivos pretendidos pero no hibridan sustancialmente con objetivos no pretendidos en una mezcla de muestra de objetivos pretendidos y objetivos no pretendidos, que comprende las etapas de: (a) determinar un conjunto de objetivos; (b) determinar un objetivo actual en particular de entre el conjunto de objetivos para sondear; (c) elegir una subcadena de una secuencia del objetivo actual y proporcionar su secuencia complementaria, que se convierte en la sonda candidata; (d) determinar que una sonda candidata satisface cualquier criterio deseado o requerido para las sondas; (e) calcular la Tm para la sonda candidata usando un modelo de hibridación; (f) calcular sustancialmente todas las posibles Tm de cruzamiento de la sonda candidata hibridando con todos los objetivos no pretendidos, y hallar la Tm de cruzamiento máximo; (g) calcular la delta Tm; (h) determinar si la delta Tm es de al menos 5°C; y (i) repetir las etapas (b) hacia delante hasta que se encuentren las sondas deseadas.

Solicitante: COMBIMATRIX CORPORATION

Nacionalidad: US

Inventor/es: ANDERSON, BROOKE, P.. MONTGOMERY, DONALD, D

Fecha de Publicación de la Concesión: 01/11/2006

Fecha Solicitud PCT: 25/01/2000

Fecha Concesión Europea: 22/03/2006

Clasificación Principal: G06F19/00

Países PCT: AT, BE, CH, DE, DK, ES, FR, GB, GR, IT, LI, LU, NL, SE, MC, PT, IE, SI, FI, RO, CY, EPO, LT, LV, MK, AL, AM, AZ, BY, GH, GM, KE, KG, KZ, LS, MD, MW, RU, SD, SL, TJ, TM, TZ, UG, ZW, BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, ML, MR, NE, SN, TD, TG, ARIPO, SZ, GW, OAPI, EAPO