Anticuerpos contra toxinas de Clostridium difficile y usos de los mismos.

Un anticuerpo monoclonal aislado, o porción de unión a antígeno del mismo,

que se une específicamente a la toxina B de Clostridium difficile (C. difficile) con una KD inferior a 10 x 10-10 M medida por resonancia de plasmones superficiales y neutraliza la toxina B de C. difficile, en donde el anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, comprende:

(a) una región variable de la cadena pesada que comprende las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de SEC ID Nº: 62, 64 y 66; y

(b) una región variable de la cadena ligera que comprende las secuencias de CDR1, CDR2 y CDR3 de SEC ID Nº: 68, 70 y 72.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E10010733.

Solicitante: UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: ONE BEACON STREET, 26TH FLOOR BOSTON, MA 02108 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: GRAZIANO,ROBERT, THOMAS,William,D, AMBROSINO,Donna, BABCOCK,Gregory,J, BROERING,Theresa, HERNANDEZ,Hector,Javier, LOWY,Israel, MANDELL,Robert, MOLRINE,Deborah, ZHANG,Hui-fen.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • A61K39/08 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 39/00 Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53). › Clostridium, p. ej. Clostridium tetani.
  • A61K39/395 A61K 39/00 […] › Anticuerpos (aglutininas A61K 38/36 ); Inmunoglobulinas; Inmunosuero, p. ej. suero antilinfocitario.
  • A61K39/40 A61K 39/00 […] › bacterianos.
  • A61K47/48
  • A61P1/00 A61 […] › A61P ACTIVIDAD TERAPEUTICA ESPECIFICA DE COMPUESTOS QUIMICOS O DE PREPARACIONES MEDICINALES.Medicamentos para el tratamiento de trastornos del tracto alimentario o del aparato digestivo.
  • A61P1/12 A61P […] › A61P 1/00 Medicamentos para el tratamiento de trastornos del tracto alimentario o del aparato digestivo. › Antidiarreicos.
  • A61P31/04 A61P […] › A61P 31/00 Antiinfecciosos, es decir antibióticos, antisépticos, quimioterápicos. › Agentes antibacterianos.
  • C07H21/04 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07H AZUCARES; SUS DERIVADOS; NUCLEOSIDOS; NUCLEOTIDOS; ACIDOS NUCLEICOS (derivados de ácidos aldónicos o sacáricos C07C, C07D; ácidos aldónicos, ácidos sacáricos C07C 59/105, C07C 59/285; cianohidrinas C07C 255/16; glicales C07D; compuestos de constitución indeterminada C07G; polisacáridos, sus derivados C08B; ADN o ARN concerniente a la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos o su aislamiento, preparación o purificación C12N 15/00; industria del azúcar C13). › C07H 21/00 Compuestos que contienen al menos dos unidades mononucleótido que tienen cada una grupos fosfato o polifosfato distintos unidos a los radicales sacárido de los grupos nucleósido, p. ej. ácidos nucleicos. › con desoxirribosilo como radical sacárido.
  • C07K16/12 C07 […] › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra materiales bacterianos.
  • C12N1/15 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 1/00 Microorganismos, p.ej. protozoos; Composiciones que los contienen (preparaciones de uso médico que contienen material de protozoos, bacterias o virus A61K 35/66, de algas A61K 36/02, de hongos A61K 36/06; preparación de composiciones de uso médico que contienen antígenos o anticuerpos bacterianos, p. ej. vacunas bacterianas, A61K 39/00 ); Procesos de cultivo o conservación de microorganismos, o de composiciones que los contienen; Procesos de preparación o aislamiento de una composición que contiene un microorganismo; Sus medios de cultivo. › modificados por la introducción de material genético extraño.
  • C12N1/21 C12N 1/00 […] › modificados por la introducción de material genético extraño.
  • C12N15/13 C12N […] › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Inmunoglobulinas.
  • C12N5/06
  • C12N5/10 C12N […] › C12N 5/00 Células no diferenciadas humanas, animales o vegetales, p. ej. líneas celulares; Tejidos; Su cultivo o conservación; Medios de cultivo para este fin (reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00). › Células modificadas por introducción de material genético extraño, p. ej. células transformadas por virus.
  • G01N33/554 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › siendo el soporte una célula o un fragmento de célula biológica, p. ej. células de bacterias, de levadura.
  • G01N33/569 G01N 33/00 […] › para microorganismos, p. ej. protozoarios, bacterias, virus.

PDF original: ES-2533492_T3.pdf

 


Fragmento de la descripción:

Anticuerpos contra toxinas de Clostridium difficile y usos de los mismos Antecedentes de la invención

Clostridium difficile (C. difficile) es una bacteria gram-negativa que produce enfermedad gastrointestinal en seres humanos. C. difficile es la causa más común de diarrea infecciosa en pacientes hospitalizados y es una de las infecciones nosocomiales más comunes en conjunto (Kelly y col., New Eng. J. Med., 330:257-62, 1994). En realidad, la enfermedad asociada a este patógeno puede aquejar a hasta tres millones de pacientes hospitalizados al año en Estados Unidos (McFarland y col., New Eng. J. Med., 320:204-10, 1989; Johnson y col., Lancet, 336:97-100, 1990).

El tratamiento con antibióticos tales como ampicilina, amoxicilina, cefalosporinas y clindamicina que altera la flora intestinal normal puede permitir la colonización del intestino con C. difficile y conduce a enfermedad por C. difficile (Kelly y Lamont, Annu. Rev. Med., 49:375-90, 1998). La aparición de enfermedad por C. difficile se produce normalmente cuatro a nueve días después de empezar el tratamiento con antibiótico, pero también puede producirse después de retirar la terapia con antibiótico. C. difficile puede producir síntomas que oscilan de diarrea y colitis leve a grave que incluye colitis pseudomembranosa (PMC), una forma grave de colitis caracterizada por dolor abdominal, diarrea líquida y enfermedad sistémica (por ejemplo, fiebre, náuseas). La enfermedad recurrente puede producirse en hasta el 20 % de los pacientes tratados de un primer episodio enfermedad, y aquellos que recayeron tienen un mayor riesgo de recaídas adicionales (Kelly y Lamont, Annu. Rev. Med., 49:375-90, 1998).

Se cree que la enfermedad por C. difficile es producida por las acciones de dos exotoxinas, la toxina A y la toxina B, sobre el epitelio intestinal. Ambas toxinas son proteínas de alto peso molecular (280-300 kDa) que catalizan la modificación covalente de proteínas Rho, proteínas pequeñas de unión a GTP que participan en la polimerización de actina, en células huésped. La modificación de proteínas Rho por las toxinas las inactiva, conduciendo a despolimerización de filamentos de actina y muerte celular. Ambas toxinas son mortales para ratones cuando se inyectan parenteralmente (Kelly y Lamont, Annu. Rev. Med., 49:375-90, 1998).

La enfermedad por C. difficile puede diagnosticarse por ensayos que detectan la presencia o actividad de toxina A o toxina B en muestras de heces, por ejemplo, inmunoensayos enzimáticos. Los ensayos de citotoxinas pueden usarse para detectar la actividad de la toxina. Para realizar un ensayo de citotoxina, las heces se filtran para eliminar bacterias y se determinan los efectos de toxinas citopáticas sobre las células cultivadas (Merz y col., J. Clin. Microbiol., 32:1142-47, 1994).

El tratamiento de C. difficile se complica por el hecho de que los antibióticos desencadenan enfermedad asociada a C. difficile. Sin embargo, los antibióticos son actualmente la opción de tratamiento primaria. Frecuentemente se usan antibióticos que es menos probable que produzcan enfermedad asociada a C. difficile tal como vancomicina y metronidazol. La resistencia a vancomicina que se desarrolla en otros microorganismos es un motivo de preocupación en el uso de este antibiótico para el tratamiento, ya que es el único tratamiento eficaz para infección por otros microorganismos (Gerding, Curr. Top. Microbiol. Immunol., 250:127-39, 2000). También se usan enfoques probióticos en los que a un sujeto se le administran microorganismos no patógenos que supuestamente compiten por nichos con las bacterias patógenas. Por ejemplo, se ha informado del tratamiento con una combinación de vancomicina y Saccharomyces bouiardii (McFarland y col., JAMA., 271 (24):1913-8, 1994. Errata en: JAMA, 272(7) :518, 1994).

Se han desarrollado vacunas que protegen a los animales de la exposición mortal en modelos infecciosos de enfermedad (Torres y col., Infect. Immun. 63(12):4619-27,1995). Además, se ha mostrado que los anticuerpos policlonales protegen a los hámsteres de la enfermedad cuando se administran mediante inyección o la comida (Giannasca y col., Infect. Immun. 67(2):527-38, 1999; Kink y Williams, Infect. Immun., 66(5):2018-25, 1998). Se han aislado anticuerpos monoclonales murinos que se unen a toxinas de C. difficile y neutralizan sus actividades in vivo e in vitro (Corthler y col., Infect. Immun., 59(3):1192-5, 1991). Hay algunos informes de que los anticuerpos policlonales humanos que contienen anticuerpos neutralizantes de toxina pueden prevenir la recaída por C. difficile (Salcedo y col., Gut., 41 (3):366-70, 1997). La respuesta de anticuerpos contra la toxina A ha guardado relación con la evolución de la enfermedad, que indica la eficacia de respuestas humorales en el control de la infección. Los individuos con respuestas robustas de ELISA a la toxina A tuvieron enfermedad menos grave en comparación con individuos con bajos niveles de anticuerpo para la toxina A (Kyne y col., Lancet, 357(9251 ):189-93, 2001).

La función individual de la toxina A y la toxina B en la patogénesis de enfermedades y la función de anticuerpos antitoxina en la protección de enfermedad por C. difficile son controvertidas y pueden depender del huésped. En seres humanos, la respuesta de anticuerpos anti-toxina A ha guardado relación con la evolución de la enfermedad, sugiriendo un requisito para la respuesta de anti-toxina A para la protección. Esta observación es a diferencia de informes de organismos de C. difficile causantes de enfermedad que sólo expresan la toxina B, implicando que la toxina B puede contribuir a una enfermedad en seres humanos. Estas cepas negativas para toxina A también pueden producir enfermedad en hámsteres (Sambol y col., J. Infect. Dis., 183(12):1760-6, 2001).

Se sabe que el antisuero policlonal contra la toxina B de C. difficile inhibe el dominio catalítico de la toxina B (Genth y col., Inf. and Immun., 68(3): 1094-1101, 2000). Se sabe que anticuerpos de fragmento variable de la cadena sencilla recombinantes dirigidos contra la toxina B de C. difficile se unen al antígeno con alta afinidad (Deng y col., Clin. Diagn. Lab. Immun., 10(4): 587-595, 2003).

Resumen de la invención

La presente invención se basa, en parte, en el descubrimiento de que la administración de anticuerpos contra la toxina A de C. difficile a un sujeto puede proteger al sujeto de la recaída de enfermedad mediada por C. difficile in vivo. La administración de anticuerpos a una o ambas de la toxina A y la toxina B puede prevenir la enfermedad mediada por C. difficile primaria. Los anticuerpos de alta afinidad contra toxinas de C. difficile pueden producirse, por ejemplo, en ratones tales como ratones transgénicos que expresan segmentos del gen de inmunoglobulina humana. Estos anticuerpos pueden neutralizar la citotoxicidad de toxinas in vitro y neutralizar la enterotoxicidad de toxinas in vivo. Los anticuerpos que reconocen la toxina A y/o la toxina B pueden inhibir y proteger de la enfermedad in vivo.

La invención proporciona un anticuerpo monoclonal aislado, o porción de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a la toxina B de Clostridium difficile (C. difficile) con una Kd inferior a 10 x10'10 M medida por resonancia de plasmones superficiales y neutraliza la toxina B de C. difficile, en el que el anticuerpo o porción de unión a antígeno del mismo comprende:

(a) una región variable de la cadena pesada que comprende las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de SEC ID N2: 62, 64 y 66; y

(b) una región variable de la cadena ligera que comprende las secuencias de CDR1, CDR2 y CDR3 de SEC ID N2: 68, 70 y 72.

Los anticuerpos o porciones de unión a antígeno de los mismos neutralizan la toxina B in vitro, inhiben la unión de toxina B a células de mamífero e/o inhiben enfermedad mediada por C. difficile in vivo.

En diversas realizaciones, los anticuerpos o porciones de unión a antígeno de los mismos tienen una o más de las siguientes características: cuando se administran a un ratón, protegen al ratón de la administración de una toxina de C. difficile en una cantidad que sería mortal para un ratón de control al que no se le administra el anticuerpo; protegen de o inhiben colitis mediada por C. difficile, colitis asociada a antibióticos o colitis pseudomembranosa (PMC) en un sujeto; protegen de o inhiben diarrea en un sujeto; e/o inhiben la recaída de enfermedad mediada por C. difficile.

En una realización, la invención proporciona un anticuerpo, o porción de unión al antígeno del mismo, de la invención, en el que la región variable de la cadena pesada comprende la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID N2: 54 y la región variable de la cadena ligera comprende la... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un anticuerpo monoclonal aislado, o porción de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a la toxina B de Clostrídium difficile (C. difficile) con una Kd inferior a 10 x 10'10 M medida por resonancia de plasmones superficiales y neutraliza la toxina B de C. difficile, en donde el anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, comprende:

(a) una región variable de la cadena pesada que comprende las secuencias de aminoácidos de CDR1, CDR2 y CDR3 de SEC ID N2: 62, 64 y 66; y

(b) una región variable de la cadena ligera que comprende las secuencias de CDR1, CDR2 y CDR3 de SEC ID N2: 68, 70 y 72.

2. El anticuerpo aislado, o porción de unión a antígeno del mismo, de la reivindicación 1, en el que la región variable de la cadena pesada comprende la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID N2: 54 y la región variable de la cadena ligera comprende la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID N2: 58.

3. El anticuerpo aislado, o porción de unión a antígeno del mismo, de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que:

(a) el anticuerpo es un anticuerpo humano, un anticuerpo humanizado o un anticuerpo quimérico; y/o

(b) la porción de unión a antígeno comprende Fab, F(ab')2, scFv o Fv.

4. Una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, de una cualquiera de las reivindicaciones anteriores en un vehículo farmacéuticamente aceptable.

5. Una composición terapéutica que comprende:

(a) el anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3; y

(b) un anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a la toxina A de C. difficile.

6. La composición de la reivindicación 5, en la que el anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a la toxina A de C. difficile:

(a) compite para unirse a la toxina A con un anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, que tiene una región variable de la cadena pesada y una región variable de la cadena ligera que comprende las secuencias de aminoácidos mostradas en SEC ID N2: 1 y 4, SEC ID N2: 2 y 5 o SEC ID N2: 3 y 6, respectivamente; o

(b) se une específicamente a la toxina A con una Kd inferior a 20 x 10'6 M medida por resonancia de plasmones superficiales.

7. La composición de una cualquiera de las reivindicaciones 5 ó 6, en la que:

(a) el anticuerpo que se une específicamente a la toxina A de C. difficile es un anticuerpo monoclonal humano, un anticuerpo humanizado o un anticuerpo quimérico; y/o

(b) la porción de unión a antígeno del anticuerpo que se une específicamente a la toxina A de C. difficile comprende Fab, F(ab')2, scFv o Fv.

8. El anticuerpo monoclonal aislado, o porción de unión a antígeno del mismo, de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 o la composición de una cualquiera de las reivindicaciones 4 a 7 para su uso en un procedimiento para tratar el cuerpo humano o animal mediante terapia o en un procedimiento de diagnóstico llevado a cabo en el cuerpo humano o animal.

9. El anticuerpo monoclonal aislado, o porción de unión a antígeno del mismo, de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 o la composición de una cualquiera de las reivindicaciones 4 a 7 para su uso en un procedimiento para tratar enfermedad mediada por C. difficile en un sujeto, opcionalmente en el que:

(a) el sujeto es humano; y/o

(b) el anticuerpo o la porción de unión a antígeno del mismo se administran intravenosamente, intramuscularmente o subcutáneamente al sujeto.

10. El anticuerpo monoclonal aislado, o porción de unión a antígeno del mismo, de la reivindicación 9 en el que el anticuerpo, o porción de unión a antígeno del mismo, se administra con otro agente terapéutico, opcionalmente en donde el agente terapéutico es:

(a) un antibiótico, gamma-globulina policlonal, agente probiótico o vacuna de C. difficile',

(b) vancomicina, metronidazol, bacitracina, Saccharomyces boulardii o una vacuna de toxoide de C. difficile', o

(c) un anticuerpo monoclonal, o porción de unión a antígeno del mismo, que se une específicamente a toxina A de C. difficile.

11. Un kit que comprende:

(a) el anticuerpo monoclonal, o porción de unión a antígeno del mismo, de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3; y

(b)

(i) una marca;

(ii) un agente terapéutico;

(iii) un agente para acoplar el anticuerpo a una marca o agente terapéutico; o

(iv) un dispositivo para administrar el anticuerpo a un sujeto.

12. Un vector de expresión ácido nucleico que comprende:

(a) una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un polipéptido que comprende SEC ID N°:

(b) una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un polipéptido que comprende SEC ID N°:

13. Una célula huésped aislada que comprende el vector de expresión de la reivindicación 12.

14. Una célula huésped aislada que comprende:

(a) una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un polipéptido que comprende SEC ID N°:

(b) una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un polipéptido que comprende SEC ID N°:

54; y 58.

54; y 58.


 

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