Detección de modificaciones químicas en ácidos nucleicos.

Procedimiento para la detección de datos estructurales en un ácido nucleico,

comprendiendo el procedimiento: a. proporcionar un ARN que ha sido expuesto a un reactivo que proporciona una modificación química, en el que el reactivo comprende un electrófilo que modifica selectivamente nucleótidos sin restricciones en el ARN para formar un aducto 2'-O- de ribosa covalente o en el que el reactivo es sulfato de dimetilo, DMS y forma aductos en la posición N1 de la adenosina y la posición N3 de la citosina;

b. sintetizar un ácido nucleico usando una transcriptasa inversa y el ARN proporcionado en la etapa (a) como una plantilla, en el que la síntesis tiene lugar en presencia de Mn2+, en el que la transcriptasa inversa lee a través de la modificación química en el ARN proporcionado en la etapa (a) para producir de este modo un nucleótido no complementario o una deleción en el ácido nucleico resultante en el sitio de la modificación química; y

c. detectar el nucleótido no complementario al nucleótido plantilla o la deleción mediante la secuenciación del ácido nucleico, en el que la información de la secuencia se alinea con la secuencia de ARN proporcionada en la etapa (a).

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/059489.

Solicitante: THE UNIVERSITY OF NORTH CAROLINA AT CHAPEL HILL.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 100 Europa Drive, Suite 430 Chapel Hill, NC 27517 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: WEEKS,KEVIN M, SIEGFRIED,NATHAN, HOMAN,PHILIP, BUSAN,STEVEN, FAVOROV,OLEG V.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N15/01 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Preparación de mutantes sin introducción de material genético extraño; Procedimientos de cribado para ello.
  • C12N9/12 C12N […] › C12N 9/00 Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas. › transfieren grupos que contienen fósforo, p. ej. Quinasas (2.7).
  • C12Q1/6806 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Preparación de ácidos nucleicos para análisis, p. ej. para el ensayo de la reacción en cadena de la polimerasa [PCR] (C12Q 1/6804 tiene prioridad).

PDF original: ES-2791873_T3.pdf

 

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